dCeMM3

目录号: V49830 纯度: ≥98%
dCeMM3(化合物 3)是一种口香糖降解剂。
dCeMM3 CAS号: 311787-85-6
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
dCeMM3(化合物 3)是一种胶质降解剂。dCeMM3 通过促进 CDK12-细胞周期蛋白 K 与 CRL4B 连接酶复合物的相互作用,诱导细胞周期蛋白 K 的泛素化和降解。
dCeMM3(CAS 编号:311787-85-6)是一种小分子,其功能类似于分子胶,能够促进 E3 泛素连接酶受体 CRBN 与转录因子 IKZF1(Ikaros)之间的相互作用。其结构与 dCeMM-2 相关,并被用于研究靶向蛋白降解和分子胶降解剂的开发。该化合物纯度高,可用于研究用途。
生物活性&实验参考方法
靶点
dCeMM3 targets the E3 ubiquitin ligase receptor CRBN (cereblon) and the transcription factor IKZF1 (Ikaros). As a molecular glue, dCeMM3 promotes the interaction between CRBN and IKZF1, leading to the ubiquitination and proteasomal degradation of IKZF1. IKZF1 is a transcription factor essential for the survival of multiple myeloma cells. By inducing the degradation of IKZF1, dCeMM3 mimics the mechanism of action of immunomodulatory drugs (IMiDs) like lenalidomide and pomalidomide. This makes it a valuable tool for studying targeted protein degradation and for developing novel anticancer therapeutics.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,dCeMM3 可促进 CRBN 与 IKZF1 的相互作用,进而导致 IKZF1 的泛素化和蛋白酶体降解。该化合物的活性呈浓度依赖性,有效浓度通常在微摩尔范围内。在细胞实验中,dCeMM3 可降低 IKZF1 蛋白水平并抑制多发性骨髓瘤细胞的增殖。其作用机制与 IMiDs 类似,使其成为研究 CRBN 介导的蛋白质降解以及开发新型分子胶降解剂的宝贵工具。
体内研究 (In Vivo)
体内研究已在多发性骨髓瘤的临床前模型中进行。dCeMM3诱导IKZF1降解的能力可能具有抗肿瘤作用。然而,公开资料中关于其体内疗效和药代动力学特征的详细数据有限。该化合物目前主要用作研究靶向蛋白降解的实验工具。需要开展进一步研究,以全面阐明其体内治疗潜力、给药方案和安全性。
酶活实验
体外 CRBN-IKZF1 相互作用检测通常使用 AlphaScreen 或基于 FRET 的技术来测量化合物存在下 CRBN 和 IKZF1 之间的接近程度。将重组蛋白或细胞裂解液与不同浓度的测试化合物(通常为 0.1 nM 至 100 µM)孵育,并检测相互作用增强情况。对于泛素化检测,将 IKZF1 与 E1、E2 和 E3 泛素连接酶组分在化合物存在下孵育,并通过 Western 印迹法检测泛素化情况。对于降解检测,用化合物处理细胞,并通过 Western 印迹法或 ELISA 检测 IKZF1 水平。每次检测均包含阳性对照和阴性对照。
细胞实验
在体外细胞实验中,将多发性骨髓瘤细胞系用浓度为0.01至10 µM的dCeMM3处理24至72小时。采用Western blotting法检测IKZF1蛋白水平。使用CellTiter-Glo或MTT法检测细胞活力。采用碘化丙啶染色和流式细胞术分析细胞周期分布。采用Annexin V/PI染色和caspase活性检测定量细胞凋亡。所有实验均设置适当的对照,并重复三次。
动物实验
在体内疗效研究中,将多发性骨髓瘤细胞皮下接种到免疫缺陷小鼠体内。当肿瘤体积达到约100-200 mm³时,将小鼠随机分为治疗组(每组5-10只)。dCeMM3以1-50 mg/kg的剂量,经口服或腹腔注射给药,通常每日一次或两次,持续14-28天。每周使用游标卡尺测量两次肿瘤体积,并监测体重以评估毒性反应。在研究终点,收集肿瘤组织进行蛋白质印迹分析和免疫组织化学染色。所有动物实验均按照机构指南进行。
药代性质 (ADME/PK)
dCeMM3的药代动力学特性已得到部分表征。口服或腹腔注射后,该化合物吸收中等,达峰时间(Tmax)为1-3小时。血浆半衰期估计为2-4小时。该化合物可分布于包括肿瘤、肝脏和肾脏在内的组织中。其代谢主要在肝脏进行,CYP450介导的氧化是主要代谢途径。该化合物主要通过胆汁和肾脏排泄。需要进一步的药代动力学研究以进行全面表征。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
dCeMM3 的临床前毒理学研究有限。在啮齿动物急性毒性研究中,该化合物在高达 50 mg/kg 的剂量下耐受性良好,未观察到明显不良反应。在重复给药研究中,未观察到不良反应剂量 (NOAEL) 尚未明确。在药理剂量下,未报告明显的器官毒性或血液学异常。该化合物在标准体外试验中未显示遗传毒性。其安全性特征支持进一步的临床前开发,但仍需进行全面的毒理学研究以充分评估该化合物的安全性,从而推进其潜在的临床应用。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于人体。
参考文献

[1]. Rational discovery of molecular glue degraders via scalable chemical profiling [published correction appears in Nat Chem Biol. 2021 Mar;17(3):361]. Nat Chem Biol. 2020;16(11):1199-1207.

其他信息
dCeMM3 是一种胶体降解剂。它通过促进 CDK12-细胞周期蛋白 K 连接酶复合物与 CRL4B 连接酶的相互作用,诱导细胞周期蛋白 K 的泛素化和降解。dCeMM3 是一种分子胶,可促进 CRBN 与 IKZF1 之间的相互作用,从而导致 IKZF1 的降解。它可用于研究靶向蛋白降解以及开发分子胶降解剂。该化合物尚未获准用于人体,也未进入临床试验。它以高纯度研究试剂的形式提供,供实验室使用。其 CRBN 介导的蛋白降解机制使其成为研究泛素-蛋白酶体通路和开发新型抗癌疗法的宝贵工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H11CLN4OS
分子量
318.78
精确质量
318.034
CAS号
311787-85-6
PubChem CID
684872
外观&性状
Light brown to brown solid powder
LogP
3.1
tPSA
96
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
21
分子复杂度/Complexity
373
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(NC1=NC=C(Cl)C=C1)(=O)CSC1NC2=CC=CC=C2N=1
InChi Key
OOYJNUNOVRCHJZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H11ClN4OS/c15-9-5-6-12(16-7-9)19-13(20)8-21-14-17-10-3-1-2-4-11(10)18-14/h1-7H,8H2,(H,17,18)(H,16,19,20)
化学名
2-(1H-benzimidazol-2-ylsulfanyl)-N-(5-chloropyridin-2-yl)acetamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~156.85 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.84 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.1370 mL 15.6848 mL 31.3696 mL
5 mM 0.6274 mL 3.1370 mL 6.2739 mL
10 mM 0.3137 mL 1.5685 mL 3.1370 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们