dmDNA31

目录号: V29129 纯度: ≥95%
dmDNA31 是一种新型强效抗生素,可抑制细菌 DNA 依赖性 RNA 聚合酶,对金黄色葡萄球菌具有强效杀菌活性。
dmDNA31 CAS号: 845625-44-7
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
dmDNA31是一种新型强效抗生素,它能抑制细菌DNA依赖性RNA聚合酶,对金黄色葡萄球菌具有强效杀菌活性。
dmDNA31(CAS号:845625-44-7)是一种新型高效抗生素,可抑制细菌DNA依赖性RNA聚合酶。它属于利福霉素类抗生素。dmDNA31对常见的致病菌金黄色葡萄球菌具有强效杀菌活性。该化合物的分子式为C50H62N4O13,分子量为927.05 g/mol。它为紫色至黑色固体粉末,纯度≥95%。dmDNA31是一种研究化合物,用于研究细菌转录和开发抗菌药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
dmDNA31 targets bacterial DNA-dependent RNA polymerase, inhibiting its enzymatic activity. As a rifamycin-class antibiotic, it binds to the beta-subunit of bacterial RNA polymerase and blocks transcription elongation. The compound exhibits potent bactericidal activity specifically against Staphylococcus aureus. Its mechanism involves inhibition of bacterial RNA synthesis, leading to bacterial cell death. The compound's selectivity for bacterial RNA polymerase over the mammalian enzyme contributes to its antibacterial activity with reduced host toxicity.
体外研究 (In Vitro)
体外研究表明,dmDNA31 是一种强效的细菌 DNA 依赖性 RNA 聚合酶抑制剂,对金黄色葡萄球菌具有显著的杀菌活性。该化合物的活性已通过测量 RNA 聚合酶抑制的生化试验和测量细菌生长抑制的细菌培养试验得到证实。作为一种利福霉素类抗生素,dmDNA31 的作用机制和效力与其他同类药物一致。多种试验已证实该化合物对金黄色葡萄球菌具有特异性活性。其抗菌谱和效力已在体外得到表征。
体内研究 (In Vivo)
现有文献中关于dmDNA31的体内研究有限。作为一种对金黄色葡萄球菌具有强效活性的利福霉素类抗生素,该化合物有望在金黄色葡萄球菌感染的动物模型中发挥疗效。然而,目前尚缺乏关于其体内疗效的具体数据。该化合物目前可作为研究细菌转录和开发抗菌药物的工具。未来需要开展更多研究,以全面阐明其体内活性和治疗潜力。
酶活实验
dmDNA31的体外酶活性测定包括在不同浓度化合物存在下测量细菌DNA依赖性RNA聚合酶的活性。将纯化的金黄色葡萄球菌或其他细菌的RNA聚合酶与DNA模板、核苷酸和化合物一起孵育。使用放射性标记核苷酸或荧光检测方法测量RNA合成。通过剂量反应曲线确定RNA聚合酶活性的抑制情况。作为一种利福霉素类抗生素,dmDNA31的作用机制涉及与RNA聚合酶的β亚基结合。数据分析得出IC50值。
细胞实验
dmDNA31 的体外细胞活性测定采用细菌培养物,特别是金黄色葡萄球菌。细菌在液体培养基中培养,并用不同浓度的 dmDNA31 处理。通过测量 600 nm 波长下的光密度 (OD600) 或进行菌落形成单位 (CFU) 计数来监测细菌生长,从而确定其杀菌活性。测定最小抑菌浓度 (MIC) 和最小杀菌浓度 (MBC)。通过对其他细菌进行测试并与对照抗生素进行比较,验证该化合物的特异性。可进行时间-杀菌曲线测定来表征其杀菌活性的动力学。
动物实验
关于dmDNA31的体内动物研究报道并不多。作为一种对金黄色葡萄球菌具有活性的利福霉素类抗生素,如果将其开发为治疗药物,则需要在金黄色葡萄球菌感染的动物模型中进行评估。典型的动物模型包括小鼠大腿感染、皮肤感染或脓毒症模型。然而,目前尚无公开的体内疗效研究数据。该化合物目前仅作为研究工具,尚未获准用于临床治疗。
药代性质 (ADME/PK)
dmDNA31的药代动力学数据报道较少。该化合物的分子量为927.05 g/mol,分子式为C50H62N4O13。作为一种利福霉素类抗生素,其药代动力学性质与其他利福霉素类药物相似。储存建议:粉末应储存于-20℃,最长可保存3年;溶剂保存液可在-80℃保存6个月,或在-20℃保存1个月。目前尚无具体的药代动力学参数。该化合物仅供研究使用。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
