| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
The primary target is KDM4 (histone lysine demethylase 4), a family of enzymes that remove methyl groups from histone H3 lysine 9 and 36, thereby regulating gene expression and chromatin structure. KDM4B-IN-B3 specifically inhibits KDM4 with an IC50 of 10 nM. The compound blocks the binding of KDM4B to the PLK1 promoter, suppressing the expression of AR and BMYB-regulated genes. By inhibiting KDM4 activity, the compound alters histone methylation patterns and gene expression, leading to anticancer effects. The high potency (10 nM IC50) indicates strong binding affinity and effective enzyme inhibition.
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| 体外研究 (In Vitro) |
NCGC00244536 对永生化上皮细胞系 PrEC1 和 PrEC4 具有超过 100 倍的选择性，并且对快速增殖的 AR 阴性 PC3 细胞具有高敏感性（IC50=40 nM）。NCGC00244536 可抑制雄激素刺激的 LNCaP 细胞生长，并能有效阻断包括 VCaP 和 LNCaP 在内的 AR 细胞系，其 IC50 值在亚微摩尔范围内。NCGC00244536 还以微摩尔级的 IC50 值成功抑制多种癌细胞系的生长，例如 MDA-MB2 和 MCF-7 乳腺癌细胞系[1]。
KDM4B-IN-B3 以 10 nM 的 IC50 值抑制 KDM4 酶活性。该化合物对永生化上皮细胞系PrEC1和PrEC4表现出超过100倍的选择性，并且对快速增殖的AR阴性PC3细胞具有高敏感性（IC50=40 nM）。该化合物抑制雄激素刺激的LNCaP细胞生长，并能有效阻断包括VCaP和LNCaP在内的AR细胞系，IC50值在亚微摩尔范围内。此外，该化合物还能成功抑制多种癌细胞系的生长，包括MDA-MB-231和MCF-7乳腺癌细胞系，IC50值在微摩尔范围内。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
除了未显示明显损害且外观正常外，NCGC00244536 治疗显著减缓了动物体内肿瘤的生长。组织学数据清晰地显示了经 NCGC00244536 治疗后肿瘤细胞密度高、结构清晰且纤维化程度高[1]。
KDM4B-IN-B3 可抑制源自 PC3 细胞的肿瘤和离体人前列腺癌组织块的体内生长。该治疗显著减缓了动物体内肿瘤的生长。组织学数据清晰地显示了经 NCGC00244536 治疗的动物体内肿瘤细胞密度高且纤维化程度高。重要的是，该治疗未显示明显损害，且动物外观正常，表明其具有良好的安全性。该化合物在细胞系来源的异种移植瘤和患者来源的组织块中的疗效表明其具有作为 KDM4 驱动型癌症治疗药物的潜力。 |
| 酶活实验 |
目前尚无针对 KDM4B-IN-B3 的特定非细胞检测方案。对于 KDM4 抑制剂，标准的无细胞检测方法使用重组 KDM4 酶和生物素标记的组蛋白 H3 肽作为底物。化合物孵育后，可通过 AlphaScreen、ELISA 或质谱检测去甲基化情况，从而确定 IC50 值。这些检测方法可以提供化合物对不同 KDM4 家族成员的效力和选择性的定量数据。此外，还可以进行动力学研究以确定抑制机制（竞争性、非竞争性或反竞争性）。
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| 细胞实验 |
目前尚无针对 KDM4B-IN-B3 的特定细胞检测方案。对于 KDM4 抑制剂，细胞检测通常包括用化合物处理癌细胞系（例如 PC3、LNCaP、MDA-MB-231、MCF-7）48-72 小时。处理后，使用 MTT 或 CellTiter-Glo 法检测细胞活力以确定 IC50 值。此外，组蛋白甲基化标记（H3K9me3、H3K36me3）的蛋白质印迹分析可以确认靶点结合情况，并证明化合物能够调节细胞内的组蛋白甲基化。qPCR 基因表达分析可以评估 AR 调控基因和其他靶基因的变化。
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| 动物实验 |
采用免疫缺陷小鼠的PC3细胞异种移植模型评估体内疗效。化合物给药（给药途径未具体说明），持续2-4周。定期测量肿瘤体积，并监测动物的体重和总体健康状况。研究结束时，收集肿瘤组织进行组织学分析，以评估治疗对肿瘤细胞密度、纤维化和其他病理特征的影响。也可使用离体人前列腺癌组织块评估化合物在患者来源组织中的疗效。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
目前尚无公开的KDM4B-IN-B3详细药代动力学数据。该化合物的分子量为382.45，分子式为C25H22N2O2。它含有2个氢键供体、3个氢键受体和6个可旋转键。分子复杂度为519。该化合物可溶于DMSO。粉末可在-20℃下保存3年，或在4℃下保存2年；溶剂可在-80℃下保存6个月，或在-20℃下保存1个月。开发该化合物用于治疗需要进行全面的药代动力学研究。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
目前尚无公开的KDM4B-IN-B3详细毒理学数据。初步体内研究表明，受试动物未出现明显损害，且外观正常。全面的毒理学研究需要按照GLP规范进行，包括遗传毒性、hERG心脏安全性以及两种动物的重复给药毒性试验。该化合物对KDM4的选择性优于其他组蛋白去甲基化酶，这可能有助于其获得良好的安全性。然而，作为一种表观遗传修饰剂，仍需仔细评估其对基因表达和细胞分化的潜在长期影响。该化合物仅供研究使用。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
KDM4B-IN-B3 又名 NCGC00244536 和 NCGC-00244536。其分子量为 382.45，分子式为 C25H22N2O2，纯度 ≥98%。化学名称为 3-(8-羟基-6-喹啉基)-N-(3-苯基丙基)-苯甲酰胺。外观为浅黄色至黄绿色固体粉末。该化合物的SMILES表达式为O([H])C1=C2C(C([H])=C([H])C([H])=N2)=C([H])C(=C1[H])C1C([H])=C([H])C([H])=C(C(N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C2C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=2[H])=O)C=1[H]。该化合物的HS编码为2934.99.9001。目前尚未发现该化合物的临床试验状态。
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| 分子式 |
C25H22N2O2
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|---|---|
| 分子量 |
382.4544
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| 精确质量 |
382.17
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| 元素分析 |
C, 78.51; H, 5.80; N, 7.32; O, 8.37
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| CAS号 |
2003260-55-5
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| PubChem CID |
127030711
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| 外观&性状 |
Light yellow to green yellow solid powder
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
3
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| 可旋转键数目(RBC) |
6
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| 重原子数目 |
29
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| 分子复杂度/Complexity |
519
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
O([H])C1=C2C(C([H])=C([H])C([H])=N2)=C([H])C(=C1[H])C1C([H])=C([H])C([H])=C(C(N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C2C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=2[H])=O)C=1[H]
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| 别名 |
KDM4B-IN-B3; KDM4B IN B3; KDM4BINB3; NCGC00244536; NCGC-00244536; NCGC 00244536;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~36.67 mg/mL (~95.88 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 2.75 mg/mL (7.19 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 27.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +，混匀；然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.6147 mL | 13.0736 mL | 26.1472 mL | |
| 5 mM | 0.5229 mL | 2.6147 mL | 5.2294 mL | |
| 10 mM | 0.2615 mL | 1.3074 mL | 2.6147 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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