| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
GNE-049 primarily targets the bromodomain of CREB-binding protein (CBP), a histone acetyltransferase that plays a critical role in transcriptional co-activation. CBP and its closely related homolog p300 are epigenetic readers that recognize acetylated lysine residues on histone tails and facilitate the assembly of transcriptional complexes. GNE-049 also inhibits BRET (BRD4-associated) with an IC50 of 12 nM and shows weaker activity against BRD4 with an IC50 of 4200 nM, indicating significant selectivity for CBP over BRD4. The compound's high potency and selectivity make it a valuable tool for dissecting the specific functions of CBP/p300 in cellular processes such as proliferation, differentiation, and oncogenesis.
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| 体外研究 (In Vitro) |
由于GNE-049兼具理想的细胞活性、选择性和肝微粒体(LM)稳定性,因此被选作进一步研究对象。GNE-049在靶点结合的正交评估中表现良好,并在BRET细胞测试中展现出极高的活性。其中,GNE-049的EC50为14 nM,能够抑制MYC(MV4-11细胞系)的表达[1]。
GNE-049在体外对CBP表现出强效活性,在TR-FRET生化分析中IC50为1.1 nM。该化合物还能抑制BRET,IC50为12 nM。在细胞模型中,GNE-049能有效抑制前列腺癌细胞的增殖。该化合物对CBP相对于BRD4的高选择性(约3800倍)最大限度地减少了脱靶效应,并允许对CBP/p300依赖性转录程序进行特异性研究。研究表明,GNE-049 可以调节与 CBP/p300 活性相关的基因表达模式,使其成为研究这些表观遗传调控因子在癌症和其他疾病中作用的宝贵工具。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
GNE-049 在犬、猴、大鼠和小鼠中均表现出可接受的药代动力学特征。针对特定溴结构域的效力实验表明,GNE-049 对 CBP/P300 具有高度选择性,并且对 BRD4 的选择性显著提高了 3820 倍 (1)。在一项针对大鼠进行的单剂量(30–250 mg/kg,每日一次)毒代动力学研究中,对 GNE-049 进行了进一步评估。给予 250 mg/kg 剂量的大鼠表现出对中枢神经系统 (CNS) 的不良反应,例如发声和明显的活动过度。此外,注射后 3 小时,250 mg/kg 剂量组的脑内游离药物浓度与血浆中游离药物浓度的比值 (Kp,uu) 为 0.43,表明 GNE-049 能够进入大脑。 GNE-049 可能影响中枢神经系统,并可能是已报道的毒性因素之一[1]。
GNE-049 已在前列腺癌模型中展现出体内疗效。该化合物在临床前模型中能有效抑制肿瘤生长,证实了 CBP/p300 抑制剂在癌症治疗中的潜力。体内研究表明,GNE-049 可以抑制肿瘤进展并调节 CBP/p300 活性的生物标志物。该化合物适用于口服给药,并已配制成用于体内研究的制剂。详细的体内疗效数据,包括具体的肿瘤生长抑制率和给药方案,可在原始文献中找到。该化合物在体内抑制 CBP/p300 的能力使其成为验证这些表观遗传调控因子在疾病发病机制中作用的宝贵工具。 |
| 酶活实验 |
用于检测 GNE-049 的体外酶/受体结合(非细胞)分析方法是一种时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 分析,用于测量化合物与 CBP 溴结构域的结合亲和力。在该分析中,使用荧光标记的乙酰化组蛋白肽作为底物,并用铽螯合物标记 CBP 溴结构域。肽与溴结构域的结合使荧光团和铽供体彼此靠近,从而发生能量转移并产生 TR-FRET 信号。GNE-049 与肽竞争结合溴结构域,导致 TR-FRET 信号减弱。通过将不同浓度的 GNE-049 与分析组分孵育并测量荧光信号,确定其 IC50 值为 1.1 nM。该化合物溶解于 DMSO 中,并在测试时用分析缓冲液稀释。
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| 细胞实验 |
GNE-049 的体外细胞活性检测通常使用依赖 CBP/p300 活性进行增殖的癌细胞系,例如前列腺癌细胞系。将细胞培养于合适的培养基中,并用不同浓度的 GNE-049(通常为纳摩尔至微摩尔级)或溶剂对照(DMSO)处理特定时间点(例如 72 小时)。采用 MTT、CellTiter-Glo 等方法或直接细胞计数评估细胞活力。量化增殖抑制情况,并绘制剂量反应曲线以确定 EC50 值。此外,可通过 qRT-PCR 或 RNA 测序评估 GNE-049 对 CBP/p300 依赖性基因表达的影响,以确认靶点结合和通路调控。该化合物对细胞周期进程和细胞凋亡的影响也可通过流式细胞术进行评估。
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| 动物实验 |
GNE-049 的体内动物实验通常使用携带人源肿瘤异种移植瘤的免疫缺陷小鼠,特别是前列腺癌模型。将癌细胞皮下植入裸鼠或 SCID 小鼠的侧腹部。当肿瘤达到预定大小(例如 100-200 mm³)时,将动物随机分为 GNE-049 治疗组和载体对照组。GNE-049 以不同剂量(例如 10-100 mg/kg)每日或定时口服给药。每周两次使用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测体重以评估耐受性。研究结束时,收集肿瘤组织,用于分析 CBP/p300 靶点结合、组蛋白乙酰化状态和下游基因表达。评估药效学生物标志物以确认靶点调控。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
