ERK5-IN-2

别名: ERK5-IN 2; ERK5 IN-2; ERK5-IN-2
目录号: V4799 纯度: ≥98%
ERK5-IN-2 是一种新型、有效、口服生物可利用、亚微摩尔、选择性 ERK5 抑制剂,其选择性优于 p38α 和 BRD4。
ERK5-IN-2 CAS号: 1888305-96-1
产品类别: ERK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
ERK5-IN-2 是一种新型、有效、口服生物可利用、亚微摩尔、选择性 ERK5 抑制剂,其选择性优于 p38α 和 BRD4。对于 ERK5 和 ERK5 MEF2D,其 IC50 值分别为 0.82 μM、3 μM。 ERK5-IN-2 抑制基质胶塞中肿瘤异种移植物的生长和碱性成纤维细胞生长因子 (bFGF) 诱导的血管生成。内皮细胞血管生成和肿瘤细胞运动是与细胞外调节激酶 5 (ERK5) 信号传导相关的两种细胞表型。一系列 4 位被芳酰基取代的吡咯-2-甲酰胺被发现表现出微摩尔范围内的 IC50 值,但对 p38 MAP 激酶没有选择性。这些新型 ERK5 抑制剂(例如 ERK5-IN-2)是通过高通量筛选发现的。 N-取代基的截断减弱了 p38α 的抑制,这一点很重要,因为它仅略微增加了针对 ERK5 的效力(约 3 倍)。选择性抑制剂 4-(2-溴-6-氟苯甲酰基)-N-(吡啶-3-基)-1H-吡咯-2-甲酰胺(ERK5 的 IC50 为 0.82 μM;p38α 的 IC50 > 120 μM)。该化合物与 ERK5 的复杂晶体结构已确定 (PDB 5O7I)。该物质具有口服生物利用度,可防止肿瘤异种移植物生长和基质胶塞中 bFGF 驱动的血管生成。本文描述的选择性 ERK5 抑制剂为进一步开发工具化合物提供了线索,以便进行更深入的研究,以了解 ERK5 信号传导如何影响癌症和其他疾病。
生物活性&实验参考方法
靶点
ERK5 (IC50 = 0.82 μM); ERK5 MEF2D (IC50 = 3 μM)
ERK5 (IC₅₀ = 0.82 ± 0.10 μM), p38α (IC₅₀ > 120 μM)
体外研究 (In Vitro)
46 在生化实验中抑制ERK5激酶活性,IC₅₀为0.82 μM,对p38α的选择性超过146倍。
在HEK293细胞的ERK5依赖性MEF2D报告基因实验中,46 的IC₅₀为3.0 ± 1.2 μM。
46 抑制PC3前列腺癌细胞的增殖,GI₅₀为44 ± 2.8 μM。
在10 μM浓度下对456种激酶进行筛选,结果显示除ERK5外,46 仅对另外7种激酶有≥90%的抑制(DCAMKL3、JAK1、SLK、MAP3K15、TYK2、JAK2、MST2和DCAMKL1)。
表面等离子体共振(SPR)分析证实,与对照化合物XMD8-92不同,46 不结合BRD4的第一个溴结构域。
46 与ERK5激酶结构域结合的晶体结构(PDB: 5O7I)已在2.4 Å分辨率下解析,揭示了其在ATP结合位点的结合模式。
体内研究 (In Vivo)
ERK5-IN-2(化合物 46)(软骨;100 mg/kg;CD1 小鼠 7 天,CD1 裸 (nu/nu) 小鼠 10 天)具有低血红蛋白浓度和抗血管生成特性 [1]。在人类和动物的 caco-2 细胞渗透性测试中,ERK5-IN-2(静脉注射或静脉注射 10 mg/kg,持续 0.083-24 小时)显示出低内部清除率、高通量和低流出比 (ER)
在雌性CD1小鼠的Matrigel栓血管生成实验中,口服给予46(100 mg/kg,每日两次,持续7天)显著降低了栓内的血红蛋白含量(p = 0.0009),表明其抑制了bFGF驱动的血管生成。
在雌性CD1裸鼠的A2780人卵巢癌异种移植模型中,口服给予46(100 mg/kg,每日两次,持续10天)使肿瘤体积较载体对照组显著减小57%(p = 0.002)。
酶活实验
ERK5生化活性采用荧光偏振(FP)法测定。将重组ERK5/MEK5复合物(5-10 nM)与FAM标记的肽底物、ATP及系列稀释的化合物在反应缓冲液中于37°C孵育2小时。通过加入结合溶液,室温孵育2小时后测量荧光偏振来检测磷酸化产物。
p38α生化活性采用LANCE TR-FRET法测定。将全长p38α(1-3 nM)与Ulight标记的肽底物、ATP及系列稀释的化合物在反应缓冲液中于37°C孵育1小时。反应用EDTA淬灭,通过加入铕标记的抗磷酸化抗体,室温避光孵育2小时后测量TR-FRET进行检测。
细胞实验
ERK5依赖性细胞活性通过在HEK293细胞中进行双荧光素酶报告基因实验来评估。细胞共转染组成型活性MEK5(MEK5DD)、ERK5、GAL4-MEF2D融合蛋白表达载体以及GAL4驱动的荧光素酶报告基因。转染后4小时,用不同浓度化合物处理细胞。20小时后收集细胞,测量萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶活性以计算IC₅₀值。
通过测定化合物处理指定时间后的细胞活力来确定其对PC3细胞的抗增殖活性,并计算GI₅₀值。
动物实验
动物/疾病模型: 接种Matrigel的雌性CD1小鼠(8-10周龄)和携带A2780人卵巢癌异种移植瘤的雌性CD1裸鼠(nu/nu)(8-10周龄)[1]
剂量: 100 mg/kg
给药途径: 口服;每日两次;CD1小鼠连续给药7天,CD1裸鼠(nu/nu)连续给药10天
实验结果: 肿瘤体积显著缩小。

