KCC 07

别名: KCC 07; KCC07; KCC-07
目录号: V23165 纯度: ≥98%
KCC 07 是一种 MBD2(甲基 CpG 结合域蛋白 2)抑制剂,可防止 MBD2 与甲基化 DNA 结合并激活大脑特异性血管生成抑制剂 1 (BAI1)/p53 信号传导。
KCC 07 CAS号: 315702-75-1
产品类别: DNA alkylator
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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产品描述
KCC 07 是一种 MBD2(甲基-CpG 结合域蛋白 2)抑制剂,可阻止 MBD2 与甲基化 DNA 结合,并激活脑特异性血管生成抑制因子 1 (BAI1)/p53 信号通路。
KCC 07(CAS 编号:315702-75-1)是一种高效、选择性强且能穿透血脑屏障的甲基-CpG 结合域蛋白 2 (MBD2) 抑制剂,具有抗癌活性。它可阻止 MBD2 与甲基化 DNA 结合,并激活脑特异性血管生成抑制因子 1 (BAI1),从而诱导抗增殖的 BAI1/p53/p21 信号通路。KCC-07 的分子量为 269.32,在 DMSO 中的溶解度为 100 mg/mL (371.3 mM),在乙醇中的溶解度为 54 mg/mL,但不溶于水。该化合物纯度为 99.81%。其选择性和脑渗透性使 KCC-07 成为研究 MBD2 在各种生物过程(包括神经系统疾病和癌症)中作用的一种很有前景的化合物。
生物活性&实验参考方法
靶点
MBD2 (methyl-CpG-binding domain protein 2)
The primary target is MBD2 (methyl-CpG-binding domain protein 2), a protein that binds to methylated DNA and regulates gene expression. KCC-07 selectively inhibits this interaction, preventing MBD2 from binding to methylated DNA. By inhibiting MBD2, KCC-07 modulates the interactions between MBD2 and methylated DNA, potentially altering gene expression patterns. This inhibition activates brain-specific angiogenesis inhibitor 1 (BAI1) and induces anti-proliferative BAI1/p53/p21 signaling. The compound also reactivates ADGRB1 expression and prevents MDM2-mediated p53 polyubiquitination.
体外研究 (In Vitro)
体外用KCC-07(10 μM;72小时)处理MB细胞可显著降低其增殖,这与抗增殖的BAI1/p53/p21信号通路一致[1]。KCC-07处理MB细胞后,MBD2与ADGRB1启动子的结合显著降低,并恢复了BAI1沉默的MB细胞中BAI1 mRNA和蛋白的表达[1]。KCC-07可阻止MBD2与甲基化DNA的结合。这种抑制作用可激活BAI1(脑特异性血管生成抑制因子1),并诱导抗增殖的BAI1/p53/p21信号通路。该化合物在多种细胞模型中均表现出抗癌活性。通过阻断MBD2的功能,KCC-07可以重新激活被DNA甲基化沉默的抑癌基因,从而抑制癌细胞增殖。该化合物对 MBD2 的选择性优于其他甲基-CpG 结合蛋白,这有助于其产生特定的生物学效应并降低脱靶活性。
体内研究 (In Vivo)
KCC-07(100 mg/kg;腹腔注射;每周5天;无胸腺裸鼠)治疗显著延长了体内髓母细胞瘤异种移植瘤的存活期并抑制了肿瘤生长[1]。
KCC-07在体内表现出抗癌活性。作为一种可穿透血脑屏障的化合物,它能够到达中枢神经系统的靶点,使其在脑肿瘤和神经系统疾病的研究中具有重要价值。该化合物能够穿过血脑屏障,这对于其在脑癌和MBD2发挥作用的神经系统疾病的潜在治疗应用至关重要。体内疗效可能会在原位脑肿瘤模型或其他预期MBD2抑制具有治疗益处的癌症模型中进行评估。
酶活实验
目前尚无针对KCC-07的特定非细胞检测方法。对于MBD2抑制剂,标准的无细胞检测方法包括使用重组MBD2蛋白和荧光标记的甲基化DNA寡核苷酸进行荧光偏振或电泳迁移率变动分析(EMSA)。将化合物与蛋白和DNA孵育,并通过荧光偏振或凝胶迁移率的变化来测量结合抑制情况。这些检测方法可以确定化合物的效力(IC50),并深入了解其干扰MBD2-DNA相互作用的机制。
细胞实验
细胞活力检测 [1]
细胞类型: 髓母细胞瘤 (MB) 细胞
测试浓度: 10 μM
孵育时间: 72 小时
实验结果: 体外显著抑制 MB 细胞生长。
蛋白质印迹分析 [1]
细胞类型: 髓母细胞瘤 (MB) 细胞
测试浓度: 10 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 在 BAI1 沉默的 MB 细胞中,MBD2 与 ADGRB1 启动子的结合基本消除。
目前尚无针对 KCC-07 细胞的特定检测方案。对于MBD2抑制剂,细胞实验包括用化合物处理癌细胞系24-72小时。处理后,分析细胞中MBD2抑制的标志物,包括甲基化基因的重新激活、通过蛋白质印迹法检测BAI1、p53和p21蛋白的表达,以及细胞增殖实验(MTT或CCK-8)。此外,还可以使用甲基化特异性PCR或亚硫酸氢盐测序来确认靶基因启动子处DNA甲基化模式的变化。
动物实验
动物/疾病模型:注射MB细胞的近交系无胸腺裸鼠(雌性;8-10周龄)[1]
剂量:100 mg/kg
给药途径:腹腔注射;每周5天
实验结果:显著延长MB异种移植的存活时间。
目前尚无针对KCC-07的特定动物实验方案。对于脑肿瘤模型,标准的体内研究采用原位异种移植模型,即将癌细胞植入小鼠脑内。化合物通常经口服或腹腔注射给药2-4周,并通过MRI或生物发光成像测量肿瘤大小。对于其他癌症模型,可使用皮下异种移植或转基因模型。 KCC-07 的脑穿透性对于脑转移瘤或原发性脑肿瘤的研究尤为重要。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无公开的KCC-07详细药代动力学数据。KCC-07被描述为具有脑渗透性,表明其能够穿过血脑屏障。其分子量为269.32,分子式为C14H11N3OS。该化合物在DMSO中的溶解度为100 mg/mL,在乙醇中的溶解度为54 mg/mL,但不溶于水。体内给药时,可在CMC-Na中制备浓度≥5 mg/mL的均质混悬液。需要进行全面的药代动力学研究以确定其吸收、分布、代谢和排泄参数。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无公开的KCC-07详细毒理学数据。作为一种研究化合物,其治疗开发需要进行标准的临床前毒理学研究。该化合物具有脑穿透性,提示可能存在中枢神经系统相关副作用,需要进行仔细评估。该化合物对MBD2的选择性可能有助于其安全性,但仍需评估其对其他甲基-CpG结合蛋白或无关靶点的潜在脱靶效应。该化合物仅供研究使用,不得用于治疗用途。
参考文献

