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MIR96-IN-1

别名: MIR96IN1; MIR96 IN 1; MIR96-IN-1 N-(3-叠氮基丙基)-4-(2,6-二-叔丁基-4-(6-(4-甲基哌嗪-1-基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)苯氧基)丁酰胺;MIR96-IN-1
目录号: V25553 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
MIR96-IN-1 靶向 miR-96（miRNA-96、microRNA-96）发夹前体结构中的 Drosha 位点，抑制其生物发生、抑制下游靶标并触发乳腺癌/肿瘤细胞凋亡。
MIR96-IN-1 CAS号: 1311982-88-3
产品类别: New1
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
100mg
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产品描述
MIR96-IN-1靶向miR-96（miRNA-96，microRNA-96）发夹前体结构中的Drosha位点，抑制其生物合成，抑制下游靶点，并诱导乳腺癌/肿瘤细胞凋亡。MIR96-IN-1与RNA1、RNA2、RNA3、RNA4和RNA5的解离常数（Kd）分别为1.3、9.4、3.4、1.3和7.4 μM。MIR96-IN-1是一种点击化学试剂。它含有叠氮（N3）基团，可以与含有炔基的化合物发生CuAAc（铜催化叠氮-炔环加成反应）。 SPAAC（应变促进的炔烃-叠氮环加成反应）也可能发生在带有BCN或DBCO基团的化合物中。
MIR96-IN-1是一种小分子抑制剂，靶向miR-96（microRNA-96）发夹结构前体中的Drosha位点，抑制其生物合成。这导致下游靶点的去抑制，并诱导乳腺癌细胞凋亡。MIR96-IN-1与RNA1、RNA2、RNA3、RNA4和RNA5的Kd值分别为1.3、9.4、3.4、1.3和7.4 µM。它选择性地抑制microRNA-96的生物合成，上调蛋白靶标FOXO1，并诱导癌细胞凋亡。
生物活性&实验参考方法
靶点
miR-96 (microRNA-96) Drosha site.
体外研究 (In Vitro)
在微摩尔浓度下，MIR96-IN-1（化合物 1）特异性抑制成熟 miR-96 的生成并诱导乳腺癌细胞死亡 [1]。化合物 3，即 MIR96-IN-1，与 miR-96 的 UU 环结合并阻止其合成 [2]。
MIR96-IN-1 在微摩尔浓度下选择性抑制成熟 miR-96 的产生并诱导乳腺癌细胞凋亡。它抑制了 Drosha 对 pri-miR-96 的切割，这表现为处理后细胞中 pri-miR-96 水平升高以及前体和成熟 miR-96 水平降低。MIR96-IN-1 在 40 µM 浓度下高效且选择性地抑制 miR-96 的产生，而不影响 miR-182 或 miR-183。在 40 µM 浓度下，它可使 miR-96 的表达降低 90%。该化合物可上调 miR-96 的靶蛋白 FOXO1，并诱导细胞凋亡。
体内研究 (In Vivo)
MIR96-IN-1的体内疗效数据有限。该化合物已被证实能够抑制乳腺癌细胞中miR-96的生物合成，并在体外诱导细胞凋亡。作为一种靶向致癌性非编码RNA的microRNA抑制剂，它具有潜在的癌症治疗应用价值。需要利用肿瘤异种移植模型进行进一步的体内研究，以评估其治疗潜力。目前，该化合物主要用作研究microRNA生物学的工具。
酶活实验
体外结合实验采用表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 测定 MIR96-IN-1 与其 RNA 靶标的亲和力。将对应于 miR-96 发夹前体中 Drosha 位点的重组 RNA 固定在传感器芯片上。向芯片上注入不同浓度的 MIR96-IN-1（通常为 0.1 至 100 µM），并实时测量其结合情况。根据结合曲线计算 Kd 值。通过与其他 microRNA 发夹前体进行比较来评估其选择性。
细胞实验
体外细胞实验采用乳腺癌细胞系（例如 MCF-7 或 MDA-MB-231）。细胞用浓度为 1 至 100 µM 的 MIR96-IN-1 处理 24 至 72 小时。通过定量 RT-PCR 检测 miR-96 水平（pre-miR-96 和成熟 miR-96）。检测 pri-miR-96 水平以评估 Drosha 裂解抑制情况。通过 Annexin V/PI 染色和流式细胞术或检测 caspase-3/7 活性来评估细胞凋亡。通过 Western blot 检测 FOXO1 蛋白水平。通过 qRT-PCR 验证 miR-96 对 miR-182 和 miR-183 的选择性。
动物实验
关于MIR96-IN-1的体内动物模型数据在文献中报道较少。作为研究microRNA生物学的工具，该化合物通常会在乳腺癌细胞系的小鼠异种移植模型中进行评估。标准疗效研究的主要终点是肿瘤生长抑制。药代动力学研究将评估口服生物利用度、血浆半衰期和组织分布。该化合物主要用作体外研究的分子探针。
药代性质 (ADME/PK)
MIR96-IN-1 的分子量为 588.79 g/mol，分子式为 C33H48N8O2。它可溶于 DMSO（100 mg/mL），应以粉末形式储存于 -20°C。该化合物含有叠氮基团，因此是一种点击化学试剂，可进行铜催化叠氮-炔环加成反应 (CuAAc) 和应变促进的炔-叠氮环加成反应 (SPAAC)。体内制剂：10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45% 生理盐水（≥ 2.5 mg/mL）。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无公开的MIR96-IN-1详细毒性数据。作为一种研究化合物，它不适用于人体，也未经过正式的毒理学评估。microRNA抑制剂的标准临床前安全性评估通常包括：针对其他microRNA的选择性分析（以评估脱靶效应）、hERG通道抑制试验（以评估心脏安全性）以及CYP450酶抑制试验（以评估药物相互作用的可能性）。该化合物为固体，应在-20°C干燥保存。
参考文献

