Paprotrain

别名: (ALPHAZ)-ALPHA-(3-吡啶基亚甲基)-1H-吲哚-3-乙腈;kinesinMKLP-2抑制剂Paprotrain
目录号: V30093 纯度: ≥98%
Paprotrain 是一种细胞穿透/可穿透的驱动蛋白 MKLP-2 抑制剂。
Paprotrain CAS号: 57046-73-8
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
Paprotrain 是一种可穿透细胞的驱动蛋白 MKLP-2 抑制剂。它能抑制 MKLP-2 的 ATPase 活性,IC50 为 1.35 μM,Ki 为 3.36 μM。它对 DYRK1A 也具有中等程度的抑制活性,IC50 为 5.5 μM。
帕普罗坦(CAS号:57046-73-8)是一种细胞渗透性抑制剂,可抑制驱动蛋白-6家族成员KIF20A(MKLP-2,有丝分裂驱动蛋白样蛋白2)。其分子式为C16H11N3,分子量为245.28。帕普罗坦抑制MKLP-2的ATPase活性,IC50值为1.35 microM,Ki值为3.36 microM。它对基础ATPase活性和微管/MT刺激的ATPase活性均有抑制作用,IC50值分别为1.35 microM和0.83 microM。
生物活性&实验参考方法
靶点
Paprotrain targets MKLP-2 (KIF20A), a kinesin-6 family member involved in cytokinesis and mitotic progression. MKLP-2 is essential for the central spindle formation and completion of cytokinesis during cell division. By inhibiting MKLP-2 ATPase activity, paprotrain disrupts mitotic progression and cytokinesis, leading to cell cycle arrest and potential cell death. The compound is also known as a passenger proteins transport inhibitor.
体外研究 (In Vitro)
帕普罗汀已针对一系列中枢神经系统激酶进行了测试。虽然它对 CDK5 和 GSK3 无活性(IC50 >10 μM),但对 DYRK1A 具有中等程度的活性(IC50=5.5 μM)[1]。延时显微镜观察显示,帕普罗汀会破坏 MKlp2 的表达,导致极体排出失败。将卵母细胞从帕普罗汀中取出并置于新鲜培养基中可以恢复极体排出。细胞周期分析显示,大多数卵母细胞停滞在减数分裂 I 期中期或末期。然而,即使帕普罗汀抑制了 MKlp2 的表达,卵母细胞的纺锤体结构和染色体排列仍然保持完整[2]。帕普罗汀处理的猪卵母细胞的核成熟失败。抑制 KIF20A 活性后,停滞在减数分裂 I 期早期的卵母细胞数量呈剂量依赖性增加,而达到减数分裂 I 期和减数分裂 II 期的卵母细胞比例下降[3]。
体外实验表明,帕普罗坦(paprotrain)能抑制MKLP-2的ATPase活性,IC50值为1.35 uM,Ki值为3.36 uM。它能抑制基础ATPase活性和微管/MT刺激的ATPase活性,IC50值分别为1.35 uM和0.83 uM。该化合物具有细胞渗透性,能够进入细胞并在细胞实验中抑制MKLP-2的功能。其活性已通过测量ATP水解的生化实验和评估有丝分裂进程的细胞实验进行了表征。
体内研究 (In Vivo)
帕普罗坦的体内活性可从其作为MKLP-2抑制剂的作用机制推断。该化合物通过干扰胞质分裂,可能对依赖于正常有丝分裂进程的癌细胞产生抗肿瘤作用。然而,现有文献中关于帕普罗坦的详细体内数据有限。该化合物可作为研究MKLP-2在细胞分裂和癌症中作用的研究工具。
酶活实验
体外酶活性测定中,帕普罗坦(paprotrain)的测定包括测量MKLP-2 ATPase活性。将纯化的MKLP-2蛋白与不同浓度的帕普罗坦(通常为0.001-100 uM)在含有ATP和微管的测定缓冲液中于37℃孵育30-60分钟。采用偶联酶法测定ATPase活性,该方法将ATP水解与NADH氧化偶联,并通过分光光度法在340 nm处监测NADH的氧化。或者,也可以使用孔雀绿磷酸盐检测法定量ATP水解释放的无机磷酸盐。IC50值通过将抑制数据拟合到剂量-反应曲线来确定。
细胞实验
体外细胞实验采用癌细胞系评估帕普罗汀对有丝分裂和胞质分裂的影响。将细胞接种于多孔板中,并用不同浓度的帕普罗汀(通常为0.01-100 μM)处理24-72小时。采用MTT、CellTiter-Glo或结晶紫染色法评估细胞活力。通过流式细胞术,使用碘化丙啶染色评估细胞周期,以检测特定细胞周期阶段的细胞积累情况。通过计数双核细胞或通过α-微管蛋白和其他有丝分裂标志物的免疫荧光染色评估胞质分裂失败。采用Annexin V-FITC/PI双染法评估细胞凋亡。
动物实验
帕普罗汀的体内动物研究通常采用免疫缺陷小鼠的异种移植模型,这些小鼠携带人肿瘤细胞系。将癌细胞皮下植入小鼠体内。当肿瘤体积达到约100-200 mm³时,将小鼠随机分为两组,分别接受帕普罗汀或载体对照治疗。化合物通过腹腔注射给药,剂量根据初步药代动力学和耐受性研究确定。每周两次使用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测体重以评估毒性。研究结束时,切除肿瘤进行组织学分析和生物标志物评估。
药代性质 (ADME/PK)
帕普罗坦的药代动力学特性尚未得到充分研究。该化合物的分子量为245.28,分子式为C16H11N3,呈黄色粉末或固体状。应将该化合物储存于-20℃并避光。作为一种小分子、细胞渗透性良好的药物,预计其具有良好的口服生物利用度和跨细胞膜的能力。已发表的文献中未见详细的ADME参数。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
帕普罗坦的毒理学特征尚未得到充分阐明。作为一种MKLP-2抑制剂,该化合物会干扰有丝分裂和胞质分裂,因此可能对快速分裂的组织(包括骨髓、胃肠道上皮和毛囊)产生影响。该化合物仅供研究使用,不得用于人类治疗。在实验室环境中操作该化合物时,应遵循标准安全预防措施。目前尚未报道具体的LD50值。
参考文献

