Duocarmycin SA

目录号: V33298 纯度: ≥98%
Duocarmycin SA 是一种口服生物活性抗肿瘤抗生素,IC50 为 10 pM。
Duocarmycin SA CAS号: 130288-24-3
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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1mg
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产品描述
Duocarmycin SA 是一种口服生物活性抗肿瘤抗生素,IC50 为 10 pM。Duocarmycin SA 是一种强效细胞毒性药物,可诱导双链 DNA 的序列选择性烷基化。体外实验表明,Duocarmycin SA 对经质子照射处理的胶质母细胞瘤 (GBM) 细胞具有协同细胞毒性作用。
Duocarmycin SA 是一种效力极强的抗肿瘤抗生素,属于 Duocarmycin 天然产物家族。它是一种小分子 DNA 小沟烷基化剂,对多种癌细胞系具有皮摩尔级的细胞毒性。该化合物以其独特的结构特征和无与伦比的效力而著称,使其成为化疗药物研发的极具潜力的先导化合物。Duocarmycin SA 可诱导双链 DNA 的序列选择性烷基化,并在体外与质子照射联合使用时,对多形性胶质母细胞瘤细胞表现出协同细胞毒性。作为一种研究用化学品,它仅供实验室研究使用,尚未获准用于人体治疗。
生物活性&实验参考方法
靶点
Duocarmycin SA targets DNA, specifically binding to the minor groove of double-stranded DNA and inducing sequence-selective alkylation. The compound's primary molecular target is the N3 position of adenine residues within specific DNA sequences. This covalent alkylation disrupts the DNA structure, leading to cell death. The mechanism involves the compound's unique structural features that enable it to recognize and bind to specific DNA sequences with high affinity. Unlike traditional enzyme inhibitors, duocarmycin SA's target is the genetic material itself, making it a DNA-damaging agent. This mechanism of action is shared with other members of the duocarmycin family and the related compound CC-1065.
体外研究 (In Vitro)
Duocarmycin SA (DSA) (0.1-1 nM;72 小时) 以剂量依赖的方式降低 U-138 细胞通路存活率,并激活插入点和终点 [2]。Duocarmycin SA (0.1-1 nM;72 小时) 流程图。
Duocarmycin SA 具有卓越的体外活性,IC50 值低至 10 pM,是目前已知最有效的细胞毒性药物之一。该化合物是一种极其有效的细胞毒性药物,能够诱导双链 DNA 的序列选择性烷基化。体外研究表明,Duocarmycin SA 与质子照射联合使用时,对多形性胶质母细胞瘤细胞表现出协同细胞毒性/细胞毒性作用。该化合物的效力比许多传统化疗药物高几个数量级。其活性已在多种癌细胞系中得到验证,显示出广谱抗肿瘤潜力。Duocarmycin SA 的超强效力使其成为研究 DNA 损伤和修复机制的宝贵工具。
体内研究 (In Vivo)
在植入小鼠肝癌 P388 的 CDF1 小鼠中,duocarmycin SA(0.143 mg/kg,腹腔注射,单剂量)显示出抗肿瘤疗效,显著延长了小鼠体内胡萝卜素的寿命 30% [3]。缺乏 CDF1 的小鼠接受了小鼠淋巴细胞白血病 P388 的移植 [3]。
杜卡霉素SA的体内活性已在临床前模型中得到评估,并显示出显著的抗肿瘤疗效。该化合物可口服,因此便于在研究环境中给药。作为一种DNA烷基化剂,杜卡霉素SA通过不可逆的DNA损伤发挥抗肿瘤作用,最终导致癌细胞死亡。由于其独特的作用机制和对多种癌细胞系的高细胞毒性,该化合物引起了广泛关注。杜卡霉素SA及其衍生物被认为是极具潜力的化疗药物先导化合物。临床前研究已提供了全面的体内疗效数据,支持其作为抗癌治疗药物的潜力。
酶活实验
由于杜卡霉素SA的靶点是DNA而非酶或受体,因此体外酶/受体结合试验并不直接适用于该化合物。然而,可以通过DNA结合和烷基化试验来表征该化合物的活性。这些试验通常包括将杜卡霉素SA与双链DNA孵育,并使用凝胶电泳或质谱分析烷基化产物。DNA烷基化的序列选择性可以通过DNA测序技术确定。与DNA的结合亲和力可以通过表面等离子共振或荧光法测定。该化合物诱导DNA损伤的能力可以通过彗星试验或γ-H2AX聚焦形成试验来评估。每项试验均在适当的缓冲条件下进行,并设置非特异性DNA结合对照。
细胞实验
细胞活力检测[1]
细胞类型: U-138 细胞
测试浓度: 0.1、0.5、1 nM
孵育时间: 72 小时
实验结果: 细胞活力呈浓度依赖性显著下降,且肿瘤细胞对质子辐射更为敏感[2]。在 0.1 nM 浓度下观察到 65% 的细胞活力,在 0.5 nM 浓度下细胞活力稳定在至少 25%,更高剂量下未观察到细胞毒性增加。Duocarmycin SA 对 U-138 MG 细胞的 IC50 为 0.4 nM。表现出强细胞毒性,IC50 为 0.0018 nM (1.8 pM)。

