PF-4618433

别名: PF-4618433; PF4618433; 1-(3-(tert-butyl)-1-(p-tolyl)-1H-pyrazol-5-yl)-3-(3-((pyridin-3-yloxy)methyl)-1H-pyrazol-5-yl)urea; 1-[5-tert-butyl-2-(4-methylphenyl)-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-ylidene]-3-{3-[(pyridin-3-yloxy)methyl]-1H-pyrazol-5-yl}urea; CHEMBL1084269; 1-[5-tert-butyl-2-(4-methylphenyl)pyrazol-3-yl]-3-[5-(pyridin-3-yloxymethyl)-1H-pyrazol-3-yl]urea; PF 4618433 N-[3-(1,1-二甲基乙基)-1-(4-甲基苯基)-1H-吡唑-5-基]-N'-[3-[(3-吡啶基氧基)甲基]-1H-吡唑-5-基]脲
目录号: V8608 纯度: ≥98%
PF-4618433 是一种新型、有效的选择性富含脯氨酸酪氨酸激酶 2 (PYK2) 和粘着斑激酶 (FAK) 抑制剂,相对于原型 BIRB796,PYK2 效力提高,p38 活性降低,总体选择性更高。
PF-4618433 CAS号: 1166393-85-6
产品类别: Pyk2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
PF-4618433 是一种新型、有效的选择性富含脯氨酸酪氨酸激酶 2 (PYK2) 和粘着斑激酶 (FAK) 抑制剂,与原型 BIRB796 相比,PYK2 效力提高,p38 活性降低,总体选择性更高。
生物活性&实验参考方法
靶点
PYK2 (IC50 = 637 nM)
体外研究 (In Vitro)
在 hMSC 培养物中,PF-4618433(0.1-1.0 μM;7 天)可刺激成骨。 PF-4618433 以药物依赖性方式增加碱性磷酸酶 (ALP) 活性和矿化作用 [1]。在剂量为 0.1 和 0.3 μM 时,PF-4618433(0.0125-0.3 μM;14 或 21 天)可改善钙沉积 [2]。微米; 24小时)增加成骨细胞的增殖[2]。
酶活实验
结晶——使用5mg/ml的蛋白质储备实现了apo-PYK2、BIRB796、PF-431396和PF-4618433(PF-46)抑制剂的结晶。对于共结晶实验,使用抑制剂(来自30 mm的DMSO储备)使终浓度在0.5-1 mm之间。在标准Linbro板中的750μl孔溶液上设置2μl+2μl的悬滴,并在22°C下孵育。使用汉普顿筛进行的初步筛选产生了一种条件,0.1 m双Tris:pH 6.0-7.0,0.2 m MgCl2,20-27%PEG 3350,1 mm TCEP,通过优化条件以及多轮条纹和微晶种,得到了针状晶体。对于抑制剂共络合物结晶,将优化的晶体进一步浸泡在3mm抑制剂中过夜,以增加抑制剂的占有率[1]。
碱性磷酸酶(ALP)活性测定[2]
BMSC以4×10~4个细胞铺板,在不同浓度的PF-43或PF-4618433 (PF-46)存在或不存在的情况下,用50μM抗坏血酸(AA)和5 mMβ-磷酸甘油酯(β-GP)分化为成熟成骨细胞7天。如前所述,通过向1.5 M碱性缓冲液中含有2 mg/mL对硝基苯磷酸盐的ALP底物中加入细胞裂解物来测定ALP活性。通过加入20mM NaOH停止酶反应,并使用分光光度计记录405nm处的吸光度。使用Pierce™BCA蛋白检测试剂盒通过总蛋白浓度使ALP活性标准化。实验一式三份,重复三次。
细胞实验
细胞增殖测定[2] 细胞
细胞类型:小鼠骨髓间充质干细胞 (BMSC)
测试浓度: 0.1, 0.3 μM
孵育持续时间:24小时
实验结果:与未处理组或对照组相比,细胞增殖活性显着增加。
参考文献

[1]. Structural Characterization of Proline-Rich Tyrosine Kinase 2 (PYK2) Reveals a Unique (DFG-out) Conformation and Enables Inhibitor Design. J Biol Chem. 2009 May 8; 284(19): 13193-201.

[2]. A Pyk2 Inhibitor Incorporated Into a PEGDA-gelatin Hydrogel Promotes Osteoblast Activity and Mineral Deposition. Biomed Mater. 2019 Feb 27; 14(2): 025015.

