DFHBI

目录号: V19702 纯度: ≥98%
DFHBI 是绿色荧光蛋白 (GFP) 荧光团的模拟物,用于对活细胞中的 RNA 进行成像。
DFHBI CAS号: 1241390-29-3
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
DFHBI 是一种模拟绿色荧光蛋白 (GFP) 荧光团的化合物,可用于活细胞中 RNA 的成像。它与 Spinach2 或 Broccoli 适体结合后可激活荧光。与 Spinach2 结合时,其激发波长峰值为 447 nm,荧光发射波长峰值为 501 nm。
DFHBI(CAS 1241390-29-3),化学名称为 (Z)-4-(3,5-二氟-4-羟基亚苄基)-1,2-二甲基-1H-咪唑-5(4H)-酮,是一种模拟绿色荧光蛋白 (GFP) 发色团的小分子化合物。DFHBI 的分子式为 C12H10F2N2O2,分子量为 252.22 g/mol,是 Spinach 家族 RNA 适体的基础荧光团。它是一种合成荧光剂,已成为研究活细胞内 RNA 动力学的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
DFHBI's primary mechanism of action involves its interaction with specific RNA aptamers, such as Spinach, Spinach2, or Broccoli. The fluorescence of DFHBI is activated upon binding to an RNA aptamer, which restricts the molecule's rotational freedom and suppresses non-radiative decay pathways, such as cis-trans isomerization. This system enables real-time visualization of RNA dynamics, localization, and expression in live cells without requiring protein-based reporters.
体外研究 (In Vitro)
当用 447 nm 的光激发时,这些 RNA 与 DFHBI 相互作用,产生蓝绿色荧光发射(501 nm)。两种名为 spinach 和 spinach2 的 RNA 适体可用于基因编码荧光 RNA。DFHBI 的荧光被 Spinach2 结合并激活,从而可以对活细胞中 Spinach2 标记的 RNA 的动态定位进行成像。由于 DFHBI 的蓝绿色荧光特性以及其对荧光显微镜常用滤光片的优化不足,限制了 Spinach2 的光谱特性。当 Spinach 和 Spinach2 与 DFHBI 结合时,它们的最大荧光激发波长为 447 nm,峰值荧光发射波长为 501 nm [1]。西兰花结合荧光染料 DFHBI 可用于凝胶电泳后对凝胶进行染色,从而选择性地识别细胞总 RNA 中西兰花标记的 RNA。 Spinach 是一种长度为 98 个核苷酸的 RNA 适体,可与 DFHBI 结合并激活其荧光。未结合时,DFHBI 和 Spinach 几乎都不发荧光,但 DFHBI 与 Spinach 的复合物在体外和活细胞中均会发出明亮的荧光。DFHBI 需要避光保存。建议将所有 DFHBI 储备液储存在不透明的试管中或用铝箔包裹。含有 DFHBI 的培养皿应使用铝箔包裹并避光保存 [2]。
在体外,未结合的 DFHBI 基本不发荧光,而 Spinach-DFHBI 复合物则发出明亮的荧光。当与 Spinach2 结合时,DFHBI 的激发波长峰值为 447 nm,发射波长峰值为 501 nm。其激发/发射波长峰值分别为 447/501 nm。
体内研究 (In Vivo)
在体内,DFHBI 可用于活细胞内 RNA 的成像。Spinach-DFHBI 复合物在活细胞内发出明亮的荧光,从而可以对 Spinach2 标记的 RNA 进行动态定位成像。DFHBI 具有细胞渗透性,因此适用于活细胞应用。
酶活实验
DFHBI的体外检测通常包括测量其与RNA适配体结合后的荧光强度。将探针与适配体孵育后,使用荧光计或酶标仪测量荧光强度。记录激发光谱和发射光谱以确认结合并评估荧光激活情况。
细胞实验
基于细胞的DFHBI检测方法包括在活细胞中表达Spinach2标记的RNA,并加入DFHBI探针。然后使用荧光显微镜或流式细胞仪观察荧光信号。标记RNA的动态定位可以实时监测。
动物实验
由于DFHBI主要用于细胞培养系统,因此针对该化合物的体内动物研究有限。其在活体动物中用于RNA成像的应用尚未得到广泛探索。
药代性质 (ADME/PK)
DFHBI 是一种荧光探针,其药代动力学性质与治疗应用无关。该化合物的分子量为 252.22 g/mol。在体外实验中,它通常溶解于 DMSO 中。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DFHBI的毒理学特性尚未得到充分阐明。作为一种研究用化合物,应采取适当的安全预防措施进行操作。其用途仅限于研究应用。
参考文献

[1]. Plug-and-play fluorophores extend the spectral properties of Spinach. J Am Chem Soc. 2014 Jan 29;136(4):1198-201.

[2]. Using Spinach-based sensors for fluorescence imaging of intracellular metabolites and proteins in living bacteria. Nat Protoc. 2014 Jan;9(1):146-55.

其他信息
DFHBI 是一种模拟绿色荧光蛋白 (GFP) 的荧光染料,可用于活细胞中 RNA 的成像。它通过与 Spinach2 或 Broccoli 适体结合而被激活荧光。DFHBI 是研究 RNA 动力学和定位的有效工具,但尚未获准用于治疗用途。DFHBI 是基于 Spinach 适体的 RNA 成像的基础荧光染料,而其衍生物 DFHBI-1T 和 BI 则表现出显著不同的性能特征,直接影响实验结果。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C12H10F2N2O2
分子量
252.216809749603
精确质量
252.071
CAS号
1241390-29-3
PubChem CID
70808995
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
326.2±52.0 °C at 760 mmHg
闪点
151.1±30.7 °C
蒸汽压
0.0±0.7 mmHg at 25°C
折射率
1.579
LogP
1.66
tPSA
52.9
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
18
分子复杂度/Complexity
410
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=N/C(=C\C2=CC(=C(C(=C2)F)O)F)/C(=O)N1C
InChi Key
ZDDIJYXDUBFLID-YHYXMXQVSA-N
InChi Code
InChI=1S/C12H10F2N2O2/c1-6-15-10(12(18)16(6)2)5-7-3-8(13)11(17)9(14)4-7/h3-5,17H,1-2H3/b10-5-
化学名
(5Z)-5-[(3,5-difluoro-4-hydroxyphenyl)methylidene]-2,3-dimethylimidazol-4-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 83.33 mg/mL (~330.39 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.43 mg/mL (5.67 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 14.3 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.43 mg/mL (5.67 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 14.3mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.43 mg/mL (5.67 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 14.3 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.9648 mL 19.8240 mL 39.6479 mL
5 mM 0.7930 mL 3.9648 mL 7.9296 mL
10 mM 0.3965 mL 1.9824 mL 3.9648 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们