Divarasib (GDC-6036)

别名: GDC-6036; RG6330; GDC 6036; RG-6330; GDC6036; RG 6330
目录号: V41717 纯度: ≥98%
Divarasib (GDC-6036) 是一种口服生物可利用的选择性 KRAS G12C 抑制剂(拮抗剂),IC50 小于 0.01 μM。
Divarasib (GDC-6036) CAS号: 2417987-45-0
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
Other Sizes

Other Forms of Divarasib (GDC-6036):

  • Divarasib adipate (GDC-6036 adipate)
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产品描述
Divarasib (GDC-6036) 是一种口服生物可利用的选择性 KRAS G12C 抑制剂(拮抗剂),IC50 小于 0.01 μM。 Divarasib 与 KRAS G12C 的开关 II (SW-II) 口袋共价结合,并不可逆地将其锁定在非活性 GDP 结合状态。
生物活性&实验参考方法
靶点
KRAS G12C (IC50 <0.01 μM)
体外研究 (In Vitro)
divarasib(化合物 17a)在 K-Ras G12C 烷基化 HCC1171 细胞中的 EC50 为 2 nM [2]。
体内研究 (In Vivo)
Divarasib(10-100 mg/kg/天;口服 7 天)可降低游离 KRAS G12C 的量 [1]。
酶活实验
GDC-6036结合KRAS G12C[1]的制备
通过烷基化反应制备了与GDC-6036结合的KRAS G12C蛋白。简言之,将5μM未标记和同位素标记的(Arg/Lys 13C15N)KRAS G12C蛋白与20μM GDC-6036在20mM HEPE、pH 8、150mM NaCl、5mM MgCl2、1mM EDTA、1mM TCEP和5mM GDP中反应。在室温下孵育过夜后,将未标记和标记的KRAS G12C转移到Amicon 3kDa离心过滤器中,用于缓冲液交换至10mM HEPES、150mM NaCl、pH 7.4。如前所述,使用Q Exactive Plus质谱仪上的高分辨率精确质谱法,使用10μL等分试样评估GDC-6036烷基化的程度。[1]

实验中的尖峰[1]
将游离和GDC-6036结合的KRAS G12C蛋白掺入空白肿瘤组织裂解物的20μg总蛋白等分试样中(足以进行5次重复运行),并进行两次连续稀释。对于异种移植物样品分析,空白组织裂解物由携带KRAS的非G12C突变形式(KRAS G12S)的A549小鼠异种移植物模型制备。对于人类肿瘤样品分析,从不携带KRAS G12C突变的切除的人类肿瘤样品制备空白组织裂解物。通过在空白组织裂解物中以4:1、1:1和1:4的比例混合游离和GDC-6036结合的KRAS G12C标准材料,制备质量控制(QC)样品,总KRAS G12C蛋白浓度恒定为5fmol/μg。将同位素标记的(Arg/Lys 13C15N)游离和GDC-6036结合的KRAS G12C以125fmol的固定量掺入每个样品中。
细胞实验
核心针活检采集与保存[1]
在最后一剂GDC-6036后2、8或24小时,使用18号活检针收集肿瘤活检。样品要么在冷冻小瓶中快速冷冻,要么嵌入最佳切割温度(OCT)化合物中,并在−80°C下储存,直到进行进一步分析。[1]
人类NSCLC肿瘤样本[1]
从BioIVT获得三份新鲜冷冻人NSCLC肿瘤样本,包括两份KRAS G12C阳性样本和一份KRAS G1 2C阴性样本。所有样品均储存在−80°C温度下,直至进行进一步分析。[1]
冷冻肿瘤活检的样品制备[1]
将冷冻的肿瘤活检转移到预先填充有1.4mm陶瓷珠和200μL冰冷的皮尔斯裂解缓冲液的0.5mL聚丙烯管中,该缓冲液补充有cOmplete EDTA游离蛋白酶抑制剂鸡尾酒片,然后使用Bead Ruptor 24冷冻冷却装置进行均化。将组织裂解物转移到1.5 mL蛋白质-LoBind管中,并在4°C下以17000 g离心5分钟。使用Pierce BCA蛋白质测定试剂盒测定上清液的蛋白质浓度。
动物实验
动物/疾病模型:雌性 CB-17 SCID(近交系)小鼠(20-21 周龄;24.1 克)人 NSCLC NCI-H2030.X1.1 细胞 [1]
剂量:10、25 或 100 mg/kg
给药途径:每日一次 (QD) 灌胃给药,持续 7 天(载体:0.5% 甲基纤维素)
实验结果:游离 KRAS G12C 与内标的比值降低。在所有时间点(末次给药后 2、8 和 24 小时)均观察到剂量依赖性靶点结合,在最高评估剂量 100 mg/kg 下,KRAS G12C 结合率 >90%。

