NAcM-OPT

别名: NAcM-OPT; NAcM OPT; NAcMOPT; NAcM-OPT - Bio-X
目录号: V26191 纯度: ≥98%
NAcM-OPT 是一种口服生物可利用的 cullin neddylation 1 (DCN1) 抑制剂,可有效抑制 DCN1-UBE2M 相互作用。
NAcM-OPT CAS号: 2089293-61-6
产品类别: E2 conjugating
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
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250mg
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产品描述
NAcM-OPT 是一种口服生物利用度高的 cullin neddylation 1 (DCN1) 抑制剂,可有效抑制 DCN1-UBE2M 相互作用。
NAcM-OPT(CAS#: 2089293-61-6)是一种特异性强、可逆且口服生物利用度高的小分子抑制剂,靶向 N-乙酰化 UBE2M(也称为 UBC12,一种 E2 结合酶)与 cullin neddylation 缺陷型 1 (DCN1) 之间的蛋白质-蛋白质相互作用。DCN1 是 cullin-RING E3 连接酶复合物的关键亚基,该复合物介导 NEDD8 的结合。在时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 检测中,NAcM-OPT 能有效抑制 DCN1-UBE2M 相互作用,IC₅₀ 为 79 nM (0.079 µM)。该化合物选择性地靶向 DCN1(也称 DCNL1),而非 DCNL3、DCNL4 和 DCNL5(IC₅₀ >50 µM),但其在 12.5 µM 浓度下也能抑制 DCNL2。NAcM-OPT 是一种有价值的化学工具,可用于探索 neddylation 修饰生物学、泛素-蛋白酶体系统调控以及针对疾病中蛋白质稳态的新策略。该化合物仅供研究使用,不得用于人类治疗。
生物活性&实验参考方法
靶点
DCN1
NAcM-OPT targets the protein-protein interaction between N-acetylated UBE2M (UBC12) and DCN1 (defective in cullin neddylation 1). DCN1 is a subunit of a multiprotein E3 ligase for the ubiquitin-like protein NEDD8. By disrupting the DCN1-UBE2M interaction, NAcM-OPT effectively inhibits the neddylation of cullins, leading to a modulation of cullin-RING ligase (CRL) activity. Cullin neddylation is a critical post-translational modification required for the full activity of CRL E3 ubiquitin ligases, which regulate the turnover of numerous proteins involved in cell cycle, DNA repair, and signal transduction. By blocking this interaction, NAcM-OPT selectively targets the NEDD8/CUL pathway.
体外研究 (In Vitro)
目前,NAcM-OPT(化合物 67)正被用于研究急性药理学抑制 DCN1-UBE2M 相互作用对 NEDD8/CUL 通路的影响。该化合物具有良好的口服生物利用度,且在小鼠体内耐受性良好[1]。
体外实验表明,NAcM-OPT 能有效抑制 DCN1-UBE2M 相互作用,IC₅₀ 为 79 nM。它能抑制细胞内的 NEDDylation 修饰,并阻止 DCN1 扩增细胞系的锚定非依赖性生长,且不影响蛋白质稳态。NAcM-OPT (10 µM) 可降低 cullin 1 的 NEDDylation 水平。此外,它还能通过促进自噬来保护角质形成细胞免受 H₂O₂ 诱导的氧化损伤。在一项肾纤维化研究中,NAcM-OPT 被用于证明通过靶向抑制 DCN1 来阻断 neddylation 可以减轻体外肾纤维化。
体内研究 (In Vivo)
体内实验表明,NAcM-OPT 是一种口服生物利用度高的 DCN1 抑制剂。动物实验已证实,通过靶向抑制 DCN1 阻断 neddylation 可减轻体内肾纤维化,提示了一种治疗肾纤维化的新型策略。NEDDylation 抑制剂 NAcM-OPT 可逆转 CRL4COP1 介导的葡萄糖响应性 p53 降解,提示 CRL4COP1 可能是营养过剩相关癌症的一个可靶向靶点。
酶活实验
NAcM-OPT 的体外生化分析通常采用时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 检测来测量其对 DCN1-UBE2M 相互作用的抑制作用。将重组蛋白与不同浓度的 NAcM-OPT 孵育,并测量相互作用的程度。IC₅₀ 值由剂量反应曲线计算得出。选择性分析针对 DCNL2、DCNL3、DCNL4 和 DCNL5 进行。该化合物抑制 NEDD8 化修饰的能力可通过蛋白质印迹法检测细胞裂解液中 NEDD8 结合的 cullin 蛋白来评估。
细胞实验
对于基于细胞的检测,将相关的细胞系(例如,HK-2人肾小管上皮细胞、NRK-49F大鼠肾成纤维细胞、角质形成细胞或DCN1扩增的癌细胞系)培养于合适的培养基中。用不同浓度(通常为1-50 µM)的NAcM-OPT处理细胞,并设定处理时间。通过Western blotting检测NEDD8偶联的cullin蛋白来评估其对NEDD8化修饰的影响。使用MTT或CellTiter-Glo等标准方法检测细胞活力和增殖。通过软琼脂克隆形成实验评估细胞的非锚定依赖性生长。自噬标志物可通过Western blotting检测LC3-II和p62来评估。
动物实验
在体内,NAcM-OPT通常以口服方式给药于啮齿动物。该化合物配制成合适的溶剂,例如注射用5% DMSO/40% PEG300/5% Tween 80/50% ddH₂O(4.35 mg/mL)或口服用CMC-Na(≥5 mg/mL均质悬浮液)。对于肾纤维化模型(例如,单侧输尿管梗阻或单侧缺血再灌注损伤),动物接受不同剂量的NAcM-OPT治疗。终点指标包括纤维化的组织学评估、胶原沉积以及肾组织中NEDDylation和信号通路的分析。
药代性质 (ADME/PK)
NAcM-OPT(分子量 434.40,C₂₃H₂₉Cl₂N₃O)为固体化合物。可溶于二甲基亚砜(DMSO,87 mg/mL)和乙醇(87 mg/mL),但不溶于水。纯度:≥98%。储存:粉末状,-20°C 保存,最长 3 年。口服:配制成浓度≥5 mg/mL 的均质 CMC-Na 混悬液。注射:配制成浓度为 4.35 mg/mL 的 5% DMSO/40% PEG300/5% Tween 80/50% ddH₂O 溶液。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
NAcM-OPT仅供研究使用,不适用于人类治疗。毒性数据仅限于体外和体内研究。该化合物已在动物模型中以不同剂量使用,未见明显毒性报道。开发其治疗用途需进行标准的安全性药理学和毒理学研究。
参考文献

