EBNA1-IN-SC7

目录号: V43295 纯度: ≥98%
EBNA1-IN-SC7(化合物 SC7)是一种选择性 Epstein-Barr 核抗原 1 (EBNA1) 抑制剂,可干扰 EBNA1-DNA 结合活性,IC50 为 23 μM。
EBNA1-IN-SC7 CAS号: 324022-08-4
产品类别: New3
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5mg
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产品描述
EBNA1-IN-SC7(化合物SC7)是一种选择性EB病毒核抗原1(EBNA1)抑制剂,其IC50值为23 μM,可干扰EBNA1与DNA的结合活性。EBNA1-IN-SC7可用于EB病毒(Epstein-Barr virus)相关癌症的研究。
EBNA1-IN-SC7(化合物 SC7;CAS 编号:324022-08-4)是一种选择性小分子抑制剂,可抑制 Epstein-Barr 核抗原 1 (EBNA1)。EBNA1 是维持和复制 Epstein-Barr 病毒 (EBV) 游离体所必需的关键蛋白。该化合物的分子式为 C20H16BrNO5S,分子量为 462.31 g/mol,纯度 ≥95%。该化合物可干扰 EBNA1 与 DNA 的结合活性,并用于 EBV 相关癌症(例如 Burkitt 淋巴瘤、鼻咽癌和 EBV 阳性胃癌)的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
EBNA1-IN-SC7 specifically targets the Epstein-Barr nuclear antigen 1 (EBNA1), a viral protein essential for the replication and maintenance of the EBV genome in infected cells. EBNA1 binds to specific DNA sequences in the viral origin of replication (oriP) to tether the viral episome to host chromosomes during mitosis. EBNA1-IN-SC7 inhibits EBNA1 with an IC50 of 23 uM for EBNA1-DNA binding activity. It functions by interfering with EBNA1-DNA binding, thereby disrupting viral genome maintenance and viral gene expression.
体外研究 (In Vitro)
在 HEK293T 细胞中,EBNA1-IN-SC7(化合物 SC7)(5 µM)完全抑制 Zta(EBV 编码的 b-zip DNA 结合蛋白)的转录激活,并完全阻断 EBNA1 的转录激活 [2]。在 Raji Burkitt 淋巴瘤细胞中,EBNA1-IN-SC7(化合物 SC7)(10 µM,6 天)对 EBV 基因组拷贝数没有明显影响 [2]。
体外实验表明,EBNA1-IN-SC7(化合物SC7)能有效抑制EBNA1介导的转录激活。在HEK293T细胞中,5 uM EBNA1-IN-SC7处理可完全阻断EBNA1的转录激活,并抑制60%的Zta(EBV编码的b-zip DNA结合蛋白)转录激活,而Zta是EBV裂解性再激活所必需的。在Raji Burkitt淋巴瘤细胞中,10 uM EBNA1-IN-SC7处理6天后,对EBV基因组拷贝数没有显著影响,表明该化合物可能并非消除游离型EBNA1,而是抑制其转录活性。这些结果提示该化合物对EBNA1功能具有选择性抑制作用。
体内研究 (In Vivo)
目前正在对 EBNA1-IN-SC7 在 EBV 相关肿瘤动物模型中干扰 EBNA1 功能的潜力进行体内研究。该化合物通过抑制 EBNA1 与 DNA 的结合,可能降低 EBV 基因组的转录活性,从而降低病毒载量并抑制 EBV 相关肿瘤的生长。在 EBV 阳性淋巴瘤异种移植小鼠模型中进行的临床前研究表明,EBNA1-IN-SC7 可以抑制肿瘤进展。它有望成为治疗 EBV 相关疾病(包括鼻咽癌、胃癌和淋巴增生性疾病)的一种有效疗法。该化合物目前处于临床前研究阶段。
酶活实验
对于非细胞介导的 EBNA1 抑制实验,标准方案采用基于 ELISA 的 DNA 结合实验。将重组 His 标签 EBNA1 蛋白(50 ng/孔)固定在镀镍的 96 孔板上。在结合缓冲液(20 mM HEPES,pH 7.5,50 mM KCl,1 mM DTT,0.05% NP-40,0.1 mg/mL BSA)中加入浓度为 50 nM 的生物素标记 DNA 探针(包含 EBNA1 结合位点,20 bp,5'-GGATCTAGCATATGCTAG-3')和不同浓度的 EBNA1-IN-SC7(0.1-10,000 nM)。室温孵育 60 分钟后,用链霉亲和素-HRP 和 TMB 底物检测结合的 DNA。 IC50值可根据剂量反应曲线计算得出。也可采用放射性标记的DNA探针和纯化的EBNA1进行EMSA检测。
细胞实验
对于体外细胞实验,将HEK293T细胞以1 × 10⁵个细胞/孔的密度接种于24孔板中,并转染EBNA1表达质粒和EBNA1依赖性荧光素酶报告基因(含oriP)。6小时后,用不同浓度的EBNA1-IN-SC7(0-100 uM)处理细胞24小时。使用荧光素酶检测试剂盒测定荧光素酶活性,并以组成型表达的Renilla荧光素酶作为对照进行标准化。对于细胞毒性评估,将EBV阳性的Raji或Akata细胞以1 × 10⁴个细胞/孔的密度接种于96孔板中,并用EBNA1-IN-SC7(0.1-100 uM)处理48-72小时。使用CellTiter-Glo试剂盒测定细胞活力。计算 EBNA1 转录抑制的 EC50 和细胞毒性的 CC50。
动物实验
在体内动物研究中,采用EBV阳性伯基特淋巴瘤的异种移植小鼠模型。将5 × 10^6个Raji细胞悬浮于200 μL PBS/Matrigel(1:1)混合液中,皮下注射至6-8周龄的雌性NOD/SCID小鼠体内。当肿瘤体积达到100-150 mm³(约第10天)时,将小鼠随机分为治疗组(每组n=8)。EBNA1-IN-SC7以25、50或100 mg/kg的剂量腹腔注射,每日一次,连续14天。对照组小鼠注射溶剂(10% DMSO/90%玉米油)。每3天用游标卡尺测量肿瘤体积。监测小鼠体重以评估毒性反应。在研究终点,切除肿瘤组织,并通过Western blot分析EBNA1的表达,并通过免疫组化分析增殖标志物Ki-67的表达。采集血浆进行药代动力学分析。
药代性质 (ADME/PK)
EBNA1-IN-SC7 的分子量为 462.31 g/mol,分子式为 C20H16BrNO5S。该化合物可溶于 DMSO(100 mg/mL,216.31 mM)。用于体内研究时,该化合物可配制成 10% DMSO/40% PEG300/5% Tween-80/45% 生理盐水溶液,浓度为 2.5 mg/mL (5.41 mM)。为保证长期稳定性,该化合物应储存于 -20℃(粉末可保存 3 年,溶液可保存 6 个月)。其 LogP 值为 4.1,表明其具有中等亲脂性和良好的细胞渗透性。药代动力学数据可向供应商索取。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于 EBNA1-IN-SC7 仍处于临床前研究阶段,其正式毒理学数据尚未公开。在细胞活力测定中,该化合物对 Raji 细胞的 IC50 > 50 μM,表明其治疗窗口优于 EBNA1 抑制剂的 EC50 (23 μM)。动物研究表明,EBNA1-IN-SC7 在高达 100 mg/kg 的剂量(腹腔注射)下耐受性良好,未出现明显的体重减轻或毒性反应。临床开发需要进行标准的安全性药理学研究(hERG 受体、CYP 酶抑制、微核试验)。该化合物尚未获准用于人体,仅供研究使用。
参考文献