GNE-049 在 DMSO 中的溶解度为 100 mg/mL (195.85 mM),在乙醇中的溶解度为 3 mg/mL,但不溶于水。对于体内口服给药,GNE-049 可配制成浓度 ≥5 mg/mL 的均质 CMC-Na 混悬液。对于注射剂,已验证的配制方法为:使用 5% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80 和 50% ddH2O,可得到浓度为 5 mg/mL 的澄清溶液。或者,也可使用 5% DMSO 的 95% 玉米油配制的溶液。该化合物应在干燥、避光条件下于 -20°C 保存。详细的药代动力学参数,例如半衰期、清除率、生物利用度和最大浓度,可在相关文献中找到,并应参考这些文献进行具体的实验设计。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
公开资料中缺乏关于GNE-049的全面毒理学数据。作为一种研究级化合物,GNE-049仅供实验室研究用途,尚未获准用于人体治疗。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全操作规程,包括使用适当的个人防护装备并在通风良好的区域工作。动物研究表明,在测试剂量下,GNE-049具有良好的耐受性,但目前的检索结果未能提供全面的毒理学分析(例如,LD50、最大耐受剂量、器官特异性毒性),需要查阅原始文献或安全数据表。应谨慎处理该化合物,并遵守机构安全指南。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
GNE-049 是一种高效且高选择性的 CBP/p300 溴结构域抑制剂,专为研究癌症及其他疾病中的表观遗传调控而开发。该化合物具有极高的效力(IC50 = 1.1 nM)以及对 CBP 相对于 BRD4 的选择性(约 3800 倍),使其成为解析 CBP/p300 在转录调控中特定功能的宝贵工具。GNE-049 已在前列腺癌模型中展现出疗效,验证了 CBP/p300 作为治疗靶点的有效性。该化合物目前尚未进入临床试验,也未获准用于临床治疗;它仍是一种用于临床前表观遗传学研究的实验性化合物。GNE-049 可从多家化学供应商处获得,用于研究用途。其高效性和高选择性使其成为研究 CBP/p300 依赖性生物学的首选工具。
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| 分子式 |
C27H32F2N6O2
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|---|---|
| 分子量 |
510.5788
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| 精确质量 |
510.255
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| CAS号 |
1936421-41-8
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| PubChem CID |
121373418
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
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| LogP |
2.9
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| tPSA |
68.4
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| 氢键供体(HBD)数目 |
0
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| 氢键受体(HBA)数目 |
7
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| 可旋转键数目(RBC) |
4
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| 重原子数目 |
37
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| 分子复杂度/Complexity |
816
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
FC([H])(C1=C(C2C([H])=NN(C([H])([H])[H])C=2[H])C([H])=C2C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])N(C2=C1[H])C1C2C([H])([H])N(C(C([H])([H])[H])=O)C([H])([H])C([H])([H])C=2N(C2([H])C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C2([H])[H])N=1)F
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| InChi Key |
FLTYKXCCCAPRLV-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C26H30F2N6O2/c1-16(35)32-8-5-23-22(14-32)26(30-34(23)19-6-9-36-15-19)33-7-3-4-17-10-20(18-12-29-31(2)13-18)21(25(27)28)11-24(17)33/h10-13,19,25H,3-9,14-15H2,1-2H3
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| 化学名 |
1-[3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methylpyrazol-4-yl)-3,4-dihydro-2H-quinolin-1-yl]-1-tetrahydrofuran-3-yl-6,7-dihydro-4H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl]ethanone
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| 别名 |
GNE-049; GNE 049; GNE049.
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~195.86 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.9586 mL | 9.7928 mL | 19.5856 mL | |
| 5 mM | 0.3917 mL | 1.9586 mL | 3.9171 mL | |
| 10 mM | 0.1959 mL | 0.9793 mL | 1.9586 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。