Divarasib (GDC-6036)

别名: GDC-6036; RG6330; GDC 6036; RG-6330; GDC6036; RG 6330
目录号: V41717 纯度: ≥98%
Divarasib (GDC-6036) 是一种口服生物可利用的选择性 KRAS G12C 抑制剂(拮抗剂),IC50 小于 0.01 μM。
Divarasib (GDC-6036) CAS号: 2417987-45-0
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
Other Sizes

Other Forms of Divarasib (GDC-6036):

  • Divarasib adipate (GDC-6036 adipate)
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产品描述
Divarasib (GDC-6036) 是一种口服生物利用度高的选择性 KRAS G12C 抑制剂(拮抗剂),IC50 <0.01 μM。Divarasib 与 KRAS G12C 的开关 II (SW-II) 口袋共价结合,并将其不可逆地锁定在非活性 GDP 结合状态。
Divarasib(GDC-6036,RG6330)是一种口服生物利用度高、高效、选择性强且与KRAS G12C共价结合的抑制剂。当KRAS G12C蛋白处于非活性GDP结合状态时,Divarasib可与KRAS G12C的II型开关口袋不可逆结合,从而阻断GTP的结合和激活。目前,Divarasib正处于临床开发阶段,用于治疗携带KRAS G12C突变的实体瘤,包括非小细胞肺癌和结直肠癌。
生物活性&实验参考方法
靶点
KRAS G12C (IC50 <0.01 μM)
KRAS G12C mutant. Divarasib specifically targets the mutant KRAS protein with a glycine-to-cysteine substitution at position 12 (G12C). The compound covalently binds to the switch II (SW-II) pocket of KRAS G12C, forming an irreversible bond with the mutant cysteine residue (Cys12). This binding locks KRAS in the inactive GDP-bound conformation, preventing its activation to the GTP-bound state and thereby blocking downstream signaling pathways including MAPK (RAF-MEK-ERK) and PI3K-AKT, which are essential for cancer cell proliferation and survival.
体外研究 (In Vitro)
divarasib(化合物 17a)在 K-Ras G12C 烷基化的 HCC1171 细胞中的 EC50 为 2 nM [2]。
在无细胞生化分析中,Divarasib 可直接结合并抑制 KRAS G12C。其对 KRAS G12C 的抑制 IC50 值小于 0.01 uM (10 nM)。在均相时间分辨荧光 (HTRF) 分析中,Divarasib 的 IC50 值为 2.9 pM。该化合物与 KRAS G12C 的开关 II 口袋共价结合。其结合特异性针对 GDP 结合形式的 KRAS,不与野生型 KRAS 或其他 KRAS 突变体结合。该结合机制不可逆,其特征在于与 Cys12 形成共价加合物。
体内研究 (In Vivo)
Divarasib(10-100 mg/kg/天;口服,持续 7 天)可降低游离 KRAS G12C 的含量 [1]。
Divarasib在体外能有效抑制KRAS G12C突变型癌细胞的增殖。在NCI-H358肺癌细胞(KRAS G12C突变型)中,Divarasib通过抑制ERK磷酸化(p-ERK)来抑制KRAS依赖性信号通路,其IC50值在低纳摩尔范围内。该化合物对NCI-HCC1171细胞(KRAS G12C突变型)烷基化的IC50值为0.32 nM。Divarasib能有效阻断KRAS突变型癌细胞中MAPK通路的激活,并诱导G1期细胞周期阻滞和细胞凋亡。相反,在KRAS野生型细胞或其他KRAS突变细胞中未观察到明显的生长抑制。
酶活实验
GDC-6036结合的KRAS G12C的制备[1]
通过烷基化反应制备GDC-6036结合的KRAS G12C蛋白。简而言之,将5 μM的未标记和同位素标记(Arg/Lys 13C15N)的KRAS G12C蛋白与20 μM的GDC-6036在20 mM HEPE(pH 8)、150 mM NaCl、5 mM MgCl2、1 mM EDTA、1 mM TCEP和5 mM GDP的缓冲液中反应。室温孵育过夜后,将未标记和标记的KRAS G12C转移至Amicon 3 kDa超滤离心管中进行缓冲液交换,最终得到10 mM HEPES、150 mM NaCl、pH 7.4的缓冲液。取10 μL样品,使用Q Exactive Plus质谱仪,采用高分辨率精确质量质谱法评估GDC-6036烷基化的程度,具体方法如前所述。[1]

