Ethynylcytidine

别名: SB596168; 3 Ethynylcytidine; ECyd; TAS106; NSC 722662; TAS 106; 3CEthynylcytidine; AIDS241582; AIDS241582; 3'-ethynylcytidine; ECyd; TAS-106; NSC722662; NSC-722662
目录号: V20811 纯度: ≥98%
乙炔胞苷 (ECyD) 是一种核苷类似物,是 RNA 合成的有效抑制剂,可以抑制 RNA 聚合酶 I、II 和 II。
Ethynylcytidine CAS号: 180300-43-0
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
乙炔胞苷 (ECyD) 是一种核苷类似物,是 RNA 合成的强效抑制剂,可抑制 RNA 聚合酶 I、II 和 III。乙炔胞苷在多种癌症模型中均显示出显著的抗肿瘤作用。乙炔胞苷是一种点击化学试剂。它含有炔基,可与含有叠氮基的化合物发生 CuAAc 催化的叠氮-炔环加成反应。乙炔胞苷(也称为 TAS-106)是一种核苷类似物,可作为 RNA 合成的强效抑制剂。它是胞苷的类似物,在 5 位连接一个乙炔基。乙炔胞苷在细胞内磷酸化为活性三磷酸形式,从而抑制 RNA 聚合酶,导致 RNA 合成受阻并诱导细胞凋亡。该化合物已被研究作为抗癌药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
Ethynylcytidine targets RNA polymerase, the enzyme responsible for RNA synthesis. After intracellular phosphorylation to its active triphosphate form, Ethynylcytidine inhibits RNA polymerase activity, blocking the synthesis of RNA. This leads to the inhibition of protein synthesis and induction of apoptosis in cancer cells. The compound shows selectivity for cancer cells over normal cells.
体外研究 (In Vitro)
在暴露4小时、24小时和72小时后,胞苷乙炔对五种人类癌症的IC50值分别为0.114至1.032 μM、0.015至0.067 μM和0.008至0.058 μM。这些结果表明,胞苷乙炔的细胞毒性随暴露时间的延长而增强。在24小时暴露时间下,胞苷乙炔对五种人类癌症均表现出足够强的细胞毒性,且24小时和72小时暴露时间下的IC50值差异不显著。乙炔基胞苷即使在处理四小时后仍表现出强烈的细胞毒性,亚微摩尔剂量下,五种人类恶性肿瘤中有四种的IC50值证实了这一点[1]。体外实验表明,乙炔基胞苷是一种强效的RNA合成抑制剂。它在细胞内被磷酸化为活性三磷酸形式,从而抑制RNA聚合酶。该化合物对多种癌细胞系表现出抗增殖活性。乙炔基胞苷通过抑制RNA和蛋白质合成诱导癌细胞凋亡。抗增殖活性的具体IC50值可通过基于细胞的检测方法获得。
体内研究 (In Vivo)
在第15天左右,OCUM-2MD3和LX-1异种移植瘤的肿瘤生长抑制率(IR)显示,在最低毒性剂量的胞嘧啶乙炔基(TAS-106)下,肿瘤消退率达到90%或更高,且在三种治疗方案中均表现出显著的抗肿瘤作用。具体而言,每周一次给予6 mg/kg胞嘧啶乙炔基治疗,LX-1肿瘤的内部衰减率(IR)达到98%。虽然每周一次的胞嘧啶乙炔基治疗的IR低于60%,抗肿瘤作用非常弱,但每周三次或五次的治疗具有有效的抗肿瘤作用,IR约为85%[1]。
在体内,乙炔基胞嘧啶已在临床前和临床研究中被研究作为一种抗癌药物。该化合物已在多种异种移植瘤模型中显示出抗肿瘤疗效。乙炔胞苷的作用机制涉及抑制RNA合成,因此对快速增殖的肿瘤细胞有效。该化合物已在治疗实体瘤的临床试验中进行评估。
酶活实验
乙炔胞苷的体外酶活性测定包括测量其磷酸化为活性三磷酸形式后对RNA聚合酶活性的抑制作用。将RNA聚合酶与不同浓度的乙炔胞苷三磷酸和含有放射性标记核苷酸的DNA模板一起孵育。通过闪烁计数法测定RNA合成。RNA聚合酶抑制的IC50值由剂量-反应曲线确定。
细胞实验
乙炔胞苷的体外细胞活性检测包括用不同浓度的乙炔胞苷处理癌细胞系。该化合物在细胞内被磷酸化为活性三磷酸形式。通过测量放射性标记尿苷的掺入量来评估RNA合成。细胞增殖采用MTT法或克隆形成实验进行评估。细胞凋亡通过流式细胞术,使用Annexin V/PI染色进行检测。
动物实验
乙炔胞苷的体内动物实验通常采用人源肿瘤小鼠异种移植模型。荷瘤小鼠通过静脉或口服途径给予不同剂量的乙炔胞苷。定期测量肿瘤体积。评估肿瘤组织中RNA合成抑制和细胞凋亡情况。通过比较治疗组和对照组肿瘤生长延迟情况来评价该化合物的抗肿瘤疗效。
药代性质 (ADME/PK)
乙炔胞苷是一种核苷类似物,分子量为267.24 (C11H13N3O5)。它通过静脉注射给药,并在细胞内磷酸化生成其活性三磷酸形式。该化合物主要经肾脏排泄清除。临床药理学研究可提供包括半衰期、分布容积和清除率在内的具体药代动力学参数。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
乙炔胞苷已在临床试验中评估其治疗实体瘤的疗效。作为一种RNA合成抑制剂,其潜在不良反应可能包括骨髓抑制、胃肠道毒性和肝毒性。该化合物对癌细胞的选择性可能降低某些毒性。完整的毒理学数据,包括急性毒性、重复给药毒性和遗传毒性研究,均可从该化合物的临床开发项目中获取。
参考文献

