| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
IC50: 0.2 μM (eIF4A3)
Kd: 0.043 μM (eIF4A3) |
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| 体外研究 (In Vitro) |
真核起始因子4A3(eIF4A3)是DEAD-box RNA解旋酶家族的成员,是外显子连接复合体(EJC)的核心成分之一。众所周知,EJC参与了以无义介导的RNA衰变(NMD)为代表的各种RNA代谢过程。为了鉴定分子探针以研究eIF4A3的功能和治疗相关性,进行了选择性eIF4A3抑制剂的搜索。通过高通量筛选(HTS)鉴定的1,4-二酰基哌嗪衍生物的化学优化,我们发现了第一个报道的具有细胞NMD抑制活性的选择性eIF4A3抑制剂53a。表面等离子体共振(SPR)生物传感测定确定了53a及其类似物52a与eIF4A3的直接结合,并揭示了该结合发生在非ATP结合位点。化合物52a和53a代表用于进一步研究eIF4A3、EJC和NMD的新型分子探针[1]。
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| 酶活实验 |
RNA依赖性ATP酶测定
使用ADP-Glo测定系统(Promega)进行RNA依赖性ATP酶测定。单链RNA poly(U)购自MP Biomedicals。测定缓冲液包含20mM Tris-HCl(pH7.5)、2.5mM MgCl2、100mM KCl、1mM二硫苏糖醇(DTT)和0.01%(v/v)Tween20。为了增强eIF4A的ATP酶活性,对于150nM eIF4A3或eIF4B,加入等效摩尔浓度的MLN51,对于100nM eIF4 A1或eIF4A2,加入当量摩尔浓度的eIF4G。关于DHX29或BRR2的ATP酶测定,最佳浓度分别为6.4nM和6.25nM。ATP或RNA的浓度设置为每种酶的每种底物的Km值,如下所示:eIF4A1和eIF4A3为35μM ATP和1.5μg/mL poly(U);20μM ATP和3.0μg/mL poly(U)用于eIF4A2;30μM ATP和1.8μg/mL聚(U)对DHX29;20μM ATP和2.5μ。在加入底物和测试化合物后,通过加入酶开始ATP酶反应。对于eIF4A3、DHX29和BRR2,将它们在室温下孵育30分钟,对于eIF4A1和eIF4A2,将它们孵育40分钟。用ADP-Glo试剂终止酶促反应,然后加入ADP-格洛检测试剂检测ADP。使用EnVision 2102多标签板读取器(PerkinElmer)测量发光信号。我们将无酶反应的发光信号定义为100%的抑制活性,将完全反应混合物的发光信号限定为0%的抑制活性。使用XLfit版本5(ID Business Solutions)程序进行曲线拟合和IC50值的计算,曲线的最大值和最小值分别限制为100和0。[1] |
| 细胞实验 |
使用Lipofectamine LTX(Thermo Fisher Scientific)用pGL4.12 SV40-Luc2CP-BGG载体和作为内部对照的pRL TK载体转染HEK293T细胞。在转染两种载体24小时后,将化合物处理6小时。使用双荧光素酶试剂盒(Promega)测定萤火虫与肾萤光素酶的相对活性。通过EnVision 2102多标签板读取器检测发光信号。[1]
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| 参考文献 |
| 分子式 |
C29H23BRCLN5O2
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|---|---|
| 分子量 |
588.882224321365
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| 精确质量 |
587.072
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| CAS号 |
2095486-67-0
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| PubChem CID |
137640621
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
5.2
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| tPSA |
82.2Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
0
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
4
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| 重原子数目 |
38
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| 分子复杂度/Complexity |
897
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| 定义原子立体中心数目 |
1
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| SMILES |
CC1=C(C=NN1C2=CC=CC(=C2)C#N)C(=O)N3CCN([C@H](C3)C4=CC=C(C=C4)Cl)C(=O)C5=CC=C(C=C5)Br
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| InChi Key |
BDGKKHWJYBQRIE-HHHXNRCGSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C29H23BrClN5O2/c1-19-26(17-33-36(19)25-4-2-3-20(15-25)16-32)29(38)34-13-14-35(28(37)22-5-9-23(30)10-6-22)27(18-34)21-7-11-24(31)12-8-21/h2-12,15,17,27H,13-14,18H2,1H3/t27-/m1/s1
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| 化学名 |
3-[4-[(3S)-4-(4-bromobenzoyl)-3-(4-chlorophenyl)piperazine-1-carbonyl]-5-methylpyrazol-1-yl]benzonitrile
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~200 mg/mL (~339.63 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (8.49 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。 配方 2 中的溶解度: 配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (8.5 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,你可以取100 μL 50 mg/mL DMSO 储备液加入到900 μL 玉米油中,混匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.6981 mL | 8.4907 mL | 16.9814 mL | |
| 5 mM | 0.3396 mL | 1.6981 mL | 3.3963 mL | |
| 10 mM | 0.1698 mL | 0.8491 mL | 1.6981 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。