INDY

目录号: V11082 纯度: ≥98%
INDY 是 Dyrk1A 和 Dyrk1B 的有效 ATP 竞争性抑制剂,IC50 分别为 0.24 μM 和 0.23 μM。
INDY CAS号: 1169755-45-6
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
INDY 是一种强效的 ATP 竞争性抑制剂,可抑制 Dyrk1A 和 Dyrk1B,其 IC50 值分别为 0.24 μM 和 0.23 μM。INDY 与酶的 ATP 结合口袋结合,对 Dyrk1A 的 Ki 值为 0.18 μM。INDY 可显著降低原发性胶质母细胞瘤 (GBM) 细胞系和神经祖细胞中正常细胞和致瘤细胞的自我更新能力。
INDY(CAS 编号:1169755-45-6)是一种强效的 ATP 竞争性抑制剂,可抑制双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶 DYRK1A 和 DYRK1B。该苯并噻唑衍生物的分子式为 C12H13NO2S,分子量为 235.3 g/mol。 INDY已被证实能够降低原发性胶质母细胞瘤(GBM)细胞系和神经祖细胞中正常细胞和肿瘤细胞的自我更新能力。在浓度高达100 μM时,INDY对DYRK1A的选择性高于单胺氧化酶(MAO)A和B。INDY主要用作研究工具,用于研究DYRK激酶在神经系统疾病和癌症中的作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
INDY targets the dual-specificity tyrosine phosphorylation-regulated kinases DYRK1A and DYRK1B. It acts as an ATP-competitive inhibitor, binding within the ATP pocket of the enzyme. The compound exhibits an IC50 value of 0.24 μM for DYRK1A and 0.23 μM for DYRK1B, with a Ki value of 0.18 μM for DYRK1A. At a high concentration of 10 µM, INDY shows >90% inhibition of CLK1. DYRK1A and DYRK1B are involved in various cellular processes, including cell cycle regulation, neuronal development, and differentiation. Inhibition of these kinases is being explored as a therapeutic strategy for cancer and neurodegenerative diseases.
体外研究 (In Vitro)
在 3 μM 和 30 μM 浓度下,INDY(0.3-30 μM;20 小时)几乎完全阻断 tau 蛋白磷酸化 [1]。当酸性磷酸化调节因子 1A (ARP1A) 过表达时,活化 T 细胞核因子 (NFAT) 信号通路被阻断 [1]。体外实验表明,INDY 能有效抑制 DYRK1A 和 DYRK1B 激酶活性,IC50 值分别为 0.24 μM 和 0.23 μM。该化合物与酶的 ATP 结合口袋结合,对 DYRK1A 的 Ki 值为 0.18 μM。INDY 能显著降低原代胶质母细胞瘤 (GBM) 细胞系和神经祖细胞中正常细胞和肿瘤细胞的自我更新能力。在浓度高达 100 μM 时,INDY 对 DYRK1A 的选择性高于 MAO-A 和 MAO-B。在 10 µM 浓度下,INDY 对 CLK1 的抑制率超过 90%,表明在高浓度下可能存在交叉反应。据报道,INDY 还能抑制 SLC13A5,一种钠偶联柠檬酸转运蛋白。
体内研究 (In Vivo)
ProINDY (2.5 μM) 可显著恢复非洲爪蟾的同步正常发育 [1]。
