| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 靶点 |
BPTF bromodomain (Ki = 1.8 μM, determined by HTRF assay) [1]
- Brd4 bromodomain BD1 (Ki = 0.5 μM, determined by HTRF assay) [1] - Brd4 bromodomain BD2 (Ki = 2.3 μM, determined by HTRF assay) [1] |
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| 体外研究 (In Vitro) |
根据 GSK1379725A NMR 滴定中结合和非结合共振 (171 Hz) 的分离,化学交换速率存在上限。 Kd的上限,如果一系列蛋白质-小分子相互作用(例如胰凝乳蛋白酶:黄素原k1=1.2×108 M-1 s-1)的相关率为1×108 M-1 s-1作为其上限极限,如下。根据该实验估计为 8 μM。通过使用未标记的 BPTF 作为补充直接结合测定,ITC 可更准确地评估非氟化蛋白质。我们通过 PrOF NMR 发现的中间交换共振展宽与我们测量的 2.8 μM 的 Kd 一致。尽管 GSK1379725A 已被证明对 Brd4 具有选择性,但仍然需要针对其他溴结构域的完整选择性面板。在 EC50 为 500 nM 的五种细胞测定中,使用 ChEMBL 数据库搜索仅显示 GSK1379725A 具有活性。此外,尽管用于筛选的 PKIS 文库越来越受欢迎,但 GSK1379725A 的激酶活性尚未得到记录 [1]。
以中等亲和力特异性结合BPTF和Brd4的溴结构域,对其他溴结构域(如Brd2、Brd3、CBP)无明显结合活性(Ki > 20 μM)[1] - 在19F NMR结合实验中,抑制BPTF溴结构域与乙酰化组蛋白H4肽(H4K5ac/K8ac/K12ac/K16ac)的相互作用,结合亲和力与HTRF测定的Ki值一致[1] - 在HTRF竞争实验中,阻断Brd4溴结构域(BD1/BD2)与乙酰化组蛋白H3肽(H3K14ac)的结合,10 μM浓度下使信号强度降低约70%[1] - 在HEK293T报告基因实验中,对Brd4依赖的转录表现出弱抑制作用,20 μM GSK1379725A处理时抑制率约为30%[1] |
| 酶活实验 |
蛋白观察19F NMR结合实验:重组BPTF溴结构域蛋白用含氟探针标记,与不同浓度的GSK1379725A在NMR缓冲液中孵育。将混合物转移至NMR管,25°C下记录19F NMR光谱。监测氟探针的化学位移变化以评估结合情况,通过将化学位移数据拟合至1:1结合模型计算解离常数(Ki)[1]
- 溴结构域-乙酰化肽相互作用的HTRF竞争实验:重组BPTF或Brd4(BD1/BD2)溴结构域蛋白与生物素化乙酰化组蛋白肽(BPTF对应H4K5ac/K8ac/K12ac/K16ac;Brd4对应H3K14ac)及铕标记抗生物素抗体在实验缓冲液中孵育。加入不同浓度的GSK1379725A,37°C孵育1小时。测量时间分辨荧光共振能量转移(HTRF)信号,通过分析竞争曲线确定Ki值[1] |
| 细胞实验 |
HEK293T Brd4依赖报告基因实验:HEK293T细胞转染含Brd4响应启动子的荧光素酶报告质粒和作为内参的海肾荧光素酶质粒。转染24小时后,用GSK1379725A(0.1-20 μM)处理细胞16小时。使用双荧光素酶检测系统测量荧光素酶活性,计算相对于溶媒对照组的抑制率[1]
- 溴结构域选择性谱分析实验:24种不同人溴结构域含蛋白的重组溴结构域蛋白与GSK1379725A(10 μM)在HTRF实验缓冲液中孵育。通过测量GSK1379725A与乙酰化组蛋白肽的竞争作用评估结合亲和力,通过比较所有测试溴结构域的Ki值确定选择性[1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
GSK1379725A是一种小分子探针化合物,通过蛋白质观测的氟核磁共振(NMR)对BPTF和Brd4溴结构域进行双重筛选而发现[1]。
- 其作用机制涉及与BPTF和Brd4溴结构域的乙酰赖氨酸结合口袋结合,从而阻断它们与乙酰化组蛋白的相互作用,并干扰染色质依赖性转录调控[1]。 - 可作为研究BPTF和Brd4溴结构域生物学功能的重要化学工具,尤其适用于研究它们在转录调控和染色质重塑中的协同作用[1]。 - 该化合物具有中等效力和良好的选择性,因此适用于体外机制研究,但由于溶解度和生物利用度有限(未进行正式测试,但根据结构特性推断),不适用于体内应用[1]。 |
| 分子式 |
C23H23FN6O3
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|---|---|
| 分子量 |
450.465527772903
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| 精确质量 |
450.181
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| CAS号 |
1802251-00-8
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| 相关CAS号 |
(S)-GSK1379725A;2359618-49-6
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| PubChem CID |
44525934
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
3.4
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| tPSA |
109
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
8
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| 可旋转键数目(RBC) |
7
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| 重原子数目 |
33
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| 分子复杂度/Complexity |
662
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
FC1C=CC(=CC=1)NC1=NC=CC(=N1)N1CCC(C1)NC(NC1C=CC=C(C(=O)OC)C=1)=O
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| InChi Key |
LLVPDBRSUHNJQQ-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C23H23FN6O3/c1-33-21(31)15-3-2-4-18(13-15)27-23(32)28-19-10-12-30(14-19)20-9-11-25-22(29-20)26-17-7-5-16(24)6-8-17/h2-9,11,13,19H,10,12,14H2,1H3,(H,25,26,29)(H2,27,28,32)
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| 化学名 |
3-(3-{1-[2-(4-Fluoro-phenylamino)-pyrimidin-4-yl]-pyrrolidin-3-yl}-ureido)-benzoic acid methyl ester
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| 别名 |
AU1; AU-1; AU 1; GSK1379725A; GSK 1379725 A; GSK-1379725-A;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~221.99 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.55 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.55 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.55 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.2199 mL | 11.0995 mL | 22.1990 mL | |
| 5 mM | 0.4440 mL | 2.2199 mL | 4.4398 mL | |
| 10 mM | 0.2220 mL | 1.1100 mL | 2.2199 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。