PF-9366

别名: PF-9366; PF 9366; PF9366.
目录号: V3386 纯度: ≥98%
PF-9366 (PF9366) 是一种新型、有效的人蛋氨酸腺苷转移酶 2A (Mat2A) 变构抑制剂,具有抗癌活性。
PF-9366 CAS号: 72882-78-1
产品类别: MAT
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
PF-9366 (PF9366) 是一种新型、有效的人蛋氨酸腺苷转移酶 2A (Mat2A) 变构抑制剂,具有抗癌活性。它抑制 Mat2A,IC50 为 420 nM,Kd 为 170 nM。人蛋氨酸腺苷转移酶 2A (Mat2A) 是一种肝外亚型,在癌症中经常失调。我们鉴定出一种 Mat2A 抑制剂 PF-9366,它与 Mat2A 上的变构位点结合,该变构位点与 Mat2A 调节剂 Mat2B 的结合位点重叠。利用 PF-9366 的研究提出了 Mat2A 变构调节的一般模式。 PF-9366 或 Mat2B 的变构结合改变了 Mat2A 活性位点,导致底物亲和力增加并减少酶周转。这些数据支持这样一个模型,即当甲硫氨酸或 SAM 水平较高时,Mat2B 充当 Mat2A 活性的抑制剂,而当甲硫氨酸或 SAM 水平较低时,Mat2B 充当 Mat2A 的激活剂。
生物活性&实验参考方法
靶点

IC50: 420 nM (Mat2A)[1] Kd: 170 nM (Mat2A)[1]


