GSK1379725A

别名: AU1; AU-1; AU 1; GSK1379725A; GSK 1379725 A; GSK-1379725-A;

目录号: V2062 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

GSK1379725A (AU1) 是第一个对 BPTF 选择性优于 Brd4 的小分子，作为 Brd4 抑制剂和 Kdof 2.8 μM 的选择性 BPTF 配体。

GSK1379725A CAS号: 1802251-00-8
产品类别: Others 8

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Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

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Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

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Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

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产品说明书

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器

产品描述

GSK1379725A (AU1) 是第一个对 BPTF 选择性优于 Brd4 的小分子，作为 Brd4 抑制剂和选择性 BPTF 配体，Kd 为 2.8 μM。 AU1 在基于细胞的报告基因检测中具有活性。未检测到与 Brd4 的结合。还发现了三种具有亚微摩尔亲和力的新 Brd4 抑制剂。 Brd4 命中在热稳定性测定中进行了验证，并通过荧光各向异性确定了效力。以多蛋白形式进行蛋白质观察 (19)F NMR 实验所需的速度、易于解释和低蛋白质浓度为发现和表征含溴结构域蛋白质的选择性配体提供了一种新方法。

生物活性&实验参考方法

靶点	BPTF bromodomain (Ki = 1.8 μM, determined by HTRF assay) [1] - Brd4 bromodomain BD1 (Ki = 0.5 μM, determined by HTRF assay) [1] - Brd4 bromodomain BD2 (Ki = 2.3 μM, determined by HTRF assay) [1]
体外研究 (In Vitro)	根据 GSK1379725A NMR 滴定中结合和非结合共振 (171 Hz) 的分离，化学交换速率存在上限。 Kd的上限，如果一系列蛋白质-小分子相互作用（例如胰凝乳蛋白酶：黄素原k1=1.2×108 M-1 s-1）的相关率为1×108 M-1 s-1作为其上限极限，如下。根据该实验估计为 8 μM。通过使用未标记的 BPTF 作为补充直接结合测定，ITC 可更准确地评估非氟化蛋白质。我们通过 PrOF NMR 发现的中间交换共振展宽与我们测量的 2.8 μM 的 Kd 一致。尽管 GSK1379725A 已被证明对 Brd4 具有选择性，但仍然需要针对其他溴结构域的完整选择性面板。在 EC50 为 500 nM 的五种细胞测定中，使用 ChEMBL 数据库搜索仅显示 GSK1379725A 具有活性。此外，尽管用于筛选的 PKIS 文库越来越受欢迎，但 GSK1379725A 的激酶活性尚未得到记录 [1]。以中等亲和力特异性结合BPTF和Brd4的溴结构域，对其他溴结构域（如Brd2、Brd3、CBP）无明显结合活性（Ki > 20 μM）[1] - 在19F NMR结合实验中，抑制BPTF溴结构域与乙酰化组蛋白H4肽（H4K5ac/K8ac/K12ac/K16ac）的相互作用，结合亲和力与HTRF测定的Ki值一致[1] - 在HTRF竞争实验中，阻断Brd4溴结构域（BD1/BD2）与乙酰化组蛋白H3肽（H3K14ac）的结合，10 μM浓度下使信号强度降低约70%[1] - 在HEK293T报告基因实验中，对Brd4依赖的转录表现出弱抑制作用，20 μM GSK1379725A处理时抑制率约为30%[1]
酶活实验	蛋白观察19F NMR结合实验：重组BPTF溴结构域蛋白用含氟探针标记，与不同浓度的GSK1379725A在NMR缓冲液中孵育。将混合物转移至NMR管，25°C下记录19F NMR光谱。监测氟探针的化学位移变化以评估结合情况，通过将化学位移数据拟合至1:1结合模型计算解离常数（Ki）[1] - 溴结构域-乙酰化肽相互作用的HTRF竞争实验：重组BPTF或Brd4（BD1/BD2）溴结构域蛋白与生物素化乙酰化组蛋白肽（BPTF对应H4K5ac/K8ac/K12ac/K16ac；Brd4对应H3K14ac）及铕标记抗生物素抗体在实验缓冲液中孵育。加入不同浓度的GSK1379725A，37°C孵育1小时。测量时间分辨荧光共振能量转移（HTRF）信号，通过分析竞争曲线确定Ki值[1]
细胞实验	HEK293T Brd4依赖报告基因实验：HEK293T细胞转染含Brd4响应启动子的荧光素酶报告质粒和作为内参的海肾荧光素酶质粒。转染24小时后，用GSK1379725A（0.1-20 μM）处理细胞16小时。使用双荧光素酶检测系统测量荧光素酶活性，计算相对于溶媒对照组的抑制率[1] - 溴结构域选择性谱分析实验：24种不同人溴结构域含蛋白的重组溴结构域蛋白与GSK1379725A（10 μM）在HTRF实验缓冲液中孵育。通过测量GSK1379725A与乙酰化组蛋白肽的竞争作用评估结合亲和力，通过比较所有测试溴结构域的Ki值确定选择性[1]