其他信息
富含脯氨酸的酪氨酸激酶2 (PYK2) 是一种胞质非受体酪氨酸激酶,参与多种信号通路。它是骨生成的负调控因子,被认为是治疗骨质疏松症的潜在药物靶点。我们解析了人PYK2激酶结构域与不同抑制剂复合物的高分辨率结构,证实了其经典的双叶激酶结构,并揭示了DFG环的构象变异性。我们的结构分析解释了经典激酶抑制剂PF-431396在FAK家族中缺乏选择性的原因。重要的是,两种二芳基脲类抑制剂(BIRB796和PF-4618433)诱导的新型DFG-out构象揭示了一类独特的非受体酪氨酸激酶亚类,其特征是门控氨基酸Met-502和独特的铰链环构象Leu-504。这是首个在DFG-out构象中,铰链环中的亮氨酸残基阻断ATP结合位点的实例。我们的结构、生物物理和药理学研究表明,DFG基序的独特特征,包括Leu-504铰链环的变异性,可用于开发选择性蛋白激酶抑制剂。[1] Pyk2是一种非受体酪氨酸激酶,属于黏着斑激酶家族。我们实验室和其他实验室的研究表明,缺乏Pyk2基因(Ptk2B)的小鼠骨量较高,这是由于成骨细胞活性增强和破骨细胞活性降低所致。此前有报道称,一种同时靶向Pyk2及其同源物FAK的化学抑制剂可增加卵巢切除大鼠的骨形成。在本研究中,我们开发了一种含有聚乙二醇二丙烯酸酯(PEGDA)和明胶的水凝胶,该水凝胶可通过可见光固化,适用于递送包括Pyk2靶向化学抑制剂在内的小分子药物。我们对该水凝胶的几个关键特性进行了表征,包括粘度、凝胶时间、溶胀性、降解性和药物释放行为。我们发现,由PEGDA1000和10%明胶组成的水凝胶(P1000:G10)表现出宾汉流体特性,在原位聚合前能够抵抗自由流动,使其适用于开放性伤口治疗中的注射载体。P1000:G10水凝胶具有良好的细胞相容性,并且与我们测试的其他水凝胶相比,其药物释放更为缓慢。重要的是,Pyk2抑制剂水凝胶保持了对Pyk2酪氨酸激酶的抑制活性,并在体外促进了成骨细胞活性和矿物质沉积。总的来说,我们的研究结果表明,基于 Pyk2 抑制剂的水凝胶可能适用于治疗颅面和四肢骨骼缺损以及靶向骨再生。[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H27N7O2
分子量
445.52
精确质量
445.222
元素分析
C, 64.70; H, 6.11; N, 22.01; O, 7.18
CAS号
1166393-85-6
相关CAS号
1166393-85-6
PubChem CID
25203958
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
587.6±50.0 °C at 760 mmHg
闪点
309.2±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.6 mmHg at 25°C
折射率
1.649
LogP
4.86
tPSA
109.75
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
635
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(NC1C=C(COC2C=NC=CC=2)NN=1)NC1=CC(C(C)(C)C)=NN1C1C=CC(C)=CC=1
InChi Key
NJARPUHZDSAXPL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H27N7O2/c1-16-7-9-18(10-8-16)31-22(13-20(30-31)24(2,3)4)27-23(32)26-21-12-17(28-29-21)15-33-19-6-5-11-25-14-19/h5-14H,15H2,1-4H3,(H3,26,27,28,29,32)
化学名
1-[5-tert-butyl-2-(4-methylphenyl)pyrazol-3-yl]-3-[5-(pyridin-3-yloxymethyl)-1H-pyrazol-3-yl]urea
别名
PF-4618433; PF4618433; 1-(3-(tert-butyl)-1-(p-tolyl)-1H-pyrazol-5-yl)-3-(3-((pyridin-3-yloxy)methyl)-1H-pyrazol-5-yl)urea; 1-[5-tert-butyl-2-(4-methylphenyl)-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-ylidene]-3-{3-[(pyridin-3-yloxy)methyl]-1H-pyrazol-5-yl}urea; CHEMBL1084269; 1-[5-tert-butyl-2-(4-methylphenyl)pyrazol-3-yl]-3-[5-(pyridin-3-yloxymethyl)-1H-pyrazol-3-yl]urea; PF 4618433
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~224.5 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.61 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.61 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.61 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2446 mL 11.2228 mL 22.4457 mL
5 mM 0.4489 mL 2.2446 mL 4.4891 mL
10 mM 0.2245 mL 1.1223 mL 2.2446 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Three-dimensional structure of PYK2:PF-4618433 complex from human. J Biol Chem . 2009 May 8;284(19):13193-201.
  • PF-4618433 promotes osteogenesis of hMSC cultures. J Biol Chem . 2009 May 8;284(19):13193-201.
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