JH-XI-10-02

别名: JH-XI-10-02JH-XI 10-02JHXI-10-02
目录号: V31556 纯度: ≥98%
JH-XI-10-02 是一种新型、有效、选择性的基于 PROTAC 的 CDK8 降解剂,在 Jurkat 细胞中降解 CDK8 的 DC50 为 159 nM。
JH-XI-10-02 CAS号: 2209085-22-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
JH-XI-10-02 是一种新型、高效且选择性的基于 PROTAC 的 CDK8 降解剂,在 Jurkat 细胞中对 CDK8 的降解 DC50 为 159 nM。JH-XI-10-02 可导致蛋白酶体降解,但不影响 CDK8 mRNA 水平。JH-XI-10-02 对 CDK19 无影响。
JH-XI-10-02 是一种高效且选择性的细胞周期蛋白依赖性激酶 8 (CDK8) PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)降解剂。其分子式为 C₅3H₆₉N₅O₉,分子量为 920.14,是一种二价小分子,由 CDK 靶向配体和 cereblon 募集基团连接而成。JH-XI-10-02 能有效促进 CDK8 的泛素化及其后续的蛋白酶体降解,且不影响 CDK8 mRNA 水平。其对 CDK8 降解的 IC₅0 值为 159 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
JH-XI-10-02 targets cyclin-dependent kinase 8 (CDK8), a component of the Mediator complex that regulates transcription. The compound functions as a PROTAC that simultaneously binds to CDK8 and the E3 ubiquitin ligase Cereblon (CRL4Cereblon). This brings CDK8 into proximity with the ubiquitin-proteasome system, leading to its ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. JH-XI-10-02 shows no effect on CDK19, demonstrating selectivity for CDK8 over the closely related CDK19.
体外研究 (In Vitro)
JH-XI-10-02 是一种二价小分子化学修饰剂,可激活 E3 连接酶 CRL4Cereblon,促进 CDK8 泛素化和蛋白酶体修饰 [1]。JH-XI-10-02 (1 μM) 处理 Jurkat 细胞 6 小时后可导致 CDK8 部分降解。JH-XI-10-02 (1 μM) 处理 24 小时后可导致 CDK8 显著降解 [1]。JH-XI-10-02 在 5 μM 浓度下可导致野生型 Molt4 细胞中 CDK8 降解。CRBN nuLl Molt4 细胞在 CRISPR/Cas9 介导的杂交 24 小时后,无论浓度为 0.1-5 μM,均未观察到 CDK8 降解,无论是野生型 Molt4 细胞还是添加 CRBN 的 Molt4 细胞 [1]。
体外实验表明,JH-XI-10-02 是一种高效且选择性的基于 PROTAC 的 CDK8 降解剂,其 IC₅0 值为 159 nM。它能诱导 CDK8 的蛋白酶体降解,而不影响 CDK8 mRNA 水平,表明其作用机制为翻译后修饰。在 Jurkat 细胞中,1 uM 的 JH-XI-10-02 可在 24 小时后显著诱导 CDK8 的蛋白酶体依赖性降解,而对 CDK19 水平无显著影响。这种选择性降解使其成为研究 CDK8 生物学的宝贵工具。
体内研究 (In Vivo)
JH-XI-10-02 的体内研究有限,因为它主要用作细胞实验中的研究工具。然而,鉴于其高效且选择性地降解 CDK8(IC₅0 为 159 nM),该化合物可能具有在 CDK8 发挥作用的疾病(例如癌症和炎症性疾病)动物模型中进行体内疗效研究的潜力。需要进一步研究以评估其药代动力学特性、生物利用度和体内疗效。该化合物的 PROTAC 机制可能使其能够催化降解。
酶活实验
对于体外酶/受体结合实验,可使用结合实验评估 JH-XI-10-02 与 CDK8 和 Cereblon 的相互作用。表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 可用于测定结合亲和力。该化合物诱导 CDK8 与 Cereblon 形成三元复合物的能力可通过生物物理方法(例如 AlphaScreen 或 TR-FRET)进行评估。泛素化实验可用于测定化合物诱导的 CDK8 泛素化水平。标准实验条件包括具有适当 pH 值和离子强度的生理缓冲体系。
细胞实验
印迹分析[1]
细胞类型: Jurkat 细胞
测试浓度: 1 μM
孵育时间: 6 小时和 24 小时
实验结果: 在 1 μM 浓度下处理 6 小时后,CDK8 部分降解。在 1 μM 浓度下处理 24 小时后,CDK8 显著降解。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型:野生型Molt4细胞和CRBN基因敲除型Molt4细胞
测试浓度:0.1、0.5、1、2、5 μM
孵育时间:24小时
实验结果:5 μM浓度的CDK8在野生型Molt4细胞中被降解。CRBN基因敲除型Molt4细胞在任何浓度下均未发生降解。
在体外细胞实验中,JH-XI-10-02 在表达 CDK8 的细胞系(例如 Jurkat 细胞)中进行测试。将细胞培养于合适的培养基中,并用不同浓度的化合物(通常为纳摩尔至微摩尔浓度)处理。通过蛋白质印迹或免疫荧光法检测 CDK8 蛋白水平,以确定降解程度。表征降解的动力学和剂量依赖性。监测 CDK19 水平以确认选择性。使用标准检测方法评估细胞活力、增殖和下游转录效应。
动物实验
在体内动物实验中,JH-XI-10-02 可通过多种途径给药,包括腹腔注射或静脉注射,具体取决于其溶解度和药代动力学特性。该化合物的疗效可在异种移植模型或其他 CDK8 发挥作用的相关疾病模型中进行评估。典型的给药方案为 1 至 50 mg/kg。采用蛋白质印迹法或免疫组织化学法检测组织中 CDK8 蛋白的表达水平。同时,测量药效学标志物和生理参数,并监测肿瘤体积、体重和整体健康状况。
药代性质 (ADME/PK)
公开文献中对JH-XI-10-02的药代动力学特性描述并不详尽。作为一种分子量为920.14的PROTAC分子,其口服生物利用度可能有限,因此在体内研究中可能需要肠外给药。该化合物在生物体液中的溶解度和稳定性会影响其药代动力学特征。需要通过全面的药代动力学研究来确定Cₘₐₓ、Tₘₐₓ、AUC、半衰期和清除率等详细参数。为了获得最佳的体内给药效果,可能需要进行制剂开发。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于 JH-XI-10-02 主要用作研究工具,其毒理学数据有限。作为一种 CDK8 降解剂,其毒性取决于 CDK8 对正常细胞功能的重要性。CDK8 是一种转录调节因子,参与多种细胞过程,其降解可能对基因表达产生显著影响。为进一步开发,需要开展包括急性毒性、重复给药毒性、遗传毒性和心脏毒性评估在内的全面毒理学研究。处理该化合物时应采取适当的安全预防措施。
参考文献