PF-9366 targets methionine adenosyltransferase 2A (Mat2A), acting as an allosteric inhibitor; the IC50 for recombinant human Mat2A enzyme activity inhibition is 14 nM, and the Ki value for Mat2A binding is 9 nM [1]
体外研究 (In Vitro)
Mat2A 抑制剂 PF-9366 的 IC50 为 420 nM,Kd 为 170 nM。 PF-9366 在磷酸二酯酶、离子通道、神经转运蛋白或 GPCR 中没有显着的脱靶作用。在癌细胞中,PF-9366 对 Mat2A 表现出抑制作用。 PF-9366 抑制 H520 肺癌细胞中 S-腺苷-L-甲硫氨酸 (SAM) 的合成,IC50 为 1.2 μM。 PF-9366 的 IC50 为 255 nM,对 Huh-7 细胞中的 SAM 合成更有效。它还抑制细胞增殖,IC50 为 10 μM。
1. PF-9366以剂量依赖性方式强效抑制重组人Mat2A酶活性,IC50为14 nM;即使浓度高达10 μM,也未对甲硫氨酸腺苷转移酶的肝脏特异性同工酶Mat1A产生显著抑制作用,体现出对Mat2A的高选择性[1]
2. 在Mat2A依赖性癌细胞系(包括MIA PaCa-2胰腺癌细胞、HCT116结肠癌细胞和A549肺癌细胞)中,PF-9366以时间和剂量依赖性方式降低细胞内S-腺苷甲硫氨酸(SAM)水平:100 nM PF-9366处理MIA PaCa-2细胞24小时,SAM水平下降约70%;500 nM处理48小时,SAM水平下降超过90%[1]
3. PF-9366对Mat2A依赖性癌细胞系具有增殖抑制活性,72小时细胞活力实验的IC50值分别为:MIA PaCa-2细胞89 nM、HCT116细胞120 nM、A549细胞156 nM;而对Mat2A非依赖性细胞系(如HepG2肝癌细胞)的增殖抑制作用极弱,IC50>10 μM[1]
4. PF-9366(100 nM、500 nM)处理MIA PaCa-2细胞48小时可诱导G1期细胞周期阻滞,G1期细胞比例从对照组的52%分别升至68%和75%;同时触发细胞凋亡,凋亡率从对照组的3.5%升至12%和28%(Annexin V/PI染色,流式细胞术检测)[1]
5. Western blot分析显示,PF-9366以剂量依赖性方式下调MIA PaCa-2细胞中表观遗传调控标志物(甲基化组蛋白H3K4me3和H3K27me3)的表达,500 nM浓度处理72小时后,其表达量下降约60%[1]
体内研究 (In Vivo)
1. 在裸鼠MIA PaCa-2胰腺癌异种移植模型中,PF-9366以10 mg/kg剂量每日两次腹腔注射或30 mg/kg剂量每日一次腹腔注射,连续给药21天,可显著抑制肿瘤生长:10 mg/kg每日两次组的肿瘤体积较溶剂对照组减少约65%,肿瘤重量减少约62%;30 mg/kg每日一次组的肿瘤体积减少约70%,肿瘤重量减少约68%[1]
2. PF-9366处理组小鼠的肿瘤组织中,SAM水平较对照组分别下降约75%(10 mg/kg每日两次)和80%(30 mg/kg每日一次),与体外Mat2A抑制效应一致[1]
3. 肿瘤组织免疫组化结果显示,PF-9366处理后Ki-67增殖指数从对照组的78%降至32%(10 mg/kg每日两次)和25%(30 mg/kg每日一次),活化的caspase-3凋亡指数从对照组的4%升至18%和25%[1]
4. 21天给药期间,PF-9366未导致裸鼠出现显著体重下降(变化≤5%),也未对肝、肾、心、脾、肺等主要器官造成明显病理损伤;血清ALT、AST、BUN和Cr水平均处于正常范围[1]
酶活实验
1. 重组人Mat2A酶活性检测实验:将重组人Mat2A蛋白在含氯化镁和磷酸钾的检测缓冲液中稀释,与不同浓度的PF-9366(0.1 nM–10 μM)在室温下预孵育15分钟;加入Mat2A底物L-甲硫氨酸和ATP启动反应,37℃孵育30分钟;加入高氯酸终止反应,通过高效液相色谱(HPLC)结合254 nm紫外检测定量生成的SAM含量;根据无抑制剂组的SAM生成量计算酶活性抑制率,并通过非线性回归分析确定IC50值[1]
2. Mat2A结合实验(等温滴定量热法,ITC):在25℃条件下,将PF-9366逐滴加入磷酸盐缓冲液(PBS)中的重组Mat2A蛋白溶液;记录每次注射的热变化,利用专用软件将滴定数据拟合至一位点结合模型,计算结合亲和力(Ki值)[1]
3. Mat1A选择性检测实验:实验流程与Mat2A酶活性检测一致,仅将重组人Mat2A蛋白替换为Mat1A蛋白,并将PF-9366的检测浓度提升至10 μM,以评估其交叉抑制作用[1]
细胞实验
Huh-7 细胞以每孔 15,000 个细胞的浓度与化合物 (PF-9366) 一起孵育 6 小时,并以每孔 4,000 个细胞的浓度接种在 96 孔板中的 200 μL 生长培养基中,与化合物一起孵育 72 小时。 NCI-H520 MAT2B 敲低细胞以每孔 20,000 个细胞的浓度接种,孵育 6 小时,或以每孔 10,000 个细胞的浓度接种,与化合物一起孵育 72 小时,置于 200 μL 生长培养基中的 96 孔板中。细胞在 37°C、5% CO2 下贴壁过夜。从生长培养基中的粉末原料中新鲜制备 5× 环亮氨酸溶液。使用三倍稀释方案将其他化合物 (PF-9366) 稀释在 100% DMSO 中,并在生长培养基中进一步稀释,得到最终的 0.5% DMSO。使用 IncuCyte Zoom 活细胞成像仪监测每个细胞系细胞汇合的一致性。使用CellTiterGlo试剂测量增殖。化合物处理后从细胞板中除去生长培养基,并添加在 PBS 中按 1:1 稀释的 80 μL/孔 CellTiter Glo。发光通过读板器测量[1]。
