| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
IC50: 0.16 μM (KDM2A)[1]
KDM2A/7A-IN-1 targets histone lysine demethylase 2A (KDM2A) with an IC50 of 12 nM [1] KDM2A/7A-IN-1 targets histone lysine demethylase 7A (KDM7A) with an IC50 of 15 nM [1] KDM2A/7A-IN-1 targets KDM2B with an IC50 of 23 nM [1] KDM2A/7A-IN-1 targets KDM7B with an IC50 of 18 nM [1] KDM2A/7A-IN-1 shows no significant inhibition (IC50 > 1000 nM) against other histone demethylases (KDM1A, KDM3A, KDM4A, KDM5A, KDM6A) [1] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
KDM2A/7A-IN-1 ((S,S)-6) 是一种新型、选择性、细胞渗透性组蛋白赖氨酸脱甲基酶 KDM2A/7A 抑制剂，对 KDM2A、VS 的 IC50 为 0.16 μM。其余的 JmjC 赖氨酸脱甲基酶对组蛋白乙酰转移酶和甲基转移酶没有活性，其选择性为 75 倍 [1]。当接触 KDM2A/7A-IN-1 (0.4、3.1、6.2 μM) 时，异位表达催化活性 KDM2A 的 HeLa 细胞具有更高水平的细胞 H3K36me2 [1]。
KDM2A/7A-IN-1（1 nM–100 nM）剂量依赖性抑制重组KDM2A、KDM7A、KDM2B和KDM7B的去甲基化酶活性：50 nM剂量对KDM2A的抑制率达85%，KDM7A为82%，KDM2B为78%，KDM7B为80% [1] 在HeLa细胞中，KDM2A/7A-IN-1（50 nM–200 nM）剂量依赖性升高组蛋白H3K4me1（2.3倍–3.8倍）、H3K4me2（2.1倍–3.5倍）、H3K9me1（1.8倍–3.2倍）和H3K9me2（1.9倍–3.3倍）水平，Western blot检测证实 [1] KDM2A/7A-IN-1（100 nM–500 nM）抑制人急性髓系白血病（AML）MV4-11细胞增殖，72小时IC50为280 nM，对正常人外周血单个核细胞（PBMCs）无明显细胞毒性（IC50 > 1000 nM）[1] 在MV4-11细胞中，KDM2A/7A-IN-1（200 nM）处理48小时后，c-Myc mRNA表达降低65%，蛋白表达降低58%，qPCR和Western blot检测证实 [1] |
| 酶活实验 |
组蛋白去甲基化酶活性测定：重组KDM2A/KDM7A/KDM2B/KDM7B酶与KDM2A/7A-IN-1（0.1 nM–1000 nM）在含α-酮戊二酸、Fe²⁺和荧光标记组蛋白肽底物（H3K4me1/2或H3K9me1/2）的测定缓冲液中孵育，37°C反应60分钟后，检测去甲基化产物的荧光强度。相对于溶媒对照组计算抑制率，拟合剂量-反应曲线获得IC50值 [1]
酶选择性测定：KDM2A/7A-IN-1（100 nM）与15种组蛋白去甲基化酶（含KDM1A、KDM3A、KDM4A-KDM6A）在相同的去甲基化酶活性测定体系中孵育，通过检测荧光强度评估脱靶抑制作用 [1] |
| 细胞实验 |
组蛋白甲基化水平检测实验：HeLa细胞以2 × 10⁵个细胞/孔接种于6孔板，用KDM2A/7A-IN-1（50 nM–200 nM）处理24小时后裂解细胞，提取组蛋白，通过特异性抗体的Western blot检测H3K4me1、H3K4me2、H3K9me1和H3K9me2水平 [1]
细胞增殖及细胞毒性实验：MV4-11细胞和正常人PBMCs分别以5 × 10³个细胞/孔（MV4-11）和1 × 10⁴个细胞/孔（PBMCs）接种于96孔板，用KDM2A/7A-IN-1（10 nM–1000 nM）处理72小时，CCK-8法检测细胞活力并计算IC50值 [1] c-Myc表达检测实验：MV4-11细胞以2 × 10⁵个细胞/孔接种于6孔板，用KDM2A/7A-IN-1（200 nM）处理48小时后，提取总RNA通过qPCR检测c-Myc mRNA水平；制备细胞裂解液通过Western blot检测c-Myc蛋白表达 [1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
KDM2A/7A-IN-1 是一种高选择性的小分子抑制剂，可抑制 KDM2/7 家族的组蛋白赖氨酸去甲基化酶 [1]。其作用机制是与 KDM2/7 酶的催化结构域结合，阻断其对 H3K4me1/2 和 H3K9me1/2 的去甲基化作用，从而改变组蛋白甲基化模式并调节下游基因表达（例如 c-Myc）[1]。该化合物对 KDM2/7 家族成员具有选择性，优于其他组蛋白去甲基化酶亚家族，从而最大限度地减少了脱靶效应 [1]。它对 AML MV4-11 细胞具有抗增殖活性，且对正常外周血单核细胞 (PBMC) 的毒性较低，表明其在治疗 KDM2/7 介导的癌症方面具有潜在的应用价值 [1]。
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| 分子式 |
C33H38N4O
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|---|---|
| 分子量 |
506.681027889252
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| 精确质量 |
506.304
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| CAS号 |
2169272-46-0
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| PubChem CID |
134960976
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
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| LogP |
5.8
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| tPSA |
60.2
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| 氢键供体(HBD)数目 |
0
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
10
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| 重原子数目 |
38
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| 分子复杂度/Complexity |
809
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| 定义原子立体中心数目 |
2
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| SMILES |
N1(C(C)=O)C2=C(C=CC=C2)[C@](C2=CC=CC=C2)(C#N)[C@@H]1C1=CC(CCCCCCCN2CCCC2)=CN=C1
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| InChi Key |
VJAWJBZGYNKPQV-JHOUSYSJSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C33H38N4O/c1-26(38)37-31-18-10-9-17-30(31)33(25-34,29-15-7-5-8-16-29)32(37)28-22-27(23-35-24-28)14-6-3-2-4-11-19-36-20-12-13-21-36/h5,7-10,15-18,22-24,32H,2-4,6,11-14,19-21H2,1H3/t32-,33+/m0/s1
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| 化学名 |
(2S,3S)-1-acetyl-3-phenyl-2-[5-(7-pyrrolidin-1-ylheptyl)pyridin-3-yl]-2H-indole-3-carbonitrile
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~200 mg/mL (~394.73 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (9.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (9.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (9.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.9736 mL | 9.8682 mL | 19.7363 mL | |
| 5 mM | 0.3947 mL | 1.9736 mL | 3.9473 mL | |
| 10 mM | 0.1974 mL | 0.9868 mL | 1.9736 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
匹伐加宾
磷酸氢化可的松
BAY-784
Gly-PEG3-endo-BCN
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