Locked nucleic acid 1

别名: 锁定核酸1
目录号: V31838 纯度: ≥98%
锁核酸1是LNA型核苷类似物。
Locked nucleic acid 1 CAS号: 206055-71-2
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
锁核酸1是一种LNA型核苷类似物。
锁核酸1(CAS号:206055-71-2)是LNA型核苷的衍生物。锁核酸(LNA)是一类核酸类似物,其结构中包含一个连接核糖环2'-氧原子和4'-碳原子的亚甲基桥,将糖锁定在C3'-内型构象中。这种结构修饰增强了寡核苷酸的结合亲和力和稳定性。该化合物的分子式为C₃₂H₃₂N₂O₈,分子量为572.61。它广泛应用于分子生物学研究,尤其是在增强DNA或RNA探针的稳定性和特异性方面。该化合物是由常规核苷酸将核苷酸骨架中的糖环锁定在特定构象而形成的分子。
生物活性&实验参考方法
靶点
Locked nucleic acid 1 does not have a specific biological target as a drug; rather, it is a synthetic nucleoside analog used in oligonucleotide synthesis. When incorporated into oligonucleotides, the LNA modification enhances the stability and binding affinity of the oligonucleotide to complementary RNA or DNA sequences. LNA oligonucleotides have improved thermal stability (higher Tm), increased nuclease resistance, and enhanced target specificity. These properties make LNA-modified oligonucleotides valuable tools for antisense therapy, siRNA, miRNA inhibition, and diagnostic applications. The compound's primary function is to serve as a monomer for the synthesis of LNA-containing oligonucleotides.
体外研究 (In Vitro)
体外研究主要集中于锁核酸1 (LNA1) 作为寡核苷酸合成的构建模块,而非其作为药理活性化合物的用途。该化合物用于固相寡核苷酸合成,以将LNA修饰引入寡核苷酸中。LNA修饰的寡核苷酸表现出与互补RNA和DNA更高的结合亲和力、更强的核酸酶抗性和更高的靶标特异性。这些特性通过测定熔解温度 (Tm)、核酸酶稳定性测定和结合亲和力研究进行评估。化合物的纯度和稳定性则通过高效液相色谱 (HPLC) 和质谱分析进行评估。
体内研究 (In Vivo)
体内研究主要针对锁核酸1 (LNA) 修饰的寡核苷酸,而非LNA本身。LNA修饰的寡核苷酸已在多种动物模型中评估了其在反义疗法、siRNA和其他核酸疗法中的治疗潜力。这些修饰增强了寡核苷酸在体内的稳定性和疗效。体内实验方案通常包括通过静脉、皮下或腹腔注射给药LNA修饰的寡核苷酸。药效学终点包括靶基因敲低、蛋白表达和治疗效果的评估。
酶活实验
在寡核苷酸合成中,锁核酸1 (Locked Nutrientacion 1) 用于采用标准亚磷酰胺化学的固相合成。该化合物溶解于无水乙腈中,并与固相载体(例如,可控孔径玻璃)上正在延伸的寡核苷酸链偶联。偶联反应在活化剂(例如,四唑或5-乙基硫代四唑)存在下进行。偶联后,使用碘或其他氧化剂将亚磷酸三酯氧化为磷酸酯。合成完成后,将寡核苷酸从载体上切割下来并脱保护。最终产物通过高效液相色谱 (HPLC) 或聚丙烯酰胺凝胶电泳 (PAGE) 纯化,并通过质谱进行表征。
细胞实验
在细胞研究中,利用锁核酸1(LNA)合成的LNA修饰寡核苷酸被用于研究基因表达和功能。将细胞培养于合适的培养基中,并使用脂质体转染或其他转染方法将LNA修饰的寡核苷酸转染至细胞内。通过qRT-PCR和Western blot检测靶基因的表达。同时评估细胞摄取、细胞内定位和生物活性。LNA修饰增强了寡核苷酸在细胞实验中的稳定性和效力。
动物实验
在体内研究中,将LNA修饰的寡核苷酸通过静脉注射、皮下注射或腹腔注射给药于动物体内。评估其组织分布、药代动力学和药效学。采用qRT-PCR和Western blot检测不同组织中靶基因的敲低情况。在疾病模型中评估其治疗效果。LNA修饰可提高寡核苷酸在体内的稳定性和生物利用度。
药代性质 (ADME/PK)
由于锁核酸1 (LNA1) 是一种用于寡核苷酸合成的结构单元,而非治疗药物,因此其药代动力学数据不适用。LNA修饰的寡核苷酸的药代动力学特性取决于寡核苷酸的序列、长度和修饰模式,而非结构单元本身。LNA修饰通常能提高寡核苷酸在体内的稳定性和生物利用度。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于锁核酸1是一种用于寡核苷酸合成的研究试剂,因此其毒理学数据有限。通常认为,在合成所用浓度下,该化合物毒性较低。目前尚未有关于其急性毒性、致突变性或致癌性的报道。与所有化学试剂一样,处理锁核酸1时应采取适当的安全预防措施,包括使用个人防护装备并在通风良好的区域操作。
其他信息
锁核酸1(CAS 206055-71-2)是LNA型核苷的衍生物。其分子式为C₃₂H₃₂N₂O₈,分子量为572.61。LNA是一类核酸类似物,其亚甲基桥将糖链锁定在C3'-内型构象中。该化合物在分子生物学研究中用于增强DNA或RNA探针的稳定性和特异性。它是反义疗法、siRNA和诊断应用的重要工具。该化合物仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H34N2O8
分子量
574.6210
精确质量
572.215
CAS号
206055-71-2
PubChem CID
11238489
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
密度
1.331±0.06 g/cm3(Predicted)
LogP
2.8
tPSA
116
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
42
分子复杂度/Complexity
990
定义原子立体中心数目
4
SMILES
O1[C@H]([C@H]2[C@@H]([C@]1(COC(C1C=CC=CC=1)(C1C=CC(=CC=1)OC)C1C=CC(=CC=1)OC)CO2)O)N1C(NC(C(C)C1)=O)=O
InChi Key
LRHODMQLNIWFSL-LBWLPYLASA-N
InChi Code
InChI=1S/C32H32N2O8/c1-20-17-34(30(37)33-28(20)36)29-26-27(35)31(42-29,18-40-26)19-41-32(21-7-5-4-6-8-21,22-9-13-24(38-2)14-10-22)23-11-15-25(39-3)16-12-23/h4-17,26-27,29,35H,18-19H2,1-3H3,(H,33,36,37)/t26-,27+,29-,31-/m1/s1
化学名
1-[(1R,3R,4R,7S)-1-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-7-hydroxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~250 mg/mL (~436.60 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 6.25 mg/mL (10.91 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 62.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 6.25 mg/mL (10.91 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 62.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7403 mL 8.7014 mL 17.4028 mL
5 mM 0.3481 mL 1.7403 mL 3.4806 mL
10 mM 0.1740 mL 0.8701 mL 1.7403 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们