由于 INDY 主要用作体外激酶抑制研究的工具,因此其体内研究有限。然而,该化合物能够降低胶质母细胞瘤 (GBM) 细胞和神经祖细胞的自我更新能力,提示其在癌症研究中具有潜在的体内应用价值。INDY 已被生物医学文献引用,包括发表在《自然医学》杂志上的一篇文章,表明其在临床前研究中具有重要意义。需要进一步的体内研究来全面表征其药代动力学特征、在动物疾病模型中的疗效以及在肿瘤学和神经病学中的潜在治疗应用。
酶活实验
对于使用 INDY 进行的体外激酶活性测定,将重组 DYRK1A 或 DYRK1B 酶与合适的肽底物和 ATP 在激酶缓冲液中孵育。INDY 通常溶解于 DMSO 中,并以不同浓度加入反应体系。反应在室温或 30°C 下进行指定时间。激酶活性可通过放射性测定法(使用 [γ-33P]ATP)或发光 ADP 检测法(例如 ADP-Glo™ 激酶测定试剂盒)进行测定。IC50 值通过绘制剩余激酶活性百分比与抑制剂浓度对数的关系图,并将数据拟合为 S 形剂量反应曲线来确定。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: 转染 EGFP-Dyrk1A 和 EGFP-tau 的 COS7 细胞
测试浓度: 0.3、1、3、10、30 μM
孵育时间: 20 小时
实验结果: 3 μM 时 tau 磷酸化受到轻微抑制,30 μM 时几乎完全抑制。
对于体外细胞研究,将原代胶质母细胞瘤 (GBM) 细胞系或神经祖细胞培养于合适的培养基中。将 INDY 溶解于 DMSO 中,并用细胞培养基稀释至所需浓度,最终 DMSO 浓度保持在 0.1% 以下,以避免溶剂毒性。细胞用 INDY 处理一段时间,通常为 24-72 小时。使用神经球形成实验或克隆形成实验评估 INDY 对细胞自我更新能力的影响。使用 MTT、CellTiter-Glo 或类似方法检测细胞活力。可通过 DYRK1A 底物或下游效应分子的蛋白质印迹分析来评估其对信号通路的影响。
动物实验
在体内动物研究中,INDY通常配制成浓度≥5 mg/mL的CMC-Na均质混悬液,用于口服给药。注射用时,可配制成浓度为1.150 mg/mL (4.89 mM)的澄清溶液,溶剂为5% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80和50% ddH2O。或者,也可配制成5% DMSO和95%玉米油的溶液。动物研究通常采用异种移植小鼠模型进行疗效评估,将荷瘤小鼠通过灌胃或静脉注射给予INDY治疗。随时间推移监测肿瘤生长抑制情况,并从血浆样本中测定半衰期、Cmax和AUC等药代动力学参数。
药代性质 (ADME/PK)
现有文献对INDY的药代动力学性质尚未进行充分表征。INDY是一种分子量为235.3 g/mol的小分子,有利于口服生物利用度。它在DMSO中的溶解度为47 mg/mL(199.74 mM),在乙醇中的溶解度为4 mg/mL,但不溶于水。对于体内给药,INDY可配制成CMC-Na均质混悬液用于口服,或配制成DMSO、PEG300、Tween 80和注射用水的澄清溶液。该化合物以粉末形式储存于-20°C时稳定。目前尚未报道其详细的药代动力学参数,例如半衰期、生物利用度和分布容积,需要进一步研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于INDY是一种研究用化学品,并非用于人类治疗,因此其毒理学数据有限。该化合物通常按照标准的实验室安全预防措施进行操作。在浓度高达100 μM时,INDY对DYRK1A的选择性高于MAO-A和MAO-B,这表明其具有良好的脱靶安全性。然而,目前尚未有包括急性毒性、慢性毒性、遗传毒性和心脏毒性评估在内的全面毒理学研究报告。该化合物在动物模型中的安全性及其临床开发潜力需要进一步的毒理学评估。
参考文献

[1]. Development of a novel selective inhibitor of the Down syndrome-related kinase Dyrk1A. Nat Commun. 2010 Oct 5;1:86.

[2]. Inhibition of DYRK1A destabilizes EGFR and reduces EGFR-dependent glioblastomagrowth. J Clin Invest. 2013 Jun;123(6):2475-87.

