FdCyd

别名: FdCyd; Ro-5-1090; NSC-48006 5-氟脱氧胞苷;2'-脱氧-5-氟胞啶;2'-Deoxy-5-fluorocytidine 2'-脱氧-5-氟胞啶;2-脱氧-5-氟胞苷;5-氟-2'--脱氧胞苷;5-氟-2'-脱氧-胞苷;5-氟-2-脱氧胞苷;5-氟-2-脱氧-胞苷
目录号: V20949 纯度: ≥98%
5-Fluoro-2'-deoxycytidine 是一种氟嘧啶核苷类似物,是一种 DNA 甲基转移酶 (DNMT) 抑制剂。
FdCyd CAS号: 10356-76-0
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
5-氟-2'-脱氧胞苷(5-Fluoro-2'-deoxycytidine,FdCyd)是一种氟嘧啶核苷类似物,属于DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂。5-氟-2'-脱氧胞苷是强效胸苷酸合成酶抑制剂5-氟-2'-dUMP的肿瘤选择性前体。
FdCyd(5-Fluoro-2'-deoxycytidine;NSC-48006;Ro-5-1090)是一种氟嘧啶核苷类似物,可作为DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂发挥作用。它是强效胸苷酸合成酶抑制剂5-氟-2'-dUMP的肿瘤选择性前体。FdCyd的分子量为245.21,分子式为C9H12FN3O4。它已被用于治疗各种肿瘤的试验中,包括肺癌、乳腺癌、头颈癌和膀胱癌。
生物活性&实验参考方法
靶点
FdCyd acts as a DNA methyltransferase (DNMT) inhibitor. As a prodrug, it is converted into the cytotoxic drug 5-fluorouracil (5-FU) by intracellular deaminases. 5-FU is then metabolized into active metabolites, including 5-fluoro-2-deoxyuridine monophosphate (FdUMP) and 5-fluorouridine triphosphate (FUTP). FdUMP binds to and inhibits thymidylate synthase, reducing thymidine monophosphate production and depleting thymidine triphosphate, thereby inhibiting DNA synthesis and cell division. FUTP competes with uridine triphosphate for RNA incorporation, inhibiting RNA and protein synthesis.
体外研究 (In Vitro)
体外研究表明,FdCyd可抑制DNA甲基转移酶活性,从而激活沉默的抑癌基因。该化合物转化为5-氟尿嘧啶及其后续代谢产物后,可抑制DNA合成、RNA合成和细胞分裂。FdCyd的抗代谢活性已在多种癌细胞系中得到证实,支持其作为抗肿瘤药物的潜力。
体内研究 (In Vivo)
FdCyd已在多种肿瘤的体内治疗试验中进行了评估,包括肺癌、乳腺癌、头颈癌和膀胱癌。作为一种由氟化嘧啶类似物组成的抗代谢物,它具有潜在的抗肿瘤活性。该化合物目前正在进行乳腺癌和其他实体瘤的临床试验。其体内活性是通过转化为活性代谢物来抑制DNA和RNA合成而实现的。
酶活实验
FdCyd的非细胞酶活性测定包括使用纯化的重组DNMT酶评估其对DNA甲基转移酶(DNMT)活性的抑制作用。将酶与DNA底物和甲基供体(S-腺苷甲硫氨酸)在不同浓度的FdCyd存在下孵育。使用放射性标记的[³H]-SAM或荧光法测定甲基掺入DNA底物的程度。DNMT抑制的IC50值由剂量-反应曲线确定。
细胞实验
FdCyd的体外细胞实验包括用该化合物处理癌细胞系,并评估细胞活力、增殖和DNA甲基化状态。细胞用不同浓度的FdCyd处理72小时后,使用MTT或CellTiter-Glo®法检测细胞活力。通过亚硫酸氢盐测序或甲基化特异性PCR (MSP)检测沉默基因的重新激活,以评估DNA甲基化的抑制情况。通过流式细胞术评估细胞凋亡和细胞周期阻滞的诱导情况。
动物实验
在小鼠异种移植人肿瘤模型中开展了FdCyd的体内动物实验。荷瘤小鼠通过腹腔注射或口服途径接受FdCyd治疗,并监测肿瘤生长抑制情况。实验终点包括肿瘤体积测量、通过亚硫酸氢盐测序评估肿瘤组织中的DNA甲基化状态,以及评估药效学标志物,例如沉默的抑癌基因的表达。这些研究还评估了该化合物的药代动力学特性和毒性。
药代性质 (ADME/PK)
FdCyd 的分子量为 245.21,分子式为 C9H12FN3O4。它是一种白色至类白色固体粉末,熔点为 196°C,密度为 1.8±0.1 g/cm³。该化合物的计算 LogP 值为 -1.61,表明其具有高亲水性。通常储存于 -20°C,可溶于 DMSO 和其他有机溶剂。纯度 ≥98%。该化合物在推荐的储存条件下稳定。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
FdCyd 是一种仅供实验室使用的研究化合物,不可用于人体治疗或诊断。在临床前和临床研究中,其在治疗剂量下通常耐受性良好。作为一种 DNA 甲基转移酶抑制剂和氟嘧啶类抗代谢药物,它可能引起与其他氟嘧啶类药物类似的副作用,包括骨髓抑制、胃肠道毒性和黏膜炎。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。
参考文献

