| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
PF-06726304 (Compound 31) inhibits Karpas-422 H3K27me3 with an IC50 of 15 nM [1]. PF-06726304, with an IC50 of 25 nM, suppresses the growth of Karpas-422 cells carrying wild-type EZH2[1].
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| 体外研究 (In Vitro) |
PF-06726304(化合物 31)抑制 Karpas-422 H3K27me3,IC50 为 15 nM [1]。 PF-06726304 的 IC50 为 25 nM,抑制携带野生型 EZH2 的 Karpas-422 细胞的生长[1]。
PF-06726304 在包含野生型或 Y641N 突变型 EZH2 的 PRC2 复合物的生化实验中能有效抑制 EZH2 酶活性,显示出对 SAM 的竞争性抑制机制。[1] PF-06726304 对 EZH2/EZH1 的选择性高于一系列其他组蛋白甲基转移酶(如 G9a、SETD7、PRMTs)和多样化激酶组(如 ABL1、AKT1、EGFR)。在激酶筛选 panel 中,对 MAP4K4 的脱靶抑制最高(约 30%)。[1] 在 KARPAS-422 细胞(携带 EZH2 Y641N 突变)和 OCI-LY19 细胞(EZH2 野生型)中,通过 qRT-PCR 检测,PF-06726304 处理可剂量依赖性地上调被 PRC2 抑制的基因 PRDM1 和 TNFRSF21 的表达。[1] 在基于细胞的模型中,通过 ELISA 和 Western blot 分析,PF-06726304 处理降低了组蛋白修饰标志物 H3K27me3 的全局水平。[1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
在皮下 Karpas-422 异种移植模型中,PF-06726304(200 和 300 mg/kg;BID 20 天)可抑制肿瘤发展并引起下游指标的强烈改变 [1]。
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| 酶活实验 |
通过测量氚标记的 SAM 中的放射性甲基基团掺入从 HeLa 细胞中分离的寡核小体底物中来监测 PRC2 四蛋白复合物(包含野生型或 Y641N 突变型 EZH2)的酶活性。反应混合物包含测定缓冲液、5 nM 酶复合物、25 µg/ml 寡核小体,并通过加入氚标记的 SAM 启动反应。孵育后,用三氯乙酸终止反应,过滤、洗涤,并通过闪烁计数测量掺入的放射性。通过将数据拟合到标准四参数方程确定 IC50 值。对于 Ki 测定和机制研究,在固定 SAM 浓度下进行实验,并将数据拟合到竞争性抑制模型。[1]
通过等温滴定量热法 (ITC) 实验测量直接结合。将蛋白质样品透析到合适的缓冲液中。在典型实验中,将化合物溶液多次注射到含有 PRC2 复合物的溶液中。记录热量变化并使用软件进行分析,以拟合 1:1 结合模型,从而获得结合常数。[1] |
| 细胞实验 |
对于基因表达分析 (qRT-PCR),收集用 PF-06726304 处理后的细胞,根据标准方案使用商业试剂盒分离 RNA。使用针对靶基因 (PRDM1, TNFRSF21) 和内参基因 (RPN1) 的特异性 TaqMan 基因表达检测试剂进行一步定量反转录 PCR。实验重复三次。[1]
对于从细胞或组织样品中提取组蛋白,使用基于裂解缓冲液的方法。将冷冻样品均质化、裂解,并通过离心收集酸溶性蛋白(包括组蛋白)。中和上清液并储存。对蛋白质浓度进行定量。[1] 对于 H3K27me3 ELISA,将组蛋白提取物稀释并包被到微孔板上过夜。洗涤孔板,封闭,然后与针对 H3K27me3 或总组蛋白 H3 的一抗孵育。洗涤后,加入辣根过氧化物酶偶联的二抗,随后使用底物进行比色检测。测量吸光度。[1] 对于组蛋白修饰的 Western blot 分析,将纯化的组蛋白提取物与上样缓冲液和还原剂制备,进行凝胶电泳分离,并转移至膜上。用针对总组蛋白 H3 和 H3K27me3 的抗体进行检测。[1] |
| 动物实验 |
Animal/Disease Models: Female Scid beige mice (6-8 weeks old) using Karpas-422 xenograft model [1]
Doses: 200 and 300 mg/kg Route of Administration: BID for 20 days Experimental Results: Inhibited tumor growth and induced downstream organisms Robust modulation of markers in a subcutaneousKarpas-422 xenograft model. |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
PF-06726304 is a pyridone-containing 3,4-dihydroisoquinoline-1(2H)-one derivative developed as a novel, potent, and selective inhibitor of EZH2. Its inhibition mechanism is competitive with the cofactor SAM. It demonstrates on-target cellular activity by reducing H3K27me3 levels and de-repressing PRC2-silenced genes. Computational methods, including DFT calculations and conformational analysis, were used in its design and to understand structure-activity relationships. [1]
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| 分子式 |
C22H21CL2N3O3
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|---|---|
| 分子量 |
446.326443433762
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| 精确质量 |
445.095
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| CAS号 |
1616287-82-1
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| 相关CAS号 |
PF-06726304 acetate;2080306-28-9
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| PubChem CID |
86723730
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
3.6
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| tPSA |
75.4
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
3
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| 重原子数目 |
30
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| 分子复杂度/Complexity |
799
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C1(=O)C2=C(C(Cl)=CC(C3=C(C)ON=C3C)=C2Cl)CCN1CC1=C(C)C=C(C)NC1=O
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| InChi Key |
PDKDOPJQPKXNCT-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C22H21Cl2N3O3/c1-10-7-11(2)25-21(28)16(10)9-27-6-5-14-17(23)8-15(20(24)19(14)22(27)29)18-12(3)26-30-13(18)4/h7-8H,5-6,9H2,1-4H3,(H,25,28)
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| 化学名 |
5,8-Dichloro-2-[(1,2-dihydro-4,6-dimethyl-2-oxo-3-pyridinyl)methyl]-7-(3,5-dimethyl-4-isoxazolyl)-3,4-dihydro-1(2H)-isoquinolinone
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| 别名 |
PF-6726304; PF 6726304; PF6726304; PF-06726304; PF 06726304; PF06726304;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ≥ 15 mg/mL (~33.61 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.2405 mL | 11.2025 mL | 22.4049 mL | |
| 5 mM | 0.4481 mL | 2.2405 mL | 4.4810 mL | |
| 10 mM | 0.2240 mL | 1.1202 mL | 2.2405 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。