Pleconaril

别名: Pleconaril, Picovir; VP 63843; Win 63843;SR-263843; SR-63843; VP-63843; Win-63843; SR263843; SR63843; VP63843; Win63843; SR 263843; SR 63843;
目录号: V2818 纯度: ≥98%
Pleconaril(也称为 VP 63843;Win 63843)是衣壳抑制剂和抗病毒药物,具有治疗肠道病毒感染和哮喘的潜力。
Pleconaril CAS号: 153168-05-9
产品类别: Enterovirus
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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  • Pleconaril-d4
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
普利康利(Pleconaril,又名VP 63843;Win 63843)是一种衣壳抑制剂和抗病毒药物,具有治疗肠道病毒感染和哮喘的潜力。普利康利能有效抑制病毒复制,IC50值为50 nM。普利康利可口服或鼻内给药,对小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)的病毒有效,包括肠道病毒和鼻病毒。它对危险的肠道病毒D68毒株也显示出一定的活性。普利康利已在新生儿和免疫缺陷患者中用于治疗严重的肠道病毒感染,属于同情用药。


普利康利是一种衣壳抑制剂,旨在对抗鼻病毒和肠道病毒感染。它是唯一进入III期临床试验的抗肠道病毒药物。

Pleconaril 已在新生儿和免疫缺陷患者中用于治疗严重的肠道病毒感染,属于同情用药。目前,该药已由先灵葆雅公司获得许可,并已在研究用于治疗高危患者中由人鼻病毒 (HRV) 引起的哮喘和慢性阻塞性肺疾病急性发作,以及治疗新生儿败血症 [1]。
生物活性&实验参考方法
靶点
Viral capsid protein VP1 (hydrophobic pocket formed by VP1, VP3 and VP2). No IC50, Ki, EC50, or DC50 values for target binding are provided in this manuscript [1].
体外研究 (In Vitro)
普利康利(Pleconaril,又名VP 63843;Win 63843)是一种衣壳抑制剂和抗病毒药物,具有治疗肠道病毒感染和哮喘的潜力。普利康利能有效抑制病毒复制,IC50值为50 nM。普利康利可口服或鼻内给药,对小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)的病毒有效,包括肠道病毒和鼻病毒。它对危险的肠道病毒D68毒株也显示出一定的活性。普利康利已在新生儿和免疫缺陷患者中用于治疗严重的肠道病毒感染,属于人道主义用药。


激酶活性测定:普利康利(也称为 VP 63843;Win 63843)是一种衣壳抑制剂和抗病毒药物,具有治疗肠道病毒感染和哮喘的潜力。普利康利能有效抑制病毒复制,IC50 为 50 nM。


细胞检测:鼻病毒感染不仅会引起普通感冒,还可能引发哮喘和慢性阻塞性肺疾病 (COPD) 的严重急性发作。尽管鼻病毒过去一直是药物研发的重点,但抗鼻病毒药物仍未上市。过去的研究表明,病毒衣壳蛋白 VP1 是抗病毒分子研发的重要靶点。此外,许多不同的化学骨架似乎都具备通过这种作用机制抑制病毒复制所需的特性。I-6602 是鼻病毒抑制剂吡罗达韦的类似物,此前已被证实是一种有效的鼻病毒感染抑制剂。本文描述了其类似物 ca603(一种具有修饰连接基结构的分子)的抗病毒活性,并证实了其作为衣壳结合剂的作用机制。我们测试了普利可那利对各种埃可病毒 11 (E11) 毒株和对照病毒的敏感性。IC50 值如下:患者毒株 M07067754、M08084333 和 M09053042 的 IC50 均 ≥32 μM;原型毒株 E11-PT 的 IC50 = 0.0038 μM;临床分离株 20750473 的 IC50 = 0.0035 μM。临床分离株 20750433 IC50 = 0.042 μM;临床分离株 20750473(另一株)IC50 = 0.0033 μM;临床分离株 21051708 IC50 = 0.0011 μM;临床分离株 21051867 IC50 = 0.0031 μM;临床分离株 21051929 IC50 = 0.0036 μM;临床分离株 21052365(C 基因群)IC50 = 0.05 μM;对照 CVB3 IC50 ≥32 μM;EV71 IC50 ≥32 μM;HRV16 IC50 = 0.0016 μM;E13 IC50 = 0.032 μM; CAV9 IC50 = 0.032 μM [1].
体外诱导耐药性:将敏感的 E11 临床菌株 (20750473) 与浓度递增的普利康利共同培养。传代 3 代(菌株 3A4)观察到耐药性,IC50 值增加至 1 μM。传代 4-6 代时,IC50 值 ≥32 μM,证实了耐药性。测序结果显示,传代 3 代后出现 I183M 突变,该突变在后续传代中得以保留。当省略普利康那利时,出现了V119I突变(菌株11B5),从而提高了复制效率[1]。
结构建模和PEARL相互作用能值:对于敏感菌株E11-PT和20750473,普利康那利的PEARL相互作用值分别为-483.6和-362.6,表明存在强相互作用;对于耐药患者菌株M07067754,该值为-270.9,表明对接效率低下。口袋因子相互作用值分别为-281.0 (E11-PT)、-237.8 (20750473) 和-286.7 (M07067754),表明普利康那利在敏感菌株中能与口袋因子竞争,但在耐药菌株中则不能[1]。
赋予耐药性的氨基酸替换:患者耐药菌株在VP1中携带V117I、V119M和I188L突变。模型分析表明,V119M突变赋予耐药性是由于甲硫氨酸的硫酸侧链突出。体外诱导的耐药菌株携带I183M突变(以及后来的V119I突变)。对V119M(单突变或与I188L双突变)进行定点诱变,可获得IC50≥32 μM的活性克隆,证实了其耐药性[1]。

