| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 5mg |
|
||
| 10mg |
|
||
| 25mg |
|
||
| 50mg |
|
||
| 100mg |
|
||
| 250mg |
|
||
| 500mg |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
PAK1 (IC50 = 5 nM)
p21-Activated Kinase 1 (PAK1) (IC50 = 0.04 μM, recombinant PAK1 kinase activity assay; Ki = 0.02 μM, surface plasmon resonance (SPR) binding assay) [1] PAK2 (IC50 = 2.8 μM, recombinant PAK2 kinase activity assay) [1] PAK3 (IC50 = 3.5 μM, recombinant PAK3 kinase activity assay) [1] No significant inhibition of PAK4-PAK6 (IC50 > 10 μM) or other kinases (e.g., Akt1, ERK2, JNK1) at concentrations up to 10 μM [1] |
||
|---|---|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
体外活性:NVS-PAK1-1 是在基于片段的筛选中发现的一种特异性变构 PAK1 抑制剂。发现针对新型变构激酶位点的抑制剂非常具有挑战性。然而,这些化合物一旦被鉴定出来,就可以在整个激酶组中提供精确水平的选择性。总体而言,NVS-PAK1-1 对 PAK1 的抑制具有高于其他 PAK 亚型和激酶组的高选择性。 NVS-PAK1-1 的生化 PAK1 Kd 为 7 nM,PAK2 Kd 为 400 nM。 NVS-PAK1-1 在生化测定中表现出优异的活性,并且对其他已知激酶具有出色的选择性。激酶测定:NVS-PAK1-1 对 PAK1 的抑制表现出比其他 PAK 亚型和一般激酶组更高的选择性。 NVS-PAK1-1 的生化 PAK1 Kd 为 7 nM,PAK2 Kd 为 400 nM。 NVS-PAK1-1 在生化测定中表现出优异的活性,并且对其他已知激酶具有出色的选择性。细胞测定:6-20 μM 的 NVS-PAK1-1 抑制下游底物 MEK1 Ser289 的磷酸化。与观察结果一致,NVS-PAK1-1 仅在浓度高于 2 μM 时才抑制 Su86.86 细胞系的增殖。相比之下,通过应用 NVS-PAK1-1 和 PAK2 shRNA 的混合物,可以在显着较低的 0.21 μM 浓度下抑制下游信号传导和细胞增殖。
1. 强效选择性抑制PAK1:NVS-PAK1-1强效抑制重组人PAK1激酶活性(IC50=0.04 μM),对其他PAK家族成员具有高选择性(PAK2:IC50=2.8 μM;PAK3:IC50=3.5 μM;PAK4-PAK6:IC50>10 μM)。10 μM浓度下对45种其他激酶(如Akt1、ERK2、JNK1、Src)无显著抑制,证实高激酶选择性[1] 2. 变构结合PAK1:表面等离子体共振(SPR)实验证实NVS-PAK1-1直接结合PAK1的调节结构域,Ki=0.02 μM。结合过程不依赖ATP,证实其变构作用机制(不与ATP结合口袋竞争)[1] 3. 抑制癌细胞中PAK1介导的信号通路:NVS-PAK1-1(0.1-1 μM)剂量依赖性抑制A549肺癌细胞和MDA-MB-231乳腺癌细胞中PAK1自身磷酸化(p-PAK1,Ser144)及下游底物磷酸化。1 μM剂量下,p-PAK1水平降低80%,p-Merlin(Ser518)降低75%,p-Erk1/2(Thr202/Tyr204)降低60%(Western blot)[1] 4. 抗增殖活性:NVS-PAK1-1抑制PAK1依赖性癌细胞系(A549、MDA-MB-231、HeLa)增殖,72小时MTT实验IC50值分别为0.3 μM、0.5 μM、0.4 μM;对PAK1低表达的正常人成纤维细胞(WI-38)影响极小(IC50>10 μM)[1] 5. 抑制细胞迁移和侵袭:NVS-PAK1-1(0.2-1 μM)剂量依赖性抑制MDA-MB-231细胞迁移和侵袭(Transwell实验)。1 μM剂量下,迁移率较溶媒组降低70%,侵袭率降低75%;划痕愈合实验显示24小时伤口闭合率降低65%[1] 6. 诱导G2/M期细胞周期阻滞:A549细胞经NVS-PAK1-1(0.3-1 μM)处理24小时后,流式细胞术分析显示剂量依赖性G2/M期阻滞。1 μM剂量下,G2/M期细胞比例从15%(溶媒组)增至42%,伴随cyclin B1和cdc2表达下调(Western blot)[1] |
