irigenin

别名: Irigenin 野鸢尾黄素;野鸢尾苷元;野鸢尾苷元(野鸢尾黄素);野鸢尾黄素(野鸢尾苷元)
目录号: V34277 纯度: ≥98%
irigenin 是一种先导化合物,通过特异性选择性阻断 Extra Domain A (EDA) 结构域 CC 环上的 α9β1 和 α4β1 整合素结合位点来介导其抗转移作用。
irigenin CAS号: 548-76-5
产品类别: Natural Products
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
鸢尾素是一种先导化合物,它通过特异性地选择性阻断整合素A结构域外环(EDA)CC环上的α9β1和α4β1整合素结合位点发挥抗转移作用。鸢尾素具有抗癌作用。它通过增强胃癌/肿瘤细胞中促凋亡分子的表达,使TRAIL诱导的细胞凋亡更加敏感。
鸢尾素(鸢尾)是从射干(Belamcanda chinensis)和喀什米尔鸢尾(Iris kashmiriana)的根茎中分离得到的一种异黄酮类化合物。它被鉴定为西喜马拉雅化学组中的一种先导化合物,能够与纤连蛋白的A结构域外环(EDA)结合,从而抑制EDA诱导的肺癌细胞转移[1]。此外,鸢尾素通过调节凋亡和抗凋亡蛋白以及活性氧(ROS)的产生,使TRAIL耐药的胃癌细胞对TRAIL诱导的细胞凋亡敏感[2]。
生物活性&实验参考方法
靶点
- Extra Domain A (EDA) of fibronectin, specifically the C-C' loop residues LEU46, PHE47, PRO48, GLU58, LEU59, and GLN60 (no IC50/Ki values reported) [1].
- Modulates expression of pro-apoptotic proteins (FADD, DR5, Bax) and anti-apoptotic proteins (c-FLIP, Bcl-2, Survivin); no direct binding affinity or IC50 reported [2].
体外研究 (In Vitro)
额外结构域A(EDA)的CC环中包含LEU46、PHE47、PRO48、GLU58、LEU59和GLN60。鸢尾素优先靶向EDA上的α9β1和α4β1整合素结合位点。随后发生的上皮-间质转化被异黄酮与EDA的CC环结合所阻止,从而阻止了EDA与细胞表面整合素的相互作用[1]。
- 在人肺癌A549和NCI-H522细胞中,异黄酮在处理24小时后抑制细胞增殖,IC50值分别为58 μM (A549)和61 μM (NCI-H522)(MTT法)[1]。
- 异黄酮(10、25、50 μM)在24小时后呈剂量依赖性地抑制A549和NCI-H522细胞的伤口愈合。在 50 μM 浓度下,A549 细胞的伤口愈合率降低至约 25%,NCI-H522 细胞的伤口愈合率降低至约 23%,而 DMSO 对照组的伤口愈合率约为 90% [1]。
- 鸢尾素 (10, 25, 50 μM) 显著降低了 A549 和 NCI-H522 细胞的 Matrigel 侵袭能力。在 50 μM 浓度下,两种细胞系的侵袭能力均被抑制了 80%(与对照组相比)[1]。
- Western blot 分析显示,鸢尾素(10、25、50 μM)以剂量依赖的方式增加 A549 和 NCI-H522 细胞中 E-钙黏蛋白的表达,并降低波形蛋白、Snail 和 Zeb-1 的表达[1]。
- 即使在对 A549 细胞有效的浓度下,鸢尾素 对 EDA 阴性的 T47D 乳腺癌细胞的迁移、侵袭或 EMT 标志物的表达也没有影响[1]。
- 在 A549 细胞中敲低 EDA(使用 shRNA)使细胞在迁移、侵袭和 EMT 实验中对 鸢尾素 处理无反应[1]。
- 在胃癌细胞系(MKN-28、BGC-823、MGC-803、 SGC-7901、ACP-01),鸢尾素单独表现出剂量依赖性细胞毒性,其中BGC-823和SGC-7901更敏感;在浓度高达 40 μM 时,未观察到对正常胃上皮细胞 GES-1 的细胞毒性 [2]。
- 与单独使用任一药物相比,鸢尾素(5、10、20 μM)与 TRAIL(100 ng/ml)联合处理 24 小时可显著增强 BGC-823 和 SGC-7901 细胞的细胞毒性 [2]。
- 鸢尾素(10 μM)联合 TRAIL(100 ng/ml)可显著增加 SGC-7901 细胞中亚 G1 期细胞比例、细胞核染色质损伤(DAPI 染色)以及胞质组蛋白相关 DNA 片段化 [2]。
- 与单独使用药物相比,鸢尾素联合 TRAIL 可显著提高 caspase-3 活性(DEVDase)[2]。
- 流式细胞术(Annexin) V/PI)显示,鸢尾素(10 μM)联合 TRAIL(100 ng/ml)可显著诱导 SGC-7901 细胞凋亡[2]。
- Western blot:鸢尾素(5、10、20 μM)单独使用可剂量依赖性地增加 caspase-8、-9、-3 和 PARP 的裂解;与 TRAIL 联合使用可进一步增强这些裂解。鸢尾素可增加 FADD、DR5 和 Bax 的表达,并降低 c-FLIP、Bcl-2 和 Survivin 的表达; DR4 和 Mcl-1 未发生变化 [2]。
- siRNA 敲低 FADD、DR5 或 Bax 可显著降低由 鸢尾素 联合 TRAIL 诱导的细胞凋亡(亚 G1 期和 Annexin V/PI 染色),并恢复细胞活力,证实了它们的参与 [2]。
