Oncrasin-1

别名: Oncrasin-1; Oncrasin 1; Oncrasin1 昂克立新 1;1-(4-氯苄基)-1H-吲哚-3-甲醛;Oncrasin 1 昂克立新 1; 1-(4-氯苯甲基)-1H-吲哚-3-甲醛;1-[(4-氯苯基)甲基]-1H-吲哚-3-甲醛
目录号: V4796 纯度: ≥98%
Oncrasin-1 是一种新型强效抗肿瘤药物,可在低或亚微摩尔浓度下杀死多种带有 K-Ras 突变的人类肺癌细胞;它还导致 PKCι 在敏感细胞的细胞核中异常聚集,但在耐药细胞中则不然。
Oncrasin-1 CAS号: 75629-57-1
产品类别: PKC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
Oncrasin-1 是一种新型强效抗肿瘤药物,可在低浓度或亚微摩尔浓度下杀死多种携带 K-Ras 突变的人类肺癌细胞;它还能导致敏感细胞核内 PKCι 异常聚集,但在耐药细胞中则不会。其作用机制是通过诱导 PKC1 的异常核聚集并抑制 RNA 转录。


Oncrasin-1(1-[(4-氯苯基)甲基]-1H-吲哚-3-甲醛)是一种小分子,可选择性地杀死 K-Ras 突变癌细胞,对正常同源细胞的影响很小。它能诱导 PKCι 和剪接因子异常核聚集形成巨型剪接体,抑制 RNA 聚合酶 II 最大亚基和 SR 蛋白的磷酸化,并抑制 RNA 转录。它还能破坏 PKCι 与 CDK9/cyclin T1 复合物之间的相互作用。

生物活性&实验参考方法
靶点
PKCι (atypical protein kinase C iota) [1].
CDK9/cyclin T1 complex - disruption of interaction observed [1].
体外研究 (In Vitro)
Oncrasin-1 可选择性地杀死 K-Ras 突变癌细胞,并在敏感细胞而非耐药细胞中诱导 PKCiota 的异常核聚集。Oncrasin-1 处理导致 PKCiota 和剪接因子共聚集形成巨型剪接体,但对 DNA 修复分子 Rad51 没有明显影响。此外,Oncrasin-1 处理抑制了敏感细胞而非耐药细胞中 RNA 聚合酶 II 最大亚基的磷酸化和无内含子报告基因的表达,表明抑制 RNA 转录是 Oncrasin-1 处理的主要作用。利用培养细胞或重组蛋白进行的研究表明,Oncrasin-1 可以破坏 PKCiota 与细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶 9/细胞周期蛋白 T1 复合物的相互作用,而该复合物已知可磷酸化 RNA 聚合酶 II 的最大亚基,是 RNA 转录所必需的。我们的研究结果共同表明,Oncrasin-1抑制RNA加工机制的功能,并且PKCι可能参与RNA加工复合物的生物学功能。
Oncrasin-1处理(T29/T29Kt1细胞浓度为10 μmol/L;H460细胞浓度为1 μmol/L)12小时后,在敏感的T29Kt1细胞中诱导PKCι聚集形成大的核内灶,但在耐药细胞中未观察到此现象[1]。
Oncrasin-1在10 μmol/L浓度下处理12小时后,导致T29Kt1细胞中RNA剪接因子SC35和ASF/SF2聚集形成巨型剪接体,免疫荧光染色观察到其与PKCι共定位[1]。
Oncrasin-1处理后对T29Kt1细胞中的DNA修复蛋白Rad51没有明显影响。 12 小时 [1]。
Oncrasin-1 处理(T29/T29Kt1 细胞浓度为 10 μmol/L;H460 细胞浓度为 1 μmol/L)在 12 小时时显著抑制了敏感的 T29Kt1 和 H460 细胞中 RNA 聚合酶 II 最大亚基(通过 H5 抗体检测)和 SR 蛋白的磷酸化,但在 T29(正常)细胞或耐药的 H1299(N-Ras 突变体)和 H322(野生型 Ras)细胞中未观察到此现象 [1]。
H460 细胞的时间进程研究表明:Oncrasin-1(1 μmol/L)在 8 小时开始降低 RNA 聚合酶 II 和 SR 蛋白的磷酸化,并在 12 小时和 24 小时时效果更显著 [1]。
Oncrasin-1(1 μmol/L H460(10 μmol/L,T29/T29Kt1)显著抑制了H460和T29Kt1细胞中无内含子报告质粒(pCMV-Luc和pRL-TK-Luc)的荧光素酶表达,但在T29细胞中无抑制或抑制作用较弱;在处理后4、8和12小时测得的抑制作用强于100 μmol/L DRB[1]。
H460细胞的免疫沉淀显示,在DMSO对照中,PKCι与细胞周期蛋白T1共沉淀;经Oncrasin-1(1 μmol/L,12 h)处理后,在 CDK9/cyclin T1 复合物中未检测到 PKCι [1]。
