KDM5A-IN-1

别名: KDM5AIN1 KDM5A IN 1 KDM5A-IN-1

目录号: V23172 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

KDM5A-IN-1 是一种有效的、口服生物可利用的泛组氨酸赖氨酸去甲基化酶 5 KDM5 抑制剂（拮抗剂），对 KDM5A、KDM5B 和 KDM5C 的 IC50 值分别为 45 nM、56 nM 和 55。

KDM5A-IN-1 CAS号: 1905481-36-8
产品类别: New1

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

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Science Adv 2022:8,eabm9427.

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PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器

产品描述

KDM5A-IN-1 是一种高效、口服生物利用度高的泛组氨酸赖氨酸去甲基酶 5 (KDM5) 抑制剂（拮抗剂），对 KDM5A、KDM5B 和 KDM5C 的 IC50 值分别为 45 nM、56 nM 和 55 nM，对 PC9 H3K4Me3 的 EC50 值为 960 nM。KDM5A-IN-1 对其他 KDM 酶（1A、2B、3B、4C、6A、7B）的抑制活性显著降低。
KDM5A-IN-1 是一种高效、口服生物利用度高的泛组蛋白赖氨酸去甲基酶 5 (KDM5) 抑制剂。它能高效抑制 KDM5A、KDM5B 和 KDM5C。 KDM5A-IN-1 对其他 KDM 家族酶（KDM1A、KDM2B、KDM3B、KDM4C、KDM6A、KDM7B）的活性显著降低。该化合物是一种用于研究的小分子表观遗传调节剂。

生物活性&实验参考方法

靶点	KDM5A (histone lysine demethylase 5A), KDM5B, and KDM5C (pan-KDM5 inhibition). These enzymes are responsible for demethylating histone H3 at lysine 4 (H3K4), a mark associated with active gene transcription. KDM5A-IN-1 shows selectivity for the KDM5 family over other KDM enzymes.
体外研究 (In Vitro)	KDM5A-IN-1 对 KDM5A、KDM5B 和 KDM5C 的 IC50 值分别为 45 nM、56 nM 和 55 nM。其在 PC9 细胞中提高 H3K4me3 水平的 EC50 值为 960 nM。该化合物对其他 KDM 酶的活性显著降低。
体内研究 (In Vivo)	KDM5A-IN-1（化合物 50，5 mg/kg；角质；雌性 CD-1 小鼠）的半衰期为 0.4 小时，在小鼠体内具有中等清除率（28 mL/min/kg）和良好的口服生物利用度（F% 34）。在糖尿病小鼠中，其蛋白结合率显著降低（40%）。 KDM5A-IN-1（化合物 50，5 mg/kg；口服；雌性 CD-1 小鼠）在小鼠体内显示出中等清除率（28 mL/min/kg），具有良好的口服生物利用度（F% 34），且在小鼠体内的血浆蛋白结合率显著降低（40%），半衰期（t₁/₂）为 0.4 小时。该化合物具有口服生物利用度。
酶活实验	KDM5酶活性测定：将重组KDM5A、KDM5B或KDM5C与不同浓度的KDM5A-IN-1以及对应于赖氨酸4三甲基化组蛋白H3（氨基酸残基1-21，H3K4me3）的肽底物在测定缓冲液（50 mM HEPES pH 7.5、50 mM KCl、1 mM DTT、0.01% Tween-20）中于37°C孵育60分钟。终止反应后，采用荧光法或抗体法（例如AlphaScreen或ELISA）检测去甲基化产物。计算IC50值。
细胞实验	PC9细胞中H3K4me3的定量：将PC9细胞用不同浓度（0.01-10 µM）的KDM5A-IN-1处理24-72小时。收集细胞，并酸提取组蛋白。使用抗H3K4me3抗体通过Western blot或ELISA检测H3K4me3水平。根据剂量反应曲线计算增加H3K4me3的EC50值。
动物实验	动物/疾病模型：雌性CD-1小鼠[1] 剂量：5 mg/kg 给药途径：口服（药代动力学/PK/PK研究）实验结果：小鼠体内清除率中等（28 mL/min/kg），口服生物利用度良好（F% 34），血浆蛋白结合率极低（40%）。小鼠药代动力学研究：雌性CD-1小鼠经口灌胃给予KDM5A-IN-1，剂量为5 mg/kg。分别于给药后不同时间点（0、0.25、0.5、1、2、4、6、8、24 h）采集血样。采用LC-MS/MS法测定血浆药物浓度。计算药代动力学参数，包括 Cmax、Tmax、AUC、半衰期、清除率和口服生物利用度。
药代性质 (ADME/PK)	KDM5A-IN-1 在小鼠体内显示出中等清除率（28 mL/min/kg），具有良好的口服生物利用度（F% 34），且血浆蛋白结合率极低（40%），半衰期为 0.4 小时。该化合物具有良好的口服生物利用度。分子量为 290.37 g/mol。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)	现有文献中尚未发表详细的毒性数据。KDM5A-IN-1 仅供研究使用。作为一种靶向组蛋白去甲基酶的表观遗传调节剂，应考虑其对基因表达的潜在脱靶效应。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全操作规程。
参考文献	[1]. From a novel HTS hit to potent, selective, and orally bioavailable KDM5 inhibitors. Bioorg Med Chem Lett. 2017 Jul 1;27(13):2974-2981.
其他信息	KDM5A-IN-1 是一种强效、口服生物利用度高的泛 KDM5 抑制剂，其 IC50 值分别为 45 nM (KDM5A)、56 nM (KDM5B) 和 55 nM (KDM5C)。在 PC9 细胞中，该化合物可显著提高 H3K4me3 水平，EC50 值为 960 nM。该化合物对 KDM5 家族的选择性优于其他 KDM 酶。在小鼠体内，该化合物具有中等清除率和良好的口服生物利用度。目前尚未有临床试验或上市许可的报道。