[1]. Pharmacokinetics, metabolism, and oral bioavailability of the DNA methyltransferase inhibitor 5-fluoro-2'-deoxycytidine in mice. Clin Cancer Res. 2006 Dec 15;12(24):7483-91.

[2]. 5-Fluorocytosine in DNA is a mechanism-based inhibitor of HhaI methylase. Biochemistry. 1988 Jul 12;27(14):5204-10.

其他信息
5-氟-2'-脱氧胞苷是一种白色细粉。(NTP, 1992)
5-氟-2'-脱氧胞苷属于嘧啶类化合物,是一种有机卤化物。
5-氟-2'-脱氧胞苷已用于多种肿瘤的治疗试验,包括肺癌、乳腺癌、头颈癌和膀胱癌。
5-氟-2'-脱氧胞苷是一种由氟化嘧啶类似物组成的抗代谢物,具有潜在的抗肿瘤活性。作为一种前药,5-氟-2'-脱氧胞苷可通过细胞内脱氨酶转化为细胞毒性药物5-氟尿嘧啶(5-FU)。 5-氟尿嘧啶 (5-FU) 随后代谢为活性代谢物,包括 5-氟-2-脱氧尿苷单磷酸 (FdUMP) 和 5-氟尿苷三磷酸 (FUTP)。FdUMP 与胸苷合成酶结合并抑制其活性,从而减少胸苷单磷酸的生成,导致胸苷三磷酸耗竭。这会抑制 DNA 合成和细胞分裂。FUTP 与尿苷三磷酸竞争 RNA 掺入,从而抑制 RNA 和蛋白质的合成。其他氟尿嘧啶代谢物也会掺入 DNA 和 RNA,进一步阻碍细胞生长。
FdCyd(5-氟-2'-脱氧胞苷;CAS 10356-76-0)是一种氟嘧啶核苷类似物和 DNA 甲基转移酶 (DNMT) 抑制剂。它是一种肿瘤选择性前药,可转化为5-氟尿嘧啶和活性代谢物,这些代谢物可抑制DNA和RNA的合成。FdCyd已用于多种肿瘤的治疗试验,包括肺癌、乳腺癌、头颈癌和膀胱癌。目前,它正在进行乳腺癌和其他实体瘤的临床试验。该化合物可从多家商业供应商处获得,用于研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H12FN3O4
分子量
245.21
精确质量
245.081
CAS号
10356-76-0
PubChem CID
515328
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.8±0.1 g/cm3
沸点
465.0±55.0 °C at 760 mmHg
熔点
196 °C
闪点
235.0±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.6 mmHg at 25°C
折射率
1.697
LogP
-1.61
tPSA
110.6
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
17
分子复杂度/Complexity
398
定义原子立体中心数目
3
SMILES
C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=C(C(=NC2=O)N)F)CO)O
InChi Key
IDYKCXHJJGMAEV-RRKCRQDMSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H12FN3O4/c10-4-2-13(9(16)12-8(4)11)7-1-5(15)6(3-14)17-7/h2,5-7,14-15H,1,3H2,(H2,11,12,16)/t5-,6+,7+/m0/s1
化学名
4-amino-5-fluoro-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
别名
FdCyd; Ro-5-1090; NSC-48006
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~203.91 mM)
H2O : ~16.67 mg/mL (~67.98 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.20 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.20 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.20 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.0781 mL 20.3907 mL 40.7814 mL
5 mM 0.8156 mL 4.0781 mL 8.1563 mL
10 mM 0.4078 mL 2.0391 mL 4.0781 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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