[1]. Development of Highly Potent and Selective Steroidal Inhibitors and Degraders of CDK8. ACS Med Chem Lett. 2018 Mar 18;9(6):540-545.

其他信息
JH-XI-10-02 是一种用于靶向蛋白降解研究的实验化合物。目前尚未有关于该化合物作为治疗药物的临床试验或监管审批报告。该化合物仅供研究用途,可从多家化学品供应商处获得。该化合物是一种高效且选择性的 PROTAC CDK8 降解剂,IC₅₀ 为 159 nM。它能有效促进 CDK8 的泛素化和蛋白酶体降解,且不影响 CDK8 mRNA 水平,对 CDK19 无影响。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C53H69N5O9
分子量
920.1430747509
精确质量
919.509
CAS号
2209085-22-1
PubChem CID
133081965
外观&性状
Yellow to brown solid powder
LogP
7.2
tPSA
166
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
19
重原子数目
67
分子复杂度/Complexity
1770
定义原子立体中心数目
6
SMILES
O=C(CCOCCOCCOCCOCCNC1=CC=CC2C(N(C(C=21)=O)C1C(NC(CC1)=O)=O)=O)N(C)C1CC[C@@]2(C)[C@@H](C1)CC[C@@H]1[C@H]3CCC(C4=CC=C5C=CN=CC5=C4)[C@@]3(C)CC[C@@H]12
InChi Key
JECHBTRAPARMGI-KMIZWFMDSA-N
InChi Code
InChI=1S/C53H69N5O9/c1-52-19-15-38(32-37(52)9-10-39-42-12-11-41(53(42,2)20-16-43(39)52)35-8-7-34-17-21-54-33-36(34)31-35)57(3)47(60)18-23-64-25-27-66-29-30-67-28-26-65-24-22-55-44-6-4-5-40-48(44)51(63)58(50(40)62)45-13-14-46(59)56-49(45)61/h4-8,17,21,31,33,37-39,41-43,45,55H,9-16,18-20,22-30,32H2,1-3H3,(H,56,59,61)/t37?,38-,39-,41+,42-,43?,45?,52-,53+/m0/s1
化学名
3-[2-[2-[2-[2-[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-N-[(3S,8R,10S,13S,14S,17S)-17-isoquinolin-7-yl-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]-N-methylpropanamide
别名
JH-XI-10-02JH-XI 10-02JHXI-10-02
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~108.68 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 5.75 mg/mL (6.25 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 57.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0868 mL 5.4340 mL 10.8679 mL
5 mM 0.2174 mL 1.0868 mL 2.1736 mL
10 mM 0.1087 mL 0.5434 mL 1.0868 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们