GlyRS-IN-1

目录号: V33804 纯度: ≥98%
GlyRS-IN-1 是一种甘氨酰-tRNA 合酶 (GlyRS) 抑制剂。
GlyRS-IN-1 CAS号: 112921-11-6
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
GlyRS-IN-1 是一种甘氨酰-tRNA 合成酶 (GlyRS) 抑制剂。更多详情,请查阅专利 WO 2017066459 A1。GlyRS-IN-1 还能抑制细菌生长。
GlyRS-IN-1(CAS 112921-11-6),又名5'-O-(甘氨酰磺酰基)腺苷,是一种强效的甘氨酰-tRNA合成酶(GlyRS)抑制剂。它是一种小分子化合物,可干扰氨酰-tRNA的生物合成,从而抑制蛋白质合成。此外,它还具有抗菌活性,可通过抑制细菌生长发挥作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
GlyRS-IN-1 targets glycyl-tRNA synthetase (GlyRS), an essential enzyme in protein synthesis that catalyzes the attachment of glycine to its cognate tRNA. By inhibiting GlyRS, the compound disrupts translation and protein production in both bacterial and eukaryotic systems, making it a valuable tool for studying translation mechanisms and antibacterial target validation.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,GlyRS-IN-1 可抑制甘氨酰-tRNA 合成酶的活性,从而抑制细菌生长。它可作为研究氨酰-tRNA 合成酶在疾病机制中作用的化学探针。该化合物已用于无细胞和基于细胞的实验,以验证 GlyRS 作为抗菌靶点的有效性。
体内研究 (In Vivo)
GlyRS-IN-1 的体内活性数据有限,因为该化合物主要用作体外研究的工具。其抗菌活性表明其在细菌感染动物模型中具有潜在的应用价值,但现有文献中尚未广泛报道具体的体内疗效数据。
酶活实验
使用纯化的重组GlyRS酶进行GlyRS-IN-1的体外酶活性测定。将该化合物与酶、ATP、甘氨酸和tRNAGly在反应缓冲液中孵育。通过比色法或发光法检测甘氨酰-tRNA的生成或焦磷酸(PPi)的释放来测定GlyRS活性。IC50值由剂量反应曲线确定。
细胞实验
使用细菌培养物进行 GlyRS-IN-1 的细胞活性测定,以评估其生长抑制作用。最低抑菌浓度 (MIC) 的测定采用肉汤微量稀释法,并遵循标准指南。此外,还对真核细胞系进行了该化合物的测试,以评估其选择性和细胞毒性。将细胞用系列稀释液 (0.1-100 μM) 处理 24-48 小时,并通过 MTT 或刃天青法检测细胞活力。
动物实验
目前文献中关于GlyRS-IN-1的体内动物研究数据尚不充分。作为一种抗菌研究化合物,它有望在小鼠细菌感染模型中进行评估,可通过腹腔注射或口服途径给药。然而,具体的实验方案和疗效数据尚未见报道。
药代性质 (ADME/PK)
GlyRS-IN-1 的药代动力学性质尚未得到充分表征。该化合物分子量为 403.37,可溶于 DMSO(100 mg/mL)。它通常以粉末形式储存于 -20℃,并配制成体外实验用溶液。文献中尚未报道其具体的药代动力学参数。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
GlyRS-IN-1 的毒理学数据有限。作为一种靶向蛋白质合成的研究化合物,标准的安全性评估应包括在哺乳动物细胞系中评估其细胞毒性以评价其选择性。现有文献中尚未报道其具有显著毒性。该化合物仅供研究使用。
参考文献

[1]. INHIBITION OF NEDDYLATION USING GLYCYL-tRNA SYNTHETASE INHIBITORS. WO 2017066459 A1.

其他信息
GlyRS-IN-1 是一种研究用化合物,公开于专利 WO 2017066459 A1 中。它可用作化学探针,用于研究氨酰-tRNA 合成酶在翻译机制中的作用、抗菌靶点验证以及开发针对耐药菌的新型抗生素。该化合物尚未获准用于临床治疗。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C12H17N7O7S
分子量
403.371080160141
精确质量
403.091
CAS号
112921-11-6
PubChem CID
9909127
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
2.1±0.1 g/cm3
折射率
1.865
LogP
-1.69
tPSA
226
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
647
定义原子立体中心数目
4
SMILES
C1=NC(=C2C(=N1)N(C=N2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COS(=O)(=O)NC(=O)CN)O)O)N
InChi Key
AMWPZASLDLLQFT-JJNLEZRASA-N
InChi Code
InChI=1S/C12H17N7O7S/c13-1-6(20)18-27(23,24)25-2-5-8(21)9(22)12(26-5)19-4-17-7-10(14)15-3-16-11(7)19/h3-5,8-9,12,21-22H,1-2,13H2,(H,18,20)(H2,14,15,16)/t5-,8-,9-,12-/m1/s1
化学名
[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl N-(2-aminoacetyl)sulfamate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~247.91 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (4.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 16.7 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (4.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 16.7mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (4.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 16.7 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4791 mL 12.3956 mL 24.7911 mL
5 mM 0.4958 mL 2.4791 mL 4.9582 mL
10 mM 0.2479 mL 1.2396 mL 2.4791 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们