体内研究 (In Vivo)
普利康纳利(Pleconaril)可口服或鼻内给药,对小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)的病毒有效,包括肠道病毒和鼻病毒。它对危险的肠道病毒D68毒株也显示出有效的活性。普利康纳利已在同情用药的基础上用于治疗新生儿和免疫缺陷患者严重的肠道病毒感染。
酶活实验
计算机模拟对接和建模:Pleconaril 的三维结构取自 PDB 编号 1C8M。使用 PATCHDOCK 软件将 Pleconaril 对接至埃可病毒 11 型衣壳模型的疏水口袋中。根据 PEARLS 计算的能量分布对前 20 个结果进行排序,以选择最稳定的复合物。使用 POCKETFINDER 识别口袋。计算 Pleconaril 的相互作用能值(PEARL)和口袋因子,以评估结合效率和竞争性。将 E11-PT 的 VP1-4 氨基酸序列提交至 I-TASSER,以 PDB 编号 1H8T 为模板进行同源建模。将最佳三维模型投影到已知的埃可病毒 VP1-4 复合物结构上,以构建 EV 衣壳不对称单元的模型。使用 CHIRON 去除空间位阻冲突。使用 RASTOP、CHIMERA 和 PDBsum 进行可视化[1]。
细胞实验
普利康利抑制试验:该试验按先前所述方法进行(Wildenbeest 等,2012)。对普利康利的敏感性以 IC50(50% 抑制浓度)表示。该方法包括将病毒与普利康利系列稀释液孵育,并确定抑制病毒复制 50% 的浓度 [1]。
体外分离耐药突变株:将对普利康利敏感的 E11 临床毒株(20750473,50 μL 中 100 TCID50)与普利康利 10 倍稀释液(100 至 0.0001 μg/mL)在含 2% 胎牛血清的 Eagle 最低必需培养基 (EMEM) 中孵育,每个浓度设置两个复孔,最多孵育 7 天。在最高浓度普利康利(Pleconaril)条件下生长的病毒,以10倍稀释度(100至0.0001 μg/mL)在含2%胎牛血清的EMEM培养基中进行传代培养,每个浓度设置两个复孔。此过程重复六代,之后病毒在不含普利康利的培养基中再传代培养五代。每次传代后,均收集病毒分离株用于VP1测序和体外药敏试验[1]。
定点诱变:通过定点诱变构建了七个E11突变克隆,分别在VP1的117、119、183和188位氨基酸残基上引入单突变、双突变或三突变。克隆经XhoI酶切线性化后,用T7 RNA聚合酶转录RNA,并使用转染试剂将RNA转染至Vero细胞。采用 TCID50 方法对上清液进行滴定,并进行测序验证[1]。
动物实验
口服或鼻内给药
药代性质 (ADME/PK)
吸收、分布和排泄
70%(口服)
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
蛋白质结合
> 99%
参考文献
2015 Jul 14;12:106.2015 Mar;96(Pt 3):571-9.
其他信息
普利康利(Pleconaril)是由先灵葆雅公司生产的一种抗病毒药物,属于病毒衣壳抑制剂,用于预防接触过小核糖核酸病毒的哮喘患者出现急性哮喘发作和普通感冒症状。其作用机制是抑制病毒复制。由于普利康利已被发现能诱导CYP3A酶活性,增加严重药物相互作用的风险,因此其使用尚未获得美国食品药品监督管理局(FDA)的批准。据报道,普利康利存在于菘蓝(Isatis tinctoria)中,并且已有相关数据。普利康利是一种小分子抑制剂,对包括肠道病毒和鼻病毒在内的小核糖核酸病毒有效。普利康利与主要衣壳蛋白中的疏水性口袋结合,阻止病毒RNA基因组的脱壳。对于肠道病毒,它还能阻止病毒附着于宿主细胞。药物适应症:普利康利已被研究用于治疗上呼吸道感染。
作用机制
普利康纳与病毒蛋白1(构成小型RNA病毒衣壳的主要蛋白)中的疏水腔结合。这会使病毒衣壳变硬并压缩,阻止其RNA脱壳。因此,病毒无法附着于宿主细胞并引起感染。

