Dafadine-A

别名: Dafadine-A 达发定
目录号: V34011 纯度: ≥98%
Dafadine-A 是 dafadine 类似物,是一种线虫 DAF-9 细胞色素 P450 抑制剂,还可以抑制哺乳动物 CYP27A1。
Dafadine-A CAS号: 1065506-69-5
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
达法定-A 是达法定类似物,是秀丽隐杆线虫 (C. elegans) DAF-9 细胞色素 P450 抑制剂,也能抑制哺乳动物 CYP27A1。
达法定-A (4-[1-([5-[(2,6-二甲基苯氧基)甲基]-3-异恶唑基]羰基)-4-哌啶基]吡啶) 是首个被发现的秀丽隐杆线虫 (Caenorhabditis elegans) 细胞色素 P450 DAF-9 的化学抑制剂。它是一种小分子工具,即使在有利的环境条件下也能有效诱导滞育期(一种不衰老、抗逆的幼虫阶段)的形成,这是此前任何小分子都无法实现的。达法定-A 还能抑制 DAF-9 的哺乳动物同源物 CYP27A1,表明其应用范围不仅限于秀丽隐杆线虫。秀丽隐杆线虫用于研究发育控制和寿命。该分子是通过筛选保守信号转导通路调节剂而发现的,并且以浓度依赖的方式诱导组成型滞育(Daf-c)、远端尖端细胞迁移(Mig)和外阴突出(Pvl)表型。[1]
生物活性&实验参考方法
靶点
Dafadine-A targets DAF-9 (a cytochrome P450) and also inhibits the mammalian functional ortholog CYP27A1. [1]
体外研究 (In Vitro)
达法定-A(25 µM)可诱导超过 60% 的野生型线虫出现外阴突出 (Pvl) 表型和远端细胞迁移 (Mig) 缺陷。

在基于 HEK293 细胞的检测中,达法定-A(20 µM)可使表达 DAF-9 的细胞中 26-羟基-4-胆甾烯-3-酮和 Δ4-达法克罗酸的产生量降低 20 倍以上 (P < 0.05)。

与 DMSO 处理的对照组相比,用达法定-A处理的野生型线虫中达法克罗酸的含量通过 LC/MS/MS 测定降低。

达法定-A处理(正文中未明确指出浓度,但用于……) L4幼虫期)可使野生型线虫的寿命延长高达29%(P < 0.001)。

达法定A并未延长daf-9缺失突变体的寿命,这与其通过抑制DAF-9发挥作用的机制相符。

外源性补充达法克罗酸可挽救达法定A诱导的Daf-c和Mig表型。

达法定A抑制哺乳动物CYP27A1代谢4-胆甾烯-3-酮的能力。

达法定A不抑制CYP7A1或CYP7B1。[1]
体内研究 (In Vivo)
达法定A被用于测试其拮抗daf-9缺失突变体从滞育期恢复的能力。大约75%的daf-9(dh6)缺失突变体在11天内从滞育期恢复,而达法定A并未拮抗这种恢复(P > 0.05)。[1]
酶活实验
采用基于HEK293细胞的检测方法评估了DAF-9的酶活性。DAF-9在HEK293细胞中表达,并用20 µM 4-胆甾烯-3-酮作为底物处理细胞。采用液相色谱-串联质谱法(LC/MS/MS)测定代谢物(26-羟基-4-胆甾烯-3-酮和Δ4-达法克罗酸)的生成量。在DAF-9(+)细胞中添加20 µM达法定A后,这些代谢物的生成量降低了20倍以上(P < 0.05)。代谢物浓度根据内标(0.2%乙醇)的提取效率进行标准化。

采用吸收光谱法研究了达法定A与DAF-9的物理相互作用。将达法定-A(终浓度为 5 µM)加入到含有人类氧化还原酶 (HOR)-DAF-9 融合蛋白或 HOR 对照蛋白的 Sf9 衍生微粒体中。观察到 HOR-DAF-9 与达法定-A 之间存在特征性的 II 型差示光谱,在 407 nm 处出现吸收最小值,在 435 nm 处出现吸收最大值,表明其与血红素铁结合。[1]
细胞实验
野生型秀丽隐杆线虫(C. elegans)在无应激、适宜的环境条件下,于含有递增浓度达法定A(dafadine-A,0至25 µM)的培养基中饲养,以评估Daf-c和Mig表型。每个浓度设置四个重复,每个重复至少包含20条线虫。