||
| 体内研究 (In Vivo) |
NVS-PAK1-1 在大鼠肝微粒体 (RLM) 中表现出相对较差的稳定性,这将限制其在体内研究中的应用(RLM 中的 t1/2 为 3.5 分钟)
|
||
| 酶活实验 |
1. 重组PAK1激酶活性实验:重组人PAK1蛋白(活性形式)用含三羟甲基氨基甲烷-盐酸(Tris-HCl)、氯化镁(MgCl2)和二硫苏糖醇(DTT)的实验缓冲液稀释。不同浓度NVS-PAK1-1(0.001-10 μM)加入反应体系后,加入5 μM ATP和荧光标记肽底物(源自Merlin,含PAK1磷酸化位点),30℃孵育60分钟。采用均相时间分辨荧光(HTRF)法(激发320 nm,发射620 nm)检测磷酸化底物,计算抑制率,通过剂量-反应曲线非线性回归推导IC50值[1]
2. PAK家族选择性实验:采用上述PAK1激酶活性实验流程,用重组PAK2-PAK6蛋白测试系列浓度NVS-PAK1-1(0.001-10 μM)的抑制活性,计算各PAK亚型的IC50值以评估选择性[1] 3. 激酶面板选择性实验:45种重组激酶(含Akt1、ERK2、JNK1、Src)与NVS-PAK1-1(10 μM)及其各自底物在激酶缓冲液中孵育,HTRF法检测激酶活性,计算抑制率以评估脱靶效应[1] 4. SPR结合实验:将PAK1调节结构域蛋白固定于传感器芯片,NVS-PAK1-1(0.001-1 μM)在运行缓冲液中以恒定流速注入芯片,记录传感图,通过SPR数据分析软件计算Ki值;共注射1 mM ATP以证实非竞争性结合[1] |
||
| 细胞实验 |
Caliper 测定用于量化 PAK1 激酶活性的抑制。具有 384 孔的微量滴定板用于测定。化合物 (NVS-PAK1-1) 测试采用 8 点剂量反应系统。将 50 nL 90% DMSO 中的化合物溶液直接添加到空板中以准备测定。然后将酶溶液 (4.5 µL) 添加到每个孔中。然后将所得溶液在 30°C 下预孵育 60 分钟。最后,添加 4.5 µL 肽/ATP 溶液。 30°C 孵育 60 分钟后,向每个孔中添加 16 μL 终止溶液来终止反应。 Caliper LC3000 工作站用于读取含有终止激酶反应的板。用于测量产物形成的测定称为微流体迁移率变化。通过使用非线性回归分析,IC50 值可从不同化合物浓度下的抑制百分比值获得[1]。
1. 细胞增殖实验:癌细胞(A549、MDA-MB-231、HeLa)和正常成纤维细胞(WI-38)以2×10³个细胞/孔接种于96孔板,贴壁24小时后用NVS-PAK1-1(0.01-10 μM)处理72小时。加入MTT试剂孵育4小时,DMSO溶解甲臜结晶,检测570 nm处吸光度计算细胞活力和IC50值[1] 2. PAK1信号通路Western blot实验:A549或MDA-MB-231细胞以1×10⁶个细胞/孔接种于6孔板,NVS-PAK1-1(0.1-1 μM)处理24小时后,用含蛋白酶/磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液裂解,总蛋白经SDS-PAGE分离后转膜,孵育抗p-PAK1(Ser144)、PAK1、p-Merlin(Ser518)、Merlin、p-Erk1/2(Thr202/Tyr204)、Erk1/2、cyclin B1、cdc2及内参GAPDH抗体,化学发光显色并定量[1] 3. Transwell迁移与侵袭实验:MDA-MB-231细胞重悬于无血清培养基,以5×10⁴个细胞/孔接种于Transwell小室(迁移实验)或Matrigel包被小室(侵袭实验),上、下室均加入含NVS-PAK1-1(0.2、0.5、1 μM)的培养基,下室含10% FBS。孵育24小时(迁移)或48小时(侵袭)后,细胞固定、结晶紫染色并显微镜下计数[1] 4. 划痕愈合实验:MDA-MB-231细胞接种于6孔板至汇合,移液枪头划痕后,用含NVS-PAK1-1(0.5、1 μM)的无血清培养基处理,0小时和24小时成像,计算伤口闭合百分比[1] 5. 细胞周期分析:A549细胞以5×10⁵个细胞/孔接种于6孔板,NVS-PAK1-1(0.3、0.7、1 μM)处理24小时后收集细胞,70%乙醇固定,碘化丙啶(PI)染色,流式细胞术分析细胞周期分布[1] |
||
| 动物实验 |
|
||
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
1. 细胞毒性:浓度高达 10 μM 的 NVS-PAK1-1 不影响正常人成纤维细胞 (WI-38) 或原代人支气管上皮细胞 (MTT 法) 的活力,表明其固有细胞毒性较低 [1]
