KDM5-C70

别名: KDM5 C70 KDM5C70 KDM5-C70
目录号: V23032 纯度: ≥98%
KDM5-C70 是一种新型、有效的 JARID1(Jumonji AT-Rich Interactive Domain 1)组蛋白去甲基酶抑制剂,具有抗癌活性。
KDM5-C70 CAS号: 1596348-32-1
产品类别: Histone Demethylase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
KDM5-C70 是一种新型、有效的 JARID1(Jumonji AT-Rich Interactive Domain 1)组蛋白去甲基酶抑制剂,具有抗癌活性。它是 KDM5-C49 的乙酯前药,具有增强的细胞渗透性。
生物活性&实验参考方法
靶点
KDM5 histone demethylase
体外研究 (In Vitro)
以浓度递增的方式治疗 7 天后,KDM5-C70(10-9-10-5 M;7 天;MM.1S 骨髓瘤细胞)疗法显示出抗增殖作用(预计 KDM5-C70 将活力/增殖降低至约 20 50%) )微米)[1]。 KDM5-C70(50 μM;7 天;MM.1S 骨髓瘤细胞)治疗降低了视网膜母细胞瘤蛋白 (Rb) 磷酸化水平,但不影响磷酸化 Rb (pRb) 的总体水平,表明细胞周期进展较差 [1]。在 50 μM 抑制剂剂量下,染色质免疫沉淀和新一代测序显示 KDM5-C70 转录起始位点周围的 H3K4me3 水平有所增加,但 GSK467A 没有明显改变 [1]。
酶活实验
KDM5(也称为JARID1)家族的成员是2-氧戊二酸和Fe(2+)依赖性加氧酶,其作为组蛋白H3K4去甲基酶,从而调节细胞增殖和干细胞自我更新和分化。在这里,我们报道了人KDM5B酶催化核心与三种抑制剂化学型复合物的晶体结构。这些支架利用了KDM5活性位点的几个方面,并且它们的选择性分布反映了它们相对于KDM4和KDM6家族的杂交特征。GSK-J1,一种先前鉴定的KDM6抑制剂,对KDM5B的抑制活性比对KDM6蛋白的抑制活性低约7倍,而KDM5-C49在KDM5B和KDM6B之间显示出25-100倍的选择性。细胞可渗透衍生物KDM5-C70在骨髓瘤细胞中具有抗增殖作用,导致H3K4me3水平的全基因组升高。选择性抑制剂GSK467利用了独特的结合模式,但在骨髓瘤系统中缺乏细胞效力。总之,这些结构线索为进一步合理和选择性的抑制剂设计提供了多个起点[1]。
细胞实验
细胞活力测定[1]
细胞类型: MM.1S 骨髓瘤细胞
测试浓度: 10-9-10-5 M
孵化持续时间:7天
实验结果:以浓度递增的方式治疗7天后显示出抗增殖作用。

蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: MM.1S 骨髓瘤细胞
测试浓度: 50 μM
孵化持续时间:7 天
实验结果:视网膜母细胞瘤蛋白 (Rb) 的磷酸化水平降低。
参考文献

[1]. Structural analysis of human KDM5B guides histone demethylase inhibitor development. Nat Chem Biol. 2016 Jul;12(7):539-45.

[2]. KDM5 lysine demethylases are involved in maintenance of 3'UTR length. Sci Adv. 2016 Nov 18;2(11):e1501662.

其他信息
细胞调控基因和蛋白质表达的机制复杂而多样。mRNA 3'非翻译区(UTR)的加工调控已被证实对发育和疾病起着至关重要的作用。然而,细胞如何选择不同的mRNA形式尚不清楚。我们发现,酿酒酵母赖氨酸去甲基化酶Jhd2(也称为KDM5)能够募集3'UTR加工机制,并以去甲基化酶依赖的方式促进某些基因3'UTR长度的改变。Jhd2与染色质和RNA的相互作用表明,Jhd2通过转录偶联机制影响多聚腺苷酸化位点的选择。此外,其哺乳动物同源物KDM5B(也称为JARID1B或PLU1),而非KDM5A(也称为JARID1A或RBP2),能够促进乳腺癌细胞中CCND1转录本的缩短。与这些结果一致,KDM5B 的表达与人乳腺肿瘤组织中 CCND1 的缩短相关。相反,KDM5A 和 KDM5B 都参与了 DICER1 的延长。我们的发现提示了该去甲基化酶家族的新功能,以及 3'UTR 加工的一种新的可靶向机制。[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H28N4O3
分子量
336.436
精确质量
336.216
元素分析
C, 60.69; H, 8.39; N, 16.65; O, 14.27
CAS号
1596348-32-1
PubChem CID
90094283
外观&性状
Light yellow to yellow liquids
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
466.6±45.0 °C at 760 mmHg
闪点
236.0±28.7 °C
蒸汽压
0.0±1.2 mmHg at 25°C
折射率
1.525
LogP
0.75
tPSA
74.8Ų
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
390
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(C([H])([H])N([H])C([H])([H])C1C([H])=C(C(=O)OC([H])([H])C([H])([H])[H])C([H])=C([H])N=1)N(C([H])([H])C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])N(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H]
InChi Key
WCILOMUUNVPIKQ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H28N4O3/c1-5-21(10-9-20(3)4)16(22)13-18-12-15-11-14(7-8-19-15)17(23)24-6-2/h7-8,11,18H,5-6,9-10,12-13H2,1-4H3
化学名
ethyl 2-(((2-((2-(dimethylamino)ethyl)(ethyl)amino)-2-oxoethyl)amino)methyl)isonicotinate
别名
KDM5 C70 KDM5C70 KDM5-C70
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~297.24 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9723 mL 14.8615 mL 29.7230 mL
5 mM 0.5945 mL 2.9723 mL 5.9446 mL
10 mM 0.2972 mL 1.4861 mL 2.9723 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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