CY5

别名: Sulfo Cy5 acid Sulfo-Cy5 acid Sulfo-Cy5-acid 2-[5-[1-(5-羧基戊基)-1,3-二氢-3,3-二甲基-5-磺基-2H-吲哚-2-亚基]-1,3-戊二烯基]-1-乙基-3,3-二甲基-5-磺基-3H-吲哚内盐;2-[5-[1-(5-羧基戊基)-1,3-二氢-3,3-二甲基-5-磺基-2H-吲哚-2-亚基]-1,3-戊二烯基]-1-乙基-3,3-二甲基-5-磺基-3H-吲哚鎓内盐;磺酸基-CY5羧酸;磺基-CY5 羧酸;CY5单体

目录号: V18921 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

CY5 是一种新型、有效的光开关荧光标记试剂和反应性染料，用于标记肽、蛋白质和寡核苷酸中的氨基。

CY5 CAS号: 146368-11-8
产品类别: New1

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

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Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器

产品描述

CY5 是一种新型、有效的光开关荧光标记试剂和活性染料，用于标记肽、蛋白质和寡核苷酸中的氨基。标记反应中需要使用少量有机共溶剂（如DMF或DMSO）。该试剂非常适合以极具成本效益的方式标记可溶性蛋白质以及各种肽和寡核苷酸。该试剂在有机溶剂中也适用于小分子标记。激发 (nm)：649，发射 (nm)：670。

生物活性&实验参考方法

体外研究 (In Vitro)	原液的精细配制 1. 蛋白制备为了获得标记效果，添加浓度为 2 mg/mL 的蛋白（抗体）。 1) 蛋白溶液的pH值应为8.5±0.5。如果 pH 值低于 8.0，请使用 1 M 二氧化碳。 2) 如果蛋白质含量低于2 mg/mL，标记效率会显着降低。为了获得最佳的标记效率，建议蛋白质浓度范围为2-10 mg/mL。 3) 蛋白质必须处于含有伯胺（如 Tris 或甘氨酸）和铵离子的透明缓冲液中，否则标记效率会受到影响。 2. 染料制备将无水 DMSO 添加到 CY 染料中，生成 10 mM 储备溶液。通过玻璃管或涡旋混合均匀。 CY储存液分装后建议-20℃或-80℃避光保存。 3. 染料工作液的量标记反应所需的CY染料的量取决于标记蛋白的量。 CY染料和蛋白的理想用量如下：假设所需标记蛋白为500 μL 2 mg/mL IgG（MW=150,000），用100 μL DMSO溶解一管1 mg CY染料，则所需的CY 体积为 3.95 μL。具体计算过程如下（以CY3-NHS酯为例）： 1）mmol（IgG）= mg/mL（IgG）×mL（IgG）/MW（IgG）=2 mg/mL×0.5 mL / 150,000 mg/mmol= 6.7×10-6 mmol 2) mmol (CY3-NHS 酯) = mmol (IgG) ×10 = 6.7×10-6 mmol×10 = 6.7×10-5 mmol 3) μL (CY3 -NHS 酯) = mmol (CY3-NHS 酯) ×MW (CY3-NHS 酯) / mg/μL (CY3-NHS 酯) = 6.7×10-5 mmol× 590.15 mg/mmol / 0.01 mg/μL =3.95 μL (CY3-NHS酯) 使用方法 1. 标记反应 1) 取计算体积的10 mg/mL CY染料新鲜载体缓慢加入0.5 mL蛋白样品溶液中，轻轻摇匀混匀，短暂收集离心样品。反应管底部。请勿模仿 2）将反应管置于暗处，轻轻摇晃，原条件下步行60分钟，每周10-15分钟，轻轻翻转反应管多次即可 2.蛋白封闭脱盐以下方法以使用 SepHadex G-25 柱封闭染料缀合物为例。 1) 根据制造商的说明准备 SepHadex G-25 柱。 2) 将反应混合物插入 SepHadex G-25 柱的顶部。 3) 当样品流到顶部树脂表面以下时，添加 PBS（pH 7.2-7.4）。 4) 立即向所选样品中添加额外的 PBS (pH 7.2-7.4) 以完成柱状收缩。合并包含适当染料-蛋白质缀合物的组分。
参考文献	[1]. Ptaszek M. Rational design of fluorophores for in vivo applications. Prog Mol Biol Transl Sci. 2013;113:59-108. [2]. Shindy, H. A. (2017). Fundamentals in the chemistry of cyanine dyes: A review. Dyes and Pigments, 145, 505–513. doi:10.1016/j.dyepig.2017.06.029.

