DNA2-IN-C5

别名: DNA2INC5; DNA2 IN C5; DNA2-IN-C5
目录号: V20141 纯度: ≥98%
DNA2 抑制剂 C5 是一种有效的、竞争性的、特异性的 DNA2 核酸酶活性抑制剂,IC50 为 20 μM。
DNA2-IN-C5 CAS号: 35973-25-2
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
50mg
100mg
250mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
DNA2抑制剂C5是一种高效、竞争性且特异性的DNA2核酸酶活性抑制剂,IC50值为20 μM。DNA2抑制剂C5可抑制DNA2的核酸酶活性、DNA依赖性ATP酶活性、解旋酶活性和DNA结合活性。DNA2抑制剂C5可用于癌症相关研究。
DNA2-IN-C5(CAS号:35973-25-2)是一种高效、竞争性且特异性的DNA2核酸酶活性抑制剂,是一种有前景的先导化合物,可用于开发诱导复制应激的癌症化疗药物增敏剂。DNA2是一种多功能酶,具有核酸酶、解旋酶和ATP酶活性,在冈崎片段成熟、DNA修复和维持基因组稳定性方面发挥着关键作用。通过抑制DNA2,该化合物会削弱癌细胞修复受损DNA的能力,从而增强DNA损伤药物的作用。 DNA2-IN-C5 是一种分子量为 234.17、CAS 编号为 35973-25-2 的小分子,对靶点具有高度特异性。目前,它被用作肿瘤学研究工具,用于探索靶向 DNA 复制和修复通路在癌症治疗中的应用潜力。该化合物的作用机制是与酶活性位点的天然底物直接竞争,从而有效阻断其催化功能。这使其成为研究 DNA2 生物学特性以及验证其作为潜在药物靶点的宝贵工具。作为一种研究级化合物,它具有高纯度(≥98%),仅供实验室使用,不得用于人体治疗。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary and specific target of DNA2-IN-C5 is the DNA2 nuclease, a multifunctional enzyme that is part of the helicase/endonuclease family. DNA2 plays an essential role in several DNA metabolic pathways, including Okazaki fragment maturation during DNA replication, end resection during homologous recombination repair, and the maintenance of telomere integrity. Its nuclease activity is crucial for processing DNA flaps, while its helicase activity unwinds double-stranded DNA. By specifically inhibiting the nuclease function of DNA2, DNA2-IN-C5 effectively disrupts these critical DNA repair and replication processes. This targeted inhibition makes cancer cells, which often have high levels of replication stress and DNA damage, particularly vulnerable to the compound's effects. The specificity of DNA2-IN-C5 for DNA2 over other related nucleases is a key feature that minimizes off-target effects and makes it a valuable tool for dissecting the precise biological functions of DNA2 within the cell.
体外研究 (In Vitro)
DNA2-IN-C5作为一种DNA2核酸酶的竞争性特异性抑制剂,在体外表现出强效活性,其半数抑制浓度(IC50)为20 μM。这种生化活性转化为对该酶所有相关催化功能的抑制,包括其DNA依赖性ATP酶活性、解旋酶活性以及与DNA结合的能力。该化合物的作用机制为竞争性抑制,即它与酶的活性位点结合,并直接与天然DNA底物竞争。这导致酶加工DNA的能力降低。在细胞环境中,这种抑制作用预计会诱导复制压力和DNA损伤积累,因为细胞的DNA修复机制会受到损害。尽管DNA2-IN-C5的效力在微摩尔范围内,但对于一种研究工具化合物而言,其效力仍然显著,使其可用于各种体外实验,以研究DNA2的生物学特性并验证其作为癌症治疗靶点的作用。
体内研究 (In Vivo)
目前,尚无公开报道的DNA2-IN-C5体内活性数据。然而,基于其作为一种强效DNA2抑制剂的明确作用机制,我们推测该化合物在临床前模型中可能表现出显著的体内活性。通过抑制DNA2,预计该化合物能够诱导快速分裂的癌细胞产生复制压力和DNA损伤,从而抑制肿瘤生长,尤其是在与DNA损伤化疗药物联合使用时。DNA2-IN-C5的体内疗效可能取决于其药代动力学特性,包括生物利用度和到达肿瘤部位的能力。作为一种先导化合物,其体内活性是目前的研究热点,预计后续研究将评估其在人源癌症小鼠异种移植模型中单独使用以及与其他疗法联合使用的抗肿瘤潜力。
酶活实验
用于评估 DNA2-IN-C5 的体外酶活性测定方案通常采用基于荧光的核酸酶活性测定法,使用纯化的重组 DNA2 蛋白和荧光 DNA 底物。在典型的实验设置中,将不同浓度的化合物与固定量的 DNA2 酶在针对核酸酶活性优化的反应缓冲液中孵育。通过加入含有荧光基团和淬灭基团的合成 DNA 底物来启动反应。当活性 DNA2 核酸酶切割 DNA 底物时,荧光基团从淬灭基团中释放出来,导致荧光信号增强,该信号可使用荧光酶标仪实时监测。对于每种化合物浓度,测量与酶催化活性成正比的初始荧光增强速率。使用不含抑制剂的对照反应来确定最大酶活性。然后将数据绘制为抑制率与化合物浓度的关系图,生成剂量反应曲线,并由此计算出 IC50 值为 20 μM。该方案是表征核酸酶抑制剂的标准生化方法。
细胞实验
体外细胞实验用于评估DNA2-IN-C5的细胞活性,通常使用已知对复制应激敏感的癌细胞系。将细胞接种于多孔板中,并用不同浓度的DNA2-IN-C5处理一定时间,通常为48至72小时。处理后,使用标准比色法或发光法(例如MTT、CCK-8或CellTiter-Glo)评估细胞活力,这些方法通过测量代谢活性或ATP含量来反映活细胞数量。为了评估该化合物增强细胞对其他药物敏感性的能力,进行联合用药研究,将细胞与DNA2-IN-C5和亚致死浓度的复制应激诱导药物(例如羟基脲或顺铂)共同处理。然后使用联合指数法分析联合效应,以确定其相互作用是协同作用、相加作用还是拮抗作用。这些检测对于将酶的生化抑制转化为功能性细胞结果以及探索该化合物作为化学增敏剂的潜力至关重要。
动物实验
目前,DNA2-IN-C5的具体体内动物研究方案在公开文献中并不常见。然而,根据评估类似具有抗癌潜力的DNA修复抑制剂的标准方法,典型的研究将使用携带皮下人源肿瘤异种移植瘤的免疫缺陷小鼠。待肿瘤达到特定体积后,将动物随机分为不同的治疗组,包括溶剂对照组和接受不同剂量化合物治疗的组。DNA2-IN-C5的给药途径可能为灌胃或腹腔注射,具体取决于其制剂。治疗方案包括每日或间歇给药,持续数周,期间定期监测肿瘤体积和体重,以评估疗效和耐受性。研究结束时,收集肿瘤组织进行进一步分析,包括组织学、免疫组织化学(例如,检测DNA损伤标志物γH2AX)以及药物浓度测定,以建立药代动力学与药效学之间的相关性。这种研究设计是评价新型化合物体内抗肿瘤活性的标准方法。
药代性质 (ADME/PK)
目前文献中尚未报道DNA2-IN-C5的详细药代动力学(PK)数据。然而,基于其理化性质,可以做出一些初步的PK预测。该化合物的分子量为234.17,计算得到的LogP值为2.07,表明其具有中等亲脂性。这提示该化合物可能具有良好的细胞渗透性,并可能具有中等的口服生物利用度。它在DMSO中的溶解度最高可达约31.25 mg/mL,制剂研究表明,它可以溶解于由10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80和45%生理盐水组成的溶剂中。这种制剂通常用于体内给药。未来的研究需要确定全面的药代动力学参数,例如半衰期(t½)、最大浓度(Cmax)、曲线下面积(AUC)和分布容积,以充分了解该化合物的吸收、分布、代谢和排泄(ADME)特征。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于DNA2-IN-C5目前仍处于研究阶段,尚未经过正式的临床前毒理学评估,因此其具体的毒性数据尚未公开。作为DNA2(一种DNA复制和修复的关键酶)的抑制剂,该化合物预计会表现出一定的细胞毒性,尤其是在快速分裂的细胞中。这种固有的靶向效应若不加以谨慎控制,可能会限制其治疗窗口。此外,还需要在标准的安全性药理学研究中评估其脱靶毒性。该化合物目前被归类为研究工具,不适用于人体;因此,尚未建立全面的毒理学特征。该化合物的任何未来开发都需要进行广泛的体外和体内毒理学研究,以确定其安全范围、识别毒性靶器官并评估其遗传毒性和致癌性。
参考文献