体外结合实验:将重组 PKCι 和 CDK9/cyclin T1 与 1 μmol/L Oncrasin-1 混合,或不混合;抗 PKCι 抗体在没有 Oncrasin-1 的情况下沉淀 cyclin T1,但在有 Oncrasin-1 的情况下则不沉淀,表明相互作用被破坏 [1]。
高浓度 Oncrasin-1(剂量依赖性,未提供确切的 IC50 值)抑制重组 CDK6 和 CDK9 的激酶活性,并对 CDK2 和 CDK7 有中等程度的抑制作用,如体外激酶活性测定所示(补充图 S3)[1]。
酶活实验
激酶反应(20 µL)在 30°C 下进行 15 分钟。反应体系包含 1× 反应缓冲液、5 mM MgCl₂、50 µM 冷 ATP、1 µL γ-[P32]-ATP (3000 Ci/mmol)、50 ng 各激酶及其相应的底物。CDK9/cyclin T1 和 CDK7/cyclin H/MAT1 激酶活性测定以 500 mM CDK7/9 为底物,而 CDK2/cyclin A 和 CDK6/cyclin D3 激酶活性测定则以 0.1 mg/ml 组蛋白 H1 为底物。将混合物与不同剂量的 oncrasin-1 孵育。游离的 γ-[P32]-ATP 通过 P81 磷酸纤维素滤膜洗去。样品在闪烁计数器下进行读数。激酶活性测定:激酶反应(20 μL)在 30°C 下进行 15 分钟。反应混合物包含 1× 反应缓冲液、5 mmol/L MgCl₂、50 μmol/L 冷 ATP、1 μL γ[P32]ATP (3000 Ci/mmol)、50 ng 的每种重组激酶(CDK2/cyclin A、CDK6/cyclin D3、CDK7/cyclin H/MAT1 或 CDK9/cyclin T1)以及相应的底物(CDK7/9 用 500 mmol/L CDK7/9 tide;CDK2/6 用 0.1 mg/mL 组蛋白 H1)。向混合物中加入不同剂量的 Oncrasin-1。通过 P81 磷酸纤维素滤膜洗涤去除游离的 γ[P32]ATP,并在闪烁计数器中计数样品。 Oncrasin-1以剂量依赖的方式抑制CDK6和CDK9(未提供确切的IC50值)[1]。体外结合实验:将重组PKCι和CDK9/cyclin T1复合物与1 μmol/L Oncrasin-1混合,或不混合,于4°C下温和混匀2小时。然后用抗PKCι抗体(以正常兔IgG作为对照)沉淀混合物。通过Western blot分析沉淀物中的cyclin T1。Oncrasin-1的存在显著抑制了PKCι和cyclin T1的共免疫沉淀[1]。
细胞实验
将细胞(3×10⁴/孔)接种于24孔板中,过夜培养。随后,将细胞置于无血清培养基中培养12小时,之后用250 ng不同的荧光素酶报告质粒进行转染。质粒转染采用FuGENE 6试剂。转染后,将细胞置于正常培养基中继续培养24小时,然后用1 µM oncrasin-1处理不同时间。收集细胞进行荧光素酶活性检测,检测采用荧光素酶检测试剂盒(Promega Life Science),并按照制造商的说明进行操作。用pCDNA3.1转染的细胞作为对照。[1]

细胞系:人非小细胞肺癌H460(K-Ras突变体)、T29(永生化正常卵巢上皮细胞)、T29Kt1(K-Ras转化细胞)、H1299(N-Ras突变体)、H322(野生型Ras)。细胞在含10%胎牛血清(FBS)和青霉素/链霉素的RPMI 1640或DMEM培养基中,于37℃、5% CO2条件下培养。[1]
免疫荧光染色:将细胞以每孔1×10^5个的密度接种于6孔板中,盖玻片经明胶处理。用Oncrasin-1(T29/T29Kt1细胞浓度为10 μmol/L;H460细胞浓度为1 μmol/L)或DMSO处理12小时后,或用10 Gy γ射线照射处理细胞,然后用2%多聚甲醛固定20分钟,用0.1% Triton X-100透化20分钟,用5%正常山羊血清封闭1小时。将玻片与一抗(抗PKCι、抗SC35、抗ASF/SF2、抗Rad51)孵育,然后与FITC或罗丹明标记的二抗孵育。最后用含DAPI的Prolong Gold抗淬灭剂封片。在荧光显微镜或共聚焦显微镜下观察[1]。
蛋白质印迹:用RIPA缓冲液(50 mmol/L Tris-HCl pH 8,150 mmol/L NaCl,1% NP40,0.5% 脱氧胆酸钠,0.1% SDS)制备细胞裂解液,用21号针头反复抽吸10次,10,000 rpm离心10分钟。取上清液进行SDS-PAGE和蛋白质印迹,使用针对磷酸化RNA聚合酶II (H5)、磷酸化SR蛋白、PKCι、细胞周期蛋白T1、β-肌动蛋白等的抗体[1]。
免疫沉淀:将细胞裂解液与一抗在温和旋转下孵育过夜,然后加入25 μL IgA/G磁珠,振荡约1小时。磁珠洗涤后,用上样缓冲液稀释,95°C加热10分钟,然后进行SDS-PAGE和Western blot分析[1]。