- 鸢尾素 (10, 20 μM) 可增加 SGC-7901 细胞中 ROS 的生成(DCF-DA 染色);与 TRAIL 联合使用可进一步增强 ROS 的生成。用 N-乙酰半胱氨酸 (NAC,ROS 清除剂) 预处理可减弱 鸢尾素 联合 TRAIL 诱导的细胞凋亡和 caspase 激活 [2]。
体内研究 (In Vivo)
在携带SGC-7901胃肿瘤的裸鼠异种移植模型中,单独使用Irigenin(10 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续21天)可轻微抑制肿瘤生长。与单独使用Irigenin(10 mg/kg,腹腔注射)或TRAIL(100 μg/kg,瘤内注射,在Irigenin给药24小时后给药)联合使用,可显著降低肿瘤体积和重量。H&E染色显示联合用药组的肿瘤细胞密度降低[2]。
酶活实验
使用 AutoDock 4.2 进行分子对接模拟,以评估鸢尾素与纤连蛋白 EDA (PDB ID: 1J8K) CC' 环的结合。对接结合能 (ΔG) 为 -10.04 kcal/mol。氢键分析显示,鸢尾素与 EDA 残基(HIS44、ILE43)之间存在六个氢键,键长为 1.81–2.43 Å [1]。
- 使用 GROMACS 4.6 和 GROMOS 43a1 力场对鸢尾素-EDA 复合物进行 100 ns 的分子动力学 (MD) 模拟。通过 MM-PBSA 计算的结合自由能为 -221.602 ± 35.657 kJ/mol。每个残基的能量分解确定了关键的相互作用残基:LEU46 (-6.9 kJ/mol)、PHE47 (-3.6 kJ/mol)、PRO48 (-7.8 kJ/mol)、GLU58 (-4.1 kJ/mol)、LEU59 (-6.1 kJ/mol) 和 GLN60 (-3.7 kJ/mol) [1]。
- Caspase-3 (DEVDase) 活性测定:将细胞裂解液 (20 μg) 与 5 μM DEVD-pNA 底物在反应缓冲液 (20 mM Tris-HCl pH 7.5、137 mM NaCl、1% NP-40、10% 甘油) 中于 37°C 孵育 2 小时,并测量 405 nm 处的吸光度 [2]。
细胞实验
细胞增殖(MTT 法):将细胞接种于 24 孔板中,用不同浓度的鸢尾素处理 24 小时,然后在 37°C 避光条件下用 0.1 mg/ml MTT 孵育 4 小时。将生成的甲臜晶体溶解于 DMSO 中,并在 565 nm 处测量吸光度,以 650 nm 为背景值 [1]。
- 伤口愈合实验:将生长至汇合的细胞接种于 6 孔板中,用 200 μl 移液器吸头划痕,用 PBS 洗涤,拍照(T0),然后用鸢尾素(10、25、50 μM)或 DMSO 处理 24 小时。在第24天(T24)拍摄伤口照片,并使用ImageJ软件计算伤口愈合百分比[1]。
- Transwell侵袭实验:将悬浮于DMEM培养基中的细胞接种到预先包被Matrigel的Transwell小室(孔径8 μm)中,小室中含有Irigenin(10、25、50 μM)或IST-9抗体。下室含有10% FBS作为趋化因子。24小时后,去除上室膜表面的未侵袭细胞,将下室膜表面的侵袭细胞用3.7%甲醛固定,结晶紫染色,并在五个视野中计数[1]。
- Western blotting:用Irigenin处理的细胞用RIPA裂解缓冲液裂解,采用BCA法测定蛋白浓度。等量的蛋白质经SDS-PAGE(10-12%)分离后,转移至PVDF膜,用5%脱脂奶粉封闭,与一抗(抗E-钙黏蛋白、抗波形蛋白、抗Snail、抗Zeb-1、抗β-肌动蛋白等)于4℃孵育过夜,再与红外标记的二抗孵育,最后用红外扫描仪进行扫描[1]。
- DAPI染色检测细胞核浓缩:细胞用1%多聚甲醛固定30分钟,PBS洗涤,DAPI溶液染色5分钟,荧光显微镜分析[2]。
- 胞质组蛋白相关DNA片段化分析:用Irigenin和/或TRAIL处理后,使用试剂盒(未具体说明)进行检测[2]。
- 流式细胞术检测亚G1期细胞:细胞重悬于PBS中,用95%多聚甲醛固定。将细胞用乙醇(涡旋振荡)处理,4°C孵育1小时,洗涤后重悬于含RNase的柠檬酸钠缓冲液(pH 8.4)中,37°C孵育30分钟,然后用碘化丙啶(50 μg/ml)室温染色30分钟,最后用流式细胞仪进行分析[2]。
- 细胞凋亡流式细胞术(Annexin V/PI):用Irigenin和/或TRAIL处理24小时后,按照制造商的方案,使用Annexin V/PI双染试剂盒对细胞进行染色[2]。
- ROS测定:按所示方法处理细胞后,用5 μM DCF-DA在37°C孵育30分钟,并使用荧光显微镜分析和采集荧光信号[2]。
- siRNA转染:将细胞转染siRNA寡核苷酸(30使用脂质体转染试剂 2000,按照制造商的建议,以 nmol/l 为单位靶向 FADD、DR5 或 Bax(或打乱对照)[2]。
动物实验
裸鼠异种移植模型:将SGC-7901细胞(2 × 10^6个,200 μl)皮下注射到4周龄雄性裸鼠的侧腹部。当肿瘤体积达到约50 mm^3时,将小鼠随机分为4组(n=?,未具体说明),并每日治疗一次,持续21天:对照组(仅注射载体);TRAIL单药组(100 μg/kg,瘤内注射);鸢尾素单药组(10 mg/kg,腹腔注射);联合用药组(10 mg/kg鸢尾素,腹腔注射,24小时后瘤内注射TRAIL 100 μg/kg)。每周使用公式:体积 = 0.5 × 长 × 宽测量肿瘤大小。实验结束时,测量肿瘤重量,并将肿瘤固定进行H&E染色[2]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