对于上位性分析,使用了daf-16(m26)、daf-12(m20)和din-1(dh127)的无效等位基因。线虫用达法定A(dafadine-A,浓度未具体说明,但与其他实验一致)处理,并统计具有Daf-c或Mig表型的线虫比例。至少进行了三次重复实验,每次重复实验至少分析了 90 只动物。

在寿命延长研究中,线虫在第四幼虫期 (L4) 用达法定-A 处理。监测寿命,结果显示达法定-A 处理可使野生型线虫的寿命延长高达 29% (P < 0.001)。正文中未提供溶剂配方、给药途径或确切浓度等详细信息。[1]
参考文献

[1]. Dafadine inhibits DAF-9 to promote dauer formation and longevity of Caenorhabditis elegans. Nat Chem Biol. 2011 Nov 6;7(12):891-3.

其他信息
Dafida A 是一种 N-酰基哌啶类化合物,由 5-[(2,6-二甲基苯氧基)甲基]-1,2-噁唑-3-羧酸的羧基与 4-(吡啶-4-基)哌啶的仲氨基缩合而成。它是一种 P450 抑制剂和抗衰老药物。它属于吡啶类、N-酰基哌啶类、异噁唑类、芳香醚类和芳香酰胺类化合物。
Dafadine-A 是首个在典型培养条件下能有效诱导秀丽隐杆线虫形成滞育幼虫的小分子工具。达法定A诱导的Daf-c和Mig表型可被daf-12或din-1S的无效突变完全抑制,但不能被daf-16的突变抑制,这表明达法定A的作用位于DAF-16的下游或平行位置,但位于DAF-12的上游或处于同一水平。

达法定A模拟了daf-9和daf-12突变体的残余咽部泵吸表型和SDS敏感性。

达法定A含有异噁唑亚结构,并与DAF-9血红素口袋中的Fe3+结合,取代催化活性所需的水分子,这可从吸收光谱中的II型光谱得到证实。

在59种抑制剂中在测试的哺乳动物细胞色素P450中,没有一种在12.5 µM浓度下诱导野生型线虫出现Daf-c或Mig表型,这表明达法定-A是CYP抑制剂中唯一能有效抑制野生型线虫中DAF-9的。

达法定-A参与了一项构效关系研究,该研究测试了158种结构相关的分子在12.5 µM浓度下诱导Daf-c和/或Mig表型的能力。只有另外三种分子(达法定-B、-C、-D)在野生型和daf-2(e1370)突变体中诱导了类似的表型。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H25N3O3
分子量
391.46290564537
精确质量
391.189
元素分析
C, 70.57; H, 6.44; N, 10.73; O, 12.26
CAS号
1065506-69-5
PubChem CID
24790866
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
600.3±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
316.9±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.7 mmHg at 25°C
折射率
1.592
LogP
1.84
tPSA
68.5
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
522
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(N1CCC(C2=CC=NC=C2)CC1)C3=NOC(COC4=C(C)C=CC=C4C)=C3
InChi Key
WNSNPYIHDMIFOO-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H25N3O3/c1-16-4-3-5-17(2)22(16)28-15-20-14-21(25-29-20)23(27)26-12-8-19(9-13-26)18-6-10-24-11-7-18/h3-7,10-11,14,19H,8-9,12-13,15H2,1-2H3
化学名
[5-[(2,6-dimethylphenoxy)methyl]-1,2-oxazol-3-yl]-(4-pyridin-4-ylpiperidin-1-yl)methanone
别名
Dafadine-A
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~127.73 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.39 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.39 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.39 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5545 mL 12.7727 mL 25.5454 mL
5 mM 0.5109 mL 2.5545 mL 5.1091 mL
10 mM 0.2555 mL 1.2773 mL 2.5545 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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