[1]. Design of a small molecule against an oncogenic noncoding RNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 May 24;113(21):5898-903.

[2]. Small Molecule Inhibition of miR-544 Biogenesis Disrupts Adaptive Responses to Hypoxia by Modulating ATM-mTOR Signaling. ACS Chem Biol. 2015 Oct 16;10(10):2267-76.
其他信息
MIR96-IN-1 是一种研究级化学探针，用于研究 miR-96 在癌症中的生物合成和功能。它尚未获准用于临床。该化合物含有叠氮基团，可用于点击化学反应。它能选择性抑制 miR-96 的生物合成，上调 FOXO1 的表达，并诱导癌细胞凋亡。MIR96-IN-1 以高纯度固体形式供应，应在 -20°C 下干燥保存。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C33H48N8O2
分子量
588.8
精确质量
588.39
CAS号
1311982-88-3
PubChem CID
72699186
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
6.02
tPSA
87.8
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
43
分子复杂度/Complexity
910
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC(C)(C)C1=CC(=CC(=C1OCCCC(=O)NCCCN=[N+]=[N-])C(C)(C)C)C2=NC3=C(N2)C=C(C=C3)N4CCN(CC4)C
InChi Key
LTPQCIXFOJELHJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C33H48N8O2/c1-32(2,3)25-20-23(31-37-27-12-11-24(22-28(27)38-31)41-17-15-40(7)16-18-41)21-26(33(4,5)6)30(25)43-19-8-10-29(42)35-13-9-14-36-39-34/h11-12,20-22H,8-10,13-19H2,1-7H3,(H,35,42)(H,37,38)
化学名
N-(3-azidopropyl)-4-[2,6-ditert-butyl-4-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]phenoxy]butanamide
别名
MIR96IN1; MIR96 IN 1; MIR96-IN-1
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 100 mg/mL (~169.84 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.25 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。
配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.25 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6984 mL 8.4918 mL 16.9837 mL
5 mM 0.3397 mL 1.6984 mL 3.3967 mL
10 mM 0.1698 mL 0.8492 mL 1.6984 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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