- MTT 检测结果显示,浓度高达 40 μM 的 鸢尾素 对正常人胃上皮细胞 GES-1 没有细胞毒性 [2]。
参考文献

[1]. Irigenin, a novel lead from Western Himalayan chemiome inhibits Fibronectin-Extra Domain A induced metastasis in Lung cancer cells. Sci Rep. 2016 Nov 16;6:37151.

[2]. Irigenin sensitizes TRAIL-induced apoptosis via enhancing pro-apoptotic molecules in gastric cancer cells. Biochem Biophys Res Commun. 2018 Feb 12;496(3):998-1005.

其他信息
鸢尾素是一种羟基异黄酮,其结构中异黄酮的5'、7'和3'位被羟基取代,6'、4'和5'位被甲氧基取代。它是一种植物代谢产物。鸢尾素属于4'-甲氧基异黄酮类化合物,在功能上与异黄酮相关。据报道,鸢尾(Iris tectorum)、鸢尾(Iris milesii)和其他具有相关数据的生物体中均发现了鸢尾素。
- 鸢尾素 是一种从克什米尔鸢尾(Iris kashmiriana)和射干(Belamcanda chinensis)中提取的黄酮类化合物[1][2]。
- 计算机筛选预测 鸢尾素 符合 Lipinski 五规则(分子量≤500,clogP≤4.5,氢键供体≤5,氢键受体≤10),并具有良好的 ADME 特性;使用 Pre-ADMET 工具预测其不具有致突变性和非致癌性 [1]。
- 鸢尾素 可阻断纤连蛋白 EDA 的 CC' 环,阻止其与 α9β1 和 α4β1 整合素的相互作用,从而抑制肺癌细胞的上皮-间质转化 (EMT) 和转移 [1]。
- 在胃癌中,鸢尾素 通过上调 FADD、DR5 和 Bax,并下调 c-FLIP、Bcl-2 和 Survivin,部分通过 ROS 生成,增强 TRAIL 诱导的细胞凋亡 [2]。
- 鸢尾素 与 TRAIL 联合使用可抑制胃癌异种移植模型中的肿瘤生长,且未见明显的全身毒性报道 [2]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H16O8
分子量
360.3148
精确质量
360.085
元素分析
C, 60.00; H, 4.48; O, 35.52
CAS号
548-76-5
PubChem CID
5464170
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
密度
1.461g/cm3
沸点
646.1ºC at 760mmHg
熔点
189-192ºC
闪点
237.7ºC
折射率
1.649
LogP
2.602
tPSA
118.59
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
549
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O1C([H])=C(C(C2C(=C(C(=C([H])C1=2)O[H])OC([H])([H])[H])O[H])=O)C1=C([H])C(=C(C(=C1[H])OC([H])([H])[H])OC([H])([H])[H])O[H]
InChi Key
TUGWPJJTQNLKCL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H16O8/c1-23-13-5-8(4-10(19)17(13)24-2)9-7-26-12-6-11(20)18(25-3)16(22)14(12)15(9)21/h4-7,19-20,22H,1-3H3
化学名
5,7-dihydroxy-3-(3-hydroxy-4,5-dimethoxyphenyl)-6-methoxychromen-4-one
别名
Irigenin
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~277.54 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.94 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.94 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.94 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7754 mL 13.8769 mL 27.7539 mL
5 mM 0.5551 mL 2.7754 mL 5.5508 mL
10 mM 0.2775 mL 1.3877 mL 2.7754 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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