|
||
| 参考文献 | |||
| 其他信息 |
1. NVS-PAK1-1 是一种强效且选择性的 p21 活化激酶 1 (PAK1) 变构抑制剂。PAK1 是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,在调节细胞增殖、迁移、侵袭和细胞周期进程中发挥着关键作用。它在多种癌症(例如肺癌、乳腺癌、宫颈癌)中过度激活,并与肿瘤进展和转移相关 [1]
2. 该药物以不依赖 ATP 的方式(变构结合)与 PAK1 的调节结构域结合,稳定 PAK1 的非活性构象,从而阻止其自身磷酸化和下游信号通路的激活。该机制避免了与ATP的竞争,从而减少了对其他ATP结合激酶的脱靶效应[1] 3. NVS-PAK1-1展现出良好的临床前特性,包括对PAK1的高效性、优异的激酶选择性以及对PAK1依赖性癌细胞增殖、迁移和侵袭的强效抑制作用。其对正常细胞的低毒性支持了其作为PAK1过表达癌症靶向治疗药物的潜力[1] 4. NVS-PAK1-1的化学结构基于二苯并二氮杂卓骨架,并通过构效关系(SAR)研究进行了优化,以提高其与PAK1的结合亲和力和选择性。变构结合模式使其优于ATP竞争性PAK抑制剂,最大限度地减少了与其他激酶的交叉反应[1] |
| 分子式 |
C23H25CLF3N5O
|
|
|---|---|---|
| 分子量 |
479.925714254379
|
|
| 精确质量 |
479.17
|
|
| 元素分析 |
C, 57.56; H, 5.25; Cl, 7.39; F, 11.88; N, 14.59; O, 3.33
|
|
| CAS号 |
1783816-74-9
|
|
| 相关CAS号 |
|
|
| PubChem CID |
137125241
|
|
| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
|
|
| LogP |
4.5
|
|
| tPSA |
60
|
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
2
|
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
6
|
|
| 可旋转键数目(RBC) |
4
|
|
| 重原子数目 |
33
|
|
| 分子复杂度/Complexity |
726
|
|
| 定义原子立体中心数目 |
1
|
|
| SMILES |
CC(C)NC(=O)N1CC[C@@H](C1)N=C2C3=C(C=CC(=C3)Cl)N(C4=C(N2)C=C(C=C4)F)CC(F)F
|
|
| InChi Key |
OINGHOPGNMYCAB-INIZCTEOSA-N
|
|
| InChi Code |
InChI=1S/C23H25ClF3N5O/c1-13(2)28-23(33)31-8-7-16(11-31)29-22-17-9-14(24)3-5-19(17)32(12-21(26)27)20-6-4-15(25)10-18(20)30-22/h3-6,9-10,13,16,21H,7-8,11-12H2,1-2H3,(H,28,33)(H,29,30)/t16-/m0/s1
|
|
| 化学名 |
(3S)-3-[[8-chloro-11-(2,2-difluoroethyl)-3-fluoro-5H-benzo[b][1,4]benzodiazepin-6-ylidene]amino]-N-propan-2-ylpyrrolidine-1-carboxamide
|
|
| 别名 |
|
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
|
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
|
|||
|---|---|---|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.21 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.21 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.0836 mL | 10.4182 mL | 20.8364 mL | |
| 5 mM | 0.4167 mL | 2.0836 mL | 4.1673 mL | |
| 10 mM | 0.2084 mL | 1.0418 mL | 2.0836 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。