普利康纳是一种衣壳抑制剂,旨在与由衣壳蛋白VP1、VP3和VP2形成的疏水腔结合。该化合物会导致衣壳结构变硬,从而阻止病毒RNA释放到细胞内[1]。
2002年,普利康纳作为治疗普通感冒的药物的新药申请被FDA驳回,主要原因是安全问题。目前,该药物已由先灵葆雅公司获得许可,并已在治疗人鼻病毒(HRV)诱发的哮喘和慢性阻塞性肺疾病(COPD)急性加重(NCT00394914)以及新生儿败血症(NCT00031512)方面进行了研究[1]。
普利可那利的耐药性可能源于VP1疏水口袋的突变(例如,V119M、I183M)。由于两者均靶向病毒衣壳,因此可能存在与静脉注射免疫球蛋白(IVIg)的交叉耐药性[1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H18F3N3O3
分子量
381.35
精确质量
381.13
元素分析
C, 56.69; H, 4.76; F, 14.95; N, 11.02; O, 12.59
CAS号
153168-05-9
相关CAS号
Pleconaril-d4;2749329-20-0
PubChem CID
1684
外观&性状
White to biege solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
481.2±55.0 °C at 760 mmHg
熔点
61-62°
闪点
244.8±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.2 mmHg at 25°C
折射率
1.509
LogP
5.77
tPSA
74.18
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
471
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC(C1=NC(C2C([H])=C(C([H])([H])[H])C(=C(C([H])([H])[H])C=2[H])OC([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C2=C([H])C(C([H])([H])[H])=NO2)=NO1)(F)F
InChi Key
KQOXLKOJHVFTRN-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H18F3N3O3/c1-10-7-13(16-22-17(27-24-16)18(19,20)21)8-11(2)15(10)25-6-4-5-14-9-12(3)23-26-14/h7-9H,4-6H2,1-3H3
化学名
3-(3,5-dimethyl-4-(3-(3-methylisoxazol-5-yl)propoxy)phenyl)-5-(trifluoromethyl)-1,2,4-oxadiazole
别名
Pleconaril, Picovir; VP 63843; Win 63843;SR-263843; SR-63843; VP-63843; Win-63843; SR263843; SR63843; VP63843; Win63843; SR 263843; SR 63843;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 76~100 mg/mL ( 199.29~262.23 mM )
Ethanol : 76 mg/mL
Water : ˂1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.56 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.56 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液添加到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

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配方 3 中的溶解度: 10% DMSO+90% Corn Oil: ≥ 2.5 mg/mL (6.56 mM)


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6223 mL 13.1113 mL 26.2226 mL
5 mM 0.5245 mL 2.6223 mL 5.2445 mL
10 mM 0.2622 mL 1.3111 mL 2.6223 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • An external file that holds a picture, illustration, etc.
Object name is 12985_2015_330_Fig5_HTML.jpg

    Plants-proposed binding mode for pleconaril (cyan) and ca603 (magenta) in the HRV14 VP1. Residues involved in direct interactions are depicted as white sticks2015 Jul 14;12:106.

  • Pleconaril

    Compound ca603 (black) inhibits HRV14 replication only when added at an early stage and behaves similar to pleconaril (grey).2015 Jul 14;12:106.

  • Pleconaril

    Sequence alignment of the HRV-A VP1 residues. Alignment was constructed with CLC sequence viewer (Qiagen)2015 Jul 14;12:106.
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