MT1 BET inhibitor

目录号: V11289 纯度: ≥98%
MT1 是 BET 溴结构域的化学探针,对于 BRD4(1) 的 IC50 为 0.789 nM。
MT1 BET inhibitor CAS号: 2060573-82-0
产品类别: New1
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产品描述
MT1 是一种针对 BET 溴结构域的化学探针,对 BRD4(1) 的 IC50 值为 0.789 nM。
MT1 BET 抑制剂(CAS# 2060573-82-0)是一种靶向 BET 溴结构域的二价化学探针,对 BRD4 的 IC₅₀ 值为 0.789 nM。MT1 的分子式为 C₅₄H₆₆Cl₂N₁₀O₉S₂,分子量为 1134.20 g/mol,是一种高效且选择性的 BET 抑制剂。该化合物具有二价结构,由两个 BET 结合基团通过 PEG7 连接子连接而成。与单价抑制剂相比,这种二价设计提高了对 BET 溴结构域的结合亲和力和选择性。 MT1 主要用作化学探针,用于研究 BET 蛋白在表观遗传调控和癌症研究中的生物学功能。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of MT1 is the BET (bromodomain and extra-terminal) family of proteins, specifically BRD4. BET proteins are epigenetic readers that recognize acetylated lysine residues on histones and regulate gene transcription. MT1 binds to the bromodomains of BET proteins with an IC₅₀ of 0.789 nM for BRD4. The bivalent nature of MT1 allows it to simultaneously engage two bromodomains, resulting in enhanced binding affinity and selectivity. By inhibiting BET bromodomains, MT1 disrupts the interaction between BET proteins and acetylated histones, leading to altered gene expression programs.
体外研究 (In Vitro)
MT1(100 nM,24 小时)通过 caspase-3 和 PARP 途径显著诱导 MV4;11 细胞凋亡 [1]。体外实验表明,MT1 对 BET 溴结构域具有强效抑制作用,对 BRD4 的 IC₅₀ 值为 0.789 nM。与单价 BET 抑制剂相比,MT1 的二价设计增强了其结合亲和力和选择性。细胞实验表明,MT1 能有效抑制 BET 依赖性基因转录,并降低依赖 BET 蛋白生存的癌细胞系的增殖。该化合物可用于研究 BET 蛋白在包括肿瘤发生、炎症和分化在内的各种细胞过程中的作用。详细的体外活性数据可参见已发表的研究。
体内研究 (In Vivo)
与 JQ1 相比,MT1(44.2 和 22.1 µmol/kg,每日腹腔注射,持续 14 天)显著减缓了小鼠(Mus musculus)白血病的进展[1]。MT1 在小鼠体内的终末半衰期为 2.70 小时[1]。体内研究已将 MT1 作为一种化学探针,用于研究动物模型中的 BET 生物学。该化合物可用于研究 BET 抑制对肿瘤生长、免疫反应和其他生理过程的影响。作为一种二价抑制剂,MT1 与单价 BET 抑制剂相比,可能具有更高的体内疗效和选择性。该化合物可溶于 DMSO,应储存于 -20°C。详细的体内疗效数据可从相关文献中获得。需要进一步的研究来全面表征其体内药代动力学和药效学特性。
酶活实验
MT1的体外酶/受体结合研究通常包括溴结构域结合实验。该化合物与BRD4和其他BET溴结构域的结合亲和力可通过AlphaScreen、TR-FRET或表面等离子共振(SPR)实验测定。IC₅₀值通过使用合适的荧光或放射性标记探针的竞争性结合曲线计算得出。针对其他含溴结构域蛋白和非BET靶标的选择性分析可通过多组筛选方法进行。这些方法仅用于研究目的。标准实验条件包括合适的缓冲体系、孵育时间和温度控制。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: MV4;11 个细胞[1]。
测试浓度: 100 nM。
孵育时间: 24 小时。
实验结果: 处理后,通过 caspase-3 和 PARP 的裂解观察到显著的细胞凋亡。
MT1 的体外细胞实验评估其对 BET 依赖性细胞功能的影响。将癌细胞系(例如,具有 MYC 扩增或 BET 依赖性的细胞)用不同浓度(通常为 0.1 nM 至 10 µM)的 MT1 处理 24-72 小时。使用 MTT、CCK-8 或 CellTiter-Glo 检测评估细胞活力。可通过 qRT-PCR 或 RNA-seq 检测基因表达变化,以评估 BET 抑制对下游靶基因的影响。可进行细胞凋亡检测(例如 Annexin V 染色、caspase 激活)以评估细胞死亡机制。细胞培养条件为标准条件(37°C,5% CO₂),并添加合适的培养基和血清。
动物实验
动物/疾病模型:白血病异种移植模型[1]。
剂量:44.2 和 22.1 µmol/kg。
给药途径:腹腔注射,持续 14 天。
实验结果:与载体或 JQ1 组相比,研究期间白血病负荷显著降低。
MT1 的体内动物研究通常采用携带对 BET 抑制剂敏感的人类肿瘤细胞系的异种移植小鼠模型。荷瘤小鼠通过腹腔注射或口服给予不同剂量和给药方案的 MT1 治疗。定期使用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测体重以评估毒性。药效学研究评估肿瘤组织中的靶点结合和生物标志物调控。该化合物配制成合适的载体(例如,DMSO/PEG300/生理盐水),用于体内给药。所有操作必须符合机构动物护理指南。
药代性质 (ADME/PK)
MT1的药代动力学性质与小分子BET抑制剂一致。该化合物可溶于DMSO,应储存于-20°C。与疏水性更强的化合物相比,二价结构中的PEG7连接基可能有助于提高水溶性并降低聚集。该化合物分子量较大(1134.20 g/mol),可能限制其口服生物利用度,因此腹腔注射或静脉注射可能是体内研究的优选给药途径。详细的药代动力学参数(半衰期、清除率、分布容积)可从已发表的研究中获取。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
MT1的毒性特征在公开文献中尚未得到充分阐明。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。作为一种BET抑制剂,其潜在毒性可能包括胃肠道反应、血液学变化以及其他与BET抑制相关的靶向毒性。处理化学探针时应遵循标准安全预防措施,包括使用个人防护装备并在通风橱内操作。临床开发需要进行临床前毒理学研究。由于该化合物具有强大的生物活性,因此应谨慎操作。
参考文献