荧光素酶活性检测:将细胞(3×10^4/孔)接种于24孔板中,在无血清培养基中培养12小时,然后使用FuGENE 6转染250 ng pCMV-Luc或pRL-TK-Luc质粒。24小时后,用Oncrasin-1(H460细胞用1 μmol/L;T29/T29Kt1细胞用10 μmol/L)、DMSO或100 μmol/L DRB处理指定时间(4、8、12小时)。收集细胞,使用荧光素酶检测试剂盒进行荧光素酶活性检测;数值已根据 DMSO 对照组进行标准化 [1]。
流式细胞术:本文未描述细胞检测方法(仅在结果部分提及,方法部分未提及?实际上,流式细胞术是在其他情况下用于评估分化率的?不,那是针对 SJA710-6 细胞系,而非 Oncrasin-1 细胞系。本文未提供 Oncrasin-1 细胞系的流式细胞术细节,因此未包含在内。)
参考文献
Mol Cancer Ther. 2009 Feb;8(2):441-8.
其他信息
Oncrasin-1 是一种吲哚类化合物,其结构为 1H-吲哚,1 位和 3 位分别被 4-氯苄基和甲酰基取代。它是一种抗癌药物,对携带 K-Ras 突变的肺癌细胞具有活性。它具有诱导细胞凋亡和抗肿瘤的双重作用。Oncrasin-1 属于吲哚类、单氯苯类和芳香甲醛类化合物。
Oncrasin-1 最初是通过对 K-Ras 突变癌细胞进行合成致死性筛选而发现的。该化合物能选择性地杀死 K-Ras 突变癌细胞,而对正常的同源细胞几乎没有影响。该化合物的抗肿瘤活性不受Raf抑制剂Bay 43-9006、MEK抑制剂U0126、PI3K抑制剂LY294002或AKT抑制剂X的影响。该化合物可诱导PKCι和剪接因子聚集形成巨型剪接体,抑制RNA聚合酶II CTD的磷酸化,并破坏PKCι与CDK9/cyclin T1复合物的相互作用。这导致RNA转录受到抑制,最终导致细胞死亡。德克萨斯大学MD安德森癌症中心已为Oncrasin-1申请了专利;发明人为W. Guo、S. Wu、J. Liu和B. Fang[1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H12CLNO
分子量
269.7256
精确质量
269.061
CAS号
75629-57-1
PubChem CID
872445
外观&性状
Light yellow to khaki solid powder
密度
1.21g/cm3
沸点
465.5ºC at 760 mmHg
熔点
117 °C
闪点
235.3ºC
折射率
1.62
LogP
4.155
tPSA
22
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
1
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
314
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
ZDRQMXCSSAPUMM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H12ClNO/c17-14-7-5-12(6-8-14)9-18-10-13(11-19)15-3-1-2-4-16(15)18/h1-8,10-11H,9H2
化学名
1-(4-Chlorobenzyl)-1H-indole-3-carbaldehyde
别名
Oncrasin-1; Oncrasin 1; Oncrasin1
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~370.74 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (9.27 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (9.27 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: 2.5 mg/mL (9.27 mM) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.7074 mL 18.5371 mL 37.0741 mL
5 mM 0.7415 mL 3.7074 mL 7.4148 mL
10 mM 0.3707 mL 1.8537 mL 3.7074 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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