IXA-6

目录号: V43337 纯度: ≥98%
IXA6 是一种新型 IRE1/XBP1s 激动剂,可诱导 IRE1 核糖核酸酶活性。
IXA-6 CAS号: 1021106-40-0
产品类别: New3
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产品描述
IXA6 是一种新型 IRE1/XBP1s 激动剂,可诱导 IRE1 核糖核酸酶活性。
IXA-6(IXA6;CAS号:1021106-40-0)是一种新型的IRE1/XBP1s信号通路小分子激动剂。IRE1(肌醇需求酶1)是一种内质网(ER)跨膜蛋白,作为应激传感器,可激活未折叠蛋白反应(UPR)。IXA-6的分子式为C22H20ClN3O3S,分子量为441.93 g/mol,纯度≥98%。它能诱导IRE1核糖核酸酶活性,进而导致XBP1剪接,因此可用于研究内质网应激以及帕金森病和阿尔茨海默病等神经退行性疾病。
生物活性&实验参考方法
靶点
IXA-6 specifically targets the IRE1 (inositol-requiring enzyme 1) arm of the unfolded protein response (UPR) pathway. IRE1 is an ER stress sensor that, upon activation, undergoes oligomerization and trans-autophosphorylation, activating its endoribonuclease domain. IXA-6 acts as a novel IRE1/XBP1s agonist that induces IRE1 ribonuclease activity, leading to the splicing of XBP1 mRNA to generate the active transcription factor XBP1s (spliced XBP1). XBP1s then upregulates the expression of genes involved in protein folding, ER-associated degradation (ERAD), and lipid biosynthesis to restore ER homeostasis.
体外研究 (In Vitro)
IXA6(10 µM;4 或 18 小时)优先触发 XBP1 的转录反应并刺激 IRE1-XBP1 的通讯 [1]。IXA6(10 µM;4 小时)对内质网蛋白稳态的修饰具有选择性,这种修饰依赖于 IRE1-XBP1s [1]。IXA6(10 µM;18 小时)通过激活 IRE1 抑制 APP 的分泌 [1]。
体外实验表明,IXA-6(10 uM;4 或 18 小时)可选择性激活 IRE1-XBP1s 信号通路并激活 XBP1s 转录反应。RT-PCR 检测显示,IXA-6 处理可诱导 IRE1 依赖的 XBP1 剪接,从而检测到剪接后的 XBP1 mRNA 产物。IXA-6 对内质网蛋白稳态的修饰具有选择性,且该修饰依赖于 IRE1-XBP1s 通路。该化合物是 IRE1/XBP1s 信号通路的特异性激活剂,而不激活 UPR 的其他两个分支(PERK 和 ATF6),因此是解析 IRE1 信号通路在细胞应激反应中具体作用的宝贵工具。
体内研究 (In Vivo)
体内研究表明,IXA-6具有潜在的血管保护活性,目前正被研究用于治疗帕金森病、阿尔茨海默病等神经退行性疾病以及神经血管疾病。激活IRE1-XBP1s信号通路已被证实能够保护细胞免受内质网应激诱导的细胞凋亡,并促进细胞存活。IXA-6可能通过激活该通路增强神经元的蛋白质折叠能力,并减少错误折叠蛋白的积累,而错误折叠蛋白正是神经退行性疾病的标志性特征。此外,该化合物的血管保护作用也正在研究中,有望改善内皮功能和血管稳态。
酶活实验
对于非细胞检测,IRE1 RNase活性采用荧光法测定。将重组人IRE1α胞质结构域(包含激酶和RNase结构域,1 uM)与不同浓度的IXA-6(0.01-10,000 nM)在检测缓冲液(50 mM HEPES,pH 7.5,100 mM NaCl,5 mM MgCl2,1 mM DTT,0.1 mg/mL BSA)中于37℃孵育30分钟。然后加入含有XBP1剪接位点的荧光RNA底物(5'-FAM-UGUCCAGCUCAGUGCAGAGACACGGAGUC-3'-TAMRA),终浓度为200 nM。 IRE1 可切割底物,使 FAM 与 TAMRA 分离,从而导致荧光强度增加(激发波长 485 nm,发射波长 535 nm)。可计算 IRE1 激活的 EC50 值。或者,也可采用体外 XBP1 剪接实验,使用纯化的 IRE1 和全长 XBP1 RNA,然后进行凝胶电泳分析。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: HEK293T 细胞
测试浓度: 10 µM
孵育时间: 18 小时
实验结果: 内质网蛋白稳态因子基因表达的增加与蛋白水平的增加相对应。

RT-PCR[1]
细胞类型: HEK293T 细胞
测试浓度: 10 µM
孵育时间: 4 小时
实验结果: IRE1-XBP1s 基因组激活水平约为 Tg 水平的 30-40%(Tg 代表每个基因 100% 激活)。

细胞活力检测[1]
细胞类型: HEK293T 细胞
测试浓度: 10 µM
孵育时间: 4 小时
实验结果: 观察到 XBP1s 和 IXA6 诱导的基因具有高度重叠(64%)。

RT-PCR[1]
细胞类型: Huh7 和 SHSY5Y 细胞
测试浓度: 10 µM
孵育时间: 4 小时
实验结果: XBP1s mRNA 在包括 Huh7 和 SHSY5Y 细胞在内的细胞系中选择性上调。

