NVP-DKY709

别名: NVP-DKY709; DKY-709; NVP-DKY-709; 2291360-73-9; NVP-DKY 709; DKY709; 3-(5-(1-benzylpiperidin-4-yl)-1-oxoisoindolin-2-yl)piperidine-2,6-dione; NVP-DKY709?; CHEMBL5077506; SCHEMBL20765247;
目录号: V42057 纯度: ≥98%
NVP-DKY709 (NVP-DKY-709; DKY-709) 是一流的 IKZF2 选择性 cereblon (CRBN) 胶降解剂,具有抗癌作用,可用于癌症免疫治疗。
NVP-DKY709 CAS号: 2291360-73-9
产品类别: New8
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
NVP-DKY709(NVP-DKY-709;DKY-709)是一流的 IKZF2 选择性 cereblon (CRBN) 胶降解剂,具有抗癌作用,可用于癌症免疫治疗。它是一种IKZF2选择性分子胶型降解剂,不降解 IKZF1 和 IKZF3 。与 DDB1:CRBN:NVP-DKY709 结合的 IKZF2 锌指的 X 射线晶体结构解释了 NVP-DKY709 的靶选择性。在体外,NVP-DKY709 调节 Treg 细胞和 Teff 细胞功能。在小鼠乳腺癌异种移植模型中,每日口服 NVP-DKY709 会导致肿瘤和外周血 Treg 细胞中的 IKZF2 降解,从而减少肿瘤生长,类似于抗 PD1 抗体 PDR001 所实现的效果。口服 NVP-DKY709 可有效降解猴子和患者中的 IKZF2,目前正在实体瘤的首次人体 I 期试验中进行评估。
生物活性&实验参考方法
靶点
IZKF2 (DC50 = 4 nM )
NVP-DKY709 is a selective molecular glue degrader that targets the IKZF2 (Helios) transcription factor by recruiting it to the CRBN E3 ubiquitin ligase. It selectively induces degradation of IKZF2 while sparing IKZF1 and IKZF3. It also degrades IKZF4 and SALL4 [2].
体外研究 (In Vitro)
NVP-DKY709是IKZF2的一流选择性蜡蛋白(CRBN)胶降解剂,使IKZF1和IKZF3免于降解。通过求解与DDB1:CRBN:NVP-DKY709结合的IKZF2锌指的X射线晶体结构,解释了NVP-DKY709的靶选择性。在体外,NVP-DKY709调节Treg细胞和Teff细胞功能[1]。
- 细胞降解选择性: 在 Jurkat 人 T 细胞中,NVP-DKY709 诱导内源性 IKZF2 呈剂量依赖性选择性降解 (DC50 = 11 nM, Dmax = 69%),而在高达 10 μM 浓度下对 IKZF1 无影响 [2]。
- 蛋白组学: 在 Jurkat 细胞中用 2.5 μM NVP-DKY709 处理 16 小时的定量蛋白组学分析显示,在 8,656 个定量蛋白中,IKZF2 是唯一显著下调的蛋白。IKZF1、IKZF3 和 IKZF5 未下调 [2]。
- 工程细胞系实验: 在 293T 细胞中,NVP-DKY709 可降解工程表达的 IKZF2 (Dmax = 53%, DC50 = 4 nM) 和 IKZF4 (DC50 = 13 nM, Dmax = 21%)。它也能降解 SALL4 (ProLabel 法: Dmax = 55%, DC50 = 2 nM; HiBit 法: Dmax = 88%, DC50 = 13 nM) [2]。
- 对 T 细胞功能的影响: 在植物血凝素 (PHA) 刺激的 Jurkat 细胞中,NVP-DKY709 以剂量依赖方式增加 IL-2 的产生。在原代人调节性 T 细胞 (Treg) 中,处理导致 IKZF2 降解 (DC50 = 11 nM, Dmax = 89%) 并降低其抑制能力。在体外 T 效应细胞耗竭模型中,NVP-DKY709 降低了耗竭的 CD4 和 CD8 T 细胞中 IKZF2+ 细胞的百分比,并增加了 IFN-γ 的表达 [2]。
体内研究 (In Vivo)
在小鼠乳腺癌症异种移植物模型中,每天口服NVP-DKY709导致肿瘤和外周血Treg细胞中IKZF2降解,类似于用抗PD1抗体PDR001实现的肿瘤生长减少。口服NVP-DKY709在猴子和患者中有效地降解了IKZF2,目前正在实体瘤的第一项人体I期试验中进行评估[1]。
