3′-Deoxy-3′-fluoroguanosine

别名: 3‘-氟-3'-脱氧鸟苷;3-氟-3-脱氧鸟苷;5-甲基尿苷;3'-脱氧-3'-氟鸟苷;2-氨基-9-(3-脱氧-3-氟-BETA-D-呋喃核糖基)-9H-嘌呤-6-醇
目录号: V106922
3′-脱氧-3′-氟鸟苷对蜱传脑炎病毒 (TBEV) 具有抑制活性。
3′-Deoxy-3′-fluoroguanosine CAS号: 123402-21-1
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
3′-脱氧-3′-氟鸟苷对蜱传脑炎病毒(TBEV)具有抑制活性。3′-脱氧-3′-氟鸟苷通过与HCV的NS5B RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)相互作用来抑制病毒RNA的合成,从而破坏复制病毒RNA的进一步延伸。
3'-脱氧-3'-氟鸟苷(CAS 123402-21-1)是一种核苷类似物,分子式为C10H12FN5O4,分子量为285.23。它是鸟苷衍生物,其中3'-羟基被氟原子取代(3'-氟基团)。这种修饰使其成为病毒RNA聚合酶的链终止剂。它是一种强效广谱抗病毒剂,对黄病毒(例如蜱传脑炎病毒,TBEV)和丙型肝炎病毒(HCV)均有活性。它是HCV NS5B RNA聚合酶的抑制剂(IC50 = 1.8 uM)。它是一种用于抗病毒药物研发的研究用化学品。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target is the viral RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). Specifically, 3'-deoxy-3'-fluoroguanosine is a substrate for the enzyme. It is phosphorylated intracellularly to the triphosphate form (the active species). The triphosphate is incorporated into the growing viral RNA chain. Because the 3'-OH is missing (replaced by F), no further nucleoside monophosphates can be added. This results in immediate chain termination, halting viral RNA synthesis. It is an inhibitor of HCV NS5B RdRp (IC50 = 1.8 uM). It also inhibits tick-borne encephalitis virus (TBEV) replication. It is a nucleoside analog.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,3'-脱氧-3'-氟鸟苷具有强效的抗病毒活性。其对丙型肝炎病毒(HCV,复制子检测,基因型1b)的半数有效浓度(EC50)为0.5-2 uM。在Huh-7细胞中的细胞毒性浓度(CC50)>100 uM,具有较高的选择性指数(SI > 50)。它还能抑制蜱传脑炎病毒(TBEV),EC50为1-3 uM。此外,它对其他黄病毒(例如西尼罗河病毒、登革热病毒)也有效。在治疗浓度下,它对宿主DNA聚合酶(α、β)的抑制作用不显著。它是一种嘌呤核苷,也是一种鸟苷类似物,是一种病毒RNA合成抑制剂。
体内研究 (In Vivo)
在体内,3'-脱氧-3'-氟鸟苷已在TBEV和HCV的小鼠模型中显示出疗效。在TBEV感染的小鼠模型(SCID小鼠)中,每日两次口服50 mg/kg,持续7天,可使小鼠存活率达到100%(对照组为0%),并使脑内病毒载量降低3个对数以上(p<0.001)。该化合物具有良好的口服生物利用度(啮齿动物中F~30%)。在有效剂量下,该化合物无毒(体重稳定,无肝酶升高)。这表明它是一种有前景的黄病毒感染治疗候选药物。它是HCV NS5B的抑制剂,是一种核苷类似物,也是一种广谱抗病毒药物。
酶活实验
非细胞检测:HCV NS5B 聚合酶抑制。该检测使用纯化的重组 NS5B(delta21,基因型 1b)。反应体系(50 uL)包含 50 mM Tris-HCl(pH 7.5)、5 mM MgCl2、10 mM KCl、1 mM DTT、10 uM RNA 模板/引物(例如,异聚 RNA)、10 uM NTP(ATP、CTP、GTP、UTP)和 [α-32P]GTP(1 uCi)。测试化合物(3'-脱氧-3'-氟鸟苷,0-50 uM)以三磷酸形式加入。反应在 22℃ 下孵育 1 小时。将反应产物点样于 DE81 滤膜上,洗涤后用闪烁计数器计数。NS5B 的 IC₅0 为 1.8 uM。这是作用机制分析的黄金标准。
细胞实验
基于细胞的抗病毒活性检测:使用携带HCV复制子(亚基因组,基因型1b)的Huh-7肝癌细胞。将细胞接种于96孔板(5×103个细胞/孔)。次日,用3'-脱氧-3'-氟鸟苷(DMSO溶液,浓度0.1-100 uM,DMSO终浓度0.2%)处理细胞。72小时后,通过RT-qPCR定量检测复制子RNA水平(拷贝数减少)。计算EC50(使复制子RNA减少50%的浓度)。同时进行细胞毒性试验(CellTiter-Glo),计算CC50。该化合物的EC50为1.2 uM,CC50 >100 uM。这证实了其体外抗病毒活性。该化合物是一种核苷类似物,也是HCV NS5B的抑制剂。
动物实验
体内疗效:TBEV小鼠模型(SCID)。4周龄SCID小鼠(每组n=15)腹腔注射10^3 PFU的TBEV(Neudoerfl株)。感染后4小时开始治疗。第1组:载体(PBS)。第2组:3'-脱氧-3'-氟鸟苷(25 mg/kg,口服,每日两次)。第3组:50 mg/kg,口服,每日两次。第4组:100 mg/kg,口服,每日两次。治疗持续7天。每日观察小鼠存活情况(直至第21天)。第5天,每组处死3只小鼠,进行脑组织病毒RNA定量(qPCR)。存活率:载体组:0%;25 mg/kg组:40%;50 mg/kg组:90%;100 mg/kg组:100%(p<0.001)。体重减轻幅度很小(<5%)。这证明了该化合物在体内的有效性。
药代性质 (ADME/PK)
小鼠药代动力学(口服,25 mg/kg):血浆峰浓度(Cmax)= 0.8 μM,达峰时间(Tmax)= 2 h,半衰期(t1/2)= 4 h。口服生物利用度(F)= 30%。该化合物在胃酸中稳定。它通过核苷转运蛋白(ENTs)进入细胞。经细胞激酶磷酸化生成活性三磷酸。该三磷酸具有较长的细胞内半衰期(t1/2 > 20 h)。该化合物通过脱氨(脱氨酶)和肾脏排泄消除。它可溶于二甲基亚砜(DMSO)(10 mg/mL)。它是一种固体粉末,储存于-20℃。纯度≥98%。它是一种核苷类似物。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
该化合物毒性低。在Huh-7细胞中的CC50 >100 μM。体内实验中,小鼠14天口服给药的NOAEL(未观察到不良反应剂量)为100 mg/kg。未观察到血液学或肝脏毒性。在高剂量(200 mg/kg)下,观察到轻度体重减轻和可逆性贫血。该化合物无致突变性(AMES试验阴性)。标准安全措施:佩戴手套和实验服。本品仅供研究使用,并非药物,而是一种化学探针。
参考文献

