D-I03

别名: DI03; D I03; D-I03
目录号: V40642 纯度: ≥98%
D-I03 (DI03) 是一种新型、有效的 RAD52 抑制剂 (Kd= 25.8 µM),具有抗癌活性。
D-I03 CAS号: 688342-78-1
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
D-I03 (DI03) 是一种新型高效的 RAD52 抑制剂 (Kd = 25.8 µM),具有抗癌活性。RAD52 是同源重组 (HR) 通路的成员,该通路对维持基因组完整性至关重要。虽然 RAD52 突变本身不会显著影响哺乳动物的表型,但当与其他基因(例如 BRCA1、BRCA2、PALB2 和 RAD51C)的突变同时发生时,则可能导致卵巢癌和乳腺癌等遗传性疾病,甚至危及生命。因此,RAD52 可能成为癌症治疗的关键靶点。D-I03 可抑制 BRCA1 和 BRCA2 缺陷细胞的生长,并阻止依赖于 RAD52 的 SSA 和 D-loop 的形成。 D-I03(CAS号:688342-78-1)是一种选择性RAD52抑制剂,Kd值为25.8 μM。它特异性抑制RAD52依赖的单链退火(SSA)和D环形成,IC50值分别为5 μM和8 μM。D-I03可抑制BRCA1和BRCA2缺陷型癌细胞的生长,并与PARP1抑制剂在体外培养和体内小鼠模型中对BRCA1缺陷型癌细胞具有协同作用。它可抑制顺铂诱导的RAD52聚集,但不影响RAD51。
生物活性&实验参考方法
靶点
RAD52 ( Ki = 25.8 µM )
D-I03 primarily targets RAD52, a protein involved in the homologous recombination (HR) DNA repair pathway that is important for maintenance of genome integrity. RAD52 plays a critical role in repairing DNA double-strand breaks, particularly in BRCA1/2-deficient cells where it becomes essential for survival. By inhibiting RAD52 with a Kd of 25.8 μM, D-I03 blocks RAD52-dependent DNA repair mechanisms including SSA and D-loop formation.
体外研究 (In Vitro)
D-I03(0-10 μM;第1天和第3天;Capan-1和UWB1.289细胞)处理以浓度依赖的方式优先抑制UWB1.289和Capan-1细胞的生长[1]。
D-I03抑制顺铂诱导的BCR-ABL1阳性、BRCA1缺陷的32Dcl3小鼠造血细胞系(表达GFP-RAD52)中RAD52灶的形成。在D-I03(2.5 μM)存在下,含有RAD52灶的细胞百分比从38.7%下降至171%;同时,用环丙沙星处理的无RAD52灶细胞百分比从48.4%上升至71.9%。 D-I03 对顺铂诱导的 RAD51 聚集灶无影响。D-I03 的基因毒性较低,因为单独使用时,它无法在 BRCA1 缺陷细胞中诱导 RAD51 或 RAD52 聚集灶 [1]。体外实验表明,D-I03 是一种选择性 RAD52 抑制剂,其 Kd 值为 25.8 μM。它特异性抑制 RAD52 依赖的单链退火 (SSA) 和 D 环形成,IC50 值分别为 5 μM 和 8 μM。D-I03 可抑制 BRCA1 和 BRCA2 缺陷型癌细胞的生长,并且在 1 μM 和 2.5 μM 的浓度下,与 PARP1 抑制剂联用可对 BRCA1 缺陷型癌细胞产生协同作用。它抑制顺铂诱导的 RAD52 焦点的形成,但不影响 RAD51 焦点的形成。
体内研究 (In Vivo)
D-I03(50 mg/kg/天;腹腔注射;每日一次;持续7天;裸鼠)治疗可减缓缺乏BRCA1的MDA-MB-436肿瘤的生长。Talazoparib脉冲式D-I03对正常组织和器官的毒性可忽略不计,且对BRCA1功能正常的肿瘤生长无影响[3]。药代动力学和毒性研究结果表明,D-I03在最大耐受剂量≥50 mg/kg时,外周血最大浓度>1 μM,半衰期为23.4小时[1]。
体内实验表明,D-I03可抑制BRCA1缺陷型肿瘤的生长,并且在50 mg/kg/天(腹腔注射)的剂量下,与PARP1抑制剂对BRCA1缺陷型肿瘤具有协同作用。该化合物靶向RAD52依赖的同源重组修复通路,该通路在BRCA1/2缺陷型癌细胞中具有合成致死性。其体内疗效已在BRCA1缺陷型癌症小鼠模型中得到证实。该化合物可作为研究DNA修复和癌症合成致死性的研究工具。
酶活实验
D-I03 的无细胞检测包括评估其与 RAD52 的结合亲和力及其抑制 RAD52 依赖性 DNA 修复活性的能力。结合亲和力 (Kd = 25.8 μM) 采用表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 测定。RAD52 依赖性 SSA 和 D-loop 形成活性采用纯化的 RAD52 蛋白和 DNA 底物进行生化分析测定。IC50 值(SSA 为 5 μM,D-loop 为 8 μM)由剂量反应曲线确定。化学纯度和鉴定通过 HPLC 和 NMR 分析确认。
细胞实验
细胞系:Capan-1 (BRCA2−) 和 UWB1.289 (BRCA1+) 细胞
浓度:0 μM、2.5 μM、5 μM 或 10 μM
孵育时间:第 1 天和第 3 天
结果:优先抑制 Capan-1 和 UWB1.289 细胞的生长。
D-I03 的体外细胞实验通常包括用不同浓度的化合物处理 BRCA1 或 BRCA2 缺陷型癌细胞。细胞孵育特定时间(24-72 小时)。使用 MTT、CellTiter-Glo 或克隆形成实验评估细胞活力。通过免疫荧光评估顺铂诱导的 RAD52 灶的形成。在 1 μM 和 2.5 μM 的浓度下,通过组合指数分析评估与 PARP1 抑制剂的协同作用。生成剂量反应曲线以确定 IC50 值。
动物实验
将 BRCA1 缺陷型 MDA-MB-436 细胞注射到 Nu/nu 小鼠体内
50 mg/kg/天
腹腔注射;每日一次;持续 7 天
D-I03 的体内动物研究在 BRCA1 缺陷型癌症的小鼠异种移植模型中进行。该化合物以 50 mg/kg/天的剂量腹腔注射给药。使用游标卡尺测量肿瘤体积来监测肿瘤生长。进行与 PARP1 抑制剂的联合研究以评估协同活性。药效学终点包括评估肿瘤组织中 RAD52 抑制和 DNA 修复标志物。通过比较治疗组和对照组的肿瘤生长情况来评估疗效。
药代性质 (ADME/PK)
D-I03 的药代动力学性质包括分子量约为 380.44 g/mol,分子式约为 C22H20N4O3。该化合物纯度≥98%。作为一种小分子化合物,预计其具有中等的口服生物利用度和组织渗透性。该化合物通常作为研究试剂储存在适宜的条件下。现有文献中鲜有关于其详细的 ADME 参数(如半衰期、Cmax 和 AUC)的报道。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
D-I03 的毒性特征已在临床前研究中得到表征。作为一种靶向 DNA 修复的 RAD52 抑制剂,其潜在毒性可能包括对正常细胞 DNA 修复的影响以及基因组不稳定性增加。该化合物对 BRCA1/2 缺陷细胞的选择性高于 BRCA1/2 正常细胞,提示其具有治疗窗口。标准毒理学研究将包括急性毒性和亚慢性毒性评估。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。
参考文献

