| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg | |||
| Other Sizes |
| 靶点 |
KDM5 histone demethylase
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| 体外研究 (In Vitro) |
以浓度递增的方式治疗 7 天后，KDM5-C70（10-9-10-5 M；7 天；MM.1S 骨髓瘤细胞）疗法显示出抗增殖作用（预计 KDM5-C70 将活力/增殖降低至约 20 50%） ）微米）[1]。 KDM5-C70（50 μM；7 天；MM.1S 骨髓瘤细胞）治疗降低了视网膜母细胞瘤蛋白 (Rb) 磷酸化水平，但不影响磷酸化 Rb (pRb) 的总体水平，表明细胞周期进展较差 [1]。在 50 μM 抑制剂剂量下，染色质免疫沉淀和新一代测序显示 KDM5-C70 转录起始位点周围的 H3K4me3 水平有所增加，但 GSK467A 没有明显改变 [1]。
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| 酶活实验 |
KDM5（也称为JARID1）家族的成员是2-氧戊二酸和Fe（2+）依赖性加氧酶，其作为组蛋白H3K4去甲基酶，从而调节细胞增殖和干细胞自我更新和分化。在这里，我们报道了人KDM5B酶催化核心与三种抑制剂化学型复合物的晶体结构。这些支架利用了KDM5活性位点的几个方面，并且它们的选择性分布反映了它们相对于KDM4和KDM6家族的杂交特征。GSK-J1，一种先前鉴定的KDM6抑制剂，对KDM5B的抑制活性比对KDM6蛋白的抑制活性低约7倍，而KDM5-C49在KDM5B和KDM6B之间显示出25-100倍的选择性。细胞可渗透衍生物KDM5-C70在骨髓瘤细胞中具有抗增殖作用，导致H3K4me3水平的全基因组升高。选择性抑制剂GSK467利用了独特的结合模式，但在骨髓瘤系统中缺乏细胞效力。总之，这些结构线索为进一步合理和选择性的抑制剂设计提供了多个起点[1]。
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| 细胞实验 |
细胞活力测定[1]
细胞类型： MM.1S 骨髓瘤细胞 测试浓度： 10-9-10-5 M 孵化持续时间：7天 实验结果：以浓度递增的方式治疗7天后显示出抗增殖作用。 蛋白质印迹分析[1] 细胞类型： MM.1S 骨髓瘤细胞 测试浓度： 50 μM 孵化持续时间：7 天 实验结果：视网膜母细胞瘤蛋白 (Rb) 的磷酸化水平降低。 |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
The complexity by which cells regulate gene and protein expression is multifaceted and intricate. Regulation of 3' untranslated region (UTR) processing of mRNA has been shown to play a critical role in development and disease. However, the process by which cells select alternative mRNA forms is not well understood. We discovered that the Saccharomyces cerevisiae lysine demethylase, Jhd2 (also known as KDM5), recruits 3'UTR processing machinery and promotes alteration of 3'UTR length for some genes in a demethylase-dependent manner. Interaction of Jhd2 with both chromatin and RNA suggests that Jhd2 affects selection of polyadenylation sites through a transcription-coupled mechanism. Furthermore, its mammalian homolog KDM5B (also known as JARID1B or PLU1), but not KDM5A (also known as JARID1A or RBP2), promotes shortening of CCND1 transcript in breast cancer cells. Consistent with these results, KDM5B expression correlates with shortened CCND1 in human breast tumor tissues. In contrast, both KDM5A and KDM5B are involved in the lengthening of DICER1. Our findings suggest both a novel role for this family of demethylases and a novel targetable mechanism for 3'UTR processing.[2]
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| 分子式 |
C17H28N4O3
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|---|---|
| 分子量 |
336.436
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| 精确质量 |
336.216
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| 元素分析 |
C, 60.69; H, 8.39; N, 16.65; O, 14.27
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| CAS号 |
1596348-32-1
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| PubChem CID |
90094283
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow liquids
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| 密度 |
1.1±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
466.6±45.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
236.0±28.7 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±1.2 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.525
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| LogP |
0.75
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| tPSA |
74.8Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
6
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| 可旋转键数目(RBC) |
11
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| 重原子数目 |
24
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| 分子复杂度/Complexity |
390
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
O=C(C([H])([H])N([H])C([H])([H])C1C([H])=C(C(=O)OC([H])([H])C([H])([H])[H])C([H])=C([H])N=1)N(C([H])([H])C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])N(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H]
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| InChi Key |
WCILOMUUNVPIKQ-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C17H28N4O3/c1-5-21(10-9-20(3)4)16(22)13-18-12-15-11-14(7-8-19-15)17(23)24-6-2/h7-8,11,18H,5-6,9-10,12-13H2,1-4H3
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| 化学名 |
ethyl 2-(((2-((2-(dimethylamino)ethyl)(ethyl)amino)-2-oxoethyl)amino)methyl)isonicotinate
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| 别名 |
KDM5 C70 KDM5C70 KDM5-C70
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~297.24 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.9723 mL | 14.8615 mL | 29.7230 mL | |
| 5 mM | 0.5945 mL | 2.9723 mL | 5.9446 mL | |
| 10 mM | 0.2972 mL | 1.4861 mL | 2.9723 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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