体外研究 (In Vitro)

原液的精细配制 1. 蛋白制备为了获得标记效果，添加浓度为 2 mg/mL 的蛋白（抗体）。 1) 蛋白溶液的pH值应为8.5±0.5。如果 pH 值低于 8.0，请使用 1 M 二氧化碳。 2) 如果蛋白质含量低于2 mg/mL，标记效率会显着降低。为了获得最佳的标记效率，建议蛋白质浓度范围为2-10 mg/mL。 3) 蛋白质必须处于含有伯胺（如 Tris 或甘氨酸）和铵离子的透明缓冲液中，否则标记效率会受到影响。 2. 染料制备将无水 DMSO 添加到 CY 染料中，生成 10 mM 储备溶液。通过玻璃管或涡旋混合均匀。 CY储存液分装后建议-20℃或-80℃避光保存。 3. 染料工作液的量标记反应所需的CY染料的量取决于标记蛋白的量。 CY染料和蛋白的理想用量如下：假设所需标记蛋白为500 μL 2 mg/mL IgG（MW=150,000），用100 μL DMSO溶解一管1 mg CY染料，则所需的CY 体积为 3.95 μL。具体计算过程如下（以CY3-NHS酯为例）： 1）mmol（IgG）= mg/mL（IgG）×mL（IgG）/MW（IgG）=2 mg/mL×0.5 mL / 150,000 mg/mmol= 6.7×10-6 mmol 2) mmol (CY3-NHS 酯) = mmol (IgG) ×10 = 6.7×10-6 mmol×10 = 6.7×10-5 mmol 3) μL (CY3 -NHS 酯) = mmol (CY3-NHS 酯) ×MW (CY3-NHS 酯) / mg/μL (CY3-NHS 酯) = 6.7×10-5 mmol× 590.15 mg/mmol / 0.01 mg/μL =3.95 μL (CY3-NHS酯) 使用方法 1. 标记反应 1) 取计算体积的10 mg/mL CY染料新鲜载体缓慢加入0.5 mL蛋白样品溶液中，轻轻摇匀混匀，短暂收集离心样品。反应管底部。请勿模仿 2）将反应管置于暗处，轻轻摇晃，原条件下步行60分钟，每周10-15分钟，轻轻翻转反应管多次即可 2.蛋白封闭脱盐以下方法以使用 SepHadex G-25 柱封闭染料缀合物为例。 1) 根据制造商的说明准备 SepHadex G-25 柱。 2) 将反应混合物插入 SepHadex G-25 柱的顶部。 3) 当样品流到顶部树脂表面以下时，添加 PBS（pH 7.2-7.4）。 4) 立即向所选样品中添加额外的 PBS (pH 7.2-7.4) 以完成柱状收缩。合并包含适当染料-蛋白质缀合物的组分。

参考文献

[1]. Ptaszek M. Rational design of fluorophores for in vivo applications. Prog Mol Biol Transl Sci. 2013;113:59-108.

[2]. Shindy, H. A. (2017). Fundamentals in the chemistry of cyanine dyes: A review. Dyes and Pigments, 145, 505–513. doi:10.1016/j.dyepig.2017.06.029.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C33H40N2O8S2
分子量	656.81
精确质量	656.222
CAS号	146368-11-8
PubChem CID	91811031
外观&性状	Brown to green black solid powder
LogP	7.515
tPSA	174.71
氢键供体(HBD)数目	2
氢键受体(HBA)数目	9
可旋转键数目(RBC)	11
重原子数目	45
分子复杂度/Complexity	1430
定义原子立体中心数目	0
SMILES	CCN\1C2=C(C=C(C=C2)S(=O)(=O)[O-])C(/C1=C/C=C/C=C/C3=[N+](C4=C(C3(C)C)C=C(C=C4)S(=O)(=O)O)CCCCCC(=O)O)(C)C
InChi Key	HPICMEGAGMPYID-UHFFFAOYSA-N
InChi Code	InChI=1S/C33H40N2O8S2/c1-6-34-27-18-16-23(44(38,39)40)21-25(27)32(2,3)29(34)13-9-7-10-14-30-33(4,5)26-22-24(45(41,42)43)17-19-28(26)35(30)20-12-8-11-15-31(36)37/h7,9-10,13-14,16-19,21-22H,6,8,11-12,15,20H2,1-5H3,(H2-,36,37,38,39,40,41,42,43)
化学名	(2Z)-2-[(2E,4E)-5-[1-(5-carboxypentyl)-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
别名	Sulfo Cy5 acid Sulfo-Cy5 acid Sulfo-Cy5-acid
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意：本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ~125 mg/mL (~190.31 mM) H2O : ~25 mg/mL (~38.06 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* ≥ 2.08 mg/mL (3.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ~125 mg/mL (~190.31 mM)
H2O : ~25 mg/mL (~38.06 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	1.5225 mL	7.6126 mL	15.2251 mL
	5 mM	0.3045 mL	1.5225 mL	3.0450 mL
	10 mM	0.1523 mL	0.7613 mL	1.5225 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。