- 人源化小鼠异种移植模型: 在移植了人造血干细胞并接种了 MDA-MB-231 异种移植瘤的 NSG 小鼠中,口服 NVP-DKY709 (100 mg/kg,每日一次) 可在肿瘤浸润和外周血的 Treg 细胞中实现强效的 IKZF2 降解。单药治疗导致肿瘤生长减缓,效果与抗 PD1 抗体 (PDR001) 治疗相当 [2]。
- 食蟹猴免疫模型: 在食蟹猴中,单次口服 NVP-DKY709 (0.01 至 1 mg/kg) 在给药后 24 小时导致循环 Treg 细胞中 IKZF2 的最大降解 (1 mg/kg 剂量下约 90%)。在一项重复给药研究 (每日口服 0.1 或 3 mg/kg,持续 36 天) 联合 KLH/角鲨烯免疫的研究中,观察到了持续的 IKZF2 降解 [2]。
酶活实验
- SPR 结合测定: 通过表面等离子体共振测定 NVP-DKY709 与 CRBN 的结合亲和力。将 DDB1:CRBN 固定在传感器芯片上,然后注入 DKY709。DKY709 与 CRBN 相互作用的 KD 为 28 nM [2]。
- 三元复合物形成: 使用 SPR 测量 IKZF2 锌指结构域 (ZF2, ZF2-3, ZF1-4) 与 DDB1:CRBN:DKY709 复合物的结合。确定了 IKZF2 (ZF2-3) 与复合物的结合亲和力,其比单独的 ZF2 高 20 倍以上 [2]。
- CRBN 结合测定 (荧光偏振): 通过化合物竞争 BodipyFL 标记的来那度胺探针的能力来确定其与 CRBN 的结合。该测定使用 CRBN/DDB1 蛋白和探针进行。计算 IC50 值 [2]。
细胞实验
- ProLabel 降解实验: 将稳定表达 ProLabel 标记蛋白 (IKZF1, IKZF2 等) 的 293T 细胞接种于 384 孔板,用化合物处理 24 小时。加入 ProLabel 底物,测量发光值以确定蛋白降解 (Dmax 和 DC50) [2]。
- NanoBiT 招募实验: 将 293T 细胞与 CRBN (SmBiT) 和 IKZF1/2 (LgBiT) 载体共转染。24 小时后,用 NAE1 抑制剂 MLN4924 处理细胞,然后加入待测化合物孵育 10 分钟。加入 NanoBiT 底物,测量发光值以评估靶蛋白向 CRBN 的招募 [2]。
- HiBit 降解实验: 将稳定表达 HiBit 融合蛋白的 293GT 细胞接种于 1536 孔板。过夜培养后,使用 Echo 分液器加入化合物。20 小时后,加入 HiBit 裂解试剂,测量发光值以确定蛋白降解 [2]。
- T 细胞内源性 IKZF2 降解实验: 将 Jurkat 细胞或原代 CD25+ 富集 T 细胞接种于 96 孔板,用化合物处理 18-24 小时。细胞进行活细胞染色、固定,并进行 IKZF2 和 Ikaros 的胞内染色。通过流式细胞术分析样品 [2]。
- Treg 抑制实验: 将扩增的 Treg 细胞与 CFSE 标记的 PBMCs 按不同比例共培养。用磁珠或抗 CD3 抗体诱导 T 细胞活化。3-4 天后,通过流式细胞术检测 CFSE 稀释程度来评估 T 效应细胞的增殖 [2]。
- T 细胞耗竭实验: 从 PBMCs 中富集的 T 细胞在化合物存在下,用 CD3/CD28 磁珠进行重复刺激。5 天后,用新鲜磁珠再次刺激细胞。然后用细胞刺激混合物刺激细胞,并对细胞进行活力、表面标志物和胞内标志物 (IKZF2, IFN-γ) 染色,用于流式细胞术分析 [2]。
- Jurkat 细胞 IL-2 产生实验: 将 Jurkat 细胞接种于 96 孔板,用化合物处理 24 小时。收集上清液,使用 MSD 检测试剂盒测量 IL-2 浓度 [2]。
动物实验
- Humanized Mouse Xenograft Study: Immunodeficient NSG mice were irradiated or treated with busulfan and engrafted with human hematopoietic stem cells. MDA-MB-231 cells in matrigel were implanted subcutaneously. Seven days post-implantation, daily oral dosing of NVP-DKY709 (100 mg/kg) was initiated. Weekly intraperitoneal injections of anti-PD1 antibody (PDR001) were administered. After 21 days, blood and tumor samples were collected for analysis [2].