参考文献	[1]. Dual Screening of BPTF and Brd4 Using Protein-Observed Fluorine NMR Uncovers New Bromodomain Probe Molecules. ACS Chem Biol. 2015 Oct 16;10(10):2246-56.
其他信息	GSK1379725A is a small-molecule probe compound identified through dual screening of BPTF and Brd4 bromodomains using protein-observed fluorine NMR [1] - Its mechanism of action involves binding to the acetyllysine-binding pocket of BPTF and Brd4 bromodomains, thereby blocking their interaction with acetylated histones and interfering with chromatin-dependent transcriptional regulation [1] - Serves as a valuable chemical tool for studying the biological functions of BPTF and Brd4 bromodomains, particularly their cooperative roles in transcriptional control and chromatin remodeling [1] - Exhibits moderate potency and good selectivity, making it suitable for in vitro mechanistic studies but not for in vivo applications due to limited solubility and bioavailability (not formally tested but inferred from structural properties) [1]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C23H23FN6O3
分子量	450.465527772903
精确质量	450.181
CAS号	1802251-00-8
相关CAS号	(S)-GSK1379725A;2359618-49-6
PubChem CID	44525934
外观&性状	White to off-white solid powder
LogP	3.4
tPSA	109
氢键供体(HBD)数目	3
氢键受体(HBA)数目	8
可旋转键数目(RBC)	7
重原子数目	33
分子复杂度/Complexity	662
定义原子立体中心数目	0
SMILES	FC1C=CC(=CC=1)NC1=NC=CC(=N1)N1CCC(C1)NC(NC1C=CC=C(C(=O)OC)C=1)=O
InChi Key	LLVPDBRSUHNJQQ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code	InChI=1S/C23H23FN6O3/c1-33-21(31)15-3-2-4-18(13-15)27-23(32)28-19-10-12-30(14-19)20-9-11-25-22(29-20)26-17-7-5-16(24)6-8-17/h2-9,11,13,19H,10,12,14H2,1H3,(H,25,26,29)(H2,27,28,32)
化学名	3-(3-{1-[2-(4-Fluoro-phenylamino)-pyrimidin-4-yl]-pyrrolidin-3-yl}-ureido)-benzoic acid methyl ester
别名	AU1; AU-1; AU 1; GSK1379725A; GSK 1379725 A; GSK-1379725-A;
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ~100 mg/mL (~221.99 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.55 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* 2.5 mg/mL (5.55 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.55 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ~100 mg/mL (~221.99 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.55 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.55 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.55 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	2.2199 mL	11.0995 mL	22.1990 mL
	5 mM	0.4440 mL	2.2199 mL	4.4398 mL
	10 mM	0.2220 mL	1.1100 mL	2.2199 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。