[1]. Targeting BRCA1- and BRCA2-deficient cells with RAD52 small molecule inhibitors. Nucleic Acids Res. 2016 May 19;44(9):4189-99.

[2]. Small-Molecule Inhibitors Targeting DNA Repair and DNA Repair Deficiency in Research and Cancer Therapy. Cell Chem Biol. 2017 Sep 21;24(9):1101-1119.

[3]. Simultaneous Targeting of PARP1 and RAD52 Triggers Dual Synthetic Lethality in BRCA-Deficient Tumor Cells. Cell Rep. 2018 Jun 12;23(11):3127-3136.

其他信息
D-I03 是一种选择性 RAD52 抑制剂,其 Kd 值为 25.8 μM。它能抑制 RAD52 依赖的 SSA(IC50 = 5 μM)和 D-loop 的形成(IC50 = 8 μM)。D-I03 可抑制 BRCA1/2 缺陷型癌细胞的生长,并与 PARP1 抑制剂具有协同作用。体内实验表明,D-I03(50 mg/kg/天,腹腔注射)可抑制 BRCA1 缺陷型肿瘤的生长。它是一种用于研究癌症中 DNA 修复和合成致死机制的研究工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H36N6S
分子量
428.6371
精确质量
428.27
元素分析
C, 64.45; H, 8.47; N, 19.61; S, 7.48
CAS号
688342-78-1
PubChem CID
24761372
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
3.6
tPSA
78.8
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
520
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCN1CCN(CC1)C2=NC3=C(C=C(C=C3)NC(=S)NCCN(CC)CC)C(=C2)C
InChi Key
UXDGHRWOHOPKIL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H36N6S/c1-5-27(6-2)11-10-24-23(30)25-19-8-9-21-20(17-19)18(4)16-22(26-21)29-14-12-28(7-3)13-15-29/h8-9,16-17H,5-7,10-15H2,1-4H3,(H2,24,25,30)
化学名
1-[2-(diethylamino)ethyl]-3-[2-(4-ethylpiperazin-1-yl)-4-methylquinolin-6-yl]thiourea
别名
DI03; D I03; D-I03
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 50~86 mg/mL (116.7~200.6 mM)
Ethanol: ~10 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3330 mL 11.6648 mL 23.3296 mL
5 mM 0.4666 mL 2.3330 mL 4.6659 mL
10 mM 0.2333 mL 1.1665 mL 2.3330 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Measurement of D-I03 (A) and D-G23 (B) binding to RAD52. Nucleic Acids Res . 2016 May 19;44(9):4189-99.
  • Effect of RAD52 inhibitors D-G23 and D-I03 (2.5 μM) on GFP-RAD52 foci formation in response to cisplatin (10 μM) treatment. Nucleic Acids Res . 2016 May 19;44(9):4189-99.
  • D-I03 inhibits single-strand annealing (SSA), but not homology dependent recombination (HDR) (gene conversion) in U2OS cells. Nucleic Acids Res . 2016 May 19;44(9):4189-99.
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