外源蛋白添加实验[1]
将游离的和GDC-6036结合的KRAS G12C蛋白以两倍系列稀释的方式加入到20 μg总蛋白(足以进行5次重复实验)的空白肿瘤组织裂解液中。对于异种移植瘤样本分析,空白组织裂解液取自携带非G12C突变型KRAS(KRAS G12S)的A549小鼠异种移植瘤模型。对于人肿瘤样本分析,空白组织裂解液取自不携带KRAS G12C突变的切除人肿瘤样本。质量控制 (QC) 样品制备方法如下:将游离态和 GDC-6036 结合的 KRAS G12C 标准品按 4:1、1:1 和 1:4 的比例混合于空白组织裂解液中,使 KRAS G12C 总蛋白浓度恒定为 5 fmol/μg。在每个样品中加入固定量的同位素标记(Arg/Lys 13C15N)的游离态和 GDC-6036 结合的 KRAS G12C,总量为 125 fmol。
采用生化烷基化试验评估 Divarasib 对 KRAS G12C 的抑制作用。将纯化的 KRAS G12C 蛋白(GDP 结合型)与不同浓度的 Divarasib(0.001-1000 nM)孵育 1-4 小时。终止反应并使蛋白变性。通过质谱联用(LC-MS)检测 Cys12 的烷基化情况,以定量抑制剂修饰的蛋白百分比。或者,使用标记的抗 KRAS 抗体和抑制剂的 HTRF 试验可以定量结合情况。烷基化的 IC50 定义为 50% KRAS G12C 发生共价修饰时的浓度。
细胞实验
核心针穿刺活检的采集和保存[1]
在最后一次给予GDC-6036后2、8或24小时,使用18号活检针采集肿瘤活检样本。样本要么在冷冻管中速冻,要么包埋在最佳切割温度(OCT)化合物中,并在−80 °C下保存,直至进一步分析。[1]
人非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤样本[1]
从BioIVT公司获得了三个新鲜冷冻的人NSCLC肿瘤样本,包括两个KRAS G12C阳性样本和一个KRAS G12C阴性样本。所有样本均储存于−80 °C直至进一步分析。[1]
冷冻肿瘤活检样本制备[1]
将冷冻肿瘤活检样本转移至预先装有1.4 mm陶瓷珠和200 μL冰冷Pierce裂解缓冲液(含cOmplete无EDTA蛋白酶抑制剂混合片剂)的0.5 mL聚丙烯管中,然后使用Bead Ruptor 24低温冷却装置进行匀浆。将组织裂解液转移至1.5 mL Protein LoBind管中,并在4 °C下以17,000 g离心5分钟。使用Pierce BCA蛋白测定试剂盒测定上清液的蛋白浓度。
基于细胞的检测采用NCI-H358或其他KRAS G12C突变型癌细胞系。将细胞接种于96孔板中,并用浓度为0.001-100 uM的Divarasib处理48-96小时。使用CellTiter-Glo(ATP定量)或MTT法检测细胞活力。根据剂量反应曲线计算生长抑制的EC50值。对于p-ERK抑制,将细胞用Divarasib处理2-6小时后裂解,并通过Western blotting、AlphaLISA或HTRF检测p-ERK水平。确定通路抑制的IC50值。通过流式细胞术检测cleaved caspase-3或Annexin V来检测细胞凋亡。
动物实验
动物/疾病模型:雌性 CB-17 SCID(近交系)小鼠(20-21 周龄;24.1 克)人 NSCLC NCI-H2030.X1.1 细胞 [1]
剂量:10、25 或 100 mg/kg
给药途径:每日一次 (QD) 灌胃给药,持续 7 天(载体:0.5% 甲基纤维素)
实验结果:游离 KRAS G12C 与内标的比值降低。在所有时间点(末次给药后 2、8 和 24 小时)均观察到剂量依赖性靶点结合,在最高评估剂量 100 mg/kg 下,KRAS G12C 结合率 >90%。