[1]. Antitumor activity and pharmacokinetics of TAS-106, 1-(3-C-ethynyl-beta-D-ribo-pentofuranosyl)cytosine. Jpn J Cancer Res. 2001 Mar;92(3):343-51.

[2]. TAS-106: preclinical, clinical and beyond. Oncology. 2013;85(6):356-363.

[3]. Phase I and pharmacokinetic study of 3'-C-ethynylcytidine (TAS-106), an inhibitor of RNA polymerase I, II and III,in patients with advanced solid malignancies. Invest New Drugs. 2012;30(1):316-326.

其他信息
3'-C-乙炔基胞苷是一种嘧啶核苷。TAS-106 是一种新型核苷类抗代谢物。在携带人源肿瘤的裸鼠模型中,TAS-106 显示出强大的抗肿瘤活性,且无严重毒性。3'-C-乙炔基胞苷是一种合成的胞苷核苷,含有共价连接的乙炔基,具有潜在的抗肿瘤和放射增敏活性。在肿瘤细胞中,3'-C-乙炔基胞苷代谢为乙炔基胞苷三磷酸 (ECTP),后者通过抑制 RNA 聚合酶 I、II 和 III 来竞争性抑制 RNA 合成;随后,RNase L 被激活,最终导致细胞凋亡。 RNase L 是一种强效的抗病毒和抗增殖内切核糖核酸酶,可切割单链 RNA,导致 28S rRNA 片段化并激活 Janus 激酶 (JAK),JAK 是一种线粒体依赖性细胞凋亡信号分子。药物适应症:已研究用于治疗实体瘤和癌症/肿瘤(未具体说明)。作用机制:3'-C-乙炔基胞苷在肿瘤细胞中代谢为乙炔基胞苷三磷酸 (ECTP)。ECTP 通过竞争性抑制 RNA 聚合酶 I、II 和 III 来抑制 RNA 合成;随后,RNase L 被激活,导致细胞凋亡。 RNase L 是一种强效的抗病毒和抗增殖内切核糖核酸酶,它能切割单链 RNA,导致 28S rRNA 片段化并激活 Janus 激酶 (JAK),JAK 是一种线粒体依赖性细胞凋亡信号分子。乙炔胞苷 (CAS#: 180300-43-0) 是一种核苷类似物,可作为强效的 RNA 合成抑制剂,也称为 TAS-106。它在细胞内磷酸化为活性三磷酸形式,抑制 RNA 聚合酶,从而抑制 RNA 合成并诱导细胞凋亡。乙炔胞苷已在临床前和临床研究中被研究作为抗癌药物。该化合物尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C11H13N3O5
分子量
267.23802
精确质量
267.086
元素分析
C, 49.44; H, 4.90; N, 15.72; O, 29.93
CAS号
180300-43-0
PubChem CID
176885
外观&性状
White to yellow solid powder
密度
1.61g/cm3
沸点
536.4ºC at 760 mmHg
闪点
278.2ºC
蒸汽压
9.56E-14mmHg at 25°C
折射率
1.677
LogP
-2.7
tPSA
131.82
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
508
定义原子立体中心数目
4
SMILES
C#C[C@]1([C@H](O[C@H]([C@@H]1O)N2C=CC(=NC2=O)N)CO)O
InChi Key
JFIWEPHGRUDAJN-DYUFWOLASA-N
InChi Code
InChI=1S/C11H13N3O5/c1-2-11(18)6(5-15)19-9(8(11)16)14-4-3-7(12)13-10(14)17/h1,3-4,6,8-9,15-16,18H,5H2,(H2,12,13,17)/t6-,8+,9-,11-/m1/s1
化学名
4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-4-ethynyl-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
别名
SB596168; 3 Ethynylcytidine; ECyd; TAS106; NSC 722662; TAS 106; 3CEthynylcytidine; AIDS241582; AIDS241582; 3'-ethynylcytidine; ECyd; TAS-106; NSC722662; NSC-722662
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~250 mg/mL (~935.49 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.78 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.78 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.78 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.7420 mL 18.7098 mL 37.4195 mL
5 mM 0.7484 mL 3.7420 mL 7.4839 mL
10 mM 0.3742 mL 1.8710 mL 3.7420 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
Phase I Study of TAS-106 in Combo With Carboplatin
CTID: NCT00752011
Phase: Phase 1
Status: Completed
Date: 2012-10-18
Phase II Study of TAS-106 to Treat Head and Neck Cancer
CTID: NCT00737360
Phase: Phase 2
Status: Terminated
Date: 2012-09-05
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