GNA002

目录号: V33029 纯度: ≥98%
GNA002 是一种新型、有效的 EZH2(zeste 同系物增强子 2)抑制剂(IC50 为 1.1 μM),具有抗癌活性。
GNA002 CAS号: 1385035-79-9
产品类别: New2
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产品描述
GNA002 是一种新型高效的 EZH2(增强子同源物 2)抑制剂(IC50 为 1.1 μM),具有抗癌活性。它的作用机制是通过与 EZH2 的半胱氨酸残基共价结合,触发 EZH2 的泛素化,并随后通过蛋白质质量控制 E3 连接酶 CHIP 降解。
GNA002 是一种高效、特异性的 EZH2(增强子组蛋白同源物 2)共价抑制剂,IC50 值为 1.1 microM。EZH2 是多梳抑制复合物 2 (PRC2) 的催化亚基,是一种组蛋白甲基转移酶,催化组蛋白 H3 第 27 位赖氨酸 (H3K27) 的甲基化。GNA002 可特异性地共价结合 EZH2-SET 结构域中的 Cys668,通过 CHIP(Hsp70 相互作用蛋白的羧基末端)介导的泛素化途径触发 EZH2 降解。该化合物的分子式为 C42H55NO8,分子量为 701.89 g/mol。GNA002 仅供实验室研究使用。
生物活性&实验参考方法
靶点
GNA002 targets EZH2 (Enhancer of zeste homolog 2), the catalytic subunit of the Polycomb repressive complex 2 (PRC2). EZH2 is a histone methyltransferase that catalyzes the methylation of histone H3 at lysine 27 (H3K27), a histone mark associated with transcriptional repression. EZH2 is frequently overexpressed or mutated in various cancers and is associated with poor prognosis. By covalently binding to Cys668 in the EZH2-SET domain with an IC50 of 1.1 microM, GNA002 inhibits EZH2 enzymatic activity and triggers EZH2 degradation through CHIP-mediated ubiquitination. GNA002 is a potent, selective, covalent EZH2 inhibitor used in epigenetic research.
体外研究 (In Vitro)
GNA002(10 μM;72 小时)可显著抑制多种指甲细胞系的增殖;其对 MV4-11 和 RS4-11 的 IC50 值分别为 0.070 μM 和 0.103 μM。在人类癌症中,GNA002(2 μM;24 小时)和 GNA002(0.1-4 μM;48 小时)均能有效抑制 EZH2 诱导的头颈骨中 Cal-27 的 H3K27 三甲基化 [1]。细胞诱导细胞死亡的能力更强 [1]。检查[1]
GNA002 作为一种 EZH2 抑制剂,在体外表现出强效活性。该化合物对 EZH2 的 IC50 值为 1.1 uM。GNA002 可特异性地共价结合 EZH2-SET 结构域中的 Cys668,并通过 CHIP 介导的泛素化诱导 EZH2 降解。其活性呈浓度依赖性,在微摩尔浓度下即可观察到强效抑制作用。GNA002 是一种强效、选择性的 EZH2 共价抑制剂,广泛应用于生物化学和细胞研究中,用于探究组蛋白甲基转移酶的功能和表观遗传调控。其共价结合机制可实现对 EZH2 活性的持续抑制。
体内研究 (In Vivo)
GNA002(Manhattan;100 mg/kg;每日一次)显著降低了肿瘤组织中的H3K27Me3水平和Cal-27来源的肿瘤体积。此外,在异种移植的A549肺癌细胞(Daudi和Pfeiffer细胞)的外周组织中,GNA002水平也显著降低。至少在异种移植实验模型中,GNA002可降低EZH2的异常核心功能,进而抑制体内肿瘤生长[1]。
在体内,GNA002 已被研究用于评估其抑制 EZH2 和调节表观遗传调控的潜力。作为一种共价 EZH2 抑制剂,该化合物可诱导 EZH2 降解,预计能够降低 H3K27 甲基化水平并改变基因表达程序。EZH2 抑制剂已在多种癌症动物模型中进行研究,并证实其能够有效抑制肿瘤生长和转移。GNA002 的体内活性已在相关研究论文中有所描述。该化合物能够共价结合并降解 EZH2,使其成为表观遗传学研究的宝贵工具。
酶活实验
GNA002 的体外酶活性测定包括测量其对 EZH2 甲基转移酶活性的抑制作用。将重组 EZH2 复合物 (PRC2) 与不同浓度的待测化合物、S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 以及组蛋白 H3 肽底物或核小体孵育。使用 [3H]-SAM 进行放射性检测,或使用 AlphaScreen 或 TR-FRET 等发光法检测甲基化的 H3K27,从而定量甲基转移至 H3K27 的量。通过非线性回归分析,绘制抑制率与化合物浓度的关系图,计算 IC50 值。该化合物的 IC50 值为 1.1 uM。可通过质谱分析或使用突变型 EZH2 蛋白来评估其与 Cys668 的共价结合情况。每个浓度通常进行重复或三次测试。
细胞实验
测试[1]
细胞类型:多种癌细胞系
测试浓度:10 μM
孵育时间:72 小时
实验结果:抑制多种癌细胞系的增殖,MV4-11 和 RS4-11 的 IC50 分别为 0.070 μM 和 0.103 μM。