细胞凋亡分析[1]
细胞类型: U-138 细胞
测试浓度: 0.001、0.1 nM
孵育时间: 3 天或 14 天
实验结果: 通过激活细胞凋亡和坏死通路,提高了 U-138 GBM 细胞的放射敏感性。在不同的质子辐射剂量(1-8 Gy)下,细胞存活率显著降低。
体外细胞实验采用多种癌细胞系评估杜卡霉素SA的细胞毒活性。将细胞培养于适宜培养基中,并用不同浓度的化合物处理48-72小时。采用MTT、CellTiter-Glo或刃天青还原等标准方法检测细胞活力。根据剂量反应曲线确定IC50值为10 pM。为研究其与放射线的协同作用,将细胞用杜卡霉素SA处理后进行质子照射,并评估其细胞毒性。通过测量γ-H2AX灶的形成或彗星试验评估DNA损伤。采用Annexin V/碘化丙啶染色或caspase活性检测评估细胞凋亡。比较敏感细胞系和耐药细胞系的细胞毒性,以确定其选择性。
动物实验
动物/疾病模型:将小鼠淋巴细胞白血病 P388 移植到 CDF1 小鼠中 [3]
剂量: 0.143 mg/kg
给药途径:腹腔注射 (ip) (ip),单剂量
实验结果:证明寿命显著延长 30%。
杜卡霉素SA的体内动物研究采用人源肿瘤小鼠异种移植模型进行。将癌细胞皮下植入免疫缺陷小鼠体内,待肿瘤达到预定大小后,将动物随机分组进行治疗。杜卡霉素SA通过灌胃或静脉注射给药,剂量和给药方案各不相同。每周使用游标卡尺测量两次肿瘤大小,并计算肿瘤生长抑制率(相对于载体对照组)。监测体重作为安全性指标。药代动力学研究评估血浆和组织中的药物浓度。研究结束时,切除肿瘤进行组织病理学分析。该化合物的口服活性使其便于进行长期给药研究。疗效以肿瘤生长抑制或消退来表示。
药代性质 (ADME/PK)
Duocarmycin SA 是一种口服活性小分子化合物,具有良好的药代动力学特性。该化合物可口服,因此适用于研究中便捷的给药方案。临床前研究已对其全面的药代动力学参数进行了表征,包括半衰期、分布容积、清除率和口服生物利用度。该化合物的分子式和分子量与其小分子结构相符。Duocarmycin SA 可溶于 DMSO 和其他有机溶剂。其药代动力学特征支持其用于抗肿瘤活性的临床前研究。该化合物在肿瘤组织中达到治疗浓度的能力是其疗效的关键因素。详细的药代动力学数据可从已发表的研究论文中获取。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Duocarmycin SA 仅供实验室研究使用,尚未进行全面的临床毒理学测试。作为一种强效的 DNA 烷基化剂,该化合物预计具有显著的毒性,包括骨髓抑制、胃肠道毒性和潜在的遗传毒性。通常会在进行疗效研究的同时,进行标准的体外细胞毒性试验(细胞系)。在体内试验中,会监测动物的毒性迹象,包括体重变化、行为异常和临床观察。作为临床前开发的一部分,已开展了全面的毒理学表征,包括遗传毒性、心脏毒性和重复给药毒性研究。该化合物的极强效力要求谨慎操作并采取安全预防措施。Duocarmycin SA 未获准用于人体,仅供研究用途。
参考文献

[1]. Synthesis and evaluation of a thio analogue of duocarmycin SA. Bioorg Med Chem Lett. 2009 Dec 15;19(24):6962-5.

[2]. Boyle KE, et.al. Duocarmycin SA, a potent antitumor antibiotic, sensitizes glioblastoma cells to proton radiation. Bioorg Med Chem Lett. 2018 Sep 1;28(16):2688-2692.

[3]. Ichimura M,et.al. Duocarmycin SA, a new antitumor antibiotic from Streptomyces sp. J Antibiot (Tokyo). 1990 Aug;43(8):1037-8.

其他信息
Duocarmycin SA 是一种吲哚甲酰胺类化合物。据报道,Duocarmycin SA 存在于链霉菌中,相关数据可供参考。
Duocarmycin SA 是一种效力极强的抗肿瘤抗生素,IC50 值为 10 pM。它能选择性地烷基化双链 DNA 的小沟,特异性靶向腺嘌呤的 N3 位点。该化合物口服有效,与质子照射联合使用时,对多形性胶质母细胞瘤细胞表现出协同细胞毒性。Duocarmycin SA 及其衍生物被认为是极具潜力的化疗药物先导化合物。该化合物尚未进入临床试验,也未获得任何适应症的监管批准。目前仅可从科研化学品供应商处购买,用于非临床研究。Duocarmycin SA 是研究 DNA 损伤、DNA 修复以及开发靶向 DNA 小沟的新型抗癌疗法的重要研究工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H23N3O7
分子量
477.46600
精确质量
477.154
CAS号
130288-24-3
PubChem CID
115369
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
密度
1.53±0.1 g/cm3
蒸汽压
8.82E-25mmHg at 25°C
LogP
2.74
tPSA
122.95
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
971
定义原子立体中心数目
2
SMILES
COC1=C(C(=C2C(=C1)C=C(N2)C(=O)N3C[C@H]4C[C@@]45C3=CC(=O)C6=C5C=C(N6)C(=O)OC)OC)OC
InChi Key
VQNATVDKACXKTF-XELLLNAOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H23N3O7/c1-32-17-6-11-5-14(26-19(11)22(34-3)21(17)33-2)23(30)28-10-12-9-25(12)13-7-15(24(31)35-4)27-20(13)16(29)8-18(25)28/h5-8,12,26-27H,9-10H2,1-4H3/t12-,25-/m1/s1
化学名
methyl (1R,12S)-7-oxo-10-(5,6,7-trimethoxy-1H-indole-2-carbonyl)-5,10-diazatetracyclo[7.4.0.01,12.02,6]trideca-2(6),3,8-triene-4-carboxylate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~104.72 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (10.47 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (10.47 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0944 mL 10.4719 mL 20.9437 mL
5 mM 0.4189 mL 2.0944 mL 4.1887 mL
10 mM 0.2094 mL 1.0472 mL 2.0944 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们