DMT-2'O-Methyl-rU Phosphoramidite

别名: 5'-O-(4,4-二甲氧基三苯甲基)-2'-O-甲基尿苷-3'-(2-氰基乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺; 2'-OMe-U 亚磷酰胺单体;2'-OMe-U 亚磷酰胺单体;5'-O-(4,4-二甲氧基三苯甲基)-2'-O-甲基尿苷-3'-(2-氰基乙基-N,N-二异丙基)亚;DMT-2′O-甲基-rU酰胺
目录号: V43837 纯度: ≥98%
DMT-2'O-甲基-rU 亚磷酰胺 (2'-O-Me-U 亚磷酰胺) 是一种 2'-O-Me 类似物,可用于寡核苷酸的制备/合成。
DMT-2'O-Methyl-rU Phosphoramidite CAS号: 110764-79-9
产品类别: New3
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产品描述
DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺(2'-O-Me-U亚磷酰胺)是一种2'-O-甲基类似物,可用于寡核苷酸的制备/合成。
DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺(CAS:110764-79-9),也称为2'-O-Me-U亚磷酰胺,是一种用于寡核苷酸合成的2'-O-甲基修饰的核糖核苷亚磷酰胺。其分子式为C40H49N4O9P,分子量为760.82。该化合物是一种化学修饰的核糖核苷结构单元,设计用于合成寡核苷酸。 5'-羟基由二甲氧基三苯甲基(DMT)基团保护,该基团在酸性条件下易于裂解;而3'-位则用亚磷酰胺基团活化,以实现高效偶联。2'-O-甲基修饰增强了寡核苷酸的稳定性和结合亲和力。
生物活性&实验参考方法
靶点
DMT-2'O-Methyl-rU Phosphoramidite does not have a direct biological target. It is a chemical reagent used in the synthesis of modified oligonucleotides. The 2'-O-methyl modification introduced by this phosphoramidite can enhance the stability and binding affinity of oligonucleotides. The compound is used in the preparation of oligonucleotides for research and therapeutic applications, including antisense and siRNA technologies. Its value is in nucleic acid chemistry.
体外研究 (In Vitro)
DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺本身不具有直接的体外生物活性。它是一种用于寡核苷酸合成的化学试剂。其体外活性需通过评估使用该试剂合成的修饰寡核苷酸的生物活性来间接评价。该化合物本身不进行生物活性测定,而是作为化学合成的试剂使用。
体内研究 (In Vivo)
DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺不具有体内生物活性。它是一种用于寡核苷酸合成的化学试剂。该化合物不适用于动物或人类。其生物学意义是间接的,是通过用它合成的修饰寡核苷酸而实现的。
酶活实验
由于DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺是一种用于寡核苷酸合成的化学试剂,而非靶向特定酶或受体的药物,因此体外酶/受体结合试验不适用于该化合物。该化合物的表征方法包括高效液相色谱(HPLC)用于纯度评估(通常≥95%)、核磁共振(NMR)用于结构确认以及质谱分析。目前尚未有关于其酶或受体结合的研究报道。
细胞实验
DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺是一种用于寡核苷酸合成的化学试剂,而非药理活性化合物,因此不适用于细胞培养实验。该化合物用于化学合成,不适用于基于细胞的检测。使用该化合物的研究人员应重点关注其化学性质和合成应用。
动物实验
由于DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺是一种化学试剂而非治疗药物,因此不适用于体内动物实验。该化合物不适用于动物。其生物学相关性是间接的,是通过利用它合成的修饰寡核苷酸来实现的。
药代性质 (ADME/PK)
DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺是一种化学试剂,而非治疗药物,因此其药代动力学性质不适用。该化合物的分子式为C40H49N4O9P,分子量为760.82,为固体。储存条件:冷藏(0-10℃),惰性气体保护。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺的安全性和毒理学数据有限。作为一种化学试剂,应采取适当的安全预防措施进行操作。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。应遵循标准的实验室安全操作规程。目前尚无具体的毒性数据。
参考文献

[1]. The use of modified primers to eliminate cycle sequencing artifacts. Nucleic Acids Res. 1999 Dec 1;27(23):4642-8.

[2]. Synthesis and characterization of 2'-modified-4'-thioRNA: a comprehensive comparison of nuclease stability. Nucleic Acids Res. 2009 Mar;37(4):1353-62.

其他信息
DMT-2'O-甲基-rU亚磷酰胺的CAS号为110764-79-9,分子式为C40H49N4O9P,分子量为760.82。它是一种2'-O-甲基修饰的核糖核苷亚磷酰胺,用于寡核苷酸合成。纯度≥95%。仅供研究用途,不可用于人体。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C40H49N4O9P
分子量
760.8122
精确质量
760.324
CAS号
110764-79-9
PubChem CID
10897989
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
6.136
tPSA
160.09
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
18
重原子数目
54
分子复杂度/Complexity
1240
定义原子立体中心数目
4
SMILES
CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@@H]1[C@H](O[C@H]([C@@H]1OC)N2C=CC(=O)NC2=O)COC(C3=CC=CC=C3)(C4=CC=C(C=C4)OC)C5=CC=C(C=C5)OC
InChi Key
UVUOJOLPNDCIHL-XKZJCBTISA-N
InChi Code
InChI=1S/C40H49N4O9P/c1-27(2)44(28(3)4)54(51-25-11-23-41)53-36-34(52-38(37(36)49-7)43-24-22-35(45)42-39(43)46)26-50-40(29-12-9-8-10-13-29,30-14-18-32(47-5)19-15-30)31-16-20-33(48-6)21-17-31/h8-10,12-22,24,27-28,34,36-38H,11,25-26H2,1-7H3,(H,42,45,46)/t34-,36-,37-,38-,54?/m1/s1
化学名
3-[[(2R,3R,4R,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-methoxyoxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~131.44 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.5 mg/mL (1.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 15.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.5 mg/mL (1.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 15.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.3144 mL 6.5719 mL 13.1439 mL
5 mM 0.2629 mL 1.3144 mL 2.6288 mL
10 mM 0.1314 mL 0.6572 mL 1.3144 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们