雌性 CB-17 SCID(近交系)小鼠,20-21 周龄,平均体重 24.1 g,购自 Charles River 实验室。人非小细胞肺癌 (NSCLC) NCI-H2030.X1.1 细胞在体外培养,于对数生长期收获,并以 1:1 的比例重悬于含 Matrigel(BD Biosciences)的 Hank's 平衡盐溶液中。然后将细胞皮下注射到 CB-17 SCID(近交系)小鼠的右侧胸腔。每只小鼠注射 10 × 10⁶ 个细胞,注射体积为 100 μL。对肿瘤进行监测,直至其平均体积达到 238–524 mm³。根据肿瘤体积,将小鼠分为 10 组,每组 4 只小鼠。在开始给予 GDC-6036 时,所有 10 组小鼠的平均肿瘤体积为 363 mm³。小鼠分别接受赋形剂(100 μL 0.5% 甲基纤维素)、10、25 或 100 mg/kg 的 GDC-6036。赋形剂和 GDC-6036 均通过灌胃法(PO)给药,每日一次,连续 7 天,每次灌胃体积为 100 μL。在分组结束时(第 0 天)和给药 1 周后(第 7 天)测量肿瘤体积,并使用 GraphPad Prism 软件绘制肿瘤体积的百分比变化图。在第 7 天采集肿瘤组织样本。
参考文献

[1]. Assessment of KRAS G12C Target Engagement by a Covalent Inhibitor in Tumor Biopsies Using an Ultra-Sensitive Immunoaffinity 2D-LC-MS/MS Approach. Anal Chem. 2022 Sep 20;94(37):12927-12933.

[2]. Fused ring compounds. WO2020097537A2.

其他信息
Divarasib 是一种口服的 KRAS 致癌突变 G12C 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。口服后,Divarasib 可选择性地靶向 KRAS G12C 突变体,并抑制 KRAS G12C 突变体依赖的信号传导。KRAS 是 RAS 癌基因家族的成员,在细胞信号传导、分裂和分化中发挥着重要作用。KRAS 突变可诱导组成型信号转导,进而导致肿瘤细胞的生长、增殖、侵袭和转移。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H32CLF4N7O2
分子量
622.06
精确质量
621.22
元素分析
C, 55.99; H, 5.19; Cl, 5.70; F, 12.22; N, 15.76; O, 5.14
CAS号
2417987-45-0
相关CAS号
2762240-36-6 (adipate); 2417987-45-0 (active atropisomer);2417917-17-8 (atropisomers)
PubChem CID
146624881
外观&性状
White to light yellow solid
LogP
5.4
tPSA
101Ų
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
43
分子复杂度/Complexity
997
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@H]1CN(CCN1C2=NC(=NC3=C(C(=C(C=C32)Cl)C4=C(C(=CC(=N4)N)C)C(F)(F)F)F)OC[C@@H]5CCCN5C)C(=O)C=C
InChi Key
ZRBPIAWWRPFDPY-IRXDYDNUSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H32ClF4N7O2/c1-5-21(42)40-9-10-41(16(3)13-40)27-18-12-19(30)22(26-23(29(32,33)34)15(2)11-20(35)36-26)24(31)25(18)37-28(38-27)43-14-17-7-6-8-39(17)4/h5,11-12,16-17H,1,6-10,13-14H2,2-4H3,(H2,35,36)/t16-,17-/m0/s1
化学名
1-((S)-4-(7-((R)-6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)-6-chloro-8-fluoro-2-(((S)-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)quinazolin-4-yl)-3-methylpiperazin-1-yl)prop-2-en-1-one
别名
GDC-6036; RG6330; GDC 6036; RG-6330; GDC6036; RG 6330
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~160.76 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (4.02 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6076 mL 8.0378 mL 16.0756 mL
5 mM 0.3215 mL 1.6076 mL 3.2151 mL
10 mM 0.1608 mL 0.8038 mL 1.6076 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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