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C21H28CL2N4O
分子量	423.38
精确质量	290.174
CAS号	1905481-36-8
PubChem CID	119081409
外观&性状	White to off-white solid powder
密度	1.3±0.1 g/cm3
沸点	592.6±50.0 °C at 760 mmHg
闪点	312.2±30.1 °C
蒸汽压	0.0±1.7 mmHg at 25°C
折射率	1.586
LogP	-1.13
tPSA	78.1
氢键供体(HBD)数目	2
氢键受体(HBA)数目	3
可旋转键数目(RBC)	4
重原子数目	21
分子复杂度/Complexity	422
定义原子立体中心数目	1
SMILES	CC(C)C1=CC(=NN1)C(=O)N2CC[C@H](C2)NC(=O)C3CC3
InChi Key	CXEXTVGTDZRKJS-LLVKDONJSA-N
InChi Code	InChI=1S/C15H22N4O2/c1-9(2)12-7-13(18-17-12)15(21)19-6-5-11(8-19)16-14(20)10-3-4-10/h7,9-11H,3-6,8H2,1-2H3,(H,16,20)(H,17,18)/t11-/m1/s1
化学名	N-[(3R)-1-(5-propan-2-yl-1H-pyrazole-3-carbonyl)pyrrolidin-3-yl]cyclopropanecarboxamide
别名	KDM5AIN1 KDM5A IN 1 KDM5A-IN-1
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ≥ 50 mg/mL (~172.20 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (9.47 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 27.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* ≥ 2.75 mg/mL (9.47 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 27.5mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20％SBE-β-CD生理盐水中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (9.47 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 27.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ≥ 50 mg/mL (~172.20 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (9.47 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 27.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (9.47 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 27.5mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20％SBE-β-CD生理盐水中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (9.47 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 27.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	2.3619 mL	11.8097 mL	23.6194 mL
	5 mM	0.4724 mL	2.3619 mL	4.7239 mL
	10 mM	0.2362 mL	1.1810 mL	2.3619 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。