[1]. Further investigation of Paprotrain: Towards the conception of selective and multi-targeted CNS kinase inhibitors. Eur J Med Chem. 2016 Nov 29;124:920-934.

[2]. MKlp2 inhibitor paprotrain affects polar body extrusion during mouse oocyte maturation. Reprod Biol Endocrinol. 2013 Dec 21;11:117.

[3]. KIF20A regulates porcine oocyte maturation and early embryo development.

[4]. Relocation of Aurora B and survivin from centromeres to the central spindle impaired by a kinesin-specific MKLP-2 inhibitor. Angew Chem Int Ed Engl. 2010 Oct 25;49(44):8228-31.

其他信息
帕普罗坦(CAS 57046-73-8)是一种细胞渗透性MKLP-2(KIF20A)抑制剂,MKLP-2是驱动蛋白-6家族成员,参与胞质分裂。该化合物抑制MKLP-2的ATPase活性,IC50值为1.35 μM,Ki值为3.36 μM。该化合物是研究MKLP-2在细胞分裂和癌症中作用的科研工具,仅供科研用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H11N3
分子量
245.2786
精确质量
245.095
CAS号
57046-73-8
PubChem CID
12248889
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
470.1±40.0 °C at 760 mmHg
闪点
149.2±12.5 °C
蒸汽压
0.0±1.2 mmHg at 25°C
折射率
1.739
LogP
3.17
tPSA
52.47
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
392
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)/C(=C/C3=CN=CC=C3)/C#N
InChi Key
YMYYQRZCCKBFBE-MDWZMJQESA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H11N3/c17-9-13(8-12-4-3-7-18-10-12)15-11-19-16-6-2-1-5-14(15)16/h1-8,10-11,19H/b13-8+
化学名
(Z)-2-(1H-indol-3-yl)-3-pyridin-3-ylprop-2-enenitrile
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 100 mg/mL (~407.70 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.19 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.0770 mL 20.3849 mL 40.7697 mL
5 mM 0.8154 mL 4.0770 mL 8.1539 mL
10 mM 0.4077 mL 2.0385 mL 4.0770 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们