细胞凋亡分析[1]
细胞类型:HN-4 和 Cal-27 头颈癌细胞
测试浓度:2 μM
孵育时间:24 小时
实验结果:诱导人癌细胞凋亡。

蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: Cal-27 头颈癌细胞
测试浓度: 0.1、0.2、0.5、1、2、4 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: H3K27Me3 水平降低。
使用癌细胞系进行GNA002的体外细胞实验。将细胞用不同浓度的化合物处理特定时间。采用EZH2特异性抗体通过Western blot检测EZH2蛋白水平。采用甲基化特异性抗体通过Western blot检测H3K27me3水平。采用qRT-PCR检测EZH2靶基因表达。采用MTT或CellTiter-Glo法检测细胞增殖和活力。采用Annexin V/碘化丙啶染色或caspase活性检测法检测细胞凋亡。采用碘化丙啶染色后,通过流式细胞术进行细胞周期分析。同时评估细胞毒性,以确保观察到的效应并非由细胞死亡引起。根据剂量反应曲线计算抑制细胞增殖的IC50值。
动物实验
动物/疾病模型:雄性BALB/C裸鼠,30-35日龄,体重18-22克,携带Cal-27异种移植瘤[1]
剂量:100毫克/千克
给药途径:口服;每日
实验结果:Cal-27 细胞形成的肿瘤大小和重量均减小。
GNA002 的体内动物研究采用小鼠异种移植瘤模型进行。将癌细胞皮下植入免疫缺陷小鼠体内。待肿瘤达到预定大小后,将动物随机分组,分别以不同剂量和给药方案,通过灌胃或腹腔注射给予 GNA002。使用游标卡尺测量肿瘤生长情况。采用免疫组织化学或蛋白质印迹法检测肿瘤组织中 EZH2 蛋白水平和 H3K27me3 水平。药代动力学研究评估血浆和肿瘤组织中的药物浓度。监测动物的临床症状和体重。疗效以与载体对照组相比的肿瘤生长抑制率表示。
药代性质 (ADME/PK)
GNA002 的药代动力学特性已在临床前研究中得到表征。该化合物的分子式为 C42H55NO8,分子量为 701.89 g/mol。其化学名称为 (2Z)-4-[(1S,2S,13S,15R)-7-[(
参考文献

[1]. A covalently bound inhibitor triggers EZH2 degradation through CHIP-mediated ubiquitination. EMBO J. 2017 May, 36(9):1243-1260.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C42H55NO8
分子量
701.888013124466
精确质量
701.392
CAS号
1385035-79-9
PubChem CID
162642890
外观&性状
Light yellow to yellow ointment
LogP
7.9
tPSA
131
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
14
重原子数目
51
分子复杂度/Complexity
1530
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCOCCNC(=O)/C(=C/CC12C(=O)C3CC(C14C(=C3)C(=O)C5=C(C(=C(C(=C5O4)CC=C(C)C)O)C/C=C(\C)/CCC=C(C)C)O)C(O2)(C)C)/C
InChi Key
HJJVIXXMFVHPER-PIZOZCJOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C42H55NO8/c1-10-49-21-20-43-39(48)27(7)18-19-41-38(47)28-22-31-36(46)33-35(45)29(17-15-26(6)13-11-12-24(2)3)34(44)30(16-14-25(4)5)37(33)50-42(31,41)32(23-28)40(8,9)51-41/h12,14-15,18,22,28,32,44-45H,10-11,13,16-17,19-21,23H2,1-9H3,(H,43,48)/b26-15+,27-18+
化学名
(E)-4-[7-[(2E)-3,7-dimethylocta-2,6-dienyl]-6,8-dihydroxy-17,17-dimethyl-5-(3-methylbut-2-enyl)-10,14-dioxo-3,16-dioxapentacyclo[11.4.1.02,11.02,15.04,9]octadeca-4,6,8,11-tetraen-15-yl]-N-(2-ethoxyethyl)-2-methylbut-2-enamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~35.62 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (1.78 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 1.25 mg/mL (1.78 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 12.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4247 mL 7.1236 mL 14.2472 mL
5 mM 0.2849 mL 1.4247 mL 2.8494 mL
10 mM 0.1425 mL 0.7124 mL 1.4247 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们