Nanatinostat

别名: Tractinostat VRx-3996 CHR 3996 VRx3996CHR-3996 CHR3996 那替诺司他
目录号: V26222 纯度: ≥98%
Nanatinostat (CHR-3996;Tractinostat; VRx-3996) 是一种新型口服、基于异羟肟酸的 HDAC 抑制剂(IC50 为 8 nM),具有潜在的抗癌活性。
Nanatinostat CAS号: 1256448-47-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
25mg
Other Sizes

Other Forms of Nanatinostat:

  • (Rac)-Nanatinostat
  • Nanatinostat TFA
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InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
Nanatinostat(CHR-3996;Tractinostat;VRx-3996)是一种新型口服的羟肟酸类组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂(IC50 为 8 nM),具有潜在的抗癌活性。Nanatinostat 通过抑制 HDAC,导致高度乙酰化组蛋白的积累、染色质重塑的诱导以及肿瘤抑制基因的选择性转录,最终抑制肿瘤细胞分裂并诱导肿瘤细胞凋亡。
Nanatinostat(CAS 1256448-47-1),也称为 CHR-3996,是一种口服生物利用度高的第二代羟肟酸类组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它是一种强效的 I 类选择性 HDAC 抑制剂,IC₅₀ 为 8 nM。它对 HDAC1、HDAC2 和 HDAC3 的选择性抑制作用强于 HDAC5 和 HDAC6(IC₅₀ 值分别为 3、4、7、200 和 2100 nM)。Nanatinostat 可抑制肿瘤细胞增殖并诱导细胞凋亡。它已被研究用于治疗神经退行性疾病和癌症。该化合物为研究级化学品,仅供实验室使用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Nanatinostat targets histone deacetylases (HDACs), a family of enzymes that remove acetyl groups from histone proteins, leading to chromatin condensation and transcriptional repression. Nanatinostat is a class I selective HDAC inhibitor, potently inhibiting HDAC1, HDAC2, and HDAC3 with IC₅₀ values of 3, 4, and 7 nM, respectively. It is less potent against HDAC5 (IC₅₀ = 200 nM) and HDAC6 (IC₅₀ = 2,100 nM). By inhibiting HDAC, Nanatinostat results in an accumulation of highly acetylated histones, the induction of chromatin remodeling, and the re-expression of tumor suppressor genes. This leads to cell cycle arrest, differentiation, and apoptosis in cancer cells.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,Nanatinostat 可抑制细胞水平的组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 活性。它能抑制多种癌细胞系的增殖并诱导其凋亡。该化合物的活性通常通过使用抗乙酰化组蛋白 H3 或 H4 抗体的蛋白质印迹法检测组蛋白乙酰化水平来评估。用浓度为 0.1 至 10 μM 的 Nanatinostat 处理 24-48 小时后,可导致组蛋白乙酰化水平升高和细胞活力降低。该化合物对 I 类 HDAC(HDAC1、2、3)的抑制作用强于对 II 类 HDAC(HDAC5、6)的抑制作用。Nanatinostat 已被广泛研究,以探讨其对癌细胞增殖和凋亡的影响。
体内研究 (In Vivo)
在体内,Nanatinostat 具有口服生物利用度,并已在癌症和神经退行性疾病的动物模型中进行了研究。该化合物的口服生物利用度使其在临床前研究中给药方便。在肿瘤异种移植模型中,Nanatinostat 给药可抑制肿瘤生长。该化合物对体内组蛋白乙酰化的影响可通过免疫组织化学或蛋白质印迹法在肿瘤组织中进行检测。Nanatinostat 已被研究用于治疗癌症和神经退行性疾病。该化合物是研究 HDAC 生物学和治疗潜力的重要工具。
酶活实验
纳那替诺的体外酶活性测定通常包括使用荧光底物测定重组HDAC酶的抑制情况。典型的实验方案如下:将重组人HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC5或HDAC6与不同浓度的纳那替诺(0.01 nM至10 μM)在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 8.0,137 mM NaCl,2.7 mM KCl,1 mM MgCl₂)中于37°C孵育30分钟。加入荧光底物(例如Boc-Lys(Ac)-AMC),继续孵育60-120分钟。加入显色剂终止反应,并在激发波长360 nm和发射波长460 nm处测定荧光强度。IC₅₀值通过非线性回归分析抑制曲线计算得出。阳性对照包括曲古抑菌素A或辛酰苯胺异羟肟酸。每种浓度均进行三次重复测试,且实验至少重复三次。
细胞实验
纳那替诺(Nanatinostat)的体外细胞活性检测采用HeLa、HCT116或MCF-7等癌细胞系进行。典型实验方案如下:将细胞以5,000-10,000个/孔的密度接种于96孔板中,并使其过夜贴壁。然后用浓度为0.01至10 μM的纳那替诺处理细胞24-72小时。组蛋白乙酰化水平通过Western blot检测,使用抗乙酰化组蛋白H3或H4抗体。细胞活力采用MTT或CellTiter-Glo法进行评估。细胞凋亡通过Annexin V/PI双染和流式细胞术进行评估。细胞周期分布通过碘化丙啶染色进行分析。每种条件均设置三个复孔,且实验至少重复三次。
动物实验