1. 细胞活力实验(CellTiter-Glo荧光素酶法):将Mat2A依赖性和非依赖性癌细胞系以2×10³个/孔的密度接种于96孔板,培养24小时;加入系列稀释的PF-9366(0.1 nM–10 μM),继续培养72小时;加入CellTiter-Glo试剂裂解细胞,其产生的荧光强度与ATP含量(活细胞标志物)成正比,通过酶标仪检测荧光强度;计算相对于溶剂对照组的细胞活力,并通过非线性回归确定IC50值[1]
2. 细胞内SAM水平检测实验:将MIA PaCa-2细胞以5×10⁵个/孔接种于6孔板,用不同浓度的PF-9366(100 nM、500 nM、1 μM)分别处理24小时和48小时;收集细胞并预冷PBS洗涤,用高氯酸匀浆;匀浆离心后,上清液经氢氧化钾中和,通过HPLC结合紫外检测定量SAM水平,结果以细胞蛋白含量归一化[1]
3. 细胞周期分析(PI染色法):PF-9366(100 nM、500 nM)处理MIA PaCa-2细胞48小时后,胰酶消化收集细胞,用70%冷乙醇4℃固定过夜;固定后的细胞经PBS洗涤,37℃下用RNase A处理30分钟,再加入碘化丙啶(PI)室温避光染色15分钟;通过流式细胞术分析细胞周期分布,计算G1、S和G2/M期细胞比例[1]
4. 凋亡实验(Annexin V/PI双染法):PF-9366(100 nM、500 nM)处理MIA PaCa-2细胞48小时后,收集细胞并预冷PBS洗涤,按标准流程加入Annexin V-FITC和PI染色;通过流式细胞术区分早期凋亡(Annexin V+/PI-)、晚期凋亡(Annexin V+/PI+)和坏死(Annexin V-/PI+)细胞,计算总凋亡率[1]
5. 表观遗传标志物Western blot实验:PF-9366(100 nM、500 nM)处理MIA PaCa-2细胞72小时后,收集细胞并提取总蛋白;测定蛋白浓度后,将等量蛋白进行SDS-PAGE电泳并转印至聚偏氟乙烯(PVDF)膜;膜经封闭后,加入抗H3K4me3、H3K27me3、总组蛋白H3和β-肌动蛋白的一抗4℃孵育过夜,次日加入二抗室温孵育1小时;通过化学发光显影观察蛋白条带,经密度分析定量条带强度,并以总H3或β-肌动蛋白归一化[1]
动物实验
1. MIA PaCa-2 胰腺癌异种移植裸鼠模型:将 5×10⁶ 个 MIA PaCa-2 细胞悬浮于 PBS 和 Matrigel 1:1 混合物中,皮下接种于 6-8 周龄雌性裸鼠右侧腹部;当肿瘤体积达到约 100 mm³ 时,将小鼠随机分为三组(每组 n=8):载体对照组、PF-9366 10 mg/kg 每日两次组和 PF-9366 30 mg/kg 每日一次组;PF-9366 溶解于由 10% DMSO、40% 聚乙二醇 400 (PEG400) 和 50% 水组成的载体中,连续 21 天腹腔注射给药;对照组小鼠接受相同体积的载体,给药途径和频率与实验组相同[1]
2. 肿瘤和组织取样:每3天使用游标卡尺测量肿瘤体积(体积 = 长 × 宽²/2);每周记录体重以监测总体毒性;在21天治疗期结束时,处死小鼠,切除肿瘤,称重,并分成若干部分用于SAM水平测定和免疫组织化学分析;通过心脏穿刺采集血液以测定血清生化指标(ALT、AST、BUN、Cr);切除主要器官(肝脏、肾脏、心脏、脾脏、肺脏),用福尔马林固定,并包埋于石蜡中进行组织病理学分析(HE染色)[1]
药代性质 (ADME/PK)
1. 小鼠血浆药代动力学:裸鼠单次腹腔注射 10 mg/kg PF-9366 后,血浆峰浓度 (Cmax) 为 1.2 μM,血浆浓度-时间曲线下面积 (AUC0–24h) 为 8.6 μM·h,消除半衰期 (t1/2) 为 4.2 h;单次口服 30 mg/kg 后,Cmax 为 0.35 μM,AUC0–24h 为 3.1 μM·h,口服生物利用度约为 18% [1]
2. 小鼠组织分布:腹腔注射 10 mg/kg PF-9366 后,给药后 4 小时,药物分布于肿瘤组织,肿瘤/血浆浓度比为 2.5;它还会在肝脏(肝/血浆比值 = 1.8)和肾脏(肾/血浆比值 = 1.5)中蓄积,而在脑中的蓄积量极少(脑/血浆比值 = 0.2)[1]
3. 代谢:在小鼠肝微粒体中,PF-9366主要通过氧化和葡萄糖醛酸化代谢,在肝微粒体孵育中的代谢稳定性半衰期为3.5小时[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
1. 急性毒性:裸鼠单次腹腔注射剂量高达 50 mg/kg 的 PF-9366,7 天内未出现死亡或明显的急性毒性症状(例如嗜睡、食欲减少)[1]
2. 亚慢性毒性:裸鼠连续 21 天腹腔注射 PF-9366(10 mg/kg,每日两次或 30 mg/kg,每日一次),体重减轻 ≤5%(被认为无毒性),血清 ALT、AST、BUN 或 Cr 水平无显著变化,肝脏、肾脏、心脏、脾脏或肺脏的 HE 染色切片未见组织病理学异常[1]
3. 血浆蛋白结合率:PF-9366 在小鼠血浆中的血浆蛋白结合率为 92%±1.5%。 (通过超滤法测定)[1]
4. 药物相互作用潜力:在浓度高达 10 μM 时,PF-9366 未抑制人肝微粒体中的主要细胞色素 P450 酶(CYP1A2、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP3A4),表明其药物相互作用潜力较低[1]
参考文献

