PDD00031705

别名: PDD-00031705; PDD 00031705
目录号: V37911 纯度: ≥98%
PDD00031705 是一种苯并咪唑酮核心、细胞失活的聚(腺苷二磷酸核糖)水解酶 (PARG) 抑制剂。
PDD00031705 CAS号: 2032096-45-8
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
PDD00031705 是一种苯并咪唑酮核心的、对细胞无活性的聚(腺苷二磷酸核糖)水解酶 (PARG) 抑制剂。
PDD00031705 是一种苯并咪唑酮核心的聚(ADP-核糖)糖苷水解酶 (PARG) 抑制剂,对细胞无活性。该化合物的分子式为 C20H22N6O3S3,分子量为 490.62,用于调节聚(ADP-核糖)(PAR) 的代谢,而 PAR 在 DNA 损伤修复、细胞信号传导和基因组稳定性中发挥着关键作用。该化合物以固体形式供应,纯度 ≥98%。
生物活性&实验参考方法
靶点
PDD00031705 targets poly(ADP-ribose) glycohydrolase (PARG), the primary enzyme responsible for hydrolyzing poly(ADP-ribose) (PAR) chains into free ADP-ribose. PARG acts as a key regulator of PAR turnover after DNA damage, and its inhibition prolongs PAR chain persistence on target proteins, including PARP1 itself. By inhibiting PARG, the compound disrupts the normal dynamics of PAR metabolism.
体外研究 (In Vitro)
HeLa 细胞对 PDD00031705 表现出一定的毒性[1]。
体外实验表明,PDD00031705 对 HeLa 细胞的毒性较低,且被鉴定为一种细胞非活性抑制剂,这意味着它主要用于无细胞生化体系,而非活细胞降解实验。该化合物可用于研究 PARG 在细胞过程中的生理和病理作用及其在癌症生物学中的意义。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无PDD00031705的具体体内活性数据。作为一种细胞非活性抑制剂,其主要应用领域是生物化学和酶学研究,而非动物模型。研究人员在分子水平上研究其作用机制,以了解PARG在DNA修复通路中的功能,避免细胞摄取或代谢问题的影响。
酶活实验
体外PARG酶抑制实验:将重组人PARG酶(10-50 ng)与不同浓度的PDD00031705(0.1 nM至10 uM)在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.4,10 mM MgCl2,1 mM DTT)中孵育。加入聚(ADP-核糖)(PAR)聚合物底物(100 ng)。于37℃孵育30分钟。通过95℃加热5分钟或加入5%三氯乙酸终止反应。采用高效液相色谱法(HPLC)、质谱法或偶联酶法(例如,使用丙酮酸激酶/乳酸脱氢酶)测定游离ADP-核糖的生成量。根据剂量-反应曲线计算IC₅0值。
细胞实验
对于基于细胞的检测(由于细胞不活跃的特性而受到限制):将 HeLa 细胞用 PDD00031705(1-100 μM)处理 24-48 小时。通过 MTT 法评估细胞活力。DNA 损伤诱导后(例如,100 μM H₂O₂ 或 10 μM 烷化剂),可使用抗 PAR 抗体通过免疫荧光法检测 PAR 水平。然而,预计在活细胞中不会观察到显著活性。
动物实验
目前尚无针对PDD00031705的特定体内动物实验方案。作为一种细胞非活性抑制剂,它通常不适用于体内给药。研究主要集中在生化和无细胞体系上。如果必须进行体内研究,则需要优化溶出度和制剂,但目前尚无标准方案。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无PDD00031705的详细药代动力学数据。该化合物在DMSO中的溶解度中等,且相对稳定。其细胞非活性表明其细胞渗透性较差,这也限制了其口服或全身生物利用度。该化合物应以粉末形式储存于-20℃,并防潮。为提高其在DMSO中的溶解度,必要时可加热试管并使用超声波清洗。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无PDD00031705的具体毒性数据。在HeLa细胞中,该化合物在高浓度下显示出一定的毒性,但尚未进行全面的毒理学研究。处理此研究用化学品时应采取标准的实验室安全预防措施。该化合物不适用于人体。
参考文献

[1]. First-in-Class Chemical Probes against Poly(ADP-ribose) Glycohydrolase (PARG) Inhibit DNA Repair with Differential Pharmacology to AZD2281. ACS Chem Biol. 2016 Nov 18;11(11):3179-3190. Epub 2016 Oct 12.

其他信息
PDD00031705 是一种研究级化合物,仅供实验室使用,不可用于诊断或治疗。它可用作研究 PAR 代谢、DNA 修复通路以及 PARG 在癌症生物学中作用的工具。该化合物为固体粉末。请于 -20℃ 干燥避光保存。其在 DMSO 中的溶解度最高可达 50 mM。对于无细胞检测,请先用 DMSO 配制储备液,并在使用前用检测缓冲液稀释。目前尚无临床试验或上市许可。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H22N6O3S3
分子量
490.622079372406
精确质量
490.091
CAS号
2032096-45-8
PubChem CID
123131658
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
2.9
tPSA
165
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
850
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C1C=CC2=C(C=1)N(C1=NC=NS1)C(N2CC1=C(C)N=C(C)S1)=O)(N(C)C1(C)CC1)(=O)=O
InChi Key
KWGUETFSHQZXMA-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H22N6O3S3/c1-12-17(30-13(2)23-12)10-25-15-6-5-14(32(28,29)24(4)20(3)7-8-20)9-16(15)26(19(25)27)18-21-11-22-31-18/h5-6,9,11H,7-8,10H2,1-4H3
化学名
1-[(2,4-dimethyl-1,3-thiazol-5-yl)methyl]-N-methyl-N-(1-methylcyclopropyl)-2-oxo-3-(1,2,4-thiadiazol-5-yl)benzimidazole-5-sulfonamide
别名
PDD-00031705; PDD 00031705
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~203.82 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.10 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.10 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.10 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0382 mL 10.1912 mL 20.3824 mL
5 mM 0.4076 mL 2.0382 mL 4.0765 mL
10 mM 0.2038 mL 1.0191 mL 2.0382 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们