动物/疾病模型: 8-10周龄雌性CD1小鼠[1]
剂量: 10 mg/kg
给药途径: 静脉注射或口服;0.083-24小时
实验结果: 终末血浆半衰期为38分钟,血浆清除率为27 mL/min/kg,口服生物利用度为68%。
在Matrigel胶塞血管生成试验中,将含有bFGF(500 ng/mL)的500 μL Matrigel胶皮下注射到8-10周龄的雌性CD1小鼠体内。 24小时后,将小鼠随机分为三组,分别接受载体、XMD8-92(50 mg/kg,腹腔注射,每日两次)或46(100 mg/kg,口服,每日两次)治疗,疗程7天。第7天,切取栓塞组织,速冻后,采用比色法定量分析血红蛋白含量。
对于A2780异种移植瘤模型,将A2780细胞皮下接种于8-10周龄的雌性CD1裸鼠。7天后,当肿瘤平均体积达到72 mm³时,将小鼠随机分为三组,分别接受载体、XMD8-92(50 mg/kg,腹腔注射,每日两次)或46(100 mg/kg,口服,每日两次)治疗,疗程10天。定期使用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测体重。
在药代动力学研究中,8-10周龄的雌性CD1小鼠单次静脉注射或口服给予46(10 mg/kg)。在终末麻醉下,通过心脏穿刺在多个时间点采集血液。分离血浆,并通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)测定药物浓度。
药代性质 (ADME/PK)
46在人肝微粒体和鼠肝微粒体中均表现出较低的固有清除率(HLM Clᵢₙₜ < 5 μL/min/mg 蛋白;MLM Clᵢₙₜ = 26 μL/min/mg 蛋白)。
在 Caco-2 细胞渗透性试验中,46显示出较高的表观渗透性(Pₐₚₚ > 10 × 10⁻⁶ cm/s)和较低的外排比(0.82)。
通过浊度法测定,46的热力学溶解度估计为 >100 μM。
46在小鼠体内的血浆蛋白结合率为中等(fᵤ = 0.06)。
在小鼠体内,单次静脉注射 10 mg/kg 后,46的终末血浆半衰期为半衰期 (T₁/₂) 为 38 分钟,血浆清除率 (CL) 为 27 mL/min/kg,分布容积 (Vd) 为 1.2 L/kg。
单次口服 10 mg/kg 后,46在 15 分钟 (Tₘₐₓ) 时达到最大血浆浓度 (Cₘₐₓ) 为 6 μM,曲线下面积 (AUC) 为 254 μg/mL·min,口服生物利用度 (F) 为 68%。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在A2780异种移植研究中未观察到明显的毒性。46治疗组的最低体重为初始体重的99%,而对照组为96%,XMD8-92组为98%。
46对四种细胞色素P450同工酶(2C19、2C9、2D6、3A4)的IC₅₀ > 5 μM,表明其CYP抑制潜力较低。
参考文献

[1]. Identification of a novel orally bioavailable ERK5 inhibitor with selectivity over p38α and BRD4. Eur J Med Chem. 2019 May 25;178:530-543.

其他信息
化合物 46 是一种吡咯-2-甲酰胺衍生物,是通过对高通量筛选先导化合物进行优化而发现的。结构优化包括截短酰胺取代基,这显著提高了其对 p38α MAP 激酶的选择性。该化合物可作为一种选择性药理学工具,用于研究 ERK5 信号通路在癌症和血管生成中的作用,并已证实具有良好的口服生物利用度和体内疗效。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H11BRFN3O2
分子量
388.190546274185
精确质量
387.001
CAS号
1888305-96-1
相关CAS号
1888305-96-1
PubChem CID
118959080
外观&性状
White to off-white solid
LogP
2.9
tPSA
74.8
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
479
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
ATKCERYALDNMPL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H11BrFN3O2/c18-12-4-1-5-13(19)15(12)16(23)10-7-14(21-8-10)17(24)22-11-3-2-6-20-9-11/h1-9,21H,(H,22,24)
化学名
4-(2-bromo-6-fluorobenzoyl)-N-pyridin-3-yl-1H-pyrrole-2-carboxamide
别名
ERK5-IN 2; ERK5 IN-2; ERK5-IN-2
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 78~250 mg/mL (200.9~644.0 mM)
Ethanol: ~3 mg/mL (~7.7 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.36 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.36 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.36 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5761 mL 12.8803 mL 25.7606 mL
5 mM 0.5152 mL 2.5761 mL 5.1521 mL
10 mM 0.2576 mL 1.2880 mL 2.5761 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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