| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
CY5-N3 is a labeling reagent that reacts with alkyne-containing molecules via a copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) or strain-promoted azide-alkyne cycloaddition (SPAAC) click reaction. This allows for the covalent attachment of the fluorescent dye to a wide variety of biomolecules, including proteins, nucleic acids, and carbohydrates.
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|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
在体外，CY5-N3 可通过点击反应用于细胞成像。它可用于标记活细胞或固定细胞中的生物分子。其远红外荧光可最大限度地降低背景自发荧光，使其成为高灵敏度成像应用的理想选择。它可透过细胞膜，并可用于活细胞成像。
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| 体内研究 (In Vivo) |
CY5-N3 可用于细胞、组织和活体成像。其近红外荧光信号背景低、组织穿透力强，适用于深层组织分子标记和活体荧光成像。它可用于追踪生物分子、研究生物分布以及监测活体动物的生物过程。
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| 酶活实验 |
体外CY5-N3标记通常是通过将含叠氮基团的染料与炔基修饰的生物分子反应来实现的。该反应在合适的缓冲液中进行，通常在室温或37°C下进行1-4小时。偶联效率可通过SDS-PAGE、HPLC或质谱等技术进行监测。
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| 细胞实验 |
使用 CY5-N3 进行细胞分析通常包括通过点击化学反应用该染料标记细胞。首先将细胞与含有炔基的分子孵育。洗涤后，用 CY5-N3 和铜催化剂（用于 CuAAC 反应）处理细胞。然后洗涤细胞，并使用荧光显微镜成像或通过流式细胞仪进行分析。
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| 动物实验 |
利用小型动物成像系统，对CY5-N3标记的探针进行体内成像。标记探针通过静脉注射给药。在不同时间点，对动物进行麻醉，并使用合适的激发和发射滤光片（646/662 nm）进行成像。通过定量分析荧光信号，确定探针的生物分布和靶向性。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
CY5-N3 的分子量为 738.92 g/mol，化学式为 C36H46N6O7S2。由于其含有磺酸基团，因此具有极高的水溶性。这一特性使其可用于纯水性缓冲液中，从而保持标记生物分子的天然构象和生物活性。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
CY5-N3 通常被认为对标记应用无毒。该染料本身细胞毒性低，且用于标记的浓度通常也很低。最终 CY5-N3 标记探针的安全性和毒性取决于与其偶联的生物分子的性质。
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| 参考文献 |
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| 其他信息 |
CY5-N3 是一种用于生物偶联和荧光成像的有效工具。其叠氮基团可通过点击化学实现特异性和高效的标记。它可用于多种应用，包括核酸修饰、蛋白质定位和糖生物学研究。
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| 分子式 |
C36H46N6O7S2
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|---|---|
| 分子量 |
738.916446208954
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| 精确质量 |
738.286
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| CAS号 |
1621101-43-6
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| PubChem CID |
118986650
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| 外观&性状 |
Brown to reddish brown solid powder
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| LogP |
5.6
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| tPSA |
178
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
10
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| 可旋转键数目(RBC) |
15
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| 重原子数目 |
51
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| 分子复杂度/Complexity |
1640
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
S(C1C=CC2=C(C=1)C(C)(C)C(/C=C/C=C/C=C1/C(C)(C)C3C=C(C=CC=3N/1CC)S(=O)(=O)[O-])=[N+]2CCCCCC(NCCCN=[N+]=[N-])=O)(=O)(=O)O
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| InChi Key |
LSISYTNZXRYXJU-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C36H46N6O7S2/c1-6-41-30-19-17-26(50(44,45)46)24-28(30)35(2,3)32(41)14-9-7-10-15-33-36(4,5)29-25-27(51(47,48)49)18-20-31(29)42(33)23-12-8-11-16-34(43)38-21-13-22-39-40-37/h7,9-10,14-15,17-20,24-25H,6,8,11-13,16,21-23H2,1-5H3,(H2-,38,43,44,45,46,47,48,49)
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| 化学名 |
(2E)-2-[(2E,4E)-5-[1-[6-(3-azidopropylamino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。 (2). 该产品在溶液状态不稳定，请现配现用。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~25 mg/mL (~33.83 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.38 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.38 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.3533 mL | 6.7666 mL | 13.5333 mL | |
| 5 mM | 0.2707 mL | 1.3533 mL | 2.7067 mL | |
| 10 mM | 0.1353 mL | 0.6767 mL | 1.3533 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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