| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5g |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
KAT8-IN-1 targets lysine acetyltransferase 8 (KAT8), also known as MOF (males absent on the first), which is a histone acetyltransferase (HAT). KAT8 acetylates histone H4 at lysine 16 (H4K16ac), a mark associated with transcriptional activation. Dysregulation of KAT8 and other HATs can contribute to diseases such as cancer and inflammatory diseases. KAT8-IN-1 inhibits histone acetyltransferases with IC50 values of 141 μM for KAT8, 221 μM for KAT2B, and 106 μM for KAT3B. The compound's mechanism involves competitive inhibition of the acetyltransferase activity. A distinctive feature of this compound is the detailed characterization of its inhibitory mechanism, including the calculation of both free enzyme and acetylated intermediate binding constants (Ki). The compound is used as a fragment for medicinal chemistry and drug discovery.
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| 体外研究 (In Vitro) |
KAT8-IN-1(化合物 19)不再具有抗氧化活性(EC50>1 mM)[1]。
体外实验表明,KAT8-IN-1 能抑制赖氨酸乙酰转移酶 8 (KAT8) 的活性,IC50 值为 141 μM。该化合物还能抑制 KAT2B(IC50 值为 221 μM)和 KAT3B(IC50 值为 106 μM)。该化合物的抑制活性已得到详细表征,包括 Ki 值的计算:游离 KAT8 的 Ki 值为 23 μM,乙酰化 KAT8 的 Ki 值为 190 μM,二者相差 8.3 倍,这使得我们能够进行机制性的自乙酰化研究。KAT8-IN-1 是一种片段分子,可用作药物化学和药物发现的构建模块。该化合物的片段特性可最大限度地减少生物物理测定中的聚集和非特异性结合。广谱 HAT 抑制剂存在脱靶效应,而 KAT8-IN-1 通过严格定义的基于片段的动力学特征解决了这一问题。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
KAT8-IN-1 并非治疗药物,而是作为研究组蛋白乙酰转移酶功能和基于片段的药物发现的工具。该化合物用于表观遗传学研究,以探究 KAT8 和其他组蛋白乙酰转移酶在基因调控和疾病中的作用。KAT8-IN-1 是一种片段分子,可作为开发更有效的 KAT8 抑制剂的起点。它在药物化学中用于基于片段的药物设计和优化。该化合物作为化学探针,使研究人员能够研究 KAT8 的生物学功能以及靶向该酶在癌症和炎症性疾病中的治疗潜力。该化合物尚未获准用于临床。
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| 酶活实验 |
KAT8-IN-1 的体外酶活性测定通常包括测量组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 的抑制率。该化合物溶于 DMSO 中配制成储备液,然后用测定缓冲液稀释至 1-1000 μM 的浓度范围。在 HAT 测定中,将重组 KAT8、KAT2B 或 KAT3B 酶与组蛋白底物、乙酰辅酶 A 和不同浓度的化合物一起孵育。通过测定 [3H]-乙酰基的掺入或使用抗体检测乙酰化组蛋白来评估其活性。IC50 值通过绘制抑制率与化合物浓度的关系图来计算。为了测定 Ki 值,在不同的底物和抑制剂浓度下测定酶动力学。该化合物在 DMSO 中的溶解度为 100 mg/mL (528.63 mM)。
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| 细胞实验 |
本研究采用KAT8-IN-1进行体外细胞实验,利用细胞培养模型研究KAT8抑制剂对组蛋白乙酰化和基因表达的影响。细胞用浓度为10-500 μM的化合物处理24-72小时。组蛋白乙酰化水平通过Western blot检测,使用针对乙酰化组蛋白H4K16的特异性抗体。基因表达变化通过qPCR或RNA测序进行分析。细胞活力采用MTT或CCK-8法进行评估。化合物通常溶于DMSO,并用细胞培养基稀释,最终DMSO浓度保持在0.1%以下。化合物对组蛋白乙酰化和基因表达的影响呈浓度依赖性。化合物储存于4℃氮气保护下。
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| 动物实验 |
KAT8-IN-1 的体内动物实验数据尚不充分,因为该化合物主要用作研究工具和药物发现的片段。该化合物的中等效力(IC50 141 μM)表明,体内研究可能需要高剂量,这可能会限制其在动物模型中的应用。然而,作为一种片段分子,KAT8-IN-1 可作为开发更有效、具有更佳药代动力学特性的 KAT8 抑制剂的起点,以用于体内研究。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于临床。如果用于动物研究,该化合物可能需要配制成合适的溶剂,例如 DMSO、PEG 或生理盐水。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
KAT8-IN-1 的分子量为 189.17 g/mol,分子式为 C10H7NO3。该化合物可溶于 DMSO,浓度为 100 mg/mL (528.63 mM)。长期储存时,该化合物需在氮气保护下于 4°C 保存。由于该化合物主要用作研究工具,其药代动力学性质尚未得到充分表征。该化合物是一种片段分子,可作为药物化学和药物发现的构建模块。其适中的效力和明确的动力学特征使其适用于基于片段的药物设计。该化合物的母体骨架为 4-氨基-1-萘酚,也称为 4-硝基-1-萘酚。该化合物以粉末形式储存于 -20°C。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