[1].Discovery of an Orally Bioavailable Inhibitor of Defective in Cullin Neddylation 1 (DCN1)-Mediated Cullin Neddylation. J Med Chem. 2018 Apr 12;61(7):2694-2706.

其他信息
1-苄基-1-(1-丁基-4-哌啶基)-3-(3,4-二氯苯基)脲是一种脲类化合物。
NAcM-OPT 是一种研究级化学探针,用于研究泛素化修饰、泛素-蛋白酶体系统以及 cullin-RING 连接酶的功能。其主要应用包括癌症研究、肾纤维化研究和药物研发。该化合物尚未获批上市,也未进入临床试验阶段。目前仅供研究用途,可从多家化学品供应商处购买。其作用机制包括选择性抑制 DCN1-UBE2M 相互作用,从而阻断 cullin 的泛素化修饰并调节 CRL 的活性。研究表明,NAcM-OPT 可通过抑制 CRL4COP1 的泛素化修饰来逆转葡萄糖响应性 p53 降解。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H29CL2N3O
分子量
434.4018638134
精确质量
433.168
元素分析
C, 63.59; H, 6.73; Cl, 16.32; N, 9.67; O, 3.68
CAS号
2089293-61-6
相关CAS号
2089293-61-6;
PubChem CID
126711307
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
5.7
tPSA
35.6
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
493
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCCCN1CCC(CC1)N(CC2=CC=CC=C2)C(=O)NC3=CC(=C(C=C3)Cl)Cl
InChi Key
VPHJABWIKCBGMC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H29Cl2N3O/c1-2-3-13-27-14-11-20(12-15-27)28(17-18-7-5-4-6-8-18)23(29)26-19-9-10-21(24)22(25)16-19/h4-10,16,20H,2-3,11-15,17H2,1H3,(H,26,29)
化学名
1-benzyl-1-(1-butylpiperidin-4-yl)-3-(3,4-dichlorophenyl)urea
别名
NAcM-OPT; NAcM OPT; NAcMOPT;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 87~125 mg/mL ( 200.27~287.75 )
Ethanol : ~87 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.79 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.79 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3020 mL 11.5101 mL 23.0203 mL
5 mM 0.4604 mL 2.3020 mL 4.6041 mL
10 mM 0.2302 mL 1.1510 mL 2.3020 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们