dmDNA31的毒理学数据尚未得到充分报道。作为一种利福霉素类抗生素,该化合物的安全性与其他利福霉素类药物相似,可能引起胃肠道紊乱和肝毒性等副作用。然而,目前尚无具体的毒性数据,包括半数致死量(LD50)和器官毒性谱。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于临床治疗。若要进行治疗开发,则需要进行标准的临床前安全性评估。
参考文献
:Randomized, Single-Ascending-Dose Study To Investigate the Safety, Tolerability, and Pharmacokinetics of DSTA4637S, an Anti-Staphylococcus aureus Thiomab Antibody-Antibiotic Conjugate, in Healthy Volunteers. Antimicrob Agents Chemother. 2019 May 24;63(6).
其他信息
dmDNA31 是一种新型高效利福霉素类抗生素,可抑制细菌 DNA 依赖性 RNA 聚合酶。它对金黄色葡萄球菌具有强效杀菌活性。该化合物的分子式为 C50H62N4O13,分子量为 927.05 g/mol。dmDNA31 为紫色至黑色固体粉末,纯度 ≥95%。dmDNA31 可用于研究细菌转录和开发抗菌药物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C50H62N4O13
分子量
927.046294689178
精确质量
926.431
CAS号
845625-44-7
PubChem CID
135428074
外观&性状
Purple to black solid powder
LogP
3.3
tPSA
226
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
16
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
67
分子复杂度/Complexity
2490
定义原子立体中心数目
9
SMILES
C[C@H]1/C=C/C=C(\C(=O)NC2=C3C(=C4C(=C(C(=C5C4=C([C@](O5)(O/C=C/[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]1O)C)O)C)OC(=O)C)C)OC)C)O)C)O)C2=O)N=C6C(=CC(=CC6=O)N7CCC(CC7)N(C)C)O3)/C
InChi Key
GBSDCXVMKJSZDN-AWHPPKCISA-N
InChi Code
InChI=1S/C50H62N4O13/c1-23-13-12-14-24(2)49(62)52-40-44(60)36-35(39-47(40)66-34-22-31(21-32(56)38(34)51-39)54-18-15-30(16-19-54)53(9)10)37-46(28(6)43(36)59)67-50(8,48(37)61)64-20-17-33(63-11)25(3)45(65-29(7)55)27(5)42(58)26(4)41(23)57/h12-14,17,20-23,25-27,30,33,41-42,45,57-59,61H,15-16,18-19H2,1-11H3,(H,52,62)/b13-12+,20-17+,24-14-/t23-,25+,26+,27+,33-,41-,42+,45+,50-/m0/s1
化学名
[(7S,9E,11S,12R,13S,14R,15R,16R,17S,18S,19E,21Z)-30-[4-(dimethylamino)piperidin-1-yl]-2,6,15,17-tetrahydroxy-11-methoxy-3,7,12,14,16,18,22-heptamethyl-23,32,37-trioxo-8,27,38-trioxa-24,34-diazahexacyclo[23.11.1.14,7.05,36.026,35.028,33]octatriaconta-1,3,5,9,19,21,25,28,30,33,35-undecaen-13-yl] acetate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~26.97 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.70 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.70 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0787 mL 5.3935 mL 10.7869 mL
5 mM 0.2157 mL 1.0787 mL 2.1574 mL
10 mM 0.1079 mL 0.5393 mL 1.0787 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们