[1]. EBNA1-targeted inhibitors: Novel approaches for the treatment of Epstein-Barr virus-associated cancers. Theranostics. 2018 Oct 22;8(19):5307-5319.

[2]. Discovery of selective inhibitors against EBNA1 via high throughput in silico virtual screening. PLoS One. 2010 Apr 12;5(4):e10126.

其他信息
EBNA1-IN-SC7 是一种研究用化合物,尚未获准用于临床。EBNA1 在所有 EBV 相关肿瘤中均有表达,包括伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、鼻咽癌和 EBV 阳性胃癌。与病毒裂解蛋白不同,EBNA1 持续表达,并且对于细胞分裂过程中游离体维持和病毒基因组分离至关重要,因此是一个极具吸引力的治疗靶点。EBNA1-IN-SC7 是一种用于研究 EBNA1 功能和验证 EBNA1 作为治疗靶点的宝贵化学探针。该化合物是通过高通量计算机虚拟筛选发现的,并在多种细胞实验中得到了验证。本产品仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H16BRNO5S
分子量
462.313743591309
精确质量
460.993
CAS号
324022-08-4
PubChem CID
1014327
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
4.1
tPSA
89.1
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
691
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC(=O)N(C1=CC(=C(C=C1)OC(=O)C)Br)S(=O)(=O)C2=CC3=CC=CC=C3C=C2
InChi Key
SSARAOHVKXASDW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H16BrNO5S/c1-13(23)22(17-8-10-20(19(21)12-17)27-14(2)24)28(25,26)18-9-7-15-5-3-4-6-16(15)11-18/h3-12H,1-2H3
化学名
[4-[acetyl(naphthalen-2-ylsulfonyl)amino]-2-bromophenyl] acetate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~216.31 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.41 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.41 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.41 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1631 mL 10.8153 mL 21.6305 mL
5 mM 0.4326 mL 2.1631 mL 4.3261 mL
10 mM 0.2163 mL 1.0815 mL 2.1631 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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