Nanatinostat 的体内动物研究采用小鼠异种移植瘤模型进行。典型的实验方案是:将癌细胞(例如 HCT116 或 MCF-7)皮下接种到免疫缺陷小鼠体内。当肿瘤体积达到 50-100 mm³ 时,将小鼠随机分组,分别以 10-100 mg/kg 的剂量,每日或隔日灌胃给予 Nanatinostat,持续 2-4 周。每 2-3 天用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测体重变化以评估毒性。实验结束时,收集肿瘤组织进行组织病理学检查和生物标志物分析(例如,通过免疫组化或蛋白质印迹法检测组蛋白乙酰化)。通过比较治疗组和载体对照组的肿瘤生长情况来评估疗效。
药代性质 (ADME/PK)
纳那替诺司他(Nanatinostat)的药代动力学特性已在临床前研究中得到表征。该化合物具有口服生物利用度。口服给药后,纳那替诺司他被吸收并在体循环中达到治疗浓度。其半衰期、分布容积、清除率和蛋白结合率已在临床前模型中进行了评估。该化合物在肝脏代谢,可能通过CYP450酶进行,其代谢产物经肾脏和胆道途径排泄。具体的药代动力学参数已在临床前研究中报道。该化合物在推荐的储存条件下稳定(粉末储存于-20°C;溶剂储存于-80°C)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Nanatinostat 的毒理学数据已在临床前安全性研究中得到评估。该化合物在治疗剂量下通常耐受性良好。常见不良反应可能包括胃肠道紊乱、疲劳和血液学效应(血小板减少症、中性粒细胞减少症),这些都是 HDAC 抑制剂的类效应。临床前研究未发现该化合物与显著的器官毒性相关。处理 Nanatinostat 时应遵循标准实验室安全预防措施:使用个人防护装备(手套、护目镜、实验服)并在通风良好的通风橱中进行操作。该化合物应储存在 -80°C 以保持长期稳定性。研究人员在操作前应查阅安全数据表 (SDS)。
参考文献
Discovery of 2-(6-{[(6-fluoroquinolin-2-yl)methyl]amino}bicyclo[3.1.0]hex-3-yl)-N-hydroxypyrimidine-5-carboxamide (CHR-3996), a class I selective orally active histone deacetylase inhibitor. J Med Chem. 2010 Dec 23;53(24):8663-78.
其他信息
Nanatinostat 正在临床试验 NCT00697879(组蛋白去乙酰化酶抑制剂 CHR-3996 在晚期实体瘤患者中的安全性研究)中进行研究。Nanatinostat 是一种高生物利用度的第二代羟肟酸类组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。Nanatinostat 靶向并抑制 HDAC,导致高度乙酰化组蛋白的积累、染色质重塑的诱导以及肿瘤抑制基因的选择性转录;这些事件最终导致肿瘤细胞分裂的抑制和肿瘤细胞凋亡的诱导。与一些第一代 HDAC 抑制剂相比,该药物可能更显著地上调 HSP70 并下调抗凋亡蛋白 Bcl-2。 HDACs在多种肿瘤细胞类型中表达上调,是一类负责染色质组蛋白去乙酰化的金属酶。
关于Nanatinostat的补充信息:该化合物的CAS号为1256448-47-1,别名包括CHR-3996。它是一种口服生物利用度高的第二代羟肟酸类HDAC抑制剂。它是一种强效的I类选择性HDAC抑制剂,IC₅₀值为8 nM。IC₅₀值:HDAC1 = 3 nM,HDAC2 = 4 nM,HDAC3 = 7 nM,HDAC5 = 200 nM,HDAC6 = 2,100 nM。它能抑制肿瘤细胞增殖并诱导细胞凋亡。目前已对其进行癌症和神经退行性疾病的研究。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于临床应用。目前尚未获得美国食品药品监督管理局(FDA)的批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H19FN6O2
分子量
394.402266740799
精确质量
393.16
CAS号
1256448-47-1
相关CAS号
914937-68-1 (racemic);1256448-47-1;1256448-48-2 (TFA);2648504-17-8 (hydrate); 1256448-48-2 (TFA); 1235859-13-8 (deleted);
PubChem CID
49857317
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
1
tPSA
103
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
592
定义原子立体中心数目
2
SMILES
FC1C=CC2=C(C=1)C=CC(CNC1C3CN(C4N=CC(C(NO)=O)=CN=4)CC31)=N2
InChi Key
QRGHOAATPOLDPF-BYICEURKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H19FN6O2/c21-13-2-4-17-11(5-13)1-3-14(25-17)8-22-18-15-9-27(10-16(15)18)20-23-6-12(7-24-20)19(28)26-29/h1-7,15-16,18,22,29H,8-10H2,(H,26,28)/t15-,16+,18?
化学名
2-[(1S,5R)-6-[(6-fluoroquinolin-2-yl)methylamino]-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-N-hydroxypyrimidine-5-carboxamide
别名
Tractinostat VRx-3996 CHR 3996 VRx3996CHR-3996 CHR3996
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~126.77 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.34 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (6.34 mM) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5355 mL 12.6775 mL 25.3550 mL
5 mM 0.5071 mL 2.5355 mL 5.0710 mL
10 mM 0.2535 mL 1.2677 mL 2.5355 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们