CY3-YNE

别名: 2-[3-[1,3-二氢-3,3-二甲基-1-[6-氧代-6-(2-丙炔-1-基氨基)己基]-5-磺基-2H-吲哚-2-亚基]-1-丙烯-1-基]-1-乙基-3,3-二甲基-5-磺基-3H-吲哚鎓;CY3-YNE
目录号: V34153 纯度: ≥98%
CY3-YNE(磺基氰基炔)是一种可用于标记可溶性蛋白质、肽和寡核苷酸/DNA 的染料。
CY3-YNE CAS号: 1010386-62-5
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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产品描述
CY3-YNE(磺基-氰基-3-炔)是一种可用于标记可溶性蛋白质、肽和寡核苷酸/DNA的染料。CY3-YNE是点击化学的试剂。它含有炔基,可以与含有叠氮基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。
CY3-YNE(磺基-菁-3-炔)是一种末端带有炔基的磺化菁染料,专为铜催化叠氮-炔环加成(CuAAC)点击化学反应而设计。它是一种荧光染料,可用于标记可溶性蛋白质、肽和寡核苷酸/DNA。磺酸基团增强了其水溶性,使其适用于生物学应用。CY3-YNE常用于荧光成像、分子追踪和需要稳定荧光标记的定量生物分析。
生物活性&实验参考方法
靶点
CY3-YNE does not have a specific biological target; it is a chemical tool for bioconjugation. The alkyne group serves as a bioorthogonal handle for selective conjugation to azide-functionalized molecules via CuAAC click chemistry. Its primary "target" is the chemical functionality of azide-containing compounds. The cyanine fluorophore provides fluorescence for detection and imaging applications.
体外研究 (In Vitro)
CY3-YNE 的体外活性通过其作为点击化学试剂的效率来评估。它可用于标记生物分子,例如蛋白质、肽和寡核苷酸。标记效率通常通过测量偶联后的荧光强度来评估。该化合物在 CuAAC 反应中的反应活性可通过高效液相色谱 (HPLC)、液相色谱-质谱联用 (LC-MS) 或荧光光谱法进行监测。CY3-YNE 具有良好的光稳定性和明亮的荧光,使其适用于各种生物分析检测。
体内研究 (In Vivo)
CY3-YNE 的体内应用主要体现在其用于生物正交标记成像方面。该化合物可与靶向配体或纳米颗粒偶联,用于体内荧光成像。其磺化结构可能限制细胞渗透性,但可提高水溶性。由于该化合物主要是一种化学试剂,因此详细的体内活性数据有限。
酶活实验
CY3-YNE并非靶向生物大分子的药物,因此标准的酶/受体结合试验不适用。取而代之的是,采用CuAAC点击化学反应来评估其化学反应活性。典型的反应方案是将该化合物与叠氮基官能化的分子在铜催化剂(例如CuSO4)和还原剂(例如抗坏血酸钠)的存在下,于室温或37℃下混合。反应进程可通过薄层色谱(TLC)、高效液相色谱(HPLC)或质谱进行监测。偶联效率通过比较起始原料和产物的相对量来计算。
细胞实验
CY3-YNE 的细胞检测包括评估其在细胞表面或细胞内标记中的应用。将细胞与叠氮修饰的生物分子(例如糖类、蛋白质)孵育,使叠氮基团代谢掺入细胞,然后通过点击化学与 CY3-YNE 反应。标记通过荧光显微镜或流式细胞术检测。使用标准细胞活力检测方法(例如 MTT 法)评估化合物或其缀合物的细胞毒性。通过比较处理组和对照组细胞的荧光信号来评估化合物的标记特异性。
动物实验
由于CY3-YNE主要是一种化学试剂,因此其体内动物研究较为有限。在体内应用时,通常将该化合物与靶向基团偶联,并用于动物模型进行荧光成像研究。组织分布和标记效率通过成像或组织分析进行评估。该化合物可用于预靶向策略,即先给予叠氮修饰的抗体或纳米颗粒,再给予CY3-YNE进行生物正交标记。目前尚无详细的体内实验方案报道。
药代性质 (ADME/PK)
CY3-YNE 的药代动力学性质具有荧光菁染料的特征。该化合物的分子量为 667.84,分子式为 C34H41N3O₇S2。磺酸基团可提高其水溶性。该化合物通常在 -20℃ 下避光保存。其药代动力学性质高度依赖于与其连接的特定缀合物。目前尚未有大量关于该试剂的详细药代动力学参数(例如半衰期和生物利用度)的报道。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
CY3-YNE 是一种研究用试剂,不适用于人体治疗。该化合物含有炔基,在生理条件下通常稳定。在细胞实验中,该化合物在标记浓度下通常耐受性良好。花菁荧光团在长时间光照下可能具有一定的光毒性。处理该化合物时应遵循标准安全预防措施。
其他信息
CY3-YNE 是一种点击化学试剂和荧光染料,广泛应用于化学生物学和生物偶联领域。其应用包括蛋白质标记、肽标记、寡核苷酸/DNA标记、荧光成像和分子追踪。该化合物与铜催化叠氮-炔环加成反应 (CuAAC) 兼容。它并非美国食品药品监督管理局 (FDA) 批准的药物,也没有临床适应症。该化合物纯度高,通常避光储存于 -20℃。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C34H41N3O7S2
分子量
667.835246801376
精确质量
667.238
CAS号
1010386-62-5
PubChem CID
124220414
外观&性状
Brown to reddish brown solid powder
LogP
3.8
tPSA
164
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
46
分子复杂度/Complexity
1490
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C1C=CC2=C(C=1)C(C)(C)C(C=CC=C1C(C)(C)C3C=C(C=CC=3N1CC)S(=O)(=O)[O-])=[N+]2CCCCCC(NCC#C)=O)(=O)(=O)O
InChi Key
DVBDEKRWCVSXGU-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C34H41N3O7S2/c1-7-20-35-32(38)15-10-9-11-21-37-29-19-17-25(46(42,43)44)23-27(29)34(5,6)31(37)14-12-13-30-33(3,4)26-22-24(45(39,40)41)16-18-28(26)36(30)8-2/h1,12-14,16-19,22-23H,8-11,15,20-21H2,2-6H3,(H2-,35,38,39,40,41,42,43,44)
化学名
2-[3-[3,3-dimethyl-1-[6-oxo-6-(prop-2-ynylamino)hexyl]-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~37.38 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (1.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 8.3mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4974 mL 7.4868 mL 14.9736 mL
5 mM 0.2995 mL 1.4974 mL 2.9947 mL
10 mM 0.1497 mL 0.7487 mL 1.4974 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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