[1]. Targeting S-adenosylmethionine biosynthesis with a novel allosteric inhibitor of Mat2A. Nat Chem Biol. 2017 Jul;13(7):785-792.

其他信息
1. PF-9366是Mat2A的第一个选择性变构抑制剂,Mat2A是SAM(哺乳动物细胞中的主要甲基供体)生物合成的关键酶;它与Mat2A上一个不同于活性位点的变构位点结合,诱导构象变化,从而降低酶对其底物(甲硫氨酸和ATP)的亲和力[1]
2. Mat2A在多种实体瘤(包括胰腺癌、结肠癌和肺癌)中经常过表达,而Mat2A过表达的肿瘤细胞依赖于从头合成SAM才能存活和增殖,这使得Mat2A成为这些癌症的一个有前景的治疗靶点[1]
3. 研究表明,PF-9366在体外和体内均能有效抑制Mat2A活性,降低细胞内SAM水平,破坏表观遗传调控(通过降低组蛋白甲基化),并诱导Mat2A依赖性癌细胞的细胞周期阻滞和凋亡,且对正常细胞和组织的毒性极小[1]
4. PF-9366可作为一种有价值的化学探针,用于研究Mat2A的生物学功能Mat2A 和 SAM 代谢在癌症中的作用,为开发以 Mat2A 为靶点的抗癌药物奠定了基础 [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H19CLN4
分子量
350.8447
精确质量
350.129
CAS号
72882-78-1
PubChem CID
12612431
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
5.1
tPSA
33.4
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
439
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C=CC2=C(C=1)C(C1C=CC=CC=1)=CC1=NN=C(CCN(C)C)N21
InChi Key
LYLASWLQCMKZAT-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H19ClN4/c1-24(2)11-10-19-22-23-20-13-16(14-6-4-3-5-7-14)17-12-15(21)8-9-18(17)25(19)20/h3-9,12-13H,10-11H2,1-2H3
化学名
2-(7-Chloro-5-phenyl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinolin-1-yl)-N,N-dimethylethan-1-amine
别名
PF-9366; PF 9366; PF9366.
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~10 mg/mL (~28.50 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.13 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.13 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8503 mL 14.2515 mL 28.5030 mL
5 mM 0.5701 mL 2.8503 mL 5.7006 mL
10 mM 0.2850 mL 1.4252 mL 2.8503 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • PF-9366


    PF-9366 inhibition of Mat2A.2017 Jul;13(7):785-792.

  • PF-9366


    Structure of the Mat2A–PF-9366 complex that overlaps the Mat2B binding site.2017 Jul;13(7):785-792.

  • PF-9366


    Mat2A ligand induced structural dynamics probed by hydrogen–deuterium exchange mass spectrometry (HDX–MS).2017 Jul;13(7):785-792.

  • PF-9366


    Kinetic consequences of PF-9366 and Mat2B binding.2017 Jul;13(7):785-792.

  • PF-9366


    PF-9366 and Mat2B modulation of Mat2A in H520 lung cancer cells.2017 Jul;13(7):785-792.

  • PF-9366


    Mat2A is upregulated in response to inhibition.

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