CY5

别名: Sulfo Cy5 acid Sulfo-Cy5 acid Sulfo-Cy5-acid 2-[5-[1-(5-羧基戊基)-1,3-二氢-3,3-二甲基-5-磺基-2H-吲哚-2-亚基]-1,3-戊二烯基]-1-乙基-3,3-二甲基-5-磺基-3H-吲哚内盐;2-[5-[1-(5-羧基戊基)-1,3-二氢-3,3-二甲基-5-磺基-2H-吲哚-2-亚基]-1,3-戊二烯基]-1-乙基-3,3-二甲基-5-磺基-3H-吲哚鎓内盐;磺酸基-CY5羧酸;磺基-CY5 羧酸;CY5单体
目录号: V18921 纯度: ≥98%
CY5 是一种新型、有效的光开关荧光标记试剂和反应性染料,用于标记肽、蛋白质和寡核苷酸中的氨基。
CY5 CAS号: 146368-11-8
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
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产品描述
CY5 是一种新型高效的光开关荧光标记试剂和活性染料,用于标记肽、蛋白质和寡核苷酸中的氨基。标记反应仅需少量有机助溶剂(例如 DMF 或 DMSO)。该试剂非常适合高效标记可溶性蛋白质以及各种肽和寡核苷酸。此外,该试剂在有机溶剂中也适用于小分子标记。激发波长 (nm):649,发射波长 (nm):670。
CY5(CAS 编号:146368-11-8),又名磺基花菁 5,是一种远红外荧光花菁染料,广泛应用于生物学和生物医学研究,用于灵敏的检测和成像。它在 649 nm 附近具有强吸收,并在 670 nm 附近发射荧光,从而实现低背景干扰和深层信号穿透。它是水溶性得到改善的磺化衍生物。
生物活性&实验参考方法
靶点
CY5 does not target a biological receptor or enzyme; it is a fluorescent labeling reagent. Its primary function is to label amino groups in peptides, proteins, and oligonucleotides for detection and imaging purposes. It can also be used to label small molecules in organic solvents. It is a photoswitchable fluorescent labeling reagent, making it suitable for advanced imaging techniques.
体外研究 (In Vitro)
最佳储备液制备方法:1. 蛋白质制备:为获得标记效果,加入浓度为 2 mg/mL 的蛋白质(抗体)。1) 蛋白质溶液的 pH 值应为 8.5±0.5。如果 pH 值低于 8.0,则使用 1 M 二氧化碳。2) 如果蛋白质浓度低于 2 mg/mL,标记效率将显著降低。为获得最佳标记效率,建议蛋白质浓度范围为 2-10 mg/mL。3) 蛋白质必须溶于含有伯胺(例如 Tris 或甘氨酸)和铵离子的澄清缓冲液中,否则标记效率会受到影响。2. 染料制备:向 CY 染料中加入无水 DMSO,配制成 10 mM 的储备液。用玻璃管或涡旋振荡器充分混匀。分装后,建议将 CY 储备液避光保存于 -20℃ 或 -80℃。 3. 染料工作液的用量 标记反应所需的CY染料用量取决于标记蛋白的量。CY染料和蛋白的理想用量如下:假设所需的标记蛋白为500 μL浓度为2 mg/mL的IgG(分子量=150,000),用100 μL DMSO溶解1 mg CY染料,则所需的CY染料体积为3.95 μL。具体计算过程如下(以CY3-NHS酯为例):1) mmol (IgG) = mg/mL (IgG) × mL (IgG) / MW (IgG) = 2 mg/mL × 0.5 mL / 150,000 mg/mmol = 6.7 × 10⁻⁶ mmol 2) mmol (CY3-NHS酯) = mmol (IgG) × 10 = 6.7 × 10⁻⁶ mmol × 10 = 6.7 × 10⁻⁵ mmol 3) μL (CY3-NHS酯) = mmol (CY3-NHS酯) × MW (CY3-NHS酯) / mg/μL (CY3-NHS酯) = 6.7 × 10⁻⁵ mmol × 590.15 mg/mmol / 0.01 mg/μL = 3.95 μL (CY3-NHS酯) 使用方法 1. 标记反应 1) 取将计算体积的10 mg/mL CY染料新鲜载体缓慢加入0.5 mL蛋白质样品溶液中,轻轻摇晃混匀,并短暂收集离心后的样品于反应管底部。请勿模仿2)将反应管置于黑暗处,在原条件下轻轻摇晃并放置60分钟,每周10-15分钟,轻轻翻转反应管多次。2. 蛋白质封闭和脱盐 以下方法以SepHadex G-25柱封闭的染料偶联物为例。1)按照制造商的说明制备SepHadex G-25柱。2)将反应混合物注入SepHadex G-25柱的顶部。3)当样品流过顶部树脂表面时,加入PBS(pH 7.2-7.4)。4)立即向选定的样品中加入额外的PBS(pH 7.2-7.4)以完成柱收缩。将组成合适染料-蛋白质偶联物的各组分混合。
在体外,CY5 可用于标记多种生物分子,包括肽、蛋白质和寡核苷酸。标记反应通常需要少量有机助溶剂,例如 DMF 或 DMSO。该化合物尤其适用于以经济高效的方式标记可溶性蛋白质以及各种肽和寡核苷酸。
体内研究 (In Vivo)
CY5本身不具有体内活性,因为它是一种标记试剂而非治疗剂。然而,CY5标记的生物分子可用于体内成像应用,例如追踪药物的生物分布或在动物模型中可视化肿瘤。该染料的远红外荧光使其能够深入组织,且在体内背景干扰低。
酶活实验
作为一种化学标记试剂,CY5 无需进行无细胞受体结合或酶活性测定。其反应活性通过分光光度法或质谱法监测靶分子(例如肽、蛋白质)的标记效率来评估。标记度 (DOL) 通过测量染料在 649 nm 处的吸光度和蛋白质在 280 nm 处的浓度来计算。
细胞实验
体外细胞实验中,CY5 通常用于标记细胞表面蛋白或细胞内靶标。将细胞与 CY5 偶联的抗体、肽或其他探针孵育。洗涤后,通过流式细胞术或荧光显微镜分析细胞,以检测标记的靶标。该染料的远红外荧光特性使其能够与其他荧光探针进行多重标记。
动物实验
利用CY5标记的探针进行体内动物实验,可用于成像应用。例如,将靶向肿瘤特异性抗原的CY5标记抗体或肽通过静脉注射注入荷瘤小鼠体内。然后使用体内成像系统(IVIS)监测探针的生物分布,该系统可检测CY5的远红外荧光,从而实现对活体动物体内探针的实时追踪。
药代性质 (ADME/PK)
药代动力学特性与CY5标记的探针相关,而非游离染料。CY5标记探针的药代动力学取决于与其偶联的生物分子(例如抗体、肽)的性质。染料本身稳定,并能提供强烈的荧光信号用于检测。游离染料通常不用于体内药代动力学研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无公开的CY5毒性数据。作为一种荧光染料,在用于标记和成像应用的浓度下,其毒性被认为较低。该化合物仅供研究使用,不得用于研究环境以外的人体治疗或诊断用途。尚未有全身毒性研究报告。
参考文献