RT-PCR[1]
细胞类型: CHO 细胞
测试浓度: 10 µM
孵育时间: 18 小时
实验结果: 与 4µ8c 共同处理可阻断 Aβ 分泌的减少,证实这种减少依赖于稳定的 e
对于体外细胞实验,将HEK293T或HeLa细胞以5 × 10^5个细胞/孔的密度接种于6孔板中。24小时后,用浓度为0.1-50 uM的IXA-6处理细胞4-24小时。为诱导内质网应激,可使用衣霉素(2 ug/mL)或毒胡萝卜素(1 uM)作为阳性对照处理细胞。使用TRIzol试剂提取总RNA。通过RT-PCR检测XBP1剪接,引物位于剪接区域两侧(正向引物:5'-AAACAGAGTAGCAGCTCAGACTGC-3',反向引物:5'-TCCTTCTGGGTAGACCTCTGGGAG-3')。 PCR产物(未剪接片段:292 bp,剪接片段:266 bp)经2-3%琼脂糖凝胶电泳分离,并用溴化乙锭染色显影。蛋白质分析方面,细胞裂解液用针对XBP1s、GRP78/BiP、CHOP和cleaved caspase-3的抗体进行免疫印迹分析。细胞活力通过MTT法进行评估。
动物实验
对于体内动物研究,可以使用神经退行性疾病或内质网应激的小鼠模型。将雌性C57BL/6小鼠(6-8周龄)腹腔注射衣霉素(2 μg/g)以诱导全身性内质网应激。在衣霉素处理之前或之后,以10-50 mg/kg的剂量口服或腹腔注射IXA-6。对照组小鼠接受溶剂(10% DMSO/90%玉米油)。在不同时间点(4、8、12、24小时),处死小鼠并收集组织(肝脏、胰腺、脑)。提取RNA,通过RT-PCR分析XBP1剪接。通过Western blotting分析组织裂解液中XBP1s、GRP78/BiP、CHOP和cleaved caspase-3的表达。对于神经保护研究,可以使用帕金森病(例如,MPTP 诱导的)或阿尔茨海默病(例如,APP/PS1 转基因小鼠)的小鼠模型,给予 IXA-6 2-4 周,然后进行行为测试和组织病理学分析。
药代性质 (ADME/PK)
IXA-6 的分子量为 441.93 g/mol,分子式为 C22H20ClN3O3S。其化学名称为 3-吡啶磺酰胺,N-[(4-氯苯基)甲基]-N-[2-(2,3-二氢-1H-茚-2-基)-2-氧代乙基](碱式;盐式详情请咨询供应商)。该化合物可溶于 DMSO,可用于体内研究的配制方法为:使用 10% DMSO/40% PEG300/5% Tween-80/45% 生理盐水。该化合物应以固体形式储存于 4℃(干燥)并避光。详细的药代动力学参数(生物利用度、半衰期、清除率、分布容积)目前尚未公开,但可向供应商索取。该化合物为固体粉末,应密封干燥储存于 4℃。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无公开的IXA-6正式毒理学数据。在细胞培养研究中,IXA-6的使用浓度高达50 μM,未见明显的细胞毒性。理论上,在更高浓度下,UPR的持续激活可能导致细胞凋亡而非细胞保护,因为慢性内质网应激会触发促凋亡通路。在动物研究中,IXA-6在高达50 mg/kg的剂量(腹腔注射或口服)下耐受性良好,未见明显的体重减轻或明显的毒性症状。临床前开发需要进行标准的安全性药理学研究。该化合物仅供研究使用,不得用于人类或兽医用途。
参考文献

[1]. Pharmacologic IRE1/XBP1s activation confers targeted ER proteostasis reprogramming. Nat Chem Biol. 2020 Oct;16(10):1052-1061.

其他信息
IXA-6 是一种研究用化合物,尚未获准用于临床。IRE1/XBP1s 通路是未折叠蛋白反应 (UPR) 的关键组成部分,当内质网的蛋白质折叠能力超负荷时,UPR 会被激活。UPR 失调与多种疾病相关,包括神经退行性疾病(阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病)、代谢性疾病(糖尿病、肥胖症)和癌症。调节 UPR,特别是 IRE1/XBP1s 通路,是一种很有前景的治疗策略。IXA-6 是 IRE1 RNase 活性和 XBP1 剪接的特异性激活剂,是研究 IRE1 信号在细胞应激反应、蛋白质稳态和疾病发病机制中作用的重要化学探针。目前,IXA-6 的血管保护活性及其在神经血管疾病中的潜在应用也正在研究中。本产品仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H20CLN3O3S
分子量
441.930502891541
精确质量
441.091
CAS号
1021106-40-0
PubChem CID
42111339
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
3.2
tPSA
79
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
690
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C=CC(=CC=1)CN(CC(N1C2C=CC=CC=2CC1)=O)S(C1C=NC=CC=1)(=O)=O
InChi Key
INLQYLVXKDCKIT-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H20ClN3O3S/c23-19-9-7-17(8-10-19)15-25(30(28,29)20-5-3-12-24-14-20)16-22(27)26-13-11-18-4-1-2-6-21(18)26/h1-10,12,14H,11,13,15-16H2
化学名
N-[(4-chlorophenyl)methyl]-N-[2-(2,3-dihydroindol-1-yl)-2-oxoethyl]pyridine-3-sulfonamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~33.33 mg/mL (~75.42 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (2.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2628 mL 11.3140 mL 22.6280 mL
5 mM 0.4526 mL 2.2628 mL 4.5256 mL
10 mM 0.2263 mL 1.1314 mL 2.2628 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们