PFM39

别名: PFM39PFM-39
目录号: V27419 纯度: ≥98%
PFM39 (PFM-39) 是一种新型有效的 Mirin 类似物,可选择性抑制 MRE11 外切核酸酶活性,但不抑制内切核酸酶活性。
PFM39 CAS号: 1310744-67-2
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
PFM39 (PFM-39) 是一种新型高效的米林类似物,可选择性抑制 MRE11 外切核酸酶活性,但不抑制其内切核酸酶活性。
PFM39 (CAS 1310744-67-2) 是一种高效且可透过细胞膜的米林类似物,可选择性抑制 MRE11 外切核酸酶活性。它抑制 MRE11 外切核酸酶活性,但不抑制其内切核酸酶活性。该化合物可抑制双链 DNA 的磷酸基团旋转,并选择性抑制 MRE11 外切核酸酶活性。它用于 DNA 修复研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
PFM39 targets MRE11, a key component of the MRN (MRE11-RAD50-NBS1) complex involved in DNA double-strand break repair. It selectively inhibits the exonuclease activity of MRE11 without affecting its endonuclease activity. PFM39 targets MRE11 in a fashion similar to Mirin but distinct from PFM01, allowing blockage of dsDNA phosphate backbone rotation and selective inhibition of MRE11 exo-nuclease activity.
体外研究 (In Vitro)
在 1BR3-hTERT 成纤维细胞中,PFM39 (100 μM) 处理可降低电离辐射 (IR) 后 G2 期双链断裂 (DSB) 的修复 [1]。50 μM 的 PFM39 可抑制同源重组 (HR),但对非同源末端连接 (NHEJ) 无明显影响 [1]。体外实验表明,50 μM 的 PFM39 可作为 MRE11 外切酶抑制剂,有效抑制同源重组 (HR),且不会显著增加 NHEJ。它选择性地抑制 MRE11 外切酶活性,同时不影响内切酶活性。该化合物是一种强效的、可透过细胞膜的米林类似物。
体内研究 (In Vivo)
现有文献中关于PFM39体内活性的数据并不详尽。作为一种MRE11核酸外切酶活性和同源重组抑制剂,该化合物有望增强癌细胞对DNA损伤剂的体内敏感性。但目前尚无具体的体内疗效数据报道。
酶活实验
针对 PFM39 的特定无细胞酶/受体结合分析方案包括 MRE11 核酸酶活性测定。使用合适的 DNA 底物测定外切酶和内切酶活性。通过比较外切酶底物和内切酶底物的活性,证实了对核酸外切酶活性的选择性抑制。
细胞实验
体外细胞实验利用细胞系评估 PFM39 对同源重组的抑制作用。细胞用 PFM39 (50 µM) 处理后,通过报告基因检测测定同源重组 (HR) 效率。同时评估非同源末端连接 (NHEJ) 效率,以确认该化合物不会显著增加 NHEJ。此外,还评估了 DNA 损伤修复通路。
动物实验
现有文献中未详细描述PFM39的体内动物研究。作为一种阻断同源重组的MRE11抑制剂,典型的体内评估将采用异种移植小鼠模型,单独使用PFM39或将其与DNA损伤剂联合使用,以评估其对放射或化疗的增敏作用。
药代性质 (ADME/PK)
PFM39 的分子式为 C10H9N3OS,分子量为 219.26 g/mol。它是一种可透过细胞膜的米林类似物。纯度 ≥98%(HPLC)。储存:干燥、避光,短期储存于 0-4°C,长期储存于 -20°C。该化合物可溶于 DMSO。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有文献中未提供PFM39的具体毒理学数据。该化合物仅供研究使用,不适用于人类治疗。作为一种阻断同源重组的MRE11抑制剂,其潜在毒性可能与正常组织中DNA修复受损有关,但目前尚无正式的毒理学报告。
参考文献

[1]. DNA double-strand break repair pathway choice is directed by distinct MRE11 nuclease activities. Mol Cell. 2014 Jan 9;53(1):7-18.

其他信息
PFM39(CAS 1310744-67-2)是一种强效的、可透过细胞膜的米林类似物,能够选择性地抑制MRE11核酸外切酶活性(但不抑制核酸内切酶活性)。在50 µM浓度下,它能有效抑制同源重组,且不会显著增加非同源末端连接(NHEJ)。该化合物用于DNA修复研究。目前尚无临床试验数据。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H9N3OS
分子量
219.262
精确质量
219.046
CAS号
1310744-67-2
PubChem CID
141991257
外观&性状
Yellow to orange solid powder
密度
1.5±0.1 g/cm3
折射率
1.739
LogP
0.82
tPSA
104
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
15
分子复杂度/Complexity
319
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC(=CC=C1/C=C\2/C(=O)NC(=N)S2)N
InChi Key
QXOIZYPBCJHYLN-YVMONPNESA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H9N3OS/c11-7-3-1-6(2-4-7)5-8-9(14)13-10(12)15-8/h1-5H,11H2,(H2,12,13,14)/b8-5-
化学名
(5Z)-5-[(4-aminophenyl)methylidene]-2-imino-1,3-thiazolidin-4-one
别名
PFM39PFM-39
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~456.08 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (11.40 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (11.40 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.5608 mL 22.8040 mL 45.6080 mL
5 mM 0.9122 mL 4.5608 mL 9.1216 mL
10 mM 0.4561 mL 2.2804 mL 4.5608 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们