[1]. Ptaszek M. Rational design of fluorophores for in vivo applications. Prog Mol Biol Transl Sci. 2013;113:59-108.

[2]. Shindy, H. A. (2017). Fundamentals in the chemistry of cyanine dyes: A review. Dyes and Pigments, 145, 505–513. doi:10.1016/j.dyepig.2017.06.029.

其他信息
CY5 是一种远红外荧光菁染料,也称为磺基菁5。搜索结果中未提供其分子式和分子量,但它是 Cy5 荧光团的磺化衍生物。它是一种广泛用于流式细胞术、荧光显微镜和活体成像的荧光标记试剂。该化合物仅供研究用途,未获准用于临床诊断。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C33H40N2O8S2
分子量
656.81
精确质量
656.222
CAS号
146368-11-8
PubChem CID
91811031
外观&性状
Brown to green black solid powder
LogP
7.515
tPSA
174.71
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
45
分子复杂度/Complexity
1430
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCN\1C2=C(C=C(C=C2)S(=O)(=O)[O-])C(/C1=C/C=C/C=C/C3=[N+](C4=C(C3(C)C)C=C(C=C4)S(=O)(=O)O)CCCCCC(=O)O)(C)C
InChi Key
HPICMEGAGMPYID-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C33H40N2O8S2/c1-6-34-27-18-16-23(44(38,39)40)21-25(27)32(2,3)29(34)13-9-7-10-14-30-33(4,5)26-22-24(45(41,42)43)17-19-28(26)35(30)20-12-8-11-15-31(36)37/h7,9-10,13-14,16-19,21-22H,6,8,11-12,15,20H2,1-5H3,(H2-,36,37,38,39,40,41,42,43)
化学名
(2Z)-2-[(2E,4E)-5-[1-(5-carboxypentyl)-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
别名
Sulfo Cy5 acid Sulfo-Cy5 acid Sulfo-Cy5-acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~125 mg/mL (~190.31 mM)
H2O : ~25 mg/mL (~38.06 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5225 mL 7.6126 mL 15.2251 mL
5 mM 0.3045 mL 1.5225 mL 3.0450 mL
10 mM 0.1523 mL 0.7613 mL 1.5225 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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