LolCDE-IN-1

别名: LolCDEIN1; LolCDE IN 1
目录号: V37984
LolCDE-IN-1 是一种具有抗菌作用的 LolCDE 复合物抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
LolCDE-IN-1 CAS号: 1639933-78-0
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
LolCDE-IN-1 是一种 LolCDE 复合物抑制剂(阻断剂/拮抗剂),具有抗菌作用。
LolCDE-IN-1(CAS 1639933-78-0)是一种小分子 LolCDE 复合物抑制剂,LolCDE 复合物是革兰氏阴性菌脂蛋白转运系统的关键组成部分。该化合物的分子式为 C₂₁H₁₆FN₃O,分子量为 345.37 g/mol,对大肠杆菌菌株具有抗菌活性。其作用机制是通过抑制 LolCDE 复合物的活性,而 LolCDE 复合物对于将脂蛋白转运至革兰氏阴性菌外膜至关重要。LolCDE-IN-1 是一种有前景的先导化合物,可用于开发靶向脂蛋白转运途径的新型抗菌药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
LolCDE-IN-1 targets the LolCDE complex, an ATP-binding cassette (ABC) transporter that is essential for the localization of lipoproteins to the outer membrane of Gram-negative bacteria. This complex consists of three proteins: LolC, LolD, and LolE. By inhibiting the ATPase activity or the substrate binding of this complex, LolCDE-IN-1 prevents the release of lipoproteins from the inner membrane and their subsequent transport to the outer membrane. This disruption of lipoprotein localization leads to the accumulation of lipoproteins in the inner membrane and ultimately results in bacterial cell death.
体外研究 (In Vitro)
LolCDE-IN-1(化合物 2)抑制 LolCDE 复合物的活性,而 LolCDE 复合物是脂蛋白转运至细胞外膜所必需的 [1]。LolCDE-IN-1 可抑制大肠杆菌 ATCC 25922 和大肠杆菌 ATCC 25922 ΔtolC 的生长,其最小抑菌浓度 (MIC) 分别为 8 μg/ml 和 0.125 μg/ml [1]。LolCDE-IN-1 通过靶向 LolCDE 并阻止脂蛋白向细胞外膜的转运,从而抑制细菌的生长 [1]。体外实验表明,LolCDE-IN-1 对 tolC 缺陷型和野生型大肠杆菌菌株均表现出显著的抗菌活性。 LolCDE-IN-1 对大肠杆菌 ATCC 25922 的最低抑菌浓度 (MIC) 为 8 μg/mL,而其对 tolC 缺陷型菌株的活性显著增强,MIC 降至 0.125 μg/mL。这种对 tolC 缺陷型菌株活性的增强表明该化合物可能是 TolC 外排泵的底物。LolCDE-IN-1 的抗菌活性特异性针对 LolCDE 复合物,因为它对其他细菌靶标没有显著活性。
体内研究 (In Vivo)
体内LolCDE-IN-1的疗效在文献中报道较少。然而,其对大肠杆菌的强效体外活性表明,它具有开发成体内抗菌药物的潜力。该化合物的作用机制靶向革兰氏阴性菌中一条保守且至关重要的通路,使其成为进一步临床前开发的理想候选药物。为了推进其研发,需要开展药代动力学特性和动物感染模型疗效评估研究。
酶活实验
LolCDE-IN-1 的体外酶/受体结合试验包括测定其对 LolCDE 复合物活性的抑制作用。该试验通常使用含有 LolCDE 复合物的膜制剂或纯化的重组蛋白进行。在不同浓度的化合物存在下测定 LolCDE 复合物的 ATPase 活性,并计算 IC50 值。此外,还可以使用表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 来评估化合物与 LolCDE 复合物的结合。这些试验对于表征化合物的作用机制和效力至关重要。
细胞实验
为评估 LolCDE-IN-1 的抗菌活性,我们采用细菌培养进行体外细胞实验。根据临床和实验室标准协会 (CLSI) 指南,采用肉汤微量稀释法测定其最低抑菌浓度 (MIC)。将细菌培养于 Mueller-Hinton 肉汤中,并与化合物的系列稀释液一起孵育。MIC 定义为孵育 18-24 小时后抑制可见细菌生长的最低化合物浓度。此外,还可以进行时间-杀菌曲线试验,以评估化合物的杀菌或抑菌特性。
动物实验
文献中关于LolCDE-IN-1的体内动物研究报道不多。然而,如果开展此类研究,通常会采用细菌感染的小鼠模型。小鼠将被感染致病性大肠杆菌菌株,并通过静脉注射、腹腔注射或口服途径给药。治疗效果将通过监测存活率、组织中的细菌载量和感染的临床症状来评估。此外,还将通过血浆样本评估药代动力学参数。
药代性质 (ADME/PK)
文献中尚未对LolCDE-IN-1的药代动力学特性进行充分表征。作为一种分子量为345.37 g/mol的小分子,如果制剂得当,预计其具有良好的口服生物利用度。该化合物的亲脂性和血浆蛋白结合率会影响其分布和半衰期。代谢可能发生在肝脏,主要通过细胞色素P450酶进行。未来开展药代动力学特征研究对于其作为抗菌药物的开发至关重要。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
文献中对LolCDE-IN-1的毒性特征报道较少。作为一种靶向细菌特异性通路化合物,预计其对哺乳动物细胞的脱靶毒性较低。然而,仍需开展标准毒理学研究以评估其安全性。这些研究应包括急性毒性、亚慢性毒性、遗传毒性和心血管安全性的评估。该化合物对细菌LolCDE复合物相对于哺乳动物靶点的选择性将是其安全性的关键因素。
参考文献
[1]. Nayar AS, et al. Novel antibacterial targets and compounds revealed by a high-throughput cell wall reporter assay. J Bacteriol. 2015 May;197(10):1726-34.
其他信息
LolCDE-IN-1 是一种新型抗菌化合物,靶向 LolCDE 复合物,该复合物是革兰氏阴性菌脂蛋白转运系统的关键组成部分。通过抑制这一重要通路,该化合物破坏脂蛋白在细胞外膜的定位,最终导致细菌死亡。它对大肠杆菌表现出强效活性,尤其对 tolC 缺陷型菌株的活性更强。LolCDE-IN-1 是一种极具潜力的先导化合物,可用于开发针对革兰氏阴性病原体的新型抗生素,以应对日益严重的抗生素耐药性威胁。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₂₁H₁₆FN₃O
分子量
345.37
精确质量
345.127
CAS号
1639933-78-0
PubChem CID
118720981
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
4
tPSA
50.8
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
424
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC(=CC(=C1)OCC2=CC=C(C=C2)F)C3=C(C=NN3)C4=CC=NC=C4
InChi Key
DNZHPYAAJMOOPF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H16FN3O/c22-18-6-4-15(5-7-18)14-26-19-3-1-2-17(12-19)21-20(13-24-25-21)16-8-10-23-11-9-16/h1-13H,14H2,(H,24,25)
化学名
4-[5-[3-[(4-fluorophenyl)methoxy]phenyl]-1H-pyrazol-4-yl]pyridine
别名
LolCDEIN1; LolCDE IN 1
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~41.67 mg/mL (~120.65 mM)
H2O : < 0.1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (6.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (6.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8954 mL 14.4772 mL 28.9545 mL
5 mM 0.5791 mL 2.8954 mL 5.7909 mL
10 mM 0.2895 mL 1.4477 mL 2.8954 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们