Cytosine

别名: NSC27787; NSC-27787; NSC 27787 胞嘧啶 ;4-氨基-2-羟基嘧啶; 4-氨基-2(1H)嘧啶酮;胞嗪;细胞碱;细胞嘧啶;氧胞嘧啶;4-氨基羟基嘧啶;胞嘧啶 USP标准品;胞嘧啶 标准品; 4-氨基-2(1H)-嘧啶酮;4-氨基-2-氧-1,2-二氢嘧啶
目录号: V19045 纯度: ≥98%
胞嘧啶是 DNA 和 RNA 中发现的四种主要碱基之一。
Cytosine CAS号: 71-30-7
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
500mg
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产品描述
胞嘧啶是 DNA 和 RNA 中发现的四种主要碱基之一。胞嘧啶修饰显示与表观遗传多样性和衰老相关的昼夜节律振荡。
生物活性&实验参考方法
参考文献

[1]. A new method for sequencing DNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 1977 Feb;74(2):560-4.

[2]. Cytosine modifications exhibit circadian oscillations that are involved in epigenetic diversity and aging. Nat Commun. 2018 Feb 13;9(1):644.

其他信息
胞嘧啶是一种氨基嘧啶,是嘧啶-2-酮,其氨基位于第 4 位。它可作为人类代谢物、大肠杆菌代谢物、酿酒酵母代谢物和小鼠代谢物。它是一种嘧啶核碱基、嘧啶酮和氨基嘧啶。
胞嘧啶是存在于大肠杆菌(K12菌株、MG1655菌株)中或由其产生的代谢产物。
据报道,茶树、大豆和其他有相关数据的生物体中也含有胞嘧啶。
胞嘧啶是DNA和RNA中存在的一种嘧啶碱基,与鸟嘌呤配对。
胞嘧啶是存在于酿酒酵母中或由其产生的代谢产物。
一种嘧啶碱基,是核酸的基本组成单元。
另见:嘧啶(亚类)。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C4H5N3O
分子量
111.1
精确质量
111.043
CAS号
71-30-7
相关CAS号
52685-04-8;26297-64-3
PubChem CID
597
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.6±0.1 g/cm3
沸点
445.8ºC at 760 mmHg
熔点
>300 °C(lit.)
闪点
223.4ºC
折射率
1.689
LogP
-2.29
tPSA
71.77
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
0
重原子数目
8
分子复杂度/Complexity
170
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C1N=C([H])C([H])=C(N([H])[H])N1[H]
InChi Key
OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C4H5N3O/c5-3-1-2-6-4(8)7-3/h1-2H,(H3,5,6,7,8)
化学名
6-amino-1H-pyrimidin-2-one
别名
NSC27787; NSC-27787; NSC 27787
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~16.67 mg/mL (~150.05 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (15.03 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 16.7 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (15.03 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 16.7mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 9.0009 mL 45.0045 mL 90.0090 mL
5 mM 1.8002 mL 9.0009 mL 18.0018 mL
10 mM 0.9001 mL 4.5005 mL 9.0009 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT05578378 Recruiting Drug: CladribineDrug: Fludarabine
Acute Lymphoblastic
Leukemia
The First Affiliated Hospital
of Soochow University
January 1, 2022 Phase 2
Phase 3
NCT05773196 Recruiting Other:Biospecimen Collection Huntington Disease
Huntington's Dementia
Sanguine Biosciences March 14, 2023
NCT04406636 Active, not recruiting Huntington Disease CHDI Foundation, Inc. May 19, 2020
NCT04168502 Recruiting Drug: Glasdegib
Drug:
Gemtuzumab Ozogamicin
Acute Myeloid Leukemia Gruppo Italiano Malattie
EMatologiche dell'Adulto
September 24, 2020 Phase 3
NCT05624827 Recruiting Diagnostic Test: Testing DNA Cervical Intraepithelial
Neoplasia Grade 2
University Medical
Centre Maribor
September 1, 2021 Not Applicable
生物数据图片
  • Global patterns of oscillations in the 9-mo mouse liver and lung. a, b A heatmap of the mean modification densities of epigenetically variable cytosines (EVCs) across chromosome 7 of a the liver and b the lung, normalized to a range of 0–1 in each 1 Mb bin. The horizontal bar plots display the number of EVCs in each bin (bins with no EVCs appear black in the heatmap). The plots in the bottom panel display the chromosome-wide means of cytosine modification as a function of ZT, fitted using the harmonic regression model. The shading around the regression lines represents the 95% confidence band. All data were double plotted to aid with visualization. ZT, Zeitgeber time; modC, cytosine modification Nat Commun. 2018 Feb 13;9(1):644.
  • Characterization of osc-modCs in the 9-mo mouse liver and lung. a, b The p-value histogram of harmonic regression fits on individual cytosines showing that 8.2% (983 of 11,941) and 35.6% (5,054 of 14,199) of EVCs were oscillating (p < 0.05) in a the liver and b the lung, respectively. c, d Average proportion of variance explained (R2) by the harmonic regression fits across all EVCs in each of 10,000 permutations of ZT labels. The red line depicts the observed average R2 in c the liver and d the lung. e, f Acrophase rose plot showing modification peak times of osc-modCs in e the liver and in f the lung. osc-modC, oscillating cytosine modifications Nat Commun. 2018 Feb 13;9(1):644.
  • The transcriptional and temporal coordination of oscillating modified cytosines in the 9-mo mouse liver and lung. a, b Mean gene-body modification densities of epigenetically variable cytosines in a the liver and b the lung were cross-correlated with corresponding circadian mRNA profiles after each iteration of a forward 1 h phase shift in the mRNA profiles. Bars represent the observed mean cross-correlation between mRNAs and modification densities for a given phase shift (red bars indicate Bonferroni corrected permuted p < 0.05). The positive faded bars are mirror images of the negative bars (by nature of correlating phase shifted waves, a wave shifted by half a period anti-correlates with itself). Fine gray curves in the background depict cross-correlations of 100 randomly selected (out of 10,000) permutations where both ZT labels and mRNA-gene modification density pairs were shuffled. c, d Representative E-box motifs enriched within 100 bp in either direction of osc-modCs in c the mouse liver and d the lung. e, f Harmonic regression fits on the average modification density of osc-modCs with wake and sleep acrophases in e the mouse liver and f the lung, as a function of ZT. Shading around the regression lines represents the 95% confidence band. ZT, Zeitgeber time; modC, cytosine modification. Nat Commun. 2018 Feb 13;9(1):644..
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