[1]. Design and characterization of bivalent BET inhibitors. Nat Chem Biol. 2016 Dec;12(12):1089-1096.

其他信息
补充信息:MT1 又名 6H-噻吩并[3,2-f][1,2,4]三唑并[4,3-a][1,4]二氮杂卓-6-乙酰胺、N,N'-3,6,9,12,15,18,21-七氧杂二十三烷-1,23-二基双[4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-,(6S,6'S)-。该化合物密度为 1.4±0.1 g/cm³,可溶于 DMSO。储存:-20°C 保存。MT1 是一种 BET 溴结构域的二价化学探针,对 BRD4 的 IC₅₀ 值为 0.789 nM。该化合物属于一类用于研究 BET 蛋白在表观遗传调控和癌症生物学中功能的化学探针。本产品仅供研究使用,未经批准用于临床或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C54H66CL2N10O9S2
分子量
1134.19944810867
精确质量
1132.383
CAS号
2060573-82-0
PubChem CID
122172644
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
5.3
tPSA
265
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
17
可旋转键数目(RBC)
30
重原子数目
77
分子复杂度/Complexity
1750
定义原子立体中心数目
2
SMILES
ClC1C=CC(=CC=1)C1C2C(C)=C(C)SC=2N2C(C)=NN=C2[C@H](CC(NCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(C[C@H]2C3=NN=C(C)N3C3=C(C(C)=C(C)S3)C(C3C=CC(=CC=3)Cl)=N2)=O)=O)N=1
InChi Key
JNSLBXJNVHYNNW-CXNSMIOJSA-N
InChi Code
InChI=1S/C54H66Cl2N10O9S2/c1-33-35(3)76-53-47(33)49(39-7-11-41(55)12-8-39)59-43(51-63-61-37(5)65(51)53)31-45(67)57-15-17-69-19-21-71-23-25-73-27-29-75-30-28-74-26-24-72-22-20-70-18-16-58-46(68)32-44-52-64-62-38(6)66(52)54-48(34(2)36(4)77-54)50(60-44)40-9-13-42(56)14-10-40/h7-14,43-44H,15-32H2,1-6H3,(H,57,67)(H,58,68)/t43-,44-/m0/s1
化学名
2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.02,6]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]-N-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.02,6]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]acetyl]amino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]acetamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~150 mg/mL (~132.25 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 7.5 mg/mL (6.61 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 75.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 7.5 mg/mL (6.61 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 75.0mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 7.5 mg/mL (6.61 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 75.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.8817 mL 4.4084 mL 8.8168 mL
5 mM 0.1763 mL 0.8817 mL 1.7634 mL
10 mM 0.0882 mL 0.4408 mL 0.8817 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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