雌性 CB-17 SCID(近交系)小鼠,20-21 周龄,平均体重 24.1 g,购自 Charles River 实验室。人非小细胞肺癌 (NSCLC) NCI-H2030.X1.1 细胞在体外培养,于对数生长期收获,并以 1:1 的比例重悬于含 Matrigel(BD Biosciences)的 Hank's 平衡盐溶液中。然后将细胞皮下注射到 CB-17 SCID(近交系)小鼠的右侧胸腔。每只小鼠注射 10 × 10⁶ 个细胞,注射体积为 100 μL。对肿瘤进行监测,直至其平均体积达到 238–524 mm³。根据肿瘤体积,将小鼠分为 10 组,每组 4 只小鼠。在开始给予 GDC-6036 时,所有 10 组小鼠的平均肿瘤体积为 363 mm³。小鼠分别接受赋形剂(100 μL 0.5% 甲基纤维素)、10、25 或 100 mg/kg 的 GDC-6036。赋形剂和 GDC-6036 均通过灌胃法(PO)给药,每日一次,连续 7 天,每次灌胃体积为 100 μL。在分组结束时(第 0 天)和给药 1 周后(第 7 天)测量肿瘤体积,并使用 GraphPad Prism 软件绘制肿瘤体积的百分比变化图。在第 7 天采集肿瘤组织样本。
Divarasib 的体内疗效已在小鼠异种移植模型中得到评估。在 PaCa-2 胰腺癌小鼠异种移植模型(KRAS G12C 突变型)中,Divarasib 每日口服一次,剂量范围为 1 至 100 mg/kg。每周使用游标卡尺测量两次肿瘤体积。观察到显著的肿瘤生长抑制(TGI),且在高剂量下肿瘤消退。对切除肿瘤的生物标志物分析显示 p-ERK 水平呈剂量依赖性降低。在其他 KRAS G12C 突变模型(例如,NCI-H358 肺癌、MIA PaCa-2 胰腺癌、SW837 结直肠癌)中,Divarasib 每日口服一次也表现出强大的抗肿瘤活性。该化合物在有效剂量下具有良好的耐受性。
药代性质 (ADME/PK)
Divarasib 具有良好的口服生物利用度,在人体和临床前动物模型中均能被有效吸收。在人体中,其末端消除半衰期约为 17.6 ± 2.7 小时,支持每日一次给药。该化合物代谢广泛,给药后 840 小时内,约 98% 的放射性标记剂量可通过粪便(95%)和尿液(3%)排出。在临床剂量范围(50-400 mg)内,Cmax 和 AUC 均呈剂量比例增加。在 I 期临床研究中,该药物的药代动力学特征表现为中等至高的口服生物利用度、低至中等的血浆蛋白结合率以及极低的药物相互作用风险。给药后 2-4 小时内即可达到血浆峰浓度。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Divarasib 已在 I 期临床试验 (NCT04449874) 中针对携带 KRAS G12C 突变的晚期或转移性实体瘤患者进行了评估。最常见的不良事件(所有级别)包括恶心、腹泻、呕吐、疲乏和丙氨酸氨基转移酶升高。部分患者会出现 ≥3 级的治疗相关不良事件,主要表现为胃肠道毒性和肝毒性。总体安全性可通过支持治疗进行控制。动物临床前毒性研究显示,Divarasib 可引起可逆的、剂量依赖性的胃肠道和肝脏毒性。目前尚未发现其他意外毒性。与其他 KRAS G12C 抑制剂一样,Divarasib 也可能引起皮疹和其他皮肤反应。
参考文献

[1]. Assessment of KRAS G12C Target Engagement by a Covalent Inhibitor in Tumor Biopsies Using an Ultra-Sensitive Immunoaffinity 2D-LC-MS/MS Approach. Anal Chem. 2022 Sep 20;94(37):12927-12933.

[2]. Fused ring compounds. WO2020097537A2.

其他信息
Divarasib是一种口服的KRAS致癌突变G12C抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。口服后,Divarasib选择性地靶向KRAS G12C突变体,并抑制KRAS G12C突变体依赖的信号传导。KRAS是RAS癌基因家族的成员,在细胞信号传导、分裂和分化中发挥着关键作用。KRAS突变可诱导组成型信号转导,导致肿瘤细胞生长、增殖、侵袭和转移。
Divarasib (GDC-6036) 由基因泰克/罗氏公司开发。截至 2025 年,该化合物正处于针对 KRAS G12C 突变型实体瘤(包括非小细胞肺癌 (NSCLC)、结直肠癌 (CRC) 和其他实体瘤)的临床试验(I/II 期)。I 期研究的初步临床活性数据显示,该化合物在 NSCLC 和 CRC 患者中具有客观缓解率 (ORR)。该化合物尚未获得任何监管机构的批准。临床前研究表明,与前几代 KRAS G12C 抑制剂相比,Divarasib 具有更高的效力和选择性。其化学结构属于喹唑啉类化合物。化合物名称“Divarasib”是其国际非专利名称 (INN)。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H32CLF4N7O2
分子量
622.06
精确质量
621.22
元素分析
C, 55.99; H, 5.19; Cl, 5.70; F, 12.22; N, 15.76; O, 5.14
CAS号
2417987-45-0
相关CAS号
2762240-36-6 (adipate); 2417987-45-0 (active atropisomer);2417917-17-8 (atropisomers)
PubChem CID
146624881
外观&性状
White to light yellow solid
LogP
5.4
tPSA
101Ų
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
43
分子复杂度/Complexity
997
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@H]1CN(CCN1C2=NC(=NC3=C(C(=C(C=C32)Cl)C4=C(C(=CC(=N4)N)C)C(F)(F)F)F)OC[C@@H]5CCCN5C)C(=O)C=C
InChi Key
ZRBPIAWWRPFDPY-IRXDYDNUSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H32ClF4N7O2/c1-5-21(42)40-9-10-41(16(3)13-40)27-18-12-19(30)22(26-23(29(32,33)34)15(2)11-20(35)36-26)24(31)25(18)37-28(38-27)43-14-17-7-6-8-39(17)4/h5,11-12,16-17H,1,6-10,13-14H2,2-4H3,(H2,35,36)/t16-,17-/m0/s1
化学名
1-((S)-4-(7-((R)-6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)-6-chloro-8-fluoro-2-(((S)-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)quinazolin-4-yl)-3-methylpiperazin-1-yl)prop-2-en-1-one
别名
GDC-6036; RG6330; GDC 6036; RG-6330; GDC6036; RG 6330
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~160.76 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (4.02 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6076 mL 8.0378 mL 16.0756 mL
5 mM 0.3215 mL 1.6076 mL 3.2151 mL
10 mM 0.1608 mL 0.8038 mL 1.6076 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们