[1]. BAI1 Suppresses Medulloblastoma Formation by Protecting p53 From Mdm2-Mediated Degradation. Cancer Cell. 2018 Jun 11;33(6):1004-1016.e5.

其他信息
KCC-07(3-[[4-(2-吡啶基)-2-噻唑基]氨基]苯酚)分子量为269.32,分子式为C14H11N3OS。它被归类为表观遗传化合物。该化合物在DMSO中的溶解度为100 mg/mL,在乙醇中的溶解度为54 mg/mL,但不溶于水。用于体内给药时,可将其配制成浓度≥5 mg/mL的CMC-Na均相混悬液。纯度为99.81%。目前尚未发现任何临床试验或已获批准的药物信息;它仍是一种用于研究MBD2生物学以及癌症和神经系统疾病中表观遗传调控的研究工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H11N3OS
分子量
269.321641206741
精确质量
269.06
元素分析
C, 62.44; H, 4.12; N, 15.60; O, 5.94; S, 11.90
CAS号
315702-75-1
PubChem CID
704347
外观&性状
White to yellow solid powder
LogP
3.1
tPSA
86.3
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
292
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=NC(=C1)C2=CSC(=N2)NC3=CC(=CC=C3)O
InChi Key
GIGNWEDIMLUWCT-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H11N3OS/c18-11-5-3-4-10(8-11)16-14-17-13(9-19-14)12-6-1-2-7-15-12/h1-9,18H,(H,16,17)
化学名
3-[(4-pyridin-2-yl-1,3-thiazol-2-yl)amino]phenol
别名
KCC 07; KCC07; KCC-07
HS Tariff Code
2934.99.03.00
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 54~125 mg/mL (200.5~464.1 mM)
Ethanol: 54 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.72 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.72 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.72 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.7131 mL 18.5653 mL 37.1306 mL
5 mM 0.7426 mL 3.7131 mL 7.4261 mL
10 mM 0.3713 mL 1.8565 mL 3.7131 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • KCC-07 distributes to the Brain and Inhibits Tumor Growth in vitro. Cancer Cell . 2018 Jun 11;33(6):1004-1016.e5.
  • KCC-07 Inhibits Orthotopic MB Growth in mice xenografts. Cancer Cell . 2018 Jun 11;33(6):1004-1016.e5.
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