由于KAT8-IN-1主要用作体外研究的工具,其毒性尚未得到充分表征。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施,包括佩戴手套和护目镜。该化合物是一种组蛋白乙酰转移酶的小分子抑制剂,其在细胞培养中的毒性可能与浓度相关。在高浓度下,该化合物可能由于抑制重要的表观遗传过程而影响细胞活力。该化合物不属于剧毒物质,但仍应谨慎处理。安全数据表建议遵循研究化学品的标准操作规程。
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| 参考文献 |
[1]. Wapenaar H, et al. The relevance of Ki calculation for bi-substrate enzymes illustrated by kinetic evaluation of a novel lysine (K) acetyltransferase 8 inhibitor. Eur J Med Chem. 2017 Aug 18;136:480-486.
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| 其他信息 |
KAT8-IN-1(CAS 605-62-9)是一种小分子片段抑制剂,靶向赖氨酸乙酰转移酶8(KAT8,又称MOF)。该化合物的分子式为C10H7NO3,分子量为189.17 g/mol。它也被称为4-硝基-1-萘酚。KAT8-IN-1是通过片段筛选方法发现的,其母体骨架为4-氨基-1-萘酚。该化合物表现出中等的抑制活性,对KAT8、KAT2B和KAT3B的IC50值分别为141 μM、221 μM和106 μM。其显著特点是对其抑制机制进行了详细的表征,包括对游离KAT8的Ki值为23 μM,对乙酰化KAT8的Ki值为190 μM。 KAT8-IN-1 是一种用于药物化学和药物发现研究的片段分子。它可溶于 DMSO,浓度为 100 mg/mL,并储存在 4°C 的氮气保护下。该化合物仅供研究使用。
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| 分子式 |
C10H7NO3
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| 分子量 |
189.1675
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| 精确质量 |
189.042
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| CAS号 |
605-62-9
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| PubChem CID |
343829
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| 外观&性状 |
Yellow to brown solid powder
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| 密度 |
1.4±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
398.8±25.0 °C at 760 mmHg
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| 熔点 |
165-168°C
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| 闪点 |
179.8±11.6 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±1.0 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.714
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| LogP |
2.8
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| tPSA |
66.05
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
3
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| 可旋转键数目(RBC) |
0
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| 重原子数目 |
14
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| 分子复杂度/Complexity |
226
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
O([H])C1=C([H])C([H])=C(C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C21)[N+](=O)[O-]
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~528.63 mM)
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| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (5.29 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.0 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再将50 μL Tween-80+加入到上述溶液中,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 5.2863 mL | 26.4313 mL | 52.8625 mL | |
| 5 mM | 1.0573 mL | 5.2863 mL | 10.5725 mL | |
| 10 mM | 0.5286 mL | 2.6431 mL | 5.2863 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。