- Cynomolgus Monkey Study (PK/PD): Male cynomolgus monkeys were administered a single oral dose of NVP-DKY709 at various concentrations (0.01, 0.1, 0.5, 1 mg/kg). Blood was collected at multiple time points to assess IKZF2 degradation in circulating Treg cells [2].
- Cynomolgus Monkey Immunization Study: A non-GLP study was conducted in male cynomolgus monkeys. Animals were immunized intramuscularly with KLH/squalene. Daily oral treatment with NVP-DKY709 (0.1 or 3 mg/kg/day) or vehicle was initiated 5 days post-immunization and continued for 36 days. A recall immunization was administered on day 15. Blood was collected at various timepoints for immunophenotyping and assessment of IKZF2 degradation [2].
药代性质 (ADME/PK)
Oral effective concentration (F > 35%)
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
- NVP-DKY709 completely spares degradation of IKZF1 and IKZF3, potentially avoiding the on-target hematopoietic toxicities (such as neutropenia and myelosuppression) associated with IMiD drugs that degrade IKZF1/3 [2].
- It degrades SALL4, a factor linked to teratogenicity. However, SALL4 is not expressed in differentiated immune cells, suggesting a specific toxicity profile [2].
参考文献
[1]. Developing an IKZF2 glue degrader. Nat Rev Drug Discov. 2023 Apr;22(4):271.
[2]. Discovery and characterization of a selective IKZF2 glue degrader for cancer immunotherapy. Cell Chem Biol. 2023 Mar 16;30(3):235-247.e12.
其他信息
Tumours can evade the immune system by recruiting immunosuppressive FOXP3+ regulatory T cells (Treg cells), which can limit the activation and proliferation of tumor-specific effector T cells (Teff cells). In recent years, IKZF2 (Helios), a member of the Ikaros transcription factor family—playing a crucial role in maintaining the function and stability of Treg cells—has become a highly attractive target for enhancing anti-tumor immune responses. However, targeting zinc finger transcription factors such as IKZF2 is extremely challenging because most of them have loose structures and lack ligand-binding sites.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H27N3O3
分子量
417.50
精确质量
417.205
元素分析
C, 71.92; H, 6.52; N, 10.06; O, 11.50
CAS号
2291360-73-9
PubChem CID
137519326
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.3
tPSA
69.7
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
696
定义原子立体中心数目
0
SMILES
N1C(=O)CCC(N2CC3=C(C2=O)C=CC(C2CCN(CC4=CC=CC=C4)CC2)=C3)C1=O
InChi Key
OMISHRJQMYQPMG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H27N3O3/c29-23-9-8-22(24(30)26-23)28-16-20-14-19(6-7-21(20)25(28)31)18-10-12-27(13-11-18)15-17-4-2-1-3-5-17/h1-7,14,18,22H,8-13,15-16H2,(H,26,29,30)
化学名
3-[6-(1-benzylpiperidin-4-yl)-3-oxo-1H-isoindol-2-yl]piperidine-2,6-dione
别名
NVP-DKY709; DKY-709; NVP-DKY-709; 2291360-73-9; NVP-DKY 709; DKY709; 3-(5-(1-benzylpiperidin-4-yl)-1-oxoisoindolin-2-yl)piperidine-2,6-dione; NVP-DKY709?; CHEMBL5077506; SCHEMBL20765247;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~16.67 mg/mL (~39.93 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.40 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.40 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.40 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3952 mL 11.9760 mL 23.9521 mL
5 mM 0.4790 mL 2.3952 mL 4.7904 mL
10 mM 0.2395 mL 1.1976 mL 2.3952 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
Study of Safety and Efficacy of DKY709 Alone or in Combination With PDR001 in Patients With Advanced Solid Tumors.
CTID: NCT03891953
Phase: Phase 1
Status: Active, not recruiting
Date: 2025-01-10
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