EEDi-5273

目录号: V42139 纯度: ≥98%
EEDi-5273 是一种有效的口服生物可利用的 EED 抑制剂 (IC50 = 0.2 nM),可实现完全且持续的肿瘤消退。
EEDi-5273 CAS号: 2585648-55-9
产品类别: New2
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产品描述
EEDi-5273 是一种强效且口服生物利用度高的 EED 抑制剂(IC50 = 0.2 nM),可实现完全且持续的肿瘤消退。
EEDi-5273(CAS号:2585648-55-9,又名APG-5918)是一种高效、口服生物利用度高的小分子抑制剂,可抑制胚胎外胚层发育(EED),EED是多梳抑制复合物2(PRC2)的核心组成部分。它是一种新一代表观遗传调节剂,IC50约为0.2 nM,能够在临床前模型中实现肿瘤的完全且持久的消退。
生物活性&实验参考方法
靶点
The compound targets the EED (Embryonic Ectoderm Development) protein, which is a core component of the Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2). PRC2 is a histone methyltransferase responsible for the trimethylation of histone H3 at lysine 27 (H3K27me3), an epigenetic mark that silences gene expression. By binding to EED, EEDi-5273 disrupts the allosteric activation of the PRC2 complex, leading to the global reduction of H3K27me3 and the re-expression of silenced genes.
体外研究 (In Vitro)
在生化分析中,EEDi-5273 对 EED 的 IC50 值为 0.2 nM,表明其具有极高的活性。该抑制剂能有效阻断 PRC2 复合物的活性,并阻止抑制性 H3K27me3 标记的形成。与早期 EZH2 和 EED 抑制剂相比,该化合物表现出更优异的活性,并且能够在某些癌症模型中实现肿瘤的完全且持久的消退。
体内研究 (In Vivo)
EEDi-5273 是一种高效且口服有效的 EED 抑制剂,在多种癌症临床前小鼠模型(例如淋巴瘤、白血病和实体瘤)中均显示出强大的抗肿瘤活性。它能够实现肿瘤的完全且持续的消退,且通常在耐受性良好的剂量水平下即可达到此效果。目前,该化合物正被研究用于治疗 PRC2 驱动的癌症以及非癌症适应症(例如血红蛋白病)。
酶活实验
EED抑制剂的生化分析通常采用AlphaScreen或TR-FRET方法来测量其与EED的结合。将生物素标记的EED蛋白与标记的组蛋白H3K27me3肽(EED的天然配体)以及不同浓度的EEDi-5273混合。通过测量供体和受体微珠的接近程度来评估EED-肽相互作用的破坏程度,从而计算出与EED蛋白竞争性结合的IC50值。
细胞实验
在细胞实验中,将PRC2依赖性癌细胞(例如KARPAS-422淋巴瘤细胞或G401横纹肌样瘤细胞)用不同浓度的EEDi-5273处理3-7天。使用CellTiter-Glo发光法检测细胞活力,以确定生长抑制的IC50值。通过处理细胞3-5天,然后通过Western blot分析H3K27me3、总H3和EZH2的水平来评估药效学效应。通过RNA测序分析整体基因表达变化。
动物实验
体内疗效通常在KARPAS-422淋巴瘤异种移植小鼠模型中进行评估。将携带已建立的皮下肿瘤(约150-200 mm³)的无胸腺裸鼠随机分为治疗组。每日通过灌胃给予EEDi-5273,剂量分别为3、10和30 mg/kg。每周两次使用游标卡尺测量肿瘤体积,以计算肿瘤生长抑制率(TGI)。研究结束时,切除肿瘤,并通过免疫组织化学和Western blot分析H3K27me3水平,以确认靶点结合情况。
药代性质 (ADME/PK)
EEDi-5273 是一种口服生物利用度高的抑制剂。虽然搜索结果中没有提供该化合物的具体定量药代动力学参数,但其被归类为“口服有效”化合物表明它具有良好的类药特性,包括足够的口服吸收、代谢稳定性和全身暴露,从而在体内实现持久的药效学效应(例如,持续降低 H3K27me3)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
EEDi-5273的具体毒理学数据尚不详尽。作为一种PRC2复合物的表观遗传抑制剂,其潜在毒性可能包括对肠道和骨髓正常分化过程的影响,这在PRC2抑制剂中较为常见。然而,临床前研究中观察到的其强大的靶向活性和良好的体内耐受性表明,其安全性可能在可控范围内。
参考文献

[1]. Discovery of EEDi-5273 as an Exceptionally Potent and Orally Efficacious EED Inhibitor Capable of Achieving Complete and Persistent Tumor Regression. J Med Chem. 2021 Oct 14;64(19):14540-14556.

其他信息
EEDi-5273 是一种新一代研究级化合物,它通过一种全新的机制靶向 PRC2 复合物——破坏 EED 与组蛋白 H3K27me3 的相互作用,而非直接抑制 EZH2 酶。这种机制可能带来诸多优势,包括更高的选择性和不同的耐药性。截至最新进展,该化合物是一种强大的临床前研究工具,尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H22F4N6O2
分子量
526.49
精确质量
526.174
CAS号
2585648-55-9
PubChem CID
155580034
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
4.8
tPSA
84.6
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
38
分子复杂度/Complexity
879
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC1C=CC2=C(CCO2)C=1CNC1=NC=C2C3=CN=C(C(F)(F)F)C=C3CN(C(C3=C2N1C=N3)=O)C(C)C
InChi Key
OAYMRNSLBKYMKG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H22F4N6O2/c1-13(2)35-11-14-7-21(26(28,29)30)31-8-16(14)18-10-33-25(36-12-34-22(23(18)36)24(35)37)32-9-17-15-5-6-38-20(15)4-3-19(17)27/h3-4,7-8,10,12-13H,5-6,9,11H2,1-2H3,(H,32,33)
化学名
15-[(5-fluoro-2,3-dihydro-1-benzofuran-4-yl)methylamino]-9-propan-2-yl-5-(trifluoromethyl)-4,9,12,14,16-pentazatetracyclo[9.6.1.02,7.014,18]octadeca-1(17),2,4,6,11(18),12,15-heptaen-10-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~47.48 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (1.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.0 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再将50 μL Tween-80+加入到上述溶液中,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8994 mL 9.4969 mL 18.9937 mL
5 mM 0.3799 mL 1.8994 mL 3.7987 mL
10 mM 0.1899 mL 0.9497 mL 1.8994 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们