其他信息
靛蓝(INDY)属于苯并噻唑类化合物,其结构为2,3-二氢-1,3-苯并噻唑,在2、3和5位分别被2-氧代亚丙基、乙基和羟基取代。它是Dyrk1A和Dyrk1B的ATP竞争性抑制剂(IC50值分别为0.24 μM和0.23 μM)。它具有抗肿瘤活性,是药物代谢产物,也是一种EC 2.7.12.1(双特异性激酶)抑制剂。靛蓝属于苯并噻唑类、有机羟基化合物和烯酮类化合物。
靛蓝是一种研究用化合物,尚未获得FDA批准。它主要用作化学探针,用于研究DYRK1A和DYRK1B在神经系统疾病和癌症中的生物学功能。该化合物已被多篇科学文献引用,包括发表在《自然医学》杂志上的一篇文章,表明其在生物医学研究中具有重要意义。INDY的苯并噻唑骨架是药物发现中常见的药效团,该化合物可作为先导化合物,用于开发更有效、更具选择性的DYRK抑制剂。此外,INDY还被报道为SLC13A5(一种钠偶联柠檬酸转运蛋白)的抑制剂,提示其在代谢性疾病领域具有潜在的研究应用价值。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C12H13NO2S
分子量
235.302
精确质量
235.067
CAS号
1169755-45-6
相关CAS号
1169755-45-6;
PubChem CID
44136031
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
2.078
tPSA
70.47
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
16
分子复杂度/Complexity
316
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCN\1C2=C(C=CC(=C2)O)S/C1=C\C(=O)C
InChi Key
GCSZJMUFYOAHFY-SDQBBNPISA-N
InChi Code
InChI=1S/C12H13NO2S/c1-3-13-10-7-9(15)4-5-11(10)16-12(13)6-8(2)14/h4-7,15H,3H2,1-2H3/b12-6-
化学名
(1Z)-1-(3-ethyl-5-hydroxy-1,3-benzothiazol-2-ylidene)propan-2-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 33.33 mg/mL (~141.65 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.62 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.2499 mL 21.2495 mL 42.4989 mL
5 mM 0.8500 mL 4.2499 mL 8.4998 mL
10 mM 0.4250 mL 2.1249 mL 4.2499 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT02159833 Completed Other: Intranasal challenge with active
substance (food protein)
Other: Intranasal challenge with placebo
Food Allergy Imperial College London 2014-10 Not Applicable
NCT04681781 Enrolling by invitation 17p13.1 Deletions Confined to SLC13A5 Gene SLC13A5 Deficiency
Citrate Transporter Deficiency
Citrate Transporter Disorder
TESS Research Foundation 2021-03-01
NCT06144957 Recruiting SLC13A5 Deficiency
Citrate Transporter Deficiency
Citrate Transporter Disorder
DEE25
2021-12-01 TESS Research Foundation
NCT02500082 No longer available Drug: triheptanoin SLC13A5 Gene Mutation
Citrate Transporter Deficiency
Irina A Anselm
NCT03964831 Completed Device: P200TxE
Device: P200DTx
Retinal Disease Optos, PLC 2019-06-18 Not Applicable
生物数据图片
  • GBM primary cells were incubated in the presence of (A) harmine or (B) INDY, and 3 days later, the spheres were dissociated and replated in the absence of the drug. A 20-μm concentration was chosen based on SVZ-NSC behavior (Figure 5A and Supplemental Figure 7). The number of secondary spheres is represented in the graphs. (C) 50,000 GBM5 cells were implanted intracranially into nude mice. Two weeks later, the animals started to receive i.p. injections of saline (Control) or harmine (15 mg/kg/day, 5 days per week; indicated by an arrow). Animal survival was evaluated using a Kaplan-Meier survival curve, and the differences in survival times were analyzed with a log-rank test (n = 5; P = 0.09). (D) Number of mitotic cells in control or harmine-treated tumor tissue. (E) Representative images of activated caspase 3 staining in control and harmine-treated tumor tissue. (F) Representative images of EGFR staining in control and harmine-treated tumor tissue. (G) Correlation between the amount of membrane EGFR present in the different GBM-TIC lines and the percentage of self-renewal inhibition induced by harmine. (H) Percentage of self-renewal inhibition induced by harmine in low- or high-passage GBM3 cells. Western blot on the right shows the amount of EGFR and DYRK1A expressed by low- and high-passage GBM3 cells. Scale bar: 40 μm. *P ≤ 0.05; **P ≤ 0.01; ***P ≤ 0.001.[2]. Inhibition of DYRK1A destabilizes EGFR and reduces EGFR-dependent glioblastomagrowth. J Clin Invest. 2013 Jun;123(6):2475-87.
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