[1]. Dna2 inhibitors for cancer treatment. US20170226063A1.

其他信息
DNA2-IN-C5 是一种用于研究 DNA2 解旋酶/核酸酶生物学及其在维持基因组稳定性中作用的重要研究工具。其作用机制涉及对 DNA2 的竞争性抑制,从而诱导复制应激,使其成为靶向 DNA 复制的癌症疗法的潜在增敏剂。该化合物尚未进入临床试验阶段,也未获得 FDA 批准用于任何适应症;目前仍处于临床前研究阶段。其主要应用是在实验室环境中研究 DNA 损伤反应,并探索靶向 DNA 修复通路以期获得治疗益处的潜力。更广泛地说,像 DNA2-IN-C5 这样的抑制剂对于验证新的药物靶点以及理解 DNA 复制、修复和细胞存活之间复杂的相互作用至关重要,而这对于开发下一代癌症疗法至关重要。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H6N2O5
分子量
234.17
精确质量
234.028
CAS号
35973-25-2
PubChem CID
225906
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.624g/cm3
沸点
437.2ºC at 760mmHg
闪点
218.2ºC
折射率
1.674
LogP
2.07
tPSA
116.24
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
17
分子复杂度/Complexity
411
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
BMIZBCVEHSUUNO-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H6N2O5/c13-9-5-2-1-3-7(12(16)17)8(5)11-4-6(9)10(14)15/h1-4H,(H,11,13)(H,14,15)
化学名
8-nitro-4-oxo-1H-quinoline-3-carboxylic acid
别名
DNA2INC5; DNA2 IN C5; DNA2-IN-C5
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~31.25 mg/mL (~133.45 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (8.88 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (8.88 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.2704 mL 21.3520 mL 42.7040 mL
5 mM 0.8541 mL 4.2704 mL 8.5408 mL
10 mM 0.4270 mL 2.1352 mL 4.2704 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们