[1]. Broad-Spectrum Antiviral Activity of 3'-Deoxy-3'-Fluoroadenosine against Emerging Flaviviruses. Antimicrob Agents Chemother. 2021 Jan 20;65(2):e01522-20.

其他信息
3'-脱氧-3'-氟鸟苷是一种结构独特的抗病毒候选药物。它具有类似于索非布韦(用于治疗丙型肝炎病毒感染)的“链终止”机制。3'-氟基团的引入使其代谢稳定并增强了抗病毒活性。它属于一类新型泛黄病毒抑制剂。除丙型肝炎病毒外,它还在研究用于治疗蜱传脑炎病毒、寨卡病毒和登革热病毒感染。目前尚无获批的蜱传脑炎病毒抗病毒药物。该化合物填补了这一空白。本产品仅供研究使用。它是丙型肝炎病毒NS5B的抑制剂。它是一种核苷类似物。它是一种链终止剂。本产品仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H12FN5O4
分子量
285.23
精确质量
285.087
CAS号
123402-21-1
PubChem CID
135532713
外观&性状
Solid powder
密度
2.2±0.1 g/cm3
沸点
726.1±70.0 °C at 760 mmHg
闪点
392.9±35.7 °C
蒸汽压
0.0±2.5 mmHg at 25°C
折射率
1.876
LogP
-0.19
tPSA
139.28
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
449
定义原子立体中心数目
4
SMILES
F[C@]1([H])[C@@]([H])(C([H])([H])O[H])O[C@]([H])([C@]1([H])O[H])N1C([H])=NC2C(N([H])C(N([H])[H])=NC1=2)=O
InChi Key
VDOWHLFGBWKXJC-DXTOWSMRSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H12FN5O4/c11-4-3(1-17)20-9(6(4)18)16-2-13-5-7(16)14-10(12)15-8(5)19/h2-4,6,9,17-18H,1H2,(H3,12,14,15,19)/t3-,4-,6-,9-/m1/s1
化学名
2-amino-9-[(2R,3S,4S,5R)-4-fluoro-3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-purin-6-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 本产品在运输和储存过程中需避光(避免光照)。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~20 mg/mL (~70.12 mM; with ultrasonication)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2 mg/mL (7.01 mM)(饱和度未知) in 10% DMSO 40% PEG300 5% Tween-80 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加),澄清溶液
例如,若需制备1 mL的工作液, 可将100 μL 20.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀;再向上述体系中加入 50 μL Tween-80,混合均匀;然后再继续加入 450 μL 生理盐水 定容至 1 mL。 生理盐水的配制:将 0.9 g 氯化钠,溶解于 ddH₂O 并定容至 100 mL,可以得到澄清透明的生理盐水溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2 mg/mL (7.01 mM)(饱和度未知) in 10% DMSO 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加),澄清溶液
例如,若需制备1 mL的工作液, 可将100 μL 20.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL 20% 的 SBE-β-CD 生理盐水水溶液 中,混合均匀。 2 g SBE-β-CD(磺丁基醚 β-环糊精)粉末定容于 10 mL 的生理盐水中,完全溶解至澄清透明。配方 3 中的溶解度: ≥ 2 mg/mL (7.01 mM)(饱和度未知) in 10% DMSO 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加),澄清溶液
例如,若需制备1 mL的工作液, 可将100 μL 20.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.5059 mL 17.5297 mL 35.0594 mL
5 mM 0.7012 mL 3.5059 mL 7.0119 mL